SICVALVES
SICVALVES - Multiscale Modeling of Valvular Heart Diseases
ERA-NET: ERA-CVD
Wissenschaftsdisziplinen
Andere Technische Wissenschaften (40%); Mathematik (20%); Medizintechnik (40%)
Keywords
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Aortic Valve Stenosis,
Heart Failure,
Arrhythmias,
Modeling,
Valvular Heart Disease
Motivation: Herzklappenerkrankungen sind eine zunehmende gesundheitliche Belastung für die alternde Bevölkerung, bei der allein die Aortenklappenstenose bei mehr als 12% der Patienten >70 Jahre vorherrscht. Es ist eine chronisch-progressive Erkrankung, die mit Geschlecht und Alter variiert. Bestehende Leitlinien für die Behandlungsplanung verwenden jedoch nur grobe Funktionsparameter, die die interindividuelle Variabilität nicht berücksichtigen und weit von den Anforderungen der Präzisionsmedizin entfernt sind. Im Zeitalter der digitalen Med izin haben Computermodelle das Potenzial, wichtige pathophysiologische Mechanismen zu entschlüsseln und zur personalisierten Präzisionsmedizin beizutragen. Ziele: Die Nutzung fortgeschrittener Modelle auf Zell-, Gewebe- und Organebene, um mechanistische Erkenntnisse über Auslöser von ventrikulären Arrhythmien, diastolischer und systolischer Dysfunktion und myokardialen metabolischen Veränderungen zu gewinnen und zu untersuchen wie sich diese Prozesse gegenseitig verstärken. Geschlechtsspezifische Unterschie de müssen systematisch berücksichtigt werden. Letztlich sollen die Modelle zur Verbesserung der Diagnostik, Risikobewertung und Behandlungsplanung von Herzklappenerkrankungen beitragen. Methoden: Basierend auf unseren bisherigen Arbeiten werden wir bestehe nde computergestützte Modelle der Biomechanik, Elektrophysiologie und der Hämodynamik technologisch weiterentwickeln, testen und validieren. Zur Modellparametrisierung verwenden wir bestehende multidimensionale klinische Daten (Bildgebung, Sensortechnik, Systembiologie) aus eigenen früheren Untersuchungen bei Patienten mit Herzklappenerkrankungen. Die Validierung der Genauigkeit der Modelle zur Vorhersage von mechanistischen Veränderungen erfolgt anhand von Daten, die vor und nach dem Einsatz von künstlichen Klappenprothesen gewonnen werden. Innovation: Fortgeschrittene computergestützte Werkzeuge werden dafür genutzt, um personalisierte Modelle zu erstellen und diese zur quantitativen Bewertung von hypertropischem Remodeling und der Neigung zu Arrhythmien zu verwenden. Es werden vollständig neue Methoden entwickelt um zugrunde liegenden Mechanismen, Verlauf und Symptome die bei Herzklappenerkrankungen auftreten zu verstehen. Des Weiteren wird ein virtueller Simulator für die patientenspezifische Planung der Therapie von Herzklappenerkrankungen entwickelt, der die Wirksamkeit der künstlichen Klappenprothesen verbessert und die Sterblichkeit bei Patienten reduziert.
Das Vorhaben ist Teil des konsortialen Forschungsverbunds ERA-CVD SICVALVES, bei dem folgende Arbeitsgruppen beteiligt sind: Dr. Christoph Augustin (Medizinische Universität Graz), Dr. Sarah Nordmeyer (Charité Berlin) und Dr. Jason Bayer (IHU LIRYC Bordeaux). Ziel des Projekts ist die Anwendung und Validierung computergestützter Modelle, um krankheitsbedingte Veränderungen des Herzmuskels besser zu verstehen und die patientenspezifische Therapieplanung bei Herzklappenerkrankungen zu optimieren. Die Modelle sollen dazu beitragen: 1. Die Therapie des Herzklappenersatzes individueller zu planen und dadurch die Behandlungsergebnisse zu verbessern, 2. den Rückgang krankheitsbedingter Herzmuskelveränderungen nach einem Klappenersatz vorherzusagen und 3. den Zusammenhang zwischen Herzmuskelveränderungen und der Entstehung von Herzrhythmusstörungen besser zu verstehen. Dazu werden bestehende hämodynamische, biomechanische und elektrophysiologische Modelle mithilfe patientenspezifischer Daten optimiert. Präoperative Patientendaten werden verwendet, um postoperative Zustände mithilfe dieser Modelle vorherzusagen. Diese Vorhersagen werden anschließend mit tatsächlichen postoperativen Messungen verglichen. Der Schwerpunkt der Arbeitsgruppe in Graz lag auf der Erstellung virtueller, anatomischer Repliken des Patientenherzens, der Entwicklung von Computersoftware zur elektromechanischen Simulation des Herzmuskels sowie der Personalisierung der Computermodelle mit klinischen Daten. Dabei wurden bereits gesammelte Daten aus früheren Studien der Charité Berlin genutzt, um die computergestützten Modelle individuell zu kalibrieren und so eine patientenspezifische Therapieplanung für den Herzklappenersatz bei Patienten mit Herzklappenerkrankungen zu ermöglichen
- Sarah Nordmeyer, Deutsches Herzzentrum Berlin - Deutschland
- Jason Bayer, Université Bordeaux Segalen - Frankreich
Research Output
- 151 Zitationen
- 26 Publikationen
- 9 Datasets & Models
- 1 Software
- 2 Disseminationen
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 4 Weitere Förderungen
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2024
Titel Multiphysics simulations reveal haemodynamic impacts of patient-derived fibrosis-related changes in left atrial tissue mechanics DOI 10.1113/jp287011 Typ Journal Article Autor Gonzalo A Journal The Journal of Physiology Seiten 6789-6812 Link Publikation -
2024
Titel Physics-informed neural network estimation of material properties in soft tissue nonlinear biomechanical models DOI 10.1007/s00466-024-02516-x Typ Journal Article Autor Caforio F Journal Computational Mechanics Seiten 1-27 Link Publikation -
2024
Titel Neural network emulation of the human ventricular cardiomyocyte action potential for more efficient computations in pharmacological studies DOI 10.7554/elife.91911 Typ Journal Article Autor Grandits T Journal eLife Link Publikation -
2024
Titel Multi-physics simulations reveal hemodynamic impacts of patient-derived fibrosis-related changes in left atrial tissue mechanics DOI 10.1101/2024.05.29.596526 Typ Preprint Autor Gonzalo A Seiten 2024.05.29.596526 Link Publikation -
2022
Titel An Integrated Workflow for Building Digital Twins of Cardiac Electromechanics—A Multi-Fidelity Approach for Personalising Active Mechanics DOI 10.3390/math10050823 Typ Journal Article Autor Jung A Journal Mathematics Seiten 823 Link Publikation -
2022
Titel Impact of intraventricular septal fiber orientation on cardiac electromechanical function DOI 10.1152/ajpheart.00050.2022 Typ Journal Article Autor Rodríguez-Padilla J Journal American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology Link Publikation -
2022
Titel An accurate, robust, and efficient finite element framework with applications to anisotropic, nearly and fully incompressible elasticity DOI 10.1016/j.cma.2022.114887 Typ Journal Article Autor Karabelas E Journal Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering Seiten 114887 Link Publikation -
2022
Titel Calibration of Cohorts of Virtual Patient Heart Models Using Bayesian History Matching DOI 10.1007/s10439-022-03095-9 Typ Journal Article Autor Rodero C Journal Annals of Biomedical Engineering Seiten 241-252 Link Publikation -
2022
Titel A coupling strategy for a first 3D-1D model of the cardiovascular system to study the effects of pulse wave propagation on cardiac function DOI 10.1007/s00466-022-02206-6 Typ Journal Article Autor Caforio F Journal Computational Mechanics Seiten 703-722 Link Publikation -
2023
Titel Mechanoelectric effects in healthy cardiac function and under Left Bundle Branch Block pathology DOI 10.1016/j.compbiomed.2023.106696 Typ Journal Article Autor Petras A Journal Computers in Biology and Medicine Seiten 106696 Link Publikation -
2021
Titel Automated personalization of in silico left ventricular models of human electro-mechanics based on clinical data Typ PhD Thesis Autor Di Dr. Laura Marx Link Publikation -
2020
Titel Reconstructing vascular homeostasis by growth-based prestretch and optimal fiber deposition DOI 10.1016/j.jmbbm.2020.104161 Typ Journal Article Autor Wu J Journal Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials Seiten 104161 Link Publikation -
2020
Titel A computationally efficient physiologically comprehensive 3D-0D closed-loop model of the heart and circulation DOI 10.48550/arxiv.2009.08802 Typ Other Autor Augustin C Link Publikation -
2021
Titel Efficient identification of myocardial material parameters and the stress-free reference configuration for patient-specific human heart models DOI 10.48550/arxiv.2101.04411 Typ Preprint Autor Marx L Link Publikation -
2021
Titel An accurate, robust, and efficient finite element framework for anisotropic, nearly and fully incompressible elasticity DOI 10.48550/arxiv.2111.00612 Typ Preprint Autor Karabelas E -
2023
Titel Cell to whole organ global sensitivity analysis on a four-chamber heart electromechanics model using Gaussian processes emulators DOI 10.1371/journal.pcbi.1011257 Typ Journal Article Autor Strocchi M Journal PLOS Computational Biology Link Publikation -
2023
Titel A personalized real-time virtual model of whole heart electrophysiology DOI 10.1093/europace/euad122.541 Typ Journal Article Autor Gillette K Journal Europace Link Publikation -
2021
Titel A computationally efficient physiologically comprehensive 3D–0D closed-loop model of the heart and circulation DOI 10.1016/j.cma.2021.114092 Typ Journal Article Autor Augustin C Journal Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering Seiten 114092 Link Publikation -
2023
Titel Computational Models of Cardiovascular Biophysics Typ Postdoctoral Thesis Autor Christoph Augustin Link Publikation -
2023
Titel Overall fibrosis content rather than regional differences in extracellular volume alters ventricular conduction in aortic stenosis patients DOI 10.1093/europace/euad122.263 Typ Journal Article Autor Augustin C Journal Europace -
2023
Titel Physics-informed Neural Network Estimation of Material Properties in Soft Tissue Nonlinear Biomechanical Models DOI 10.48550/arxiv.2312.09787 Typ Other Autor Caforio F Link Publikation -
2022
Titel A personalized real-time virtual model of whole heart electrophysiology DOI 10.3389/fphys.2022.907190 Typ Journal Article Autor Gillette K Journal Frontiers in Physiology Seiten 907190 Link Publikation -
2022
Titel Robust and efficient fixed-point algorithm for the inverse elastostatic problem to identify myocardial passive material parameters and the unloaded reference configuration DOI 10.1016/j.jcp.2022.111266 Typ Journal Article Autor Marx L Journal Journal of Computational Physics Seiten 111266 Link Publikation -
2022
Titel The interplay of sex-specific electrophysiology and repolarization heterogeneity governs ventricular arrhythmia sustainability in women DOI 10.1093/eurheartj/ehac544.2518 Typ Journal Article Autor Prassl A Journal European Heart Journal -
2022
Titel Exploring Role of Accessory Pathway Location in Wolff-Parkinson-White Syndrome in a Model of Whole Heart Electrophysiology DOI 10.22489/cinc.2022.057 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Gillette K Seiten 1-4 -
2022
Titel A Method for Incorporating Changes in Extracellular Volume and Myocyte Size Into the Cardiac Bidomain Equations DOI 10.22489/cinc.2022.203 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Sobota V Seiten 1-4 Link Publikation
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2024
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Titel Cardiomyocyte Emulator Training Data DOI 10.5281/zenodo.10640338 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel pyCEPS DOI 10.1016/j.cmpb.2024.108299 Typ Computer model/algorithm Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel ForCEPSS DOI 10.1016/j.cmpb.2024.108189 Typ Computer model/algorithm Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Virtual cohort of 1000 synthetic heart meshes from adult human healthy population DOI 10.5281/zenodo.4506930 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Virtual cohort of adult healthy four-chamber heart meshes from CT images DOI 10.5281/zenodo.4590293 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
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Titel Virtual cohort of extreme and average four-chamber heart meshes from statistical shape model DOI 10.5281/zenodo.4593738 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel Meshtool DOI 10.1016/j.softx.2020.100454 Typ Computer model/algorithm Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel A Publicly Available Virtual Cohort of Four-chamber Heart Meshes for Cardiac Electro-mechanics Simulations DOI 10.5281/zenodo.3890033 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2018
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Titel openCARP DOI 10.35097/3k23ep4qffdze09u Typ Computer model/algorithm Öffentlich zugänglich Link Link
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2018
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Titel openCARP DOI 10.1016/j.cmpb.2021.106223 Link Link
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2024
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Titel Lecturer at the CISM-EUROMECH Advanced Course on "Computational Modelling of the heart: From Fundamentals to Clinical Applications" Typ Participation in an activity, workshop or similar Link Link -
2024
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Titel Participation with a booth on Digital Cardiology in the Long Night of Research 2024 Typ Participation in an open day or visit at my research institution Link Link
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2024
Titel Keynote Speaker at the International Student Congress 2024 Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International
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2024
Titel Principal Investigator Projects Typ Research grant (including intramural programme) DOI 10.55776/p 37063 Förderbeginn 2024 Geldgeber Austrian Science Fund (FWF) -
2022
Titel NIH Research Project Grant Program (R01) Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2022 Geldgeber National Institutes of Health (NIH) -
2021
Titel Walter Benjamin Programme Typ Fellowship Förderbeginn 2021 Geldgeber German Research Foundation -
2024
Titel Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA) Typ Fellowship DOI 10.3030/101148636 Förderbeginn 2024 Geldgeber European Commission