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Protonengradienten in bakterieller Proteintranslokation

Proton gradients in bacterial protein translocation

Denis Knyazev (ORCID: 0000-0003-3197-1849)
  • Grant-DOI 10.55776/P29841
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.12.2016
  • Projektende 30.11.2021
  • Bewilligungssumme 387.354 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    SecYEG, Arrest Peptide, Proton-Motive Force, Single Dye Tracing, Single Channel Electrophysiology, Protein Reconstitution

Abstract Endbericht

Das bakterielle Translokon SecYEG transportiert bakterielle Eiweiße durch die Plasmamembran, die anderenfalls eine unüberwindliche Barriere darstellen würde. Bisher ist unklar, welche Energiequelle die Translokation speist. Eine Möglichkeit wäre, dass die Translokationsmaschinerie chemisch gespeicherte Energie, etwa in Form von ATP nutzt, um die Eiweiße mit Hilfe von Motorproteinen (genannt SecA) durch die Membran zu drücken. Alternativ könnte die Eiweißtranslokation auch direkt vom transmembranen Protonenkonzentrationsgradienten getrieben werden. Dies wäre weit effizienter als der Umweg über ATP, das mit Hilfe desselben Protonengradienten hergestellt wird. Ziel des vorliegenden Projektes ist zu zeigen, auf welche Weise der Protonengradient die Proteintranslokation treiben kann. Um dieses Ziel zu erreichen, werden wir hochauflösende Techniken einsetzen, die es erlauben einzelne Eiweiße auf ihrem Weg durch eine Membran zu verfolgen und die vollständige Kontrolle über die Protonenkonzentration zu beiden Seiten der Membran bieten. Kenntnis der Rolle von Protonen erlaubt uns, Kontrolle über die Translokationsgeschwindigkeit auszuüben, um so die biotechnologische Eiweißproduktion zu steuern oder die Faltung von Eiweißen zu beobachten.

Protonengradienten in bakterieller Proteintranslokation Das bakterielle Translocon SecYEG transportiert bakterielle Proteine durch die Plasmamembran. Wie jede gerichtete Bewegung erfordert auch die Translokation Energie. Sie kann aus der ATP-Hydrolyse (Adenosintriphosphat) stammen, die es dem Motorprotein SecA ermöglicht, Proteine durch SecYEG-Kanäle zu schieben. Alternativ kann die Translokation auch direkt durch den transmembranen Protonengradienten, die so genannte protonen-motorische Kraft (PMF), angetrieben werden. Das Projekt untersuchte die Regulierung von SecYEG durch die Komponenten der PMF, das elektrische Transmembranpotenzial und den pH-Unterschied über die Zellmembran. Wir haben eine State-of-the-art-Technik entwickelt, die es erlaubt, die Dynamik eines einzelnen Translokationskomplexes zu beobachten. Mit dieser Technik konnten wir die Teile des Translokons identifizieren, die das PMF spüren. Die gewonnenen Erkenntnisse können dazu genutzt werden, die Translokationsrate von Proteinen für biotechnologische Zwecke zu manipulieren.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 95%
  • FH Oberösterreich - 5%
Nationale Projektbeteiligte
  • Birgit Plochberger, FH Oberösterreich , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 58 Zitationen
  • 8 Publikationen
Publikationen
  • 2019
    Titel Modelling of conformational transitions of fluorescent-labelled proteins
    Typ PhD Thesis
    Autor Ekaterina Sobakinskaja
    Link Publikation
  • 2023
    Titel YidC from Escherichia coli forms an ion-conducting pore upon activation by ribosomes
    DOI 10.1101/2023.05.10.540180
    Typ Preprint
    Autor Knyazev D
    Seiten 2023.05.10.540180
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Biophysical quantification of unitary solute and solvent permeabilities to enable translation to membrane science
    DOI 10.1016/j.memsci.2022.121308
    Typ Journal Article
    Autor Wachlmayr J
    Journal Journal of Membrane Science
    Seiten 121308
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Steady-state polypeptide transfer from the translocon to the membrane
    DOI 10.1101/2023.01.10.523415
    Typ Preprint
    Autor Knyazev D
    Seiten 2023.01.10.523415
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Voltage Sensing in Bacterial Protein Translocation
    DOI 10.3390/biom10010078
    Typ Journal Article
    Autor Knyazev D
    Journal Biomolecules
    Seiten 78
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Driving Forces of Translocation Through Bacterial Translocon SecYEG
    DOI 10.1007/s00232-017-0012-9
    Typ Journal Article
    Autor Knyazev D
    Journal The Journal of Membrane Biology
    Seiten 329-343
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Voltage Sensing in Bacterial Protein Translocation
    DOI 10.17169/refubium-26309
    Typ Other
    Autor Knyazev D
    Link Publikation
  • 2023
    Titel YidC from Escherichia coli Forms an Ion-Conducting Pore upon Activation by Ribosomes
    DOI 10.3390/biom13121774
    Typ Journal Article
    Autor Knyazev D
    Journal Biomolecules
    Seiten 1774
    Link Publikation

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