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Analyse von Schleimhautläsionen von HD digitaler Chromokoloskopie mit Wavelets

Mucosal Lesion Analysis of HD digital Chromocolonoscopy using Wavelets

Andreas Uhl (ORCID: 0000-0002-5921-8755)
  • Grant-DOI 10.55776/TRP206
  • Förderprogramm Translational-Research-Programm
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.06.2011
  • Projektende 31.10.2014
  • Bewilligungssumme 344.030 €

Wissenschaftsdisziplinen

Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (50%); Informatik (40%); Klinische Medizin (10%)

Keywords

    High Definition Colonoscopy, Digital Chromoendoscopy, Computed Virtual Chromoendoscopy, Pit Pattern/Vascular Pattern/Texture Classificatio, Decision Support System, Wavelets

Abstract Endbericht

Dickdarmkrebs ist der dritthäufigste Krebs bei Männern und der vierthäufigste Krebs bei Frauen in den westlichen Industrienationen. Daher wurden Screeningprogramme ins Leben gerufen, um Läsionen mit malignem Potential so früh wie möglich zu erkennen. Mithilfe eines Kolonoskops können Untersuchungen durchgeführt werden, es können Gewebeproben entnommen werden und bestimmte Typen von Polypen können direkt entfernt werden. Moderne Geräte ermöglichen die Aufnahme von Bildern und Videosequenzen, die durch Computereinsatz analysiert werden können. Dies ermöglicht computerunterstützte Erkennung und Klassifikation von Läsionen. In den letzten Jahren wurde high definition (HD und HD+) Endoskopie am Markt eingeführt und wird schnell zum de-facto Standard zumindest in grösseren Zentren. Die wichtigsten Hersteller bieten ensprechende Produkte an, z.B. Olympus EVIS EXARA II oder Pentax HiLINE HD+. Diese Technologie setzt sich auc schnell im Bereich der Kolonoskopie durch. Die Kombination digitaler Chromoendoskopie und HD-Endoskopie führt zu charakteristischen Schleimhaut Oberflächenmustern die durch einen trainierten Untersucher gut interpretiert werden können. Die Genauigkeit dieser Interpretation liegt im Bereich 90% - 95% und auch Unterschiede zwischen einzelnen Untersuchern wurden dokumentiert. Dies führt dazu, dass diese Ergebnisse für klinischen Einsatz in Screening Programmen verbessert werden müssen. Der Projektantrag zielt ab auf die Entwicklung von Verfahren für eine computerunterstützte klinische Beurteilung der visuellen Daten, die durch digital virtual chromoendoscopy (Pentax i-Scan) HD-Endoskope gewonnen werden. Dafür sollen verschiedene Wavelet-basierte Verfahren realisiert und verglichen werden. Neben der Erstellung einer HD-Texturdatenbank mit verfügbarer Histologie Grundwahrheit, soll eine Sammlung von Vorverarbeitungskomponenten, Wavelet-basierten Merkmalsextraktionsverfahren und Klassifikationsalgorithmen enstehen, die zu einem Prototypen eines decision support Systems kombiniert werden können. Dieser Prototyp soll in einer abschliessenden klinischen Studie validiert werden.

Dickdarmkrebs ist der dritthäufigste Krebs bei Männern und der vierthäufigste Krebs bei Frauen in den westlichen Industrienationen. Daher wurden Screeningprogramme ins Leben gerufen, um Läsionen mit malignem Potential so früh wie möglich zu erkennen. Mithilfe eines Kolonoskops können Untersuchungen durchgeführt werden, es können Gewebeproben entnommen werden und bestimmte Typen von Polypen können direkt entfernt werden. Moderne Geräte ermöglichen die Aufnahme von Bildern und Videosequenzen, die durch Computereinsatz analysiert werden können. Dies ermöglicht computerunterstützte Erkennung und Klassifikation von Läsionen.In den letzten Jahren wurde high definition (HD und HD+) Endoskopie am Markt eingeführt und wird schnell zum de-facto Standard zumindest in größeren Zentren. Die wichtigsten Hersteller bieten entsprechende Produkte an, z.B. Olympus EVIS EXARA II oder Pentax HiLINE HD+. Diese Technologie setzt sich auch schnell im Bereich der Kolonoskopie durch. Die Kombination digitaler Chromoendoskopie und HD-Endoskopie führt zu charakteristischen Schleimhaut Oberflächenmustern die durch einen trainierten Untersucher gut interpretiert werden können. Die Genauigkeit dieser Interpretation liegt im Bereich 90% - 95% und auch Unterschiede zwischen einzelnen Untersuchern wurden dokumentiert. Dies führt dazu, dass diese Ergebnisse für klinischen Einsatz in Screening Programmen verbessert werden müssen. Das Projekt zielte ab auf die Entwicklung von Verfahren für eine computerunterstützte klinische Beurteilung der visuellen Daten, die durch digital virtual chromoendoscopy (Pentax i-Scan) HD-Endoskope gewonnen werden. Dafür wurden verschiedene Merkmalsextraktionsverfahren entwickelt und bewertet, darunter auch Wavelet-basierte. Neben der Erstellung einer HD-Texturdatenbank mit verfügbarer Histologie Grundwahrheit, ist eine Sammlung von Vorverarbeitungskomponenten, Merkmalsextraktionsverfahren und Klassifikationsalgorithmen entstanden, die zu einem Prototypen eines Diagnose decision support Systems kombiniert wurden.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Salzburg - 85%
  • Krankenhaus St. Elisabeth - 15%
Nationale Projektbeteiligte
  • Michael Häfner, Krankenhaus St. Elisabeth , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 368 Zitationen
  • 20 Publikationen
Publikationen
  • 2012
    Titel Evaluation of Cross-validation Protocols for the Classification of Endoscopic Images of Colonic Polyps
    DOI 10.1109/cbms.2012.6266355
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Häfner M
    Seiten 1-6
  • 2012
    Titel Delaunay triangulation-based pit density estimation for the classification of polyps in high-magnification chromo-colonoscopy
    DOI 10.1016/j.cmpb.2011.12.012
    Typ Journal Article
    Autor Häfner M
    Journal Computer Methods and Programs in Biomedicine
    Seiten 565-581
    Link Publikation
  • 2015
    Titel A scale- and orientation-adaptive extension of Local Binary Patterns for texture classification
    DOI 10.1016/j.patcog.2015.02.024
    Typ Journal Article
    Autor Hegenbart S
    Journal Pattern Recognition
    Seiten 2633-2644
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Colonic Polyp Classification in High-Definition Video Using Complex Wavelet-Packets
    DOI 10.1007/978-3-662-46224-9_63
    Typ Book Chapter
    Autor Häfner M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 365-370
  • 2011
    Titel Computer-Aided Decision Support Systems for Endoscopy in the Gastrointestinal Tract: A Review
    DOI 10.1109/rbme.2011.2175445
    Typ Journal Article
    Autor Liedlgruber M
    Journal IEEE Reviews in Biomedical Engineering
    Seiten 73-88
  • 2019
    Titel Quest for the best endoscopic imaging modality for computer-assisted colonic polyp staging
    DOI 10.3748/wjg.v25.i10.1197
    Typ Journal Article
    Autor Wimmer G
    Journal World Journal of Gastroenterology
    Seiten 1197-1209
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Scale invariant texture descriptors for classifying celiac disease
    DOI 10.1016/j.media.2013.02.001
    Typ Journal Article
    Autor Hegenbart S
    Journal Medical Image Analysis
    Seiten 458-474
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Super-Resolution Techniques Evaluated in the Context of HD Endoscopic Imaging.
    Typ Journal Article
    Autor Häfner M
    Journal Department of Computer Sciences, University of Salzburg, Austria, Technical Report 2013-04, 2013
  • 2014
    Titel Bridging the Resolution Gap Between Endoscope Types for a Colonic Polyp Classification
    DOI 10.1109/icpr.2014.472
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Häfner M
    Seiten 2739-2744
  • 2014
    Titel Degradation Adaptive Texture Classification
    DOI 10.1109/icip.2014.7025558
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Gadermayr M
    Seiten 2759-2763
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Scale-Adaptive Texture Classification
    DOI 10.1109/icpr.2014.457
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Gadermayr M
    Seiten 2643-2648
    Link Publikation
  • 2014
    Titel A Scale-Adaptive Extension to Methods Based on LBP Using Scale-Normalized Laplacian of Gaussian Extrema in Scale-Space
    DOI 10.1109/icassp.2014.6854417
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Hegenbart S
    Seiten 4319-4323
  • 2014
    Titel Shape and Size Adapted Local Fractal Dimension for the Classification of Polyps in HD Colonoscopy
    DOI 10.1109/icip.2014.7025466
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Uhl A
    Seiten 2299-2303
  • 2014
    Titel A Novel Shape Feature Descriptor for the Classification of Polyps in HD Colonoscopy
    DOI 10.1007/978-3-319-05530-5_20
    Typ Book Chapter
    Autor Häfner M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 205-213
  • 2014
    Titel Evaluation Of Super-Resolution Methods In The Context Of Colonic Polyp Classification
    DOI 10.1109/cbmi.2014.6849830
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Häfner M
    Seiten 1-6
  • 2013
    Titel Customised Frequency Pre-filtering in a Local Binary Pattern-Based Classification of Gastrointestinal Images
    DOI 10.1007/978-3-642-36678-9_10
    Typ Book Chapter
    Autor Hegenbart S
    Verlag Springer Nature
    Seiten 99-109
  • 2013
    Titel POCS-based Super-Resolution for HD Endoscopy Video Frames
    DOI 10.1109/cbms.2013.6627786
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Häfner M
    Seiten 185-190
  • 2014
    Titel Evaluation of Super-Resolution Methods in the Context of Colonic Polyp Classification.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Häfner M
  • 2014
    Titel A systematic evaluation of the scale invariance of texture recognition methods
    DOI 10.1007/s10044-014-0435-1
    Typ Journal Article
    Autor Uhl A
    Journal Pattern Analysis and Applications
    Seiten 945-969
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Comparison of Super-Resolution Methods for HD-Video Endoscopy
    DOI 10.1007/978-3-642-54111-7_19
    Typ Book Chapter
    Autor Häfner M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 78-83

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