Katalytische Mechanismen und Anwendungen von Oxidoreduktasen - CATALOX
CATalytic mechanisms and AppLications of OXidoreductases - CATALOX
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (50%); Chemie (50%)
Keywords
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Biocatalysis,
Enzymes,
Reaction Mechanism,
Redox Reactions,
Protein Engineering
Aufgrund ihrer Bedeutung für den Energiestoffwechsel in Lebewesen sowie der Biosynthese einer Vielzahl von Naturprodukten spielen Reduktions- und Oxidationsreaktionen (Redox) eine Schlüsselrolle in der Natur. Darüber hinaus werden diese Reaktionen auch in der chemischen Industrie für Synthesen eingesetzt, die allerdings oftmals den Einsatz giftiger Reagenzien beinhalten oder aber ökonomisch ineffizient sind. Unser Ausbildungsprogramm wird daher sowohlherausragende Forschungsprojekte anbietenals auch eineausgewogene Technologieplattform bereitstellen, um neue und innovative Konzepte zum besseren Verständnis Enzym-katalysierter Redox-Reaktionen und deren Anwendungen zu etablieren. Die Auswahl der Forschungsprojekte wird dabei von dem zu erwarteten Fortschritt bei der Entwicklung eines struktur-basierten Verständnisses in die molekularen Funktionen und Mechanismen von Enzymen geleitet werden. Mit diesem Ansatz werden Wissenschaftler aus fünf Instituten der Technischen Universität Graz, für Biochemie (Macheroux), für Biotechnologie und Biochemische Prozesstechnik (Nidetzky), für Molekulare Biotechnologie (Winkler, Glieder & Kourist), dem für Organische Chemie (Breinbauer), für Verfahrens- und Partikeltechnik (Gruber-Wölffler) sowie zweier Institute an der Universität Graz, für Chemie (Kroutil, Glück) und für Molekulare Biowissenschaften (Gruber), ihre wissenschaftlichen Aktivitäten bündeln, um ein international konkurrenzfähiges und sichtbares Konsortium im Bereich der Biokatalyse und Biotechnologie zu bilden. Unsere Vorhaben werden dabei auch von einer engen Zusammenarbeit mit dem Austrian Centre of Industrial Biotechnology (ACIB) profitieren, besonders in Hinblick auf mögliche Anwendungsbereiche der gewonnenen Erkenntnisse. Ein besonderes Kennzeichen des geplanten Ausbildungsprogramms stellt das hohe Maß der geplanten Kooperationen innerhalb des Konsortiums dar, welche für DoktorandINNen hervorragende Voraussetzungen schaffen, um signifikante und sichtbare Beiträge bei der Erforschung von Enzym-katalysierten Reaktionen zu leisten. Die Rekrutierung und Auswahl der DoktorandINNen wird nach internationalen Standards durchgeführt werden, um sicher zu stellen, dass die besten KandidatINNen für das Ausbildungsprogramm gewonnen werden können. Während der Ausbildung werden die DoktorandINNen zusätzlich durch gezielte Maßnahmen unterstützt, um sowohl ihre fachlichen als auch sozialen Kompetenzen zu entwickeln und sie damit auf Führungsaufgaben im Bereich der Forschung und Entwicklung im Anschluss an die Promotion optimal vorzubereiten. Im Rahmen der wissenschaftlichen Ausbildung profitieren die DoktorandINNen klarerweise sowohl vom internationalen Ansehen der beteiligten Arbeitsgruppenleiter als auch von den fokussierten Forschungsprojekten. Dieses einzigartige Umfeld wird es den DoktorandINNen erlauben detailliertes Wissen in den Kerngebieten der Biokatalyse und Biotechnologie von der organischenSynthese,mechanistischen Enzymologie,Strukturbiologiebis hin zur Prozesstechnikzu erwerben. Daherwirdunserehrgeiziges und kompetitives Ausbildungsprogramm sowohl die weitere berufliche Laufbahn junger WissenschaftlerINNen maßgeblich prägen, als auch die Reputation der biotechnologischen Forschung in Österreich international stärken. 1
Die doc.funds-Initiative CATALOX brachte 10 junge Forscherinnen und Forscher zusammen, um gemeinsam die Mechanismen und Anwendungen sogenannter Oxidoreduktasen zu untersuchen. Diese Biokatalysatoren bilden die größte Klasse an Enzymen und spielen eine wichtige Rolle im Energiestoffwechsel. Das zugehörige Doktoratsprogramm ist Teil einer Zusammenarbeit zwischen der TU Graz und der Universität Graz im Rahmenprogramm "NaWI Graz". Im Rahmen der wissenschaftlichen Ausbildung profitierten die Doktorandinnen und Doktoranden vom internationalen Ansehen der beteiligten Arbeitsgruppenleiterinnen und -leiter sowie von den fokussierten Forschungsprojekten. Der interdisziplinäre Ansatz bot den Nachwuchsforscherinnen und Nachwuchsforschern die Möglichkeit, sich auf attraktive Karriereoptionen in Forschung und Entwicklung vorzubereiten. In den Dissertationsprojekten erwarben die Dissertanden detailliertes Wissen in den Kerngebieten der Biokatalyse und Biotechnologie - von der organischen Synthese, mechanistischen Enzymologie, Enzym Engineering, Strukturbiologie bis hin zur Prozesstechnik - zu erwerben. Die Ergebnisse der Forschung reichen von der Isolierung neuer Kälte-aktiver Oxidoreduktasen und mechanistischen Untersuchungen bis hin zur Etablierung neuer Katalysatoren für die Nutzung nachwachsender Rohstoffe.
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
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Konsortiumsmitglied (1.10.2019 - 29.2.2024)
- Technische Universität Graz
- Siegfried Waldvogel, Johannes Gutenberg-Universität Mainz - Deutschland
- Nicholas J. Turner, University of Manchester - Großbritannien
- Andrea Mattevi, Università degli studi di Pavia - Italien
- Paula Tamagnini, Universidade do Porto - Portugal
- Fahmi Himo, University of Stockholm - Schweden
Research Output
- 670 Zitationen
- 67 Publikationen
- 6 Disseminationen
- 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2024
Titel A multistep (semi)-continuous biocatalytic setup for the production of polycaprolactone DOI 10.1039/d3re00536d Typ Journal Article Autor Valotta A Journal Reaction Chemistry & Engineering Seiten 713-727 Link Publikation -
2024
Titel Deciphering the Unconventional Reduction of C?N Bonds by Old Yellow Enzymes Using QM/MM DOI 10.1021/acscatal.3c04362 Typ Journal Article Autor Sahrawat A Journal ACS Catalysis Seiten 1257-1266 Link Publikation -
2024
Titel Cyclic Deracemization of rac-Sulfoxides via Alternating Biocatalytic Reduction and Light-Dependent Oxidation Employing Eosin Y as Photocatalyst DOI 10.1002/cctc.202400073 Typ Journal Article Autor Bierbaumer S Journal ChemCatChem Link Publikation -
2024
Titel Loop 6 and the ß-hairpin flap are structural hotspots that determine cofactor specificity in the FMN-dependent family of ene-reductases DOI 10.1111/febs.17055 Typ Journal Article Autor Kerschbaumer B Journal The FEBS Journal Seiten 1560-1574 Link Publikation -
2024
Titel Analysis of homodimer formation in 12-oxophytodienoate reductase 3 in solutio and crystallo challenges the physiological role of the dimer DOI 10.1038/s41598-024-69160-6 Typ Journal Article Autor Kerschbaumer B Journal Scientific Reports Seiten 18093 Link Publikation -
2024
Titel Enzyme Machinery for Bacterial Glucoside Metabolism through a Conserved Non-hydrolytic Pathway DOI 10.1002/anie.202410681 Typ Journal Article Autor Kastner K Journal Angewandte Chemie International Edition Link Publikation -
2024
Titel Old Yellow Enzymes as Oxime Reductases: New Variants by Substrate-Based Enzyme Engineering DOI 10.1002/cctc.202400642 Typ Journal Article Autor Polidori N Journal ChemCatChem Link Publikation -
2024
Titel Coupling photocatalytic trifluoromethylation with biocatalytic stereoselective ketone reduction in continuous flow DOI 10.1007/s11696-024-03649-2 Typ Journal Article Autor Valotta A Journal Chemical Papers Seiten 7973-7986 Link Publikation -
2024
Titel Structural investigation of Trypanosoma cruzi Akt-like kinase as drug target against Chagas disease DOI 10.1038/s41598-024-59654-8 Typ Journal Article Autor Stadler K Journal Scientific Reports Seiten 10039 Link Publikation -
2024
Titel Asymmetric Synthesis of Chiral 2-Cyclohexenones with Quaternary Stereocenters via Ene-Reductase Catalyzed Desymmetrization of 2,5-Cyclohexadienones DOI 10.1021/acscatal.4c00276 Typ Journal Article Autor Friess M Journal ACS Catalysis Seiten 7256-7266 Link Publikation -
2024
Titel Investigation of the Substrate Acceptance of Decarboxylative Enzymes Typ PhD Thesis Autor Bauer, Kristin -
2024
Titel Biochemical and structural studies on selected flavoenzymes Typ PhD Thesis Autor Kerschbaumer, Bianca -
2024
Titel Multistep (bio)catalytic cascade reactions in continuous flow Typ PhD Thesis Autor Valotta, Alessia -
2024
Titel Investigation of Non-natural Ene-reductase Catalyzed Reactions Typ PhD Thesis Autor Friess, Michael -
2023
Titel Enzymatic ß-elimination in natural product O- and C-glycoside deglycosylation DOI 10.1038/s41467-023-42750-0 Typ Journal Article Autor Bitter J Journal Nature Communications Seiten 7123 Link Publikation -
2022
Titel Structural bioinformatics analysis of SARS-CoV-2 variants reveals higher hACE2 receptor binding affinity for Omicron B.1.1.529 spike RBD compared to wild type reference DOI 10.1038/s41598-022-18507-y Typ Journal Article Autor Durmaz V Journal Scientific Reports Seiten 14534 Link Publikation -
2022
Titel Synthesis of Enantiopure Sulfoxides by Concurrent Photocatalytic Oxidation and Biocatalytic Reduction DOI 10.1002/anie.202117103 Typ Journal Article Autor Bierbaumer S Journal Angewandte Chemie International Edition Link Publikation -
2022
Titel Regioselective Biocatalytic C4-Prenylation of Unprotected Tryptophan Derivatives DOI 10.1002/cbic.202200311 Typ Journal Article Autor Eggbauer B Journal ChemBioChem Link Publikation -
2022
Titel Transmembrane Shuttling of Photosynthetically Produced Electrons to Propel Extracellular Biocatalytic Redox Reactions in a Modular Fashion DOI 10.1002/ange.202207971 Typ Journal Article Autor Jurkaš V Journal Angewandte Chemie Link Publikation -
2022
Titel Transmembrane Shuttling of Photosynthetically Produced Electrons to Propel Extracellular Biocatalytic Redox Reactions in a Modular Fashion DOI 10.1002/anie.202207971 Typ Journal Article Autor Jurkaš V Journal Angewandte Chemie International Edition Link Publikation -
2022
Titel Photobiocatalysis in Continuous Flow DOI 10.3389/fctls.2021.816538 Typ Journal Article Autor Chanquia S Journal Frontiers in Catalysis Seiten 816538 Link Publikation -
2022
Titel Optimizing variant-specific therapeutic SARS-CoV-2 decoys using deep-learning-guided molecular dynamic simulations. DOI 10.21203/rs.3.rs-1971184/v1 Typ Preprint Autor Koechl K Link Publikation -
2022
Titel More enzymes more opportunities for oxyfunctionalization: Sixty novel unspecific peroxygenases for biocatalysis Typ Other Autor Pichler C. Konferenz Pichia 2022 -
2022
Titel More enzymes more opportunities for oxyfunctionalization: Sixty novel unspecific peroxygenases for biocatalysis Typ Other Autor Pichler C. Konferenz European Summit of Industrial Biotechnology 2022 (ESIB 2022) -
2022
Titel More enzymes more opportunities for oxyfunctionalization: Sixty novel unspecific peroxygenases for biocatalysis Typ Other Autor Novak K. Konferenz Summer School Biotransformations 2022 -
2022
Titel Flavofun: Exploration of fungal flavoproteomes DOI 10.3389/fctls.2022.1021691 Typ Journal Article Autor Kerschbaumer B Journal Frontiers in Catalysis Seiten 1021691 Link Publikation -
2022
Titel Structure of the Reductase Domain of a Fungal Carboxylic Acid Reductase and Its Substrate Scope in Thioester and Aldehyde Reduction DOI 10.1021/acscatal.2c04426 Typ Journal Article Autor Daniel B Journal ACS Catalysis Seiten 15668-15674 Link Publikation -
2022
Titel From linoleic acid to hexanal and hexanol by whole cell catalysis with a lipoxygenase, hydroperoxide lyase and reductase cascade in Komagataella phaffii DOI 10.3389/fmolb.2022.965315 Typ Journal Article Autor Hashem C Journal Frontiers in Molecular Biosciences Seiten 965315 Link Publikation -
2022
Titel Recent changes in the mutational dynamics of the SARS-CoV-2 main protease substantiate the danger of emerging resistance to antiviral drugs DOI 10.3389/fmed.2022.1061142 Typ Journal Article Autor Krassnigg A Journal Frontiers in Medicine -
2021
Titel The scope of flavin-dependent reactions and processes in the model plant Arabidopsis thaliana DOI 10.1016/j.phytochem.2021.112822 Typ Journal Article Autor Eggers R Journal Phytochemistry Seiten 112822 Link Publikation -
2021
Titel The role of biocatalysis in the asymmetric synthesis of alkaloids – an update DOI 10.1039/d1ra04181a Typ Journal Article Autor Cigan E Journal RSC Advances Seiten 28223-28270 Link Publikation -
2020
Titel Secretion of Pseudomonas aeruginosa Lipoxygenase by Pichia pastoris upon Glycerol Feed DOI 10.1002/biot.202000089 Typ Journal Article Autor Hashem C Journal Biotechnology Journal Link Publikation -
2020
Titel C?C-Ene-Reductases Reduce the C?N Bond of Oximes DOI 10.1021/acscatal.0c03755 Typ Journal Article Autor Velikogne S Journal ACS Catalysis Seiten 13377-13382 Link Publikation -
2020
Titel Pyrazines: Synthesis and Industrial Application of these Valuable Flavor and Fragrance Compounds DOI 10.1002/biot.202000064 Typ Journal Article Autor Mortzfeld F Journal Biotechnology Journal Seiten 2000064 Link Publikation -
2023
Titel Optimizing variant-specific therapeutic SARS-CoV-2 decoys using deep-learning-guided molecular dynamics simulations DOI 10.1038/s41598-023-27636-x Typ Journal Article Autor Köchl K Journal Scientific Reports Seiten 774 Link Publikation -
2023
Titel Reduction of Oximes by Old-Yellow-Enzymes: Structures of Substrate Complexes and Enzyme Engineering Typ PhD Thesis Autor Polidori, Nakia -
2023
Titel Biocatalyitc Reduction of Oximes Using Ene-Reductases: Substrate Scope, Cascades and Mechanism Typ PhD Thesis Autor Breukelaar, Willem B. -
2023
Titel Synthesis of Enantiopure Sulfoxides by Combination of Photo- and Biocatalysis Typ PhD Thesis Autor Bierbaumer, Sarah -
2023
Titel Simulating Biomolecular Interactions Across Scales - From Electrons to Macromolecules Typ PhD Thesis Autor Sahrawat, Amit Singh -
2023
Titel Transformations of Indole Derivatives to Build Multi-Enzymatic Sequences Combined with Classic Organic Synthesis towards Chanoclavine-I Typ PhD Thesis Autor Eggbauer, Bettina -
2023
Titel Enzymatic Conversion of CO2: From Natural to Artificial Utilization DOI 10.1021/acs.chemrev.2c00581 Typ Journal Article Autor Bierbaumer S Journal Chemical Reviews Seiten 5702-5754 Link Publikation -
2023
Titel Mechanistic Insights into the Ene-Reductase-Catalyzed Promiscuous Reduction of Oximes to Amines DOI 10.1021/acscatal.2c06137 Typ Journal Article Autor Breukelaar W Journal ACS Catalysis Seiten 2610-2618 Link Publikation -
2023
Titel A chromosome-level genome assembly for Erianthus fulvus provides insights into its biofuel potential and facilitates breeding for improvement of sugarcane DOI 10.1016/j.xplc.2023.100562 Typ Journal Article Autor Kui L Journal Plant Communications Seiten 100562 Link Publikation -
2021
Titel Chromoselective Photocatalysis Enables Stereocomplementary Biocatalytic Pathways** DOI 10.1002/ange.202100164 Typ Journal Article Autor Schmermund L Journal Angewandte Chemie Seiten 7041-7045 Link Publikation -
2021
Titel Chromoselective Photocatalysis Enables Stereocomplementary Biocatalytic Pathways** DOI 10.1002/anie.202100164 Typ Journal Article Autor Schmermund L Journal Angewandte Chemie International Edition Seiten 6965-6969 Link Publikation -
2021
Titel Serine 477 plays a crucial role in the interaction of the SARS-CoV-2 spike protein with the human receptor ACE2 DOI 10.1038/s41598-021-83761-5 Typ Journal Article Autor Singh A Journal Scientific Reports Seiten 4320 Link Publikation -
2021
Titel Switching Between Enantiomers by Combining Chromoselective Photocatalysis and Biocatalysis DOI 10.26434/chemrxiv.13521527.v1 Typ Preprint Autor Schmermund L Link Publikation -
2021
Titel Switching Between Enantiomers by Combining Chromoselective Photocatalysis and Biocatalysis DOI 10.26434/chemrxiv.13521527 Typ Preprint Autor Schmermund L Link Publikation -
2021
Titel 3D printed ceramics as solid supports for enzyme immobilization: an automated DoE approach for applications in continuous flow DOI 10.1007/s41981-021-00163-4 Typ Journal Article Autor Valotta A Journal Journal of Flow Chemistry Seiten 675-689 Link Publikation -
2019
Titel Valorization of Fatty Acids by Pichia pastoris: A Fresh Approach for Green Leaf Volatile Synthesis Typ Other Autor Hashem C. Konferenz International Congress of the Malaysian Society for Microbiology 2019 (ICMSM2019) -
2019
Titel Goodbye methanol induction: Secretion of Pseudomonas aeruginosa lipoxygenase by Pichia pastoris upon glycerol feed Typ Other Autor Hashem C. Konferenz European Summit of Industrial Biotechnology -
2021
Titel Characterization and immobilization of Pycnoporus cinnabarinus carboxylic acid reductase, PcCAR2 DOI 10.1016/j.jbiotec.2021.12.010 Typ Journal Article Autor Maphatsoe M Journal Journal of Biotechnology Seiten 47-54 Link Publikation -
2021
Titel Characterization and Immobilization of Pycnoporous cinnabarinus Carboxylic Acid Reductase - A Prospective Reusable Biocatalyst Typ Other Autor Hashem C. Konferenz Biotrans 2021 -
2021
Titel Approaching an Efficient System for Green Leaf Volatile Synthesis. Typ Other Autor Hashem C. Konferenz Next Generation Biocatalysis - An International Young Investigator Virtual Symposium -
2021
Titel Reduction Domain of Carboxylic Acid Reductase - A New Insight into Fungal CARs Typ Other Autor Daniel B. Konferenz 23rd DocDays -
2020
Titel Inverted Binding of Non-natural Substrates in Strictosidine Synthase Leads to a Switch of Stereochemical Outcome in Enzyme-Catalyzed Pictet–Spengler Reactions DOI 10.1021/jacs.9b08704 Typ Journal Article Autor Eger E Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 792-800 Link Publikation -
2023
Titel A community effort in SARS-CoV-2 drug discovery DOI 10.1002/minf.202300262 Typ Journal Article Autor Schimunek J Journal Molecular Informatics -
2023
Titel More enzymes more opportunities for oxyfunctionalization: Sixty novel unspecific peroxygenases for biocatalysis Typ Other Autor Pichler C. Konferenz 3rd NextGenBiocat 2023 -
2023
Titel A Magic Piece of Short Unspecific Peroxygenases? - A Surface Alpha Helix as Key Part for Catalytic Specificity Typ Other Autor Holzschuster V. Konferenz Biotrans 2023: 16th International Symposium on Biocatalysis & Biotransformations -
2023
Titel Laboratory evolution of a fungal unspecific peroxygenase to elucidate the structural and functional relationship Typ Other Autor Holzschuster V. Konferenz Enzyme Engineering XXVII -
2023
Titel Laboratory evolution of fungal heme-thiolate enzymes employing Komagataella phaffii as a host system Typ Other Autor Holzschuster V. Konferenz 11th Conference on Recombinant Protein Production: RPP 2023 -
2020
Titel Towards the Quantification of Phosphopantetheinylation - Scouting for Activated Carboxylic Acid Reductase Typ Other Autor Hashem C. Konferenz ÖGMBT Life Science -
2020
Titel Engineering of NADPH Supply Boosts Photosynthesis-Driven Biotransformations DOI 10.1021/acscatal.0c02601 Typ Journal Article Autor Assil-Companioni L Journal ACS Catalysis Seiten 11864-11877 Link Publikation -
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Titel Novel unspecific peroxygenases for hydroxylation of heterocyclic molecules Typ PhD Thesis Autor Pichler, Carsten -
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Titel Oxidation-reduction driven multi-step transformation in sugar metabolism and synthesis: mechanism and application Typ PhD Thesis Autor Bitter, Johannes -
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Titel Novel biocatalysts for the hydroxylation of heterocyclic compounds Typ PhD Thesis Autor Peces Perez, Rosa Maria -
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Titel Systematic investigation towards exhaustive post-translational modification of carboxylate reductases Typ PhD Thesis Autor Hashem, Chiam
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2020
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Titel Announcement of scientific results on TU Graz website Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2020
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Titel Article in national news on cyanobacteria as environmentally-friendly catalysts Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link -
2020
Titel Educational video "Cupriavidus example" Typ A talk or presentation -
2020
Link
Titel Engineering of NADPH Supply Boosts Photosynthesis-Driven Biotransformations Typ Engagement focused website, blog or social media channel Link Link -
2020
Link
Titel NADPH-availability is a limiting factor for photobiocatalytic biotransformations Typ A talk or presentation Link Link -
2021
Link
Titel Photosynthesis-driven biocatalytic redox reactions Typ A talk or presentation Link Link
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2022
Titel NextGenBiocat 2022/Delft Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2021
Titel Vincent Massey Award Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International