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Synthese von Donor-Substraten der 4-Amino-4-desoxy-L-arabinose Transferasen

Synthesis of donor substrates for 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferases

Paul Kosma (ORCID: 0000-0001-5342-7161)
  • Grant-DOI 10.55776/P28826
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2016
  • Projektende 31.07.2019
  • Bewilligungssumme 349.960 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (85%); Gesundheitswissenschaften (15%)

Keywords

    Lipopolysaccharide, Glycosyl transferase, Synthesis, Glycophospholipid, Aminoarabinose

Abstract Endbericht

Viele Gram-negative Bakterien verfügen über effiziente Abwehrmechanismen gegenüber dem Immunsystem der jeweiligen Wirtsorganismen. Grundlegende Funktionen übt in diesem Zusammenhang die äußere Membran der bakteriellen Zellwand aus, die zahlreiche negativ geladene Substituenten in Form von Säure- bzw. Phosphathältigen Kohlenhydratstrukturen aufweist. Diese Barrierewirkung der bakteriellen Zellmembran wird jedoch insbesondere durch entgegengesetzt (positiv) geladene Eiweißverbindungen (Peptide) des angeborenen Immunsystems überwunden, wogegen sich viele Bakterien wiederum durch Einbau positiv geladener Aminozucker wie Aminoarabinose schützen und somit resistent werden. Von besonderer Bedeutung sind diese Membranmodifikationen in den pflanzenpathogenen Burkholderien, die landwirtschaftlich genutzt werden, aber in den letzten Jahren zunehmend Bedeutung als Humanpathogene erlangt haben. Die Besiedlung der Lunge mit Burkholderia cepacia führt zum drastischen Verfall der Lungenfunktion und in Form des Cepacia-Syndroms zu einem letalen Verlauf der Infektion. Die Multiresistenz vieler klinischer Isolate gegen die meisten gängigen Antibiotika ist eine weitere Besonderheit von Burkholderien. Die Enzyme, welche die Aminoarabinose auf das bakterielle Lipopolysaccharid übertragen sind noch sehr unvollständig charakterisiert, ebenso die an der Biosynthese beteiligten Enzyme die in mehreren Schritten die Aktivierung der Aminoarabinose in Form langkettiger Zuckerphosphat-Lipide als Substrat bewirken. Nachdem diese Verbindungen nur in sehr geringen Mengen aus natürlichen Quellen isolierbar sind, sollen durch chemische Synthese die nativen Substrate, Inhibitoren und eine Reihe von Fluoreszenz-markierten Derivaten hergestellt werden. Mit den Syntheseprodukten sollte auch zu klären sein, ob ein oder zwei unterschiedliche Enzyme die Aminoarabinose übertragen. Die zentralen Syntheseschritte sollen zunächst an kürzeren, einfachen Lipiden etabliert und in der Folge auf die komplexen lang-kettigen Lipide (Heptaprenol und Undekaprenol mit 35 bzw. 55 Kohlenstoffatomen) übertragen werden. Darüber hinaus sind auch Kohlenstoffverknüpfte Derivate (C- Phosphonate und monofluorierte C-Phosphonate) geplant, die den Aminoarabinose-Transfer blockieren sollen und damit die Wirksamkeit der antimikrobiellen Peptide wiederherstellen könnten. In Kooperation mit Miguel Valvano (Queens University Belfast, UK), der über langjährige Forschungserfahrung in der Mikrobiologie und Genetik von Burkholderien verfügt, sollen die in Wien synthetisierten Verbindungen getestet werden. Geeignete Inhibitoren und Substrate sollen in der Folge in Bindungsstudien (Kernresonanzspektroskopie, Röntgenkristallographie) eingesetzt werden. Insgesamt ist ein wesentlicher Beitrag zum Verständnis der Übertragung von Phospholipid-Zuckern auf die bakteriellen Akzeptorsubstrate mit weitreichenden Implikationen in der künftigen Therapie von multiresistenten Burkholderien und anderen Gram-negativen Pathogenen zu erwarten.

Viele Gram-negative Bakterien verfügen über effiziente Abwehrmechanismen gegenüber dem Immunsystem der jeweiligen Wirtsorganismen. Im Zusammenhang mit der zunehmenden Antibiotikaresistenz sind es vor allem negativ geladene Gruppen in der äußeren Membran der bakteriellen Zellwand, die von Komponenten des angeborenen Immunsystems und einigen Antibiotika gebunden werden, wogegen sich Bakterien durch Maskierung dieser Ladungen durch den Einbau positiv geladener Aminozucker wie Aminoarabinose schützen und somit resistent werden. Die Übertragung der Aminoarabinose durch die entsprechenden Transferasen ist noch wenig untersucht, zumal der für den Transfer erforderliche aktivierte Zucker in Form langkettiger Zuckerphosphat-Lipide nur in sehr geringen Mengen isoliert werden kann. Im Rahmen des Projekts wurde daher die chemische Synthese für diese Donorsubstrate eingesetzt, mit der Fragestellung ob auch vereinfachte und kürzere Lipid-Ketten von den Transferasen akzeptiert werden. Dabei wurde eine Substanzbibliothek mit sieben Phosphodiester-verknüpften Aminoarabinose-Donoren hergestellt aber auch Verbindungen, welche eine Kohlenstoff-Bindung am aktiven Zentrum des Kohlenhydrats aufweisen. Letztere Verbindungen können enzymatisch nicht umgesetzt werden, eignen sich daher als Inhibitoren der Transferreaktion und könnten somit die Wirksamkeit bestimmter Antibiotika wieder herstellen. Im Rahmen einer Kooperation mit der Gruppe von Miguel Valvano an der Queens University in Belfast wurde die Transferase aus pathogenen Burkholderien in Escherichia coli exprimiert und als Membranpräparation mit den Syntheseprodukten und einem Lipopolysaccharid aus E. coli als Akzeptor getestet. Die enzymatische Reaktion wurde über Dünnschichtchromatographie verfolgt und die Produkte mittels hochauflösender Massenspektrometrie strukturell charakterisiert. Von allen Syntheseprodukten konnte der Glykosyltransfer ausschließlich mit dem -Neryl Derivat beobachtet werden - was die allgemein hohe Spezifität von Glykosyltransferasen bestätigt - wobei mono- und disubstituierte Produkte gebildet wurden. Der Ort der Substitution an den 1- und 4'-Phosphaten des Lipid A Teils im Lipopolysaccharid-Akzeptor wurde sodann nach Säurehydrolyse der Kdo-Einheiten identifiziert. Mit dem einfachen kurzkettigen Donor steht nunmehr ein gut zugängliches Donorsubstrat zur Verfügung mit dem in der Folge biochemische Untersuchungen an weiteren Aminoarabinosetransferasen, Lipopolysaccharid-Akzeptoren sowie Bindungsstudien (Kernresonanzspektroskopie, Röntgen-strukturuntersuchungen) ermöglicht werden. Insgesamt ist ein wesentlicher Beitrag zum Verständnis der Übertragung von Phospholipid-Zuckern auf die bakteriellen Akzeptorsubstrate mit möglichen Implikationen in der künftigen Therapie von multiresistenten Burkholderien und anderen Gram-negativen Pathogenen gelungen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Miguel A. Valvano, Queen´s University Belfast - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 61 Zitationen
  • 14 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 4 Disseminationen
  • 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2020
    Titel Stereoelectronic Effects Impact Glycan Recognition
    DOI 10.1021/jacs.9b11699
    Typ Journal Article
    Autor Mcmahon C
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 2386-2395
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Synthesis of C-glycosyl phosphonate derivatives of 4-amino-4-deoxy-a-?-arabinose
    DOI 10.3762/bjoc.16.2
    Typ Journal Article
    Autor Kerner L
    Journal Beilstein Journal of Organic Chemistry
    Seiten 9-14
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Recent Trends in Carbohydrate Chemistry: Synthesis, Structure and Function of Carbohydrates
    Typ Book
    Autor Rauter
    Verlag Elsevier Science Publishing Co Inc
    Link Publikation
  • 2020
    Titel 4 Synthesis of lipopolysaccharide core fragments
    DOI 10.1016/b978-0-12-820954-7.00004-9
    Typ Book Chapter
    Autor Kosma P
    Verlag Elsevier
    Seiten 103-141
  • 2019
    Titel Synthetic Phosphodiester-Linked 4-Amino-4-deoxy-l-arabinose Derivatives Demonstrate that ArnT is an Inverting Aminoarabinosyl Transferase
    DOI 10.1002/cbic.201900349
    Typ Journal Article
    Autor Olagnon C
    Journal ChemBioChem
    Seiten 2936-2948
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Synthesis of 4-amino-4-deoxy-L-arabinose C-phosphonate esters as transferase inhibitors
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Kerner
    Konferenz Eurocarb 20, Leiden, June 30-July 04, 2019
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Synthesis and biological studies of phospho-lipid linked donor substrates for L-Ara4N transferases involved in Gram-negative bacterial antibiotic resistance
    Typ Other
    Autor Olagnon
  • 2019
    Titel Investigation of 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferases from Gram-negative bacteria involved in antibiotic resistance
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Olagnon
    Konferenz Eurocarb 20, Leiden, June 30-July 04, 2019
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Analysis fo bacterial arabinosyl transferase reaction products of Kdo2-lipid A by LC-ESI-MS
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Grünwald-Gruber
    Konferenz Austrian Proteomics and Metabolomics Research Symposium, 18-20 September 2019, Salzburg
  • 2018
    Titel Synthesis of donor substrates of 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferases
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Olagnon
    Konferenz 8th Baltic Meeting on Microbial Carbohydrates, Dublin, 09.09.2018 - 12.09.2018
  • 2018
    Titel Synthesis of 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase inhibitors
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Kerner
    Konferenz 29th International Carbohydrate Symposium, Lisbon, July 14-19, 2018
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Synthesis of donor substrates of 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferases.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Olagnon
    Konferenz 29th International Carbohydrate Symposium, Lisbon, July 14-19, 2018
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Synthesis towards donor substrates of 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferases
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Olagnon
    Konferenz 19th European Carbohydrate Symposium, Barcelona, July 2-6
  • 0
    Titel Synthesis of lipopolysaccharide core fragments; In: RECENT TRENDS IN CARBOHYDRATE CHEMISTRY: SYNTHESIS AND BIOMEDICAL APPLICATIONS OF GLYCANS AND GLYCOCONJUGATES Elsevier, Amsterdam,
    Typ Book Chapter
    Autor Kosma
    Verlag Elsevier
    Seiten 42
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 2019
    Titel Assay of ArnT reactions
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
Disseminationen
  • 2017
    Titel Chemie-Camp
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2019
    Titel newsletter of the International Innate Immunity and Endotoxin Society
    Typ A magazine, newsletter or online publication
  • 2017
    Titel LPS group meeting
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2016
    Titel seminar lecture
    Typ A talk or presentation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2018
    Titel Ehrenkreuz für Wissenschaft und Kunst 1. Klasse
    Typ Medal
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2018
    Titel Plenary lecture at 29th International Carbohydrate Symposium Lisbon, July 15-19, 2018, (http://www.ics2018.eventos.chemistry.pt/)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel RECENT TRENDS IN CARBOHYDRATE CHEMISTRY: SYNTHESIS AND BIOMEDICAL APPLICATIONS OF GLYCANS AND GLYCOCONJUGATES (Rauter, A; Christensen, B.; Somsak, L.; Kosma, P.; Adamo, R. eds.);
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Editor of the Book series: Carbohydrate Chemistry Proven Synthetic Methods
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2019
    Titel Molecular basis of cell wall polymer pyruvylation
    Typ Other
    Förderbeginn 2019

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