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Kinasen und DNS-Schaden

Kinases and DNA damage

Joanna Loizou (ORCID: 0000-0003-1853-0424)
  • Grant-DOI 10.55776/P29763
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.11.2016
  • Projektende 31.12.2019
  • Bewilligungssumme 235.431 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Kinases, DNA damage, DNA repair, Genome integrity

Abstract Endbericht

Die korrekte Regulierung und Kontrolle der DNS-Schadensreaktion wird benötigt um Veränderungen im Erbgut zu unterdrücken, die Krebs auslösen könnten. Eine Gruppe von Proteinen, die dafür bekannt sind eine wichtige Rolle bei der DNS- Schadensreaktion zu spielen, sind die Kinasen. Zwar ist bereits klar, dass bei verschiedenen menschlichen Krebsarten zahlreiche Kinasen mutiert sind, betrachtet man jedoch die Gesamtheit so wird deutlich, dass die Mehrheit der Kinasen noch wenig erforscht ist. Wir konnten bereits eine Untersuchung durchführen die es uns erlaubte darzustellen, welche Kinasen für die Reaktion auf DNS-Schäden von Bedeutung sind. Im Rahmen dieser Untersuchung konnten vier Kinasen identifiziert werden, die für weitere Studien äußerst interessant wären, dass sie auch eine wichtige Rolle für Krebs spielen. Daher ist Ziel dieses Projektes besser zu charakterisieren und zu verstehen wie diese vier Kinasen auf DNS-Schäden reagieren, und zwar im Speziellen jene Arten von DNS-Schäden, die als Chemotherapie eingesetzt werden. Wir gehen davon aus, dass diese Forschung zu einer besseren Behandlung von Krebspatienten mit Mutationen der identifizierten Kinasen führen wird, da paradoxerweise jahrzehntelang DNS-schädigendeMittelals effektive Chemotherapeutika eingesetzt wurden.

1. Artificial gene defect reveals target to fight genetic disease Fanconi anemia (FA). A rare, inherited disease, is caused by defective genes for DNA-repair in the cells of the patient leading to bone marrow failure, developmental abnormalities and increased cancer risk. Using genome-wide genetic approaches, researchers at CeMM systematically screened for the loss of an additional gene that could rescue the disease and found it. The corresponding protein turned out to be a potential target that could be therapeutically exploited for FA. The study was published in Nature Communications (DOI: 10.1038/s41467- 018-04649-z). 2. When two wrongs make a right: Artificial CRISPR gene disruptions could rescue genetic disease. Defective DNA repair mechanisms can lead to diseases like Fanconi anemia. Utilizing a concept called synthetic viability, researchers at CeMM, in international collaboration, found additional gene disruptions that rescue the phenotype of this disease in cell culture and identified the responsible protein complex. The study, published in Nature Communications, intriguingly demonstrates the potential of synthetic viability screens to identify genetic interactions rescuing cells with defects in the DNA damage response (DOI: 10.1038/s41467-017-01439-x).3. Tracing the footprints of a tumor: genomic scars allow cancer profiling. DNA mutations driving cancer development are caused by different mechanisms, each of them leaving behind specific patterns, or scars in the genome. In principle, the combination of those scars, so-called mutational signatures, allow for profiling of the cancer type and its development but the noisy environment of a cancer genome, makes correlations at times difficult. Using CRISPR-Cas9 technology, researchers at CeMM and the Wellcome Trust Sanger Institute at Cambridge, UK were able to show for the first time in cell culture that specific genetic alterations indeed lead to the predicted pattern of mutational signaturesobserved in human cancers. The results were published in Nature Communications (DOI: 10.1038/s41467-018-04052-8).4. Diabetes drug helps repair UV- damaged DNA in cells of "Moon children". The severe and debilitating genetic disease Xeroderma pigmentosum impedes cells to repair UV-induced DNA damage. Scientists from CeMM found a drug approved for diabetes treatment to alleviate the impact of the gene defect in cell culture, which led to the discovery of a previously unknown DNA repair mechanism. The study was published in Molecular Cell (DOI: 10.1016/j.molcel.2017.10.021).

Forschungsstätte(n)
  • CeMM – Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH - 100%

Research Output

  • 329 Zitationen
  • 9 Publikationen
Publikationen
  • 2019
    Titel Synthetic Lethal Interactions for Kinase Deficiencies to DNA Damage Chemotherapeutics
    DOI 10.1158/0008-5472.can-19-1364
    Typ Journal Article
    Autor Robinson-Garcia L
    Journal Cancer Research
    Seiten 5693-5698
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Mapping the Human Kinome in Response to DNA Damage
    DOI 10.1016/j.celrep.2018.12.087
    Typ Journal Article
    Autor Owusu M
    Journal Cell Reports
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Genome-scale CRISPR screens are efficient in non-homologous end-joining deficient cells
    DOI 10.1038/s41598-019-52078-9
    Typ Journal Article
    Autor Ferreira Da Silva J
    Journal Scientific Reports
    Seiten 15751
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Map of synthetic rescue interactions for the Fanconi anemia DNA repair pathway identifies USP48
    DOI 10.1038/s41467-018-04649-z
    Typ Journal Article
    Autor Velimezi G
    Journal Nature Communications
    Seiten 2280
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Validating the concept of mutational signatures with isogenic cell models
    DOI 10.1038/s41467-018-04052-8
    Typ Journal Article
    Autor Zou X
    Journal Nature Communications
    Seiten 1744
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Mapping the human kinome in response to DNA damage
    DOI 10.1101/385344
    Typ Preprint
    Autor Owusu M
    Seiten 385344
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Repair of UV-Induced DNA Damage Independent of Nucleotide Excision Repair Is Masked by MUTYH
    DOI 10.1016/j.molcel.2017.10.021
    Typ Journal Article
    Autor Mazouzi A
    Journal Molecular Cell
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Parallel genome-wide screens identify synthetic viable interactions between the BLM helicase complex and Fanconi anemia
    DOI 10.1038/s41467-017-01439-x
    Typ Journal Article
    Autor Moder M
    Journal Nature Communications
    Seiten 1238
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Perioperative Non-Invasive Indocyanine Green-Clearance Testing to Predict Postoperative Outcome after Liver Resection
    DOI 10.1371/journal.pone.0165481
    Typ Journal Article
    Autor Haegele S
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation

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