SARS-CoV-2 kontrollierte Kinasefunktionen
Uncage hijacked kinases from SARS-CoV-2 interactions
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (50%); Chemie (25%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)
Keywords
-
Kinase,
Inhibitor,
Biosensor,
Omics
Kinasen agieren als zentrale zelluläre Signalmoleküle. Dadurch sind sie aber auch das Ziel von Viren, um in der Folge die infizierte Wirtszelle auf Virenproduktion umzuprogrammieren. Auch der SARS-CoV-2 Virus verfolgt diese Strategie. Wir vertreten die Hypothese, dass die Modulation von zellulären Kinase-Aktivitäten pathologische SARS-CoV-2 Funktionen eindämmen könnte. Die pharmakologische Blockade von Kinasen könnte eventuell neben der Reduktion der Virusproduktion auch die pathologischen Auswirkungen auf die Zellphysiologie verringern. Das Ziel unseres Projektes ist es zwei Kinase-kaskaden, die mit viralen Proteinen wechselwirken, in menschlichen Lungenzelllinien zu charakterisieren. Zunächst verwenden wir einen zellbasierten Kinase-Konformations-Reporter (KinCon),um die AuswirkungvonSARS-CoV-2 Proteininteraktionen auf die Enzymaktivität ausgewählter Kinasen zu bestimmen. Zweitens, analysieren wir den Effekt von bioaktiven chemischen Molekülen auf zelluläre SARS-CoV-2- Funktionen. Drittens, modulieren wir pharmakologisch die cAMP-PKA und MAPK-Kinase- signalwege und bestimmen Veränderungen der Virusassemblierung. Impfstoffe zur Bekämpfung von SARS-CoV-2-Infektionen retten Tausende von Menschenleben. Mutationen können die Wirksamkeit der Spikeprotein-spezifischen Antikörper beeinträchtigen! Wir hoffen, dass die pharmakologische Veränderung von Kinaseaktivitäten eine Strategie für mutations-entkoppelte COVID-19 Therapieansätze darstellen könnte.
- Dorothee Von Laer, Medizinische Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
- Janine Kimpel, Medizinische Universität Innsbruck , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Marcel Kwiatkowski, Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
- Susan S. Taylor, University of California - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 199 Zitationen
- 26 Publikationen
-
2025
Titel Exploiting metabolic adaptations to overcome dabrafenib treatment resistance in melanoma cells DOI 10.1002/1878-0261.70169 Typ Journal Article Autor Eller S Journal Molecular Oncology Link Publikation -
2025
Titel CDK6 kinase inhibition unmasks metabolic dependencies in BCR::ABL1+ leukemia DOI 10.1038/s41419-025-07434-1 Typ Journal Article Autor Scheiblecker L Journal Cell Death & Disease Seiten 107 Link Publikation -
2025
Titel A Catalytically Inactive Protein Kinase C alpha Mutation Drives Chordoid Glioma by Pathway Rewiring DOI 10.1101/2025.05.30.657104 Typ Preprint Autor Bellamy C Seiten 2025.05.30.657104 Link Publikation -
2022
Titel Resistor: An algorithm for predicting resistance mutations via Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures DOI 10.1016/j.cels.2022.09.003 Typ Journal Article Autor Guerin N Journal Cell Systems Link Publikation -
2022
Titel DISRUPTOR: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein interactions DOI 10.1101/2022.11.02.514903 Typ Preprint Autor Kugler V Seiten 2022.11.02.514903 Link Publikation -
2024
Titel Cdk6’s functions are critically regulated by its unique C-terminus DOI 10.1016/j.isci.2024.111697 Typ Journal Article Autor Schirripa A Journal iScience Seiten 111697 Link Publikation -
2024
Titel Phosphorylation of the compartmentalized PKA substrate TAF15 regulates RNA–protein interactions DOI 10.1007/s00018-024-05204-4 Typ Journal Article Autor Feichtner A Journal Cellular and Molecular Life Sciences Seiten 162 Link Publikation -
2023
Titel Characterizing SARS-CoV-2 neutralization profiles after bivalent boosting using antigenic cartography DOI 10.1038/s41467-023-41049-4 Typ Journal Article Autor Rössler A Journal Nature Communications Seiten 5224 Link Publikation -
2023
Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function DOI 10.26508/lsa.202302043 Typ Journal Article Autor Moesslacher C Journal Life Science Alliance Link Publikation -
2023
Titel Tracking and blocking interdependencies of cellular BRAF-MEK oncokinase activities DOI 10.1093/pnasnexus/pgad185 Typ Journal Article Autor Fleischmann J Journal PNAS Nexus Link Publikation -
2023
Titel Disruptor: Computational identification of oncogenic mutants disrupting protein-protein and protein-DNA interactions DOI 10.1038/s42003-023-05089-2 Typ Journal Article Autor Kugler V Journal Communications Biology Seiten 720 Link Publikation -
2022
Titel Tracking mutation and drug-driven alterations of oncokinase conformations DOI 10.1007/s12254-021-00790-6 Typ Journal Article Autor Feichtner A Journal memo - Magazine of European Medical Oncology Seiten 137-142 Link Publikation -
2022
Titel Resistor: an algorithm for predicting resistance mutations using Pareto optimization over multistate protein design and mutational signatures DOI 10.1101/2022.01.18.476733 Typ Preprint Autor Guerin N Seiten 2022.01.18.476733 Link Publikation -
2022
Titel Kinase perturbations redirect mitochondrial function in cancer DOI 10.26124/bec:2022-0013 Typ Journal Article Autor Torres-Quesada O Journal Bioenergetics communications Seiten 17 -
2022
Titel BA.2 omicron differs immunologically from both BA.1 omicron and pre-omicron variants DOI 10.1101/2022.05.10.22274906 Typ Preprint Autor Rössler A Seiten 2022.05.10.22274906 Link Publikation -
2024
Titel Enhanced TROSY Effect in [2-19F, 2-13C] Adenosine and ATP Analogs Facilitates NMR Spectroscopy of Very Large Biological RNAs in Solution DOI 10.1002/anie.202316273 Typ Journal Article Autor Juen F Journal Angewandte Chemie International Edition Link Publikation -
2024
Titel Enhanced TROSY Effect in [2-19F, 2-13C] Adenosine and ATP Analogs Facilitates NMR Spectroscopy of Very Large Biological RNAs in Solution DOI 10.1002/ange.202316273 Typ Journal Article Autor Juen F Journal Angewandte Chemie Link Publikation -
2024
Titel A mutation in the PRKAR1B gene drives pathological mechanisms of neurodegeneration across species DOI 10.1093/brain/awae154 Typ Journal Article Autor Benjamin-Zukerman T Journal Brain Seiten 3890-3905 Link Publikation -
2024
Titel Direct comparison of SARS-CoV-2 variant specific neutralizing antibodies in human and hamster sera DOI 10.1038/s41541-024-00888-y Typ Journal Article Autor Rössler A Journal npj Vaccines Seiten 85 Link Publikation -
2024
Titel Impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations DOI 10.7554/elife.94755 Typ Journal Article Autor Kugler V Journal eLife Link Publikation -
2024
Titel Impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations DOI 10.7554/elife.94755.3 Typ Journal Article Autor Kugler V Journal eLife Link Publikation -
2024
Titel Kinases in motion: impact of protein and small molecule interactions on kinase conformations DOI 10.1101/2024.01.11.575270 Typ Preprint Autor Kugler V Seiten 2024.01.11.575270 Link Publikation -
2023
Titel Characterizing SARS-CoV-2 neutralization profiles after bivalent boosting using antigenic cartography DOI 10.1101/2023.05.02.23289412 Typ Preprint Autor Rössler A Seiten 2023.05.02.23289412 Link Publikation -
2022
Titel Missense variant interaction scanning reveals a critical role of the FERM-F3 domain for tumor suppressor protein NF2 conformation and function DOI 10.1101/2022.12.11.519953 Typ Preprint Autor Moesslacher C Seiten 2022.12.11.519953 Link Publikation -
2022
Titel BA.2 and BA.5 omicron differ immunologically from both BA.1 omicron and pre-omicron variants DOI 10.1038/s41467-022-35312-3 Typ Journal Article Autor Rössler A Journal Nature Communications Seiten 7701 Link Publikation -
2022
Titel Physiological Cell Culture Media Tune Mitochondrial Bioenergetics and Drug Sensitivity in Cancer Cell Models DOI 10.3390/cancers14163917 Typ Journal Article Autor Torres-Quesada O Journal Cancers Seiten 3917 Link Publikation