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SARS-CoV-2 kontrollierte Kinasefunktionen

Uncage hijacked kinases from SARS-CoV-2 interactions

Eduard Stefan (ORCID: 0000-0003-3650-4713)
  • Grant-DOI 10.55776/P35159
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2021
  • Projektende 30.09.2025
  • Bewilligungssumme 399.504 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Chemie (25%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)

Keywords

    Kinase, Inhibitor, Biosensor, Omics

Abstract

Kinasen agieren als zentrale zelluläre Signalmoleküle. Dadurch sind sie aber auch das Ziel von Viren, um in der Folge die infizierte Wirtszelle auf Virenproduktion umzuprogrammieren. Auch der SARS-CoV-2 Virus verfolgt diese Strategie. Wir vertreten die Hypothese, dass die Modulation von zellulären Kinase-Aktivitäten pathologische SARS-CoV-2 Funktionen eindämmen könnte. Die pharmakologische Blockade von Kinasen könnte eventuell neben der Reduktion der Virusproduktion auch die pathologischen Auswirkungen auf die Zellphysiologie verringern. Das Ziel unseres Projektes ist es zwei Kinase-kaskaden, die mit viralen Proteinen wechselwirken, in menschlichen Lungenzelllinien zu charakterisieren. Zunächst verwenden wir einen zellbasierten Kinase-Konformations-Reporter (KinCon),um die AuswirkungvonSARS-CoV-2 Proteininteraktionen auf die Enzymaktivität ausgewählter Kinasen zu bestimmen. Zweitens, analysieren wir den Effekt von bioaktiven chemischen Molekülen auf zelluläre SARS-CoV-2- Funktionen. Drittens, modulieren wir pharmakologisch die cAMP-PKA und MAPK-Kinase- signalwege und bestimmen Veränderungen der Virusassemblierung. Impfstoffe zur Bekämpfung von SARS-CoV-2-Infektionen retten Tausende von Menschenleben. Mutationen können die Wirksamkeit der Spikeprotein-spezifischen Antikörper beeinträchtigen! Wir hoffen, dass die pharmakologische Veränderung von Kinaseaktivitäten eine Strategie für mutations-entkoppelte COVID-19 Therapieansätze darstellen könnte.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Innsbruck - 36%
  • Universität Innsbruck - 64%
Nationale Projektbeteiligte
  • Dorothee Von Laer, Medizinische Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Janine Kimpel, Medizinische Universität Innsbruck , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Marcel Kwiatkowski, Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Susan S. Taylor, University of California - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 199 Zitationen
  • 26 Publikationen
Publikationen
  • 2025
    Titel Exploiting metabolic adaptations to overcome dabrafenib treatment resistance in melanoma cells
    DOI 10.1002/1878-0261.70169
    Typ Journal Article
    Autor Eller S
    Journal Molecular Oncology
    Link Publikation
  • 2025
    Titel CDK6 kinase inhibition unmasks metabolic dependencies in BCR::ABL1+ leukemia
    DOI 10.1038/s41419-025-07434-1
    Typ Journal Article
    Autor Scheiblecker L
    Journal Cell Death & Disease
    Seiten 107
    Link Publikation
  • 2025
    Titel A Catalytically Inactive Protein Kinase C alpha Mutation Drives Chordoid Glioma by Pathway Rewiring
    DOI 10.1101/2025.05.30.657104
    Typ Preprint
    Autor Bellamy C
    Seiten 2025.05.30.657104
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Resistor: An algorithm for predicting resistance mutations via Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures
    DOI 10.1016/j.cels.2022.09.003
    Typ Journal Article
    Autor Guerin N
    Journal Cell Systems
    Link Publikation
  • 2022
    Titel DISRUPTOR: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein interactions
    DOI 10.1101/2022.11.02.514903
    Typ Preprint
    Autor Kugler V
    Seiten 2022.11.02.514903
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Cdk6’s functions are critically regulated by its unique C-terminus
    DOI 10.1016/j.isci.2024.111697
    Typ Journal Article
    Autor Schirripa A
    Journal iScience
    Seiten 111697
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Phosphorylation of the compartmentalized PKA substrate TAF15 regulates RNA–protein interactions
    DOI 10.1007/s00018-024-05204-4
    Typ Journal Article
    Autor Feichtner A
    Journal Cellular and Molecular Life Sciences
    Seiten 162
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Characterizing SARS-CoV-2 neutralization profiles after bivalent boosting using antigenic cartography
    DOI 10.1038/s41467-023-41049-4
    Typ Journal Article
    Autor Rössler A
    Journal Nature Communications
    Seiten 5224
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function
    DOI 10.26508/lsa.202302043
    Typ Journal Article
    Autor Moesslacher C
    Journal Life Science Alliance
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Tracking and blocking interdependencies of cellular BRAF-MEK oncokinase activities
    DOI 10.1093/pnasnexus/pgad185
    Typ Journal Article
    Autor Fleischmann J
    Journal PNAS Nexus
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Disruptor: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein-protein and protein-DNA interactions
    DOI 10.1038/s42003-023-05089-2
    Typ Journal Article
    Autor Kugler V
    Journal Communications Biology
    Seiten 720
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Tracking mutation and drug-driven alterations of oncokinase conformations
    DOI 10.1007/s12254-021-00790-6
    Typ Journal Article
    Autor Feichtner A
    Journal memo - Magazine of European Medical Oncology
    Seiten 137-142
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Resistor: an algorithm for predicting resistance mutations using Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures
    DOI 10.1101/2022.01.18.476733
    Typ Preprint
    Autor Guerin N
    Seiten 2022.01.18.476733
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Kinase perturbations redirect mitochondrial function in cancer
    DOI 10.26124/bec:2022-0013
    Typ Journal Article
    Autor Torres-Quesada O
    Journal Bioenergetics communications
    Seiten 17
  • 2022
    Titel BA.2 omicron differs immunologically from both BA.1 omicron and pre-omicron variants
    DOI 10.1101/2022.05.10.22274906
    Typ Preprint
    Autor Rössler A
    Seiten 2022.05.10.22274906
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Enhanced TROSY Effect in [2-19F, 2-13C] Adenosine and ATP Analogs Facilitates NMR Spectroscopy of Very Large Biological RNAs in Solution
    DOI 10.1002/anie.202316273
    Typ Journal Article
    Autor Juen F
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Enhanced TROSY Effect in [2-19F, 2-13C] Adenosine and ATP Analogs Facilitates NMR Spectroscopy of Very Large Biological RNAs in Solution
    DOI 10.1002/ange.202316273
    Typ Journal Article
    Autor Juen F
    Journal Angewandte Chemie
    Link Publikation
  • 2024
    Titel A mutation in the PRKAR1B gene drives pathological mechanisms of neurodegeneration across species
    DOI 10.1093/brain/awae154
    Typ Journal Article
    Autor Benjamin-Zukerman T
    Journal Brain
    Seiten 3890-3905
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Direct comparison of SARS-CoV-2 variant specific neutralizing antibodies in human and hamster sera
    DOI 10.1038/s41541-024-00888-y
    Typ Journal Article
    Autor Rössler A
    Journal npj Vaccines
    Seiten 85
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations
    DOI 10.7554/elife.94755
    Typ Journal Article
    Autor Kugler V
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations
    DOI 10.7554/elife.94755.3
    Typ Journal Article
    Autor Kugler V
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Kinases in motion: impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations
    DOI 10.1101/2024.01.11.575270
    Typ Preprint
    Autor Kugler V
    Seiten 2024.01.11.575270
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Characterizing SARS-CoV-2 neutralization profiles after bivalent boosting using antigenic cartography
    DOI 10.1101/2023.05.02.23289412
    Typ Preprint
    Autor Rössler A
    Seiten 2023.05.02.23289412
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM-F3 domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function
    DOI 10.1101/2022.12.11.519953
    Typ Preprint
    Autor Moesslacher C
    Seiten 2022.12.11.519953
    Link Publikation
  • 2022
    Titel BA.2 and BA.5 omicron differ immunologically from both BA.1 omicron and pre-omicron variants
    DOI 10.1038/s41467-022-35312-3
    Typ Journal Article
    Autor Rössler A
    Journal Nature Communications
    Seiten 7701
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Physiological Cell Culture Media Tune Mitochondrial Bioenergetics and Drug Sensitivity in Cancer Cell Models
    DOI 10.3390/cancers14163917
    Typ Journal Article
    Autor Torres-Quesada O
    Journal Cancers
    Seiten 3917
    Link Publikation

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