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Korrektur von DNS-Reparatur assoziierte Krankheiten

Correcting Nucleotide Excision Repair-associated diseases

Joanna Loizou (ORCID: 0000-0003-1853-0424)
  • Grant-DOI 10.55776/P29555
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.08.2016
  • Projektende 31.05.2019
  • Bewilligungssumme 286.356 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    DNA repair, Synthetic viability, Nucleotide excision repair

Abstract Endbericht

Die Erhaltung genomischer Integrität durch die Reparatur von DNA-Schäden ist ein Schlüsselprozess, um Krankheiten zu unterdrücken, von denen viele kaum behandelbar sind. Kürzlich ist das Konzept der synthetischen Rettung erschienen, um Pathologien seltener Krankheiten zu verbessern. Unserer Hypothese nach können synthetische Interaktionen identifiziert und angewandt werden, um seltene Krankheiten zu lindern, die aus Defekten im DNA-Reparaturweg der Nukleotid- Exzisionsreparatur (NER) entstehen. Daher haben wir Funktionsverlust-Mutanten für vier seltene Krankheiten generiert, die mit fehlerhaftem NER assoziiert sind. Als nächstes werden wir systematisch den kombinatorischen Verlust des zweiten Gens/Ziels identifizieren, der zur synthetischen Rettung führt. Patientenzellen werden für Bestätigungsstudien herangezogen werden. Danach wollen wir den Wirkungsmechanismus erläutern und folglich die Entdeckung neuer Behandlungen für diese belastenden Krankheiten katalysieren.

Die Erhaltung genomischer Integrität durch die Reparatur von DNA-Schäden ist ein Schlüsselprozess, um Krankheiten zu unterdrücken, von denen viele kaum behandelbar sind. Kürzlich ist das Konzept der synthetischen Rettung erschienen, um Pathologien seltener Krankheiten zu verbessern. Im Projekt haben wir Ansätze zur Linderung von seltenen Erkrankungen aufgrund von Defekten im DNA-Reparaturweg der Nukleotid-Exzisionsreparatur (NER) sowie der Fanconi Anemia (FA) entwickelt. Dazu haben wir Zelllinien mit Genmutationen dieser Erkrankungen generiert und systematisch den kombinatorischen Verlust des zweiten Gens/Ziels identifiziert, der zur synthetischen Rettung führt.. Da sich die lindernde Wirkung in den Patientenproben bestätigt hat, haben wir uns auf die Untersuchung der dahinterliegenden Zellprozesse konzentriert. Dieses Projekt hat insgesamt zur Identifikation von genetischen Methoden zur Linderung von Symptomen bei seltenen Erkrankungen, verursacht von Defekten im DNA-Reparaturweg, geführt.

Forschungsstätte(n)
  • CeMM – Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH - 100%

Research Output

  • 92 Zitationen
  • 5 Publikationen
Publikationen
  • 2019
    Titel Synthetic Lethal Interactions for Kinase Deficiencies to DNA Damage Chemotherapeutics
    DOI 10.1158/0008-5472.can-19-1364
    Typ Journal Article
    Autor Robinson-Garcia L
    Journal Cancer Research
    Seiten 5693-5698
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Mapping the Human Kinome in Response to DNA Damage
    DOI 10.1016/j.celrep.2018.12.087
    Typ Journal Article
    Autor Owusu M
    Journal Cell Reports
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Map of synthetic rescue interactions for the Fanconi anemia DNA repair pathway identifies USP48
    DOI 10.1038/s41467-018-04649-z
    Typ Journal Article
    Autor Velimezi G
    Journal Nature Communications
    Seiten 2280
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Mapping the human kinome in response to DNA damage
    DOI 10.1101/385344
    Typ Preprint
    Autor Owusu M
    Seiten 385344
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Parallel genome-wide screens identify synthetic viable interactions between the BLM helicase complex and Fanconi anemia
    DOI 10.1038/s41467-017-01439-x
    Typ Journal Article
    Autor Moder M
    Journal Nature Communications
    Seiten 1238
    Link Publikation

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