Detaillierte Studien von actinobakterieller ChdC
In-depth studies of actinobacterial coproheme decarboxylases
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Chemie (20%)
Keywords
-
Heme Biosynthesis,
Coproheme Decarboxylase,
Gram-positive bacteria,
Protein structure and function,
Enzyme Reaction Mechanism,
Spectroscopy
Häm ist für das Überleben der meisten Bakterien unerlässlich. Gram-positive Organismen stellen Häm auf eine Art und Weise her, die sich grundlegend von dem Biosyntheseweg Gram-negativer Organismen oder dem der Säugetiere unterscheidet. Viele mechanistische Fragen im Zusammenhang mit diesem erst vor wenigen Jahren beschriebenen Häm-Biosyntheseweg sind derzeit noch offen. In diesem Projekt wird das Enzym "Coprohämdecarboxylase" im Detail untersucht, um die Struktur- Funktions-Beziehungen aufzuklären. Coprohämdecarboxylasen katalysieren den letzten Schritt des Häm-Biosyntheseweges von Gram-positiven Bakterien. Sie wandeln Coproheme in das Endprodukt Häm b um, indem sie zwei Propionatgruppen zu Vinylgruppen decarboxylieren. Einige mechanistische Details sind bereits bekannt, aber alles in allem ist die Reaktion noch lange nicht vollständig erforscht. In diesem Projekt wollen wir spezielle, wichtige mechanistische Details verstehen, die während der Redoxreaktion auftreten, indem wir fortgeschrittene strukturelle und mechanistische Studien an dem aktinobakteriellen Vertreter des Erregers Corynebacterium diphteriae durchführen. Aus diesen Untersuchungen lassen sich wesentliche Rückschlüsse auf die Wirkungsweise dieses Enzyms ziehen und mit seinen strukturellen Eigenschaften verknüpfen. Die Kenntnis des Reaktionsmechanismus von Coprohämdecarboxylasen ist notwendig, um weitere Studien zu konzipieren, die versuchen, die enzymatische Aktivität zu hemmen. Eine Substanz, die spezifisch den Häm-Biosyntheseweg pathogener Gram-positiver Bakterien hemmen kann, ist ein vielversprechender Ansatzpunkt für die Entwicklung dringend benötigter neuer Antibiotika.
Research Output
- 18 Zitationen
- 9 Publikationen
-
2025
Titel Insights into the flexibility of the domain-linking loop in actinobacterial coproheme decarboxylase through structures and molecular dynamics simulations DOI 10.1002/pro.70027 Typ Journal Article Autor Patil G Journal Protein Science Link Publikation -
2024
Titel Entrance channels to coproheme in coproporphyrin ferrochelatase probed by exogenous imidazole binding DOI 10.1016/j.jinorgbio.2024.112681 Typ Journal Article Autor Dali A Journal Journal of Inorganic Biochemistry Seiten 112681 Link Publikation -
2024
Titel Proximal ligand tunes active site structure and reactivity in bacterial L. monocytogenes coproheme ferrochelatase DOI 10.1016/j.saa.2024.124120 Typ Journal Article Autor Dali A Journal Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy Seiten 124120 Link Publikation -
2024
Titel Insights into heme degradation and hydrogen peroxide induced dimerization of human neuroglobin. DOI 10.1042/bsr20241265 Typ Journal Article Autor Cassiani A Journal Bioscience reports Link Publikation -
2023
Titel Reactivity of Coproheme Decarboxylase with Monovinyl, Monopropionate Deuteroheme DOI 10.3390/biom13060946 Typ Journal Article Autor Patil G Journal Biomolecules Seiten 946 Link Publikation -
2023
Titel Structural aspects of enzymes involved in prokaryotic Gram-positive heme biosynthesis DOI 10.1016/j.csbj.2023.07.024 Typ Journal Article Autor Falb N Journal Computational and Structural Biotechnology Journal Seiten 3933-3945 Link Publikation -
2023
Titel The role of the distal cavity in carbon monoxide stabilization in the coproheme decarboxylase enzyme from C. diphtheriae DOI 10.1016/j.jinorgbio.2023.112243 Typ Journal Article Autor Sebastiani F Journal Journal of Inorganic Biochemistry Seiten 112243 Link Publikation -
2023
Titel The Role of the Hydrogen Bond Network in Maintaining Heme Pocket Stability and Protein Function Specificity of C. diphtheriae Coproheme Decarboxylase DOI 10.3390/biom13020235 Typ Journal Article Autor Sebastiani F Journal Biomolecules Seiten 235 Link Publikation -
2023
Titel The Molecular Evolution, Structure, and Function of Coproporphyrinogen Oxidase and Protoporphyrinogen Oxidase in Prokaryotes DOI 10.3390/biology12121527 Typ Journal Article Autor Zámocký M Journal Biology Seiten 1527 Link Publikation