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3D-Nanoskopie der Immunologischen Synapse

3D nanoscopy of the immunological synapse

Alexander Jesacher (ORCID: 0000-0003-4285-9406)
  • Grant-DOI 10.55776/P30214
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.08.2017
  • Projektende 31.07.2021
  • Bewilligungssumme 351.543 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (30%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (30%); Physik, Astronomie (40%)

Keywords

    Microscopy, Localization Microscopy, Immunology, Single Molecule Tracking

Abstract Endbericht

In diesem Projekt wollen wir eine der erstaunlichsten Eigenschaften unseres adaptiven Immunsystems erforschen, nämlich dessen einzigartige Empfindlichkeit bei der Unterscheidung von Freund und Feind: unter Umständen reicht schon der Kontakt einer Abwehrzelle (T-Zelle) mit einem einzigen Fremdprotein aus, um eine Abwehrreaktion auszulösen. Diese exquisite Sensitivität ist bis heute nicht vollständig verstanden. Entscheidend für ein besseres Verständnis ist eine genaue Beobachtung der Kommunikation zwischen T-Zellen und jenen Zellen, die Fremdproteine im Körper aufsammeln, in die Lymphknoten wandern und diese den dort vorhandenen T-Zellen bei direkter Berührung präsentieren. Um die Kontaktstelle zwischen den beiden Zelltypen sowie die an der Zell-Kommunikation beteiligten Proteine in ihrer Position und zeitlichem Verhalten genauestens untersuchen zu können, wollen wir drei der präzisesten Messtechniken die uns heutzutage zur Verfügung stehen weiterentwickeln und in einem einzigen Mikroskop vereinen. Wir erwarten, dass dadurch dreidimensionale Positionsbestimmungen im Bereich von bis zu 10 nm Genauigkeit möglich werden, was der Länge von etwa hundert Atomdurchmessern entspricht. Diese Messempfindlichkeit wird es ermöglichen, in bis dato unerreichter Genauigkeit der Kommunikation zwischen beiden Zelltypen folgen zu können sowie vielleicht noch unbekannte Vorgänge aufzudecken.

Unser interdisziplinäres Projekt hat sich zum Ziel gesetzt, mehr über die Antigen-Erkennung durch T-Zellen, spezielle Lymphozyten unseres Immunsystems, herauszufinden. T-Zellen interagieren mit anderen Zellen unseres Körpers (Antigen-präsentierende Zellen), welche kleinste Bruchstücke von Fremdstoffen (z.B. von Viren) den T-Zellen präsentieren. Es ist zurzeit nicht genau geklärt, wie potenziell gefährliche Fremdstoffe von T-Zellen so effektiv erkannt werden können und in weiterer Folge eine Immunantwort des gesamten Körpers auslösen. Wir konnten Ergebnisse in zwei Forschungsfeldern erzielen: Mikroskopie Hier wurden technologische Aspekte der Nanoskopie, d.h. Mikrokopie auf kleinsten Größenskalen, weiterentwickelt. Es wurde ein einfaches Verfahren entwickelt, mit dem sich 3D Positionen von einzelnen Bio-molekülen - zum Beispiel Proteinen in der Zellmembran - im Bereich von nur wenigen Nanometern Genauigkeit bestimmen lassen. In unserem Forschungsprojekt wurde dieses Verfahren eingesetzt, um mehr über die Antigen-Erkennung durch T-Zellen herauszufinden. Weiters konnte unsere Forschung die Frage beantworten, ob eine gemeinhin etablierte Methode (Interferenz-Reflexionsmikroskopie, IRM) verwendet werden kann, um die Abstände einer Zellmembran vom Mikroskop-Deckglas zuverlässig zu bestimmen. Wir konnten zeigen, das IRM meist zuverlässig funktioniert, aber in manchen Bereichen der Zellmembran gravierende Fehler liefert. Biologie Im Hinblick auf die biologischen Aspekte konnte unsere Forschung im Wesentlichen folgende Fragen beantworten: 1) Existieren "Nanocluster" von T-Zellen Rezeptoren (TCR) tatsächlich? Wir konnten nachweisen, dass die bisher beschriebenen TCR Nano-Cluster in der Zellmembran von inaktiven T-Zellen auf Artefakte der Bildgebung und der Datenanalyse zurückgeführt werden können. Manche Farbstoff-Moleküle werden mehrfach gemessen und gezählt, und gaukeln so lokal höhere TCR-Dichten - also TCR-Cluster - vor. 2) Was sind physikalische Gründe für die Beobachtung von TCR - Mikroclustern? Die Beobachtung von Mikro-Clustern bei der Aktivierung von T-Zellen könnte ebenfalls zum Teil von Artefakten der Bildgebung herrühren: Da sich diese Moleküle näher am Deckglas befinden, erscheinen Sie durch eine erhöhte Licht-Einkopplung ins Deckglas besonders hell, was wiederum eine Anreicherung von Molekülen suggerieren kann. Wir konnten zeigen, dass dieser "Verstärkungseffekt" nur eine untergeordnete Rolle spielt und tatsächlich molekulare Anreicherung, d.h. die Formierung von Mikro-Clustern, stattfindet. 3) Ist der Abstand zwischen den Membranen von T-Zelle und Antigen-präsentierender Zelle zu klein für das Protein CD45? Eine etablierte Theorie für die Triggerung von T-Zellen involviert das recht große Molekül CD45. Darum ist es wichtig zu wissen, ob diese Molekül überhaupt in den schmalen Spalt zwischen den beiden Zellmembranen hineinpasst. Unsere hochgenauen Messungen deuten darauf hin, dass der Membranabstand tatsächlich zu klein für CD45 sein könnte, sowohl für aktive als auch für inaktive T-Zellen. Dies erlaubt nun die Eingrenzung der möglichen Theorien für die T-Zell Aktivierung.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Innsbruck - 50%
  • Technische Universität Wien - 50%
Nationale Projektbeteiligte
  • Gerhard J. Schütz, Technische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Irina Harder, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland

Research Output

  • 360 Zitationen
  • 22 Publikationen
Publikationen
  • 2019
    Titel Spectral image scanning microscopy
    DOI 10.1364/boe.10.002513
    Typ Journal Article
    Autor Strasser F
    Journal Biomedical Optics Express
    Seiten 2513-2527
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Automated Two-dimensional Spatiotemporal Analysis of Mobile Single-molecule FRET Probes.
    DOI 10.3791/63124
    Typ Journal Article
    Autor Schrangl L
    Journal Journal of visualized experiments : JoVE
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Three-Dimensional Single Molecule Localization Microscopy Reveals the Topography of the Immunological Synapse at Isotropic Precision below 15 nm
    DOI 10.1021/acs.nanolett.1c03160
    Typ Journal Article
    Autor Velas L
    Journal Nano Letters
    Seiten 9247-9255
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Two-photon PSF-engineered image scanning microscopy.
    DOI 10.1364/ol.44.000895
    Typ Journal Article
    Autor Tzang O
    Journal Optics letters
    Seiten 895-898
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Unscrambling Fluorophore Blinking for Comprehensive Cluster Detection via Photoactivated Localization Microscopy
    DOI 10.1101/545152
    Typ Preprint
    Autor Platzer R
    Seiten 545152
    Link Publikation
  • 2018
    Titel TCRs are randomly distributed on the plasma membrane of resting antigen-experienced T cells
    DOI 10.1038/s41590-018-0162-7
    Typ Journal Article
    Autor Rossboth B
    Journal Nature Immunology
    Seiten 821-827
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Unscrambling fluorophore blinking for comprehensive cluster detection via photoactivated localization microscopy
    DOI 10.1038/s41467-020-18726-9
    Typ Journal Article
    Autor Platzer R
    Journal Nature Communications
    Seiten 4993
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Temporal Analysis of T-Cell Receptor-Imposed Forces via Quantitative Single Molecule FRET Measurements
    DOI 10.1101/2020.04.03.024299
    Typ Preprint
    Autor Göhring J
    Seiten 2020.04.03.024299
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Defocused imaging exploits supercritical-angle fluorescence emission for precise axial single molecule localization microscopy
    DOI 10.1364/boe.375678
    Typ Journal Article
    Autor Zelger P
    Journal Biomedical Optics Express
    Seiten 775-790
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Adaptive illumination for optimal image quality in phase contrast microscopy
    DOI 10.1016/j.optcom.2019.124972
    Typ Journal Article
    Autor Hofmeister A
    Journal Optics Communications
    Seiten 124972
    Link Publikation
  • 2018
    Titel What we talk about when we talk about nanoclusters
    DOI 10.1088/2050-6120/aaed0f
    Typ Journal Article
    Autor Baumgart F
    Journal Methods and Applications in Fluorescence
    Seiten 013001
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Temporal Filtering to Improve Single Molecule Identification in High Background Samples
    DOI 10.3390/molecules23123338
    Typ Journal Article
    Autor Reismann A
    Journal Molecules
    Seiten 3338
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Erratum: Defocused imaging exploits supercritical-angle fluorescence emission for precise axial single molecule localization microscopy: erratum.
    DOI 10.1364/boe.408790
    Typ Journal Article
    Autor Zelger P
    Journal Biomedical optics express
    Seiten 5456-5457
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Single-Molecule Localization Microscopy to Study Protein Organization in the Filamentous Fungus Trichoderma atroviride
    DOI 10.3390/molecules25143199
    Typ Journal Article
    Autor Reismann A
    Journal Molecules
    Seiten 3199
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Robust and bias-free localization of individual fixed dipole emitters achieving the Cramér Rao bound for applications in cryo-single molecule localization microscopy
    DOI 10.1371/journal.pone.0263500
    Typ Journal Article
    Autor Hinterer F
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2021
    Titel 3D single molecule localization microscopy reveals the topography of the immunological synapse at isotropic precision below 15 nm
    DOI 10.1101/2021.08.09.455230
    Typ Preprint
    Autor Velas L
    Seiten 2021.08.09.455230
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Robust and bias-free localization of individual fixed dipole emitters achieving the Cram\'{e}r Rao bound
    DOI 10.48550/arxiv.2104.02449
    Typ Preprint
    Autor Hinterer F
  • 2021
    Titel Temporal analysis of T-cell receptor-imposed forces via quantitative single molecule FRET measurements
    DOI 10.1038/s41467-021-22775-z
    Typ Journal Article
    Autor Göhring J
    Journal Nature Communications
    Seiten 2502
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Three-dimensional single molecule localization close to the coverslip: a comparison of methods exploiting supercritical angle fluorescence
    DOI 10.1364/boe.413018
    Typ Journal Article
    Autor Zelger P
    Journal Biomedical Optics Express
    Seiten 802-822
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Temporal analysis of T-cell receptor-imposed forces via quantitative single molecule FRET measurements
    DOI 10.3929/ethz-b-000484291
    Typ Other
    Autor Göhring
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Automated Two-dimensional Spatiotemporal Analysis of Mobile Single-molecule FRET Probes
    DOI 10.3791/63124-v
    Typ Journal Article
    Autor Schrangl L
    Journal Journal of Visualized Experiments
    Link Publikation
  • 2017
    Titel 3D image scanning microscopy with engineered excitation and detection
    DOI 10.1364/optica.4.001373
    Typ Journal Article
    Autor Roider C
    Journal Optica
    Seiten 1373
    Link Publikation

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