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Neue Verwandtschaftsmerkmale bei Oligotrichea (Ciliophora)

New Phylogenetic Features in Oligotrichea (Ciliophora)

Sabine Agatha (ORCID: 0000-0003-3083-9782)
  • Grant-DOI 10.55776/P28790
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2016
  • Projektende 30.06.2020
  • Bewilligungssumme 280.182 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Planktonic Ciliates, Molecular Phylogeny, Cladistic Analyses, Ultrastructure, Species Descriptions, Morphology

Abstract Endbericht

Ciliaten (Wimpertiere) sind mikroskopisch-kleine tierische Einzeller (< 1 mm). Die derzeit ca. 4.500 bekannten Arten stellen vermutlich nur einen winzigen Bruchteil (~ 20%) der tatsächlichen Vielfalt dar. Die Oligotrichea (griech. Die-wenig-Bewimperten) sind typische Plankton-Organismen, insbesondere der Meere. Sie umfassen ca. 190 gehäuselose Arten und etwa 1000 gehäusebauende Tintinnen-Arten. Im Nahrungsnetz des marinen Planktons spielen sie eine essentielle Rolle: die kugeligen oder kegeligen Oligo- trichea schwimmen mit ihren winzigen Wimpernfächern am Vorderende durch das Wasser, aus dem sie Bakterien und andere Einzeller, u.a. Algen, in großen Mengen herausfiltern. Sie selbst sind wiederum Futter für kleine Krebschen, der Nahrung einer Vielzahl von Fischlarven. In den vergangenen 20 Jahren haben morphologische und genetische Untersuchungen dazu beigetragen, viele neue Arten zu entdecken und die Verwandtschaftsbeziehungen zwischen ihnen neu zu formulieren. Nun zeigen genetischen Daten allerdings oft überraschende Verwandtschaftsbeziehungen, die sich nicht in der äußeren Ähnlichkeit, insbesondere der vasenförmigen Tintinnen-Gehäuse, widerspiegeln. Es werden also (neue) Zellmerkmale benötigt, um die morphologischen Verwandtschaftshypothesen mit den genetischen Stammbäumen in Einklang zu bringen. Die kaum erforschte Ultrastruktur, die anhand von hauchdünnen (0.00007 mm) Längs- und Querschnitten der Zellen im Transmissionselektronenmikroskop untersucht werden kann, ist dabei sehr vielversprechend. In dem Projekt werden daher neben der Beschreibung neuer und ungenügend bekannter Arten somit erstmals Ultrastrukturmerkmale zur Verwandtschaftsanalyse bei den Oligotrichea herangezogen. Diese neuartige, synergistische Herangehensweise kombiniert Lebendbeobachtung, die Untersuchung gefärbten Materials (zeigt u.a. die artspezifischen Bewimperungsmuster), elektronenmikroskopische Daten und genetische Analysen. Damitliefert das Projekt nicht nur Erkenntnisse über die Diversität und die Verwandtschaftsbeziehungen innerhalb der Oligotrichea, sondern auch neue Einblicke in generelle evolutionäre Prinzipien bei Protisten und die Entwicklung der Einzeller-Vielfalt. Insbesondere potenzielle morphologische Anpassungen der Organismen bei der Besiedlung des Süßwassers und der Umstellung der Ernährung auf eine Kombination aus Fressen und Fotosynthese stehen dabei im Fokus. Die Fähigkeit, Arten zu bestimmen und zu beschreiben, ist inzwischen in Europa und den USA selten geworden, aber unverzichtbar für ökologische Studien und das sogenannte Barcoding. Hierbei soll es auch Nicht- Spezialisten möglich sein, Arten durch den Vergleich kurzer Genabschnitte schnell und verhältnismäßig günstig zu identifizieren, was aber voraussetzt, dass die genetisch analysierten Referenz-Individuen zuvor von Experten verlässlich bestimmt wurden; erst dann ist diese Methode routinemäßigen einsetzbar. Im Rahmen des Projektes werden Master-Studierende und ein/e DoktorandIn in dem ganzen Spektrum morphologischer und genetischer Untersuchungstechniken ausgebildet und gehören damit zu den wenigen Experten weltweit für diese artenreiche Einzeller-Gruppe.

Neue Merkmale zur Verwandtschaftsanalyse bei planktischen Wimpertieren (Ciliaten, Einzeller) Ciliaten sind mikroskopisch-kleine tierische Einzeller (< 1 mm). Die derzeit ca. 4500 bekannten Arten stellen vermutlich nur ca. 20% der tatsächlichen Vielfalt dar. Die Oligotrichea sind typische Plankton-Organismen der Meere. Sie umfassen ca. 200 gehäuselose Arten und etwa 1000 gehäusebauende Tintinnen-Arten. Im Nahrungsnetz des marinen Planktons spielen sie eine essentielle Rolle: die Oligotrichea nutzen ihre winzigen Wimpernfächer am Vorderende nicht nur zum Schwimmen, sondern auch zum Filtrieren von Bakterien und anderen Einzellern. Sie selbst sind wiederum Futter für kleine Krebschen, der Nahrung vieler Fischlarven. In den letzten 20 Jahren haben morphologische und genetische Studien dazu beigetragen, viele neue Arten zu entdecken und Verwandtschaftshypothesen zu formulieren. Allerdings sind die genetischen Stammbäume oft nicht im Einklang mit der Morphologie oder statistisch abgesichert. Daher wurden neben zahlreichen neuen Gensequenzen, auch aussagekräftige Zellmerkmale für einen neuartigen integrativ-synergistischen Ansatz im Projekt analysiert; gemeinsam gestatten sie Rückschlüsse auf die Diversifizierung der Oligotrichea und ihrer morphologisch/ultrastrukturellen Anpassungen. Die Beschreibung einer Tintinnen-Art mittels Licht- und Rasterelektronenmikroskopie sowie genetischer Analysen enthüllte ein neues Bewimperungsmuster, das den Ursprung einer spezialisierten Wimpernreihe erklärt. Zur Untersuchung der nahezu unbekannten Ultrastruktur wurden die Zellen in hauchdünne (70 nm) Scheibchen geschnitten und im Transmissionselektronenmikroskop erforscht. Die Körperwimpern der Tintinnen zeigten dabei gänzlich neue Verankerungsstrukturen, die ein einzigartiges Netz in der Zellrinde ausbilden. Beide Strukturen stehen vermutlich mit der Entwicklung der vasenförmigen Gehäuse in Zusammenhang, in denen die Tintinnen sitzen und nur mit den Wimpernfächern herausschauen. Die Untersuchung der Mundbewimperungen gab ebenfalls überraschende Einblicke in die Evolution der Oligotrichea, deren nächste Verwandte auf dem Untergrund krabbeln und die Wimpernfächer lediglich zum Nahrungserwerb nutzen. Erstaunlicherweise hatte weder die neuerworbene Schwimmfunktion bei den Oligotrichea noch der Besitz eines Gehäuses bei den Tintinnen einen Effekt auf die Ultrastruktur der Wimpernfächer, sondern nur deren kreisförmige Anordnung am Zellvorderende einiger nahverwandter Arten. Die Erforschung der Gehäuse-Ultrastruktur bei fast 40 Tintinnen-Arten demonstrierte deren Relevanz als Merkmal gemeinsamer Abstammung. Erkenntnisse in generelle evolutionäre Prinzipien bei Protisten, insbesondere morphologisch/ultrastrukturelle Anpassungen an das Süßwasser wurden bei der Analyse eines gehäuselosen Vertreters gewonnen: eine außergewöhnliche Struktur reguliert hier die Cytoplasma-Konzentration.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Salzburg - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Mona Hoppenrath, Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN) - Deutschland
  • Thorsten Stoeck, Universität Kaiserslautern - Deutschland
  • John R. Dolan, Observatoire Océanologique - Frankreich
  • Alfred Beran, Istituto Nazionale di Oceanografia e di Geofisica Sperimentale (OGS) - Italien
  • Thomas Posch, University of Zurich - Schweiz

Research Output

  • 97 Zitationen
  • 32 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 4 Disseminationen
  • 13 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2022
    Titel A light and electron microscopical study on the resting cyst of the tintinnid Schmidingerella (Alveolata, Ciliophora) including a phylogeny-aware comparison
    DOI 10.1016/j.ejop.2022.125922
    Typ Journal Article
    Autor Ganser M
    Journal European Journal of Protistology
    Seiten 125922
  • 2020
    Titel Phylogenetic comparison of the oral ultrastructures within the Perilemmaphora (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Gruber M.
    Konferenz XXXIX. Congress of the German Society for Protozoology, Kaiserslautern, Germany
    Seiten 75
  • 2022
    Titel A comparative ultrastructural study of tintinnid loricae (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) and a hypothesis on their evolution
    DOI 10.1111/jeu.12877
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Somatic infraciliature in tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha): An ultrastructural comparison*
    DOI 10.1111/jeu.12885
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A comparative ultrastructural study on the nanoscale extrusomes of tintinnids (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) and their phylogenetic significance
    DOI 10.1016/j.ejop.2022.125953
    Typ Journal Article
    Autor Ganser M
    Journal European Journal of Protistology
    Seiten 125953
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Tintinnid's first top model: Ultrastructural insights into the oral ciliature of Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XIII. NOBIS Congress, Salzburg, Austria
    Seiten 18
  • 2019
    Titel The significance of the lorica matrix for inferring tintinnid phylogeny (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XIII. NOBIS Congress, Salzburg, Austria
    Seiten 11
  • 2019
    Titel Unique kinetid ultrastructure in the tintinnid ciliate Schmidingerella meunieri and its phylogenetic implications
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 82
  • 2019
    Titel The significance of the lorica matrix for inferring tintinnid phylogeny (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 12
  • 2019
    Titel Tintinnid's first top model: ultrastructural insights into the oral ciliature of Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 124
  • 2019
    Titel The biology and systematics of oligotrichean ciliates (Alveolata, Ciliophora): new findings and old concepts
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 3
  • 2019
    Titel Tintinnid's first top model: ultrastructural insights into the ciliature of Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna
    Seiten 61
  • 2019
    Titel Tricky trees - problematic inference of relationships in Oligotrichea (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna, Austria
    Seiten 15
  • 2018
    Titel A new type of somatic kinetid and cortical network in the model tintinnid Schmidingerella meunieri and a scenario of character evolution (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XII. NOBIS Congress, Bozen, Italy
    Seiten 13
  • 2018
    Titel Phylogenetic significance of ultrastructural features in the planktonic freshwater ciliate Limnostrombidium viride (Alveolata, Ciliophora, Oligotrichida)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XII. NOBIS Congress, Bozen, Italy
    Seiten 8
  • 2018
    Titel Testing the kinetid transformation hypothesis in choreotrichid ciliates: first ultrastructural data on dikinetids in a tintinnid (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Gruber M.
    Konferenz XXXVII. Congress of the German Society for Protozoology, Cologne, Germany
    Seiten 64
  • 2016
    Titel Three rDNA Loci-Based Phylogenies of Tintinnid Ciliates (Ciliophora, Spirotrichea, Choreotrichida)
    DOI 10.1111/jeu.12354
    Typ Journal Article
    Autor Zhang Q
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Seiten 226-241
    Link Publikation
  • 2016
    Titel The "Rapunzel tintinnid" - redescription of Tintinnopsis subacuta JÖRGENSEN, 1899 (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Kagerer M.
    Konferenz Moscow Forum "Protist - 2016"
    Seiten 48-49
    Link Publikation
  • 2016
    Titel The beginning: inference of the tintinnid ancestor's morphology (Alveolata, Spirotricha, Tintinnina)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz Moscow Forum "Protist - 2016"
    Seiten 20-21
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Biodiversity studies in loricate protists: the case of tintinnids (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz Moscow Forum "Protist - 2016"
    Seiten 6
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Best practice in description and documentation of ciliate biodiversity (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz X. NOBIS Congress, Linz, Austria
    Seiten 11
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Some Ultrastructural Features of the Planktonic Freshwater Ciliate Limnostrombidium viride (Alveolata, Ciliophora, Oligotrichida) and Improved Diagnoses of Oligotrich Taxa
    DOI 10.4467/16890027ap.18.014.10090
    Typ Journal Article
    Autor Bardele C
    Journal Acta Protozoologica
    Seiten 169-193
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Ultrastructural Studies on a Model Tintinnid - Schmidingerella meunieri (Kofoid and Campbell, 1929) Agatha and Strüder-Kypke, 2012 (Ciliophora). I. Somatic Kinetids with Unique Ultrastructure
    DOI 10.4467/16890027ap.18.015.10091
    Typ Journal Article
    Autor Gruber M
    Journal Acta Protozoologica
    Seiten 195-214
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Redescription of Tintinnopsis everta Kofoid and Campbell 1929 (Alveolata, Ciliophora, Tintinnina) Based on Taxonomic and Genetic Analyses—Discovery of a New Complex Ciliary Pattern
    DOI 10.1111/jeu.12496
    Typ Journal Article
    Autor Gruber M
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Seiten 484-504
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Symposium on Ciliates in Memory of Denis Lynn
    DOI 10.1016/j.ejop.2020.125694
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal European Journal of Protistology
    Seiten 125694
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Ultrastructural Studies on a Model Tintinnid – Schmidingerella meunieri (Kofoid & Campbell, 1929) Agatha & Strüder-Kypke, 2012 (Ciliophora). II. The Oral Apparatus
    DOI 10.1111/jeu.12795
    Typ Journal Article
    Autor Gruber M
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Seiten 463-479
    Link Publikation
  • 2014
    Titel T-Wave Variability for the Prediction of Fast Ventricular Arrhythmias
    DOI 10.1253/circj.cj-14-1028
    Typ Journal Article
    Autor Stojkovic S
    Journal Circulation Journal
    Seiten 318-324
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MSF: Modulated Sub-graph Finder
    DOI 10.12688/f1000research.16005.1
    Typ Journal Article
    Autor Farman M
    Journal F1000Research
    Seiten 1346
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Morphology of Tintinnopsis everta (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) suggests homology of posterior and second dorsal kinety
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Gruber M.
    Konferenz 2nd Young Researchers' Day 2017 of NOBIS Austria, Vienna, Austria
    Seiten 13
  • 2017
    Titel Morphology of Tintinnopsis everta (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) suggests homology of posterior and second dorsal kinety
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Gruber M.
    Konferenz XV. International Congress of Protistology, Prague, Czech Republic
    Seiten 253
  • 2017
    Titel The morphology of Tintinnidium mucicola (Claparède & Lachmann, 1858) Daday, 1887 and its implications for the genus Tintinnidium Kent 1881 (Alveolata, Ciliophora, Tintinnida)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XXXVI. Congress of the German Society for Protozoology, Meißen, Germany
    Seiten 58
  • 2017
    Titel Recommendations for the description and documentation of ciliate biodiversity (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XXXVI. Congress of the German Society for Protozoology, Meißen, Germany
    Seiten 48
Methoden & Materialien
  • 0
    Titel Fixation of marine planktonic ciliates for transmission electron microscopy
    Typ Biological samples
    Öffentlich zugänglich
Disseminationen
  • 2017 Link
    Titel Wissensmonat - Jetzt Zukunft erleben
    Typ A talk or presentation
    Link Link
  • 2019
    Titel Protists Diversity and Ecology in Aquatic and Terrestrial Ecosystems" organized by Université de Neuchâtel, Neuchâtel, Switzerland
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2017
    Titel Open house of the University of Salzburg
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2016 Link
    Titel Istituto Nazionale di Oceanografia e di Geofisica Sperimentale, Trieste, Italy
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel Plenary talk at XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Symposium on Ciliates in Memory of Denis Lynn
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Poster prize
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2019
    Titel Protists Diversity and Ecology in Aquatic and Terrestrial Ecosystems
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2019
    Titel Ciliates (Ciliophora) and other protists in the marine plankton
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2019
    Titel Second prize for the oral presentation
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel First poster prize
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Publication of the Month
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2017
    Titel Award by the International Society of Protistology
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2017
    Titel Associated Editor for Journal of Eukaryotic Microbiology
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2016
    Titel Taxonomy of marine planktonic protists - Ciliophora
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2016
    Titel The International Research Coordination Network for Biodiversity of Ciliates
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2016
    Titel President of the Network of Biological Systematics (NOBIS) Austria
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad National (any country)

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