Nukleäre Funktionen von CagA

Infektionen mit Helicobacter pylori (H. pylori) sind eng mit der Entstehung und dem Fortschreiten von entzündungsbedingtem Magenkrebs und MALT-Lymphomen in Verbindung assoziiert. Das Risiko, diese Erkrankungen zu entwickeln, ist deutlich erhöht, wenn H. pylori den Virulenzfaktor Cytotoxin- assoziiertes Gen A (CagA) exprimiert. CagA ist ein bakterielles Onkoprotein, das in infizierte Wirtszellen injiziert wird und dort als bedeutsames Signalmolekül der Karzinogenese fungiert. Im Gegensatz zu Epithelzellen wird CagA in Immunzellen in ein N-terminales und ein C-terminales CagA-Fragment gespalten. Die funktionellen Konsequenzen der CagA-Fragmentierung in Immunzellen sind jedoch völlig unbekannt. In diesem Projekt untersuchen wir einen neuartigen und komplexen Mechanismus, wie diese CagA-Fragmente die Funktionen von Makrophagen regulieren. Im Rahmen des Projekts wird eine effiziente Kombination innovativer -omics-Technologien und klassischer molekular- und zellbiologischer Assays eingesetzt, um die CagA Fragmente in vitro und in vivo zu untersuchen. Die durch CagA Spaltung induzierte Transkriptionssignatur wird in RNA-Seq- und ATAC-Seq- Experimenten identifiziert. Der molekulare Mechanismus wird durch ChIP-Seq, EMSA, Luciferase- Reporter-Assays und Co-Immunopräzipitations-Assays mit anschließender Massenspektrometrie untersucht. ELISA, Durchflusszytometrie und Multiplex-Technologien werden durchgeführt, um die Auswirkungen auf die Makrophagen-Polarisierung, Phagozytose und Antigenpräsentation zu analysieren. In vivo Experimente an der Mongolischen Wüstenrennmaus werden Aufschluss über die Kolonisierung und die Pathogenität von H. pylori geben. Die Daten aus diesem Projekt werden zu einem neuen Verständnis der komplexen Pathogenese von H. pylori beitragen und könnten völlig neue Ansätze für die Behandlung von H. pylori-vermittelten chronischen