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Proteasomale Abbaumechanismen von APOBEC3-Deaminasen

Proteasomal degradation mechanisms of APOBEC3 deaminases

Gijsbert Adriaan Versteeg (ORCID: 0000-0002-6150-2165)
  • Grant-DOI 10.55776/P36945
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.10.2023
  • Projektende 30.09.2026
  • Bewilligungssumme 404.951 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)

Keywords

    Deaminase, Proteasome, Ubiquitin, Apobec3, Protein Degradation

Abstract

APOBEC3-Proteine werden in den meisten menschlichen Zellen produziert und haben die Fähigkeit genetisches Material, wie z.B. DNA, zu verändern. Eine der wichtigsten Aufgaben der APOBEC-Enzyme besteht darin, den Wirt vor viralen Infektionen zu schützen, insbesondere vor Retroviren wie HIV-1. Retroviren verwenden Reverse Transkription um ihr RNA-Genom in DNA zu kopieren und in das Genom der Wirtszelle zu integrieren. APOBEC- Enzyme können diesen Prozess stören, indem sie Bausteine in der viralen DNA verändern. Dies führt zu Mutationen, die die virale Vermehrung behindern kann. Dieser Mechanismus ist eine Form der angeborenen Immunität, die die erste Verteidigungslinie gegen Krankheitserreger darstellt. Allerdings sind APOBEC-Enzyme nicht nur antiviral wirksam, sondern können auch die DNA im menschlichen Wirt verändern. Dadurch können Mutationen entstehen, die die Funktion oder Regulation von Genen verändern und zu Krankheiten wie Krebs führen können. APOBEC-Enzyme wurden mit verschiedenen Krebsarten in Verbindung gebracht, wie Brustkrebs, Lungenkrebs, Blasenkrebs, Gebärmutterhalskrebs und Kopf-Hals-Krebs. Die Mechanismen, durch die APOBEC-Enzyme in normalen und Krebszellen reguliert werden, sind immer noch unklar und werden derzeit noch erforscht. Unsere Arbeit hat gezeigt, dass APOBEC3-Proteine schnell abgebaut werden, sobald sie in das zelluläre Kompartiment gelangen, das unsere DNA enthält. Aufgrund dieser Erkenntnis nehmen wir an, dass es derzeit unbekannte Faktoren gibt, die unsere DNA schützen indem sie die Menge an APOBEC-Proteinen in der Nähe der DNA begrenzen. In diesem Projekt möchten wir mithilfe von High-Throughput-Screening-Methoden diese Schutz-Faktoren identifizieren, die eines der stark krebsassoziierten APOBEC-Proteine abbauen. Letztendlich werden wir versuchen herauszufinden, wie APOBEC-Proteine in Zellen erkannt und für den Abbau markiert werden. Wir werden außerdem überprüfen, ob die menschliche DNA tatsächlich nicht mehr vor Hypermutationen geschützt ist, wenn die identifizierten Schutz-Faktoren experimentell aus den Zellen entfernt werden. Die Ergebnisse dieses Projekts sollen unser Verständnis dafür erhöhen, wie APOBEC- Enzyme in unseren Zellen kontrolliert werden, was entscheidend für die Entwicklung neuartiger Strategien zur Vorbeugung und Behandlung viraler und neoplastischer Krankheiten in der Zukunft ist.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • David Haselbach, Institut für Molekulare Pathologie - IMP , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Tim Clausen, Institut für Molekulare Pathologie - IMP , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Joerg Menche, Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Petra Beli, Institute of Molecular Biology Mainz - Deutschland

Research Output

  • 8 Zitationen
  • 5 Publikationen
Publikationen
  • 2024
    Titel TRIM52 is a primate-specific player in the DNA repair process under tight proteolytic control by a triad of giant E3 ligases
    DOI 10.1101/2024.05.16.594269
    Typ Preprint
    Autor Shulkina A
    Seiten 2024.05.16.594269
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Guardian ubiquitin E3 ligases target cancer-associated APOBEC3 deaminases for degradation to promote human genome integrity
    DOI 10.1101/2024.04.23.590688
    Typ Preprint
    Autor Schwartz I
    Seiten 2024.04.23.590688
    Link Publikation
  • 2024
    Titel ERH regulates type II interferon immune signaling through post-transcriptional regulation of JAK2 mRNA
    DOI 10.1101/2024.08.20.607899
    Typ Preprint
    Autor Soderholm A
    Seiten 2024.08.20.607899
    Link Publikation
  • 2025
    Titel ERH regulates type II interferon immune signaling through post-transcriptional regulation of JAK2 mRNA
    DOI 10.1093/nar/gkaf545
    Typ Journal Article
    Autor Soderholm A
    Journal Nucleic Acids Research
    Link Publikation
  • 2025
    Titel TRIM52 maintains cellular fitness and is under tight proteolytic control by multiple giant E3 ligases
    DOI 10.1038/s41467-025-59129-y
    Typ Journal Article
    Autor Shulkina A
    Journal Nature Communications
    Seiten 3894
    Link Publikation

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