Analyse von Schleimhautläsionen von HD digitaler Chromokoloskopie mit Wavelets
Mucosal Lesion Analysis of HD digital Chromocolonoscopy using Wavelets
Wissenschaftsdisziplinen
Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (50%); Informatik (40%); Klinische Medizin (10%)
Keywords
-
High Definition Colonoscopy,
Digital Chromoendoscopy,
Computed Virtual Chromoendoscopy,
Pit Pattern/Vascular Pattern/Texture Classificatio,
Decision Support System,
Wavelets
Dickdarmkrebs ist der dritthäufigste Krebs bei Männern und der vierthäufigste Krebs bei Frauen in den westlichen Industrienationen. Daher wurden Screeningprogramme ins Leben gerufen, um Läsionen mit malignem Potential so früh wie möglich zu erkennen. Mithilfe eines Kolonoskops können Untersuchungen durchgeführt werden, es können Gewebeproben entnommen werden und bestimmte Typen von Polypen können direkt entfernt werden. Moderne Geräte ermöglichen die Aufnahme von Bildern und Videosequenzen, die durch Computereinsatz analysiert werden können. Dies ermöglicht computerunterstützte Erkennung und Klassifikation von Läsionen. In den letzten Jahren wurde high definition (HD und HD+) Endoskopie am Markt eingeführt und wird schnell zum de-facto Standard zumindest in grösseren Zentren. Die wichtigsten Hersteller bieten ensprechende Produkte an, z.B. Olympus EVIS EXARA II oder Pentax HiLINE HD+. Diese Technologie setzt sich auc schnell im Bereich der Kolonoskopie durch. Die Kombination digitaler Chromoendoskopie und HD-Endoskopie führt zu charakteristischen Schleimhaut Oberflächenmustern die durch einen trainierten Untersucher gut interpretiert werden können. Die Genauigkeit dieser Interpretation liegt im Bereich 90% - 95% und auch Unterschiede zwischen einzelnen Untersuchern wurden dokumentiert. Dies führt dazu, dass diese Ergebnisse für klinischen Einsatz in Screening Programmen verbessert werden müssen. Der Projektantrag zielt ab auf die Entwicklung von Verfahren für eine computerunterstützte klinische Beurteilung der visuellen Daten, die durch digital virtual chromoendoscopy (Pentax i-Scan) HD-Endoskope gewonnen werden. Dafür sollen verschiedene Wavelet-basierte Verfahren realisiert und verglichen werden. Neben der Erstellung einer HD-Texturdatenbank mit verfügbarer Histologie Grundwahrheit, soll eine Sammlung von Vorverarbeitungskomponenten, Wavelet-basierten Merkmalsextraktionsverfahren und Klassifikationsalgorithmen enstehen, die zu einem Prototypen eines decision support Systems kombiniert werden können. Dieser Prototyp soll in einer abschliessenden klinischen Studie validiert werden.
Dickdarmkrebs ist der dritthäufigste Krebs bei Männern und der vierthäufigste Krebs bei Frauen in den westlichen Industrienationen. Daher wurden Screeningprogramme ins Leben gerufen, um Läsionen mit malignem Potential so früh wie möglich zu erkennen. Mithilfe eines Kolonoskops können Untersuchungen durchgeführt werden, es können Gewebeproben entnommen werden und bestimmte Typen von Polypen können direkt entfernt werden. Moderne Geräte ermöglichen die Aufnahme von Bildern und Videosequenzen, die durch Computereinsatz analysiert werden können. Dies ermöglicht computerunterstützte Erkennung und Klassifikation von Läsionen.In den letzten Jahren wurde high definition (HD und HD+) Endoskopie am Markt eingeführt und wird schnell zum de-facto Standard zumindest in größeren Zentren. Die wichtigsten Hersteller bieten entsprechende Produkte an, z.B. Olympus EVIS EXARA II oder Pentax HiLINE HD+. Diese Technologie setzt sich auch schnell im Bereich der Kolonoskopie durch. Die Kombination digitaler Chromoendoskopie und HD-Endoskopie führt zu charakteristischen Schleimhaut Oberflächenmustern die durch einen trainierten Untersucher gut interpretiert werden können. Die Genauigkeit dieser Interpretation liegt im Bereich 90% - 95% und auch Unterschiede zwischen einzelnen Untersuchern wurden dokumentiert. Dies führt dazu, dass diese Ergebnisse für klinischen Einsatz in Screening Programmen verbessert werden müssen. Das Projekt zielte ab auf die Entwicklung von Verfahren für eine computerunterstützte klinische Beurteilung der visuellen Daten, die durch digital virtual chromoendoscopy (Pentax i-Scan) HD-Endoskope gewonnen werden. Dafür wurden verschiedene Merkmalsextraktionsverfahren entwickelt und bewertet, darunter auch Wavelet-basierte. Neben der Erstellung einer HD-Texturdatenbank mit verfügbarer Histologie Grundwahrheit, ist eine Sammlung von Vorverarbeitungskomponenten, Merkmalsextraktionsverfahren und Klassifikationsalgorithmen entstanden, die zu einem Prototypen eines Diagnose decision support Systems kombiniert wurden.
- Universität Salzburg - 85%
- Krankenhaus St. Elisabeth - 15%
- Michael Häfner, Krankenhaus St. Elisabeth , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 368 Zitationen
- 20 Publikationen
-
2012
Titel Evaluation of Cross-validation Protocols for the Classification of Endoscopic Images of Colonic Polyps DOI 10.1109/cbms.2012.6266355 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Häfner M Seiten 1-6 -
2012
Titel Delaunay triangulation-based pit density estimation for the classification of polyps in high-magnification chromo-colonoscopy DOI 10.1016/j.cmpb.2011.12.012 Typ Journal Article Autor Häfner M Journal Computer Methods and Programs in Biomedicine Seiten 565-581 Link Publikation -
2015
Titel A scale- and orientation-adaptive extension of Local Binary Patterns for texture classification DOI 10.1016/j.patcog.2015.02.024 Typ Journal Article Autor Hegenbart S Journal Pattern Recognition Seiten 2633-2644 Link Publikation -
2015
Titel Colonic Polyp Classification in High-Definition Video Using Complex Wavelet-Packets DOI 10.1007/978-3-662-46224-9_63 Typ Book Chapter Autor Häfner M Verlag Springer Nature Seiten 365-370 -
2011
Titel Computer-Aided Decision Support Systems for Endoscopy in the Gastrointestinal Tract: A Review DOI 10.1109/rbme.2011.2175445 Typ Journal Article Autor Liedlgruber M Journal IEEE Reviews in Biomedical Engineering Seiten 73-88 -
2019
Titel Quest for the best endoscopic imaging modality for computer-assisted colonic polyp staging DOI 10.3748/wjg.v25.i10.1197 Typ Journal Article Autor Wimmer G Journal World Journal of Gastroenterology Seiten 1197-1209 Link Publikation -
2013
Titel Scale invariant texture descriptors for classifying celiac disease DOI 10.1016/j.media.2013.02.001 Typ Journal Article Autor Hegenbart S Journal Medical Image Analysis Seiten 458-474 Link Publikation -
2013
Titel Super-Resolution Techniques Evaluated in the Context of HD Endoscopic Imaging. Typ Journal Article Autor Häfner M Journal Department of Computer Sciences, University of Salzburg, Austria, Technical Report 2013-04, 2013 -
2014
Titel Bridging the Resolution Gap Between Endoscope Types for a Colonic Polyp Classification DOI 10.1109/icpr.2014.472 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Häfner M Seiten 2739-2744 -
2014
Titel Degradation Adaptive Texture Classification DOI 10.1109/icip.2014.7025558 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Gadermayr M Seiten 2759-2763 Link Publikation -
2014
Titel Scale-Adaptive Texture Classification DOI 10.1109/icpr.2014.457 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Gadermayr M Seiten 2643-2648 Link Publikation -
2014
Titel A Scale-Adaptive Extension to Methods Based on LBP Using Scale-Normalized Laplacian of Gaussian Extrema in Scale-Space DOI 10.1109/icassp.2014.6854417 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Hegenbart S Seiten 4319-4323 -
2014
Titel Shape and Size Adapted Local Fractal Dimension for the Classification of Polyps in HD Colonoscopy DOI 10.1109/icip.2014.7025466 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Uhl A Seiten 2299-2303 -
2014
Titel A Novel Shape Feature Descriptor for the Classification of Polyps in HD Colonoscopy DOI 10.1007/978-3-319-05530-5_20 Typ Book Chapter Autor Häfner M Verlag Springer Nature Seiten 205-213 -
2014
Titel Evaluation Of Super-Resolution Methods In The Context Of Colonic Polyp Classification DOI 10.1109/cbmi.2014.6849830 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Häfner M Seiten 1-6 -
2013
Titel Customised Frequency Pre-filtering in a Local Binary Pattern-Based Classification of Gastrointestinal Images DOI 10.1007/978-3-642-36678-9_10 Typ Book Chapter Autor Hegenbart S Verlag Springer Nature Seiten 99-109 -
2013
Titel POCS-based Super-Resolution for HD Endoscopy Video Frames DOI 10.1109/cbms.2013.6627786 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Häfner M Seiten 185-190 -
2014
Titel Evaluation of Super-Resolution Methods in the Context of Colonic Polyp Classification. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Häfner M -
2014
Titel A systematic evaluation of the scale invariance of texture recognition methods DOI 10.1007/s10044-014-0435-1 Typ Journal Article Autor Uhl A Journal Pattern Analysis and Applications Seiten 945-969 Link Publikation -
2014
Titel Comparison of Super-Resolution Methods for HD-Video Endoscopy DOI 10.1007/978-3-642-54111-7_19 Typ Book Chapter Autor Häfner M Verlag Springer Nature Seiten 78-83