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Aldo-Keto Reduktasen als Biokatalysatoren

Harnessing aldo-keto reductases for biocatalysis

Regina Kratzer (ORCID: 0000-0002-9318-1247)
  • Grant-DOI 10.55776/T350
  • Förderprogramm Hertha Firnberg
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2008
  • Projektende 31.12.2010
  • Bewilligungssumme 182.370 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (65%); Industrielle Biotechnologie (35%)

Keywords

    Aldo-Keto Reductase, Enantioselective Ketone Reduction, Candida tenuis xylose reductase, Whole Cell Bioreduction, Substrate Specificity, Saccharomyces cerevisiae

Abstract

Aldo-Keto Reduktasen (AKRs) bilden eine Superfamilie von hauptsächlich NAD(P)-abhängigen Oxidoreduktasen. Eine charakteristische Eigenschaft vieler AKRs ist ihr außerordentlich breites Substratspektrum, welches in in-vitro Aktivitätsstudien gefunden wird. Diese breite Substratakzeptanz ist im Hinblick auf die Produktion chiraler Alkohole ein großer Vorteil und bietet einen guten Anknüpfungspunkt für die Verwendung von AKRs in der Biokatalyse. Aber welche AKR ist für eine bestimmte Biotransfomation gegeignet? Antworten auf diese Frage könnten von einem guten Verständnis der molekularen Basis von Substratspezifitäten in den AKRs kommen und sind relevant hinsichtlich Grundlagenforschung sowie industrieller Anwendbarkeit der AKRs. In diesem Projekt schlagen wir eine Studie der Keton-Substratspezifität sowie der stereochemischen Selektivität der Ketonreduktion der Enzyme Xylose Reduktase aus Candida tenuis (CtXR) und Glycerol Dehydrogenase aus Saccharomyces cerevisiae (Gcy1) vor. Als Basis unserer Untersuchungen werden die bestehenden Kristallstrukturen dieser Enzyme dienen. Ein Ziel des eingereichten Projekts ist die Erweiterung des Spektrums stereoselektiv umgesetzter Ketone von CtXR durch Protein Engineering, auf Basis der Zusammenhänge von Struktur und Substratspezifitäten ausgewählter AKRs. Während CtXR keine C-C Doppelbindungs-Reduktaseaktivität besitzt, akzeptieren einige wenige AKRs sowie kurzkettige Dehydrogenasen/Reduktasen (SDRs), Enoate als Substrat. Anhand des Beispiels dieser verwandten Enzyme wollen wir das aktive Zentrum von CtXR remodellieren um C-C Doppelbindungs-Reduktaseaktivität zu implementieren. Für diese spezielle Aktivität in der AKR Familie 1D ist eine His?Glu Punktmutation in der katalytischen Tetrade der AKRs verantwortlich. In einer His113Glu CtXR Mutante haben wir das aktive Zentrum der AKR 1D Enzyme nachgeahmt. Ebenso haben wir eine SDR-Typ katalytische Triade in CtXR durch eine Tyr51Phe Mutation realisiert. Ziel unserer Arbeit ist die Untersuchung der beiden Mutanten auf C-C Doppelbindungs-Reduktaseaktivität. Aldo-Keto Reduktasen und andere Reduktasen, können in ganzen Zellen oder als isolierte Biokatalysatoren für die Reduktion von Ketonen verwendet werden. In beiden Fällen muß das Coenzym (NADH oder NAD(P)H) in substöchiometrischen Mengen vorliegen, und muß während der Reaktion rezykliert werden. Bäckerhefe- katalysierte Reduktionen haben den Vorteil, daß der Bedarf von NAD(P)H durch den Metabolismus eines Co- substrates gedeckt wird. Leider sind Ganzzellreduktionen oft durch niedrige Stereoselektivitäten gekennzeichnet, welche auf das Vorhandensein von multiplen NADPH-abhängigen Reduktasen mit divergenten enantio- und diastereomeren Bevorzugungen zurückzuführen sind. Um diese Einschränkungen zu überwinden stellen wir eine integrierte Prozessentwicklung mit den Komponenten (i) Struktur-basiertes Enzymengineering, (ii) Zellengineering und (iii) Prozessengineering vor.

Forschungsstätte(n)
  • Technische Universität Graz - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Bernd Nidetzky, Technische Universität Graz , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 76 Zitationen
  • 3 Publikationen
Publikationen
  • 2008
    Titel Integration of enzyme, strain and reaction engineering to overcome limitations of baker's yeast in the asymmetric reduction of a-keto esters
    DOI 10.1002/bit.21980
    Typ Journal Article
    Autor Kratzer R
    Journal Biotechnology and Bioengineering
    Seiten 1094-1101
  • 2008
    Titel Studying non-covalent enzyme carbohydrate interactions by STD NMR
    DOI 10.1016/j.carres.2007.12.023
    Typ Journal Article
    Autor Brecker L
    Journal Carbohydrate Research
    Seiten 2153-2161
  • 2008
    Titel Whole-cell bioreduction of aromatic a-keto esters using Candida tenuis xylose reductase and Candida boidinii formate dehydrogenase co-expressed in Escherichia coli
    DOI 10.1186/1475-2859-7-37
    Typ Journal Article
    Autor Kratzer R
    Journal Microbial Cell Factories
    Seiten 37
    Link Publikation

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