SDR5C1: ein multifunktionelles Protein und seine pathogene Rolle
SDR5C1: a multifunctional protein in health and disease
Wissenschaftsdisziplinen
Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (100%)
Keywords
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Mitochondrial disease,
Transfer RNA (tRNA),
Short-chain dehydrogenase/reductase,
RNA processing,
MHBD deficiency,
HSD10 disease
SDR5C1 ist ein multifunktionelles, mitochondriales Protein. Aufgrund seiner Struktur wird es zu der großen, in allen Lebensformen vorkommenden Enzymfamilie der Kurzkettendehydrogenasen/-reduktasen gezählt. Als Dehydrogenase ist SDR5C1 am Abbau der Aminosäure Isoleucin und kurzer, verzweigtkettiger Fettsäuren beteiligt. Gemeinsam mit dem Protein TRMT10C bildet es eine Methyltransferase, die für die Modifikation mitochondrialer Transfer-RNAs (tRNAs) verantwortlich ist. Mit einem weiteren Protein, PRORP, bildet dieser Methyltransferase- Komplex eine tRNA-prozessierende Nuklease, die Ribonuklease P genannt wird. Neben seiner Rolle im Aminosäure- und Fettsäuremetabolismus, hat SDR5C1 damit noch eine wichtige Funktion bei der Biosynthese mitochondrialer tRNAs, die für die Herstellung von Proteinen der mitochondrialen Atmungskette, und damit der zelluläre Energieproduktion benötigt werden. Mutationen im SDR5C1-Gen können eine schwere Erkrankung des Zentralnervensystems und des Herzens verursachen. In betroffenen Knaben (das Gen liegt auf dem X-Chromosom) manifestiert sich die Erkrankung etwa im Alter von einem Jahr. Kognitive und motorische Fähigkeiten lassen schnell nach, die Patienten erblinden, leiden an Epilepsie und weisen eine zunehmende Gehirnatrophie auf. Diese neurologischen Symptome werden von einer schweren, progressiven Kardiomyopathie begleitet. Die Patienten sterben meist im dritten oder vierten Lebensjahr. Wegen erhöhter Konzentrationen von Zwischenprodukten des Isoleucin-Abbaus im Urin der Patienten wurde die Erkrankung zunächst als metabolische Erkrankung eingestuft und als 2-Methyl-3-Hydroxybutyryl-CoA- Dehydrogenase-Mangel (MHBD-Mangel) klassifiziert. Symptome, klinischer Verlauf und neuere experimentelle Untersuchungen legen nahe, daß die Erkrankung ihre Ursache tatsächlich aber in einer Fehlfunktion der mitochondrialen Atmungskette hat, und nicht in einer Insuffizienz des Isoleucin-Stoffwechsels. Ziel des Projekts ist es den Pathomechanismus der durch Mutationen im SDR5C1-Gen verursachten Erkrankungen aufzuklären. Wir vermuten, daß Störungen der Funktion von SDR5C1 bei der Biosynthese mitochondrialer tRNAs für eine Unterfunktion der mitochondrialen Atmung, und damit für die Erkrankung verantwortlich sind. Diese Hypothese wollen wir mit biochemischen Methoden und mit Hilfe eines neuartigen, durch "Genome-Engineering" aus menschlichen Zellen in Kultur hergestellten Erkrankungsmodels überprüfen.
SDR5C1 ist ein Enzym des Aminosäure- und Fettsäure-Abbaus, und darüber hinaus eine Untereinheit der mitochondrialen Ribonuklease P (RNase P), welche ein Schlüsselenzym der Transfer-RNA (tRNA) Biogenese ist. Ein Teilkomplex der mitochondrialen RNase P, der auch SDR5C1 enthält, katalysiert die spezifische chemische Modifikation mitochondrialer tRNAs. Diese Modifikation wird für die strukturelle Stabilisierung letzterer verantwortlich gemacht. Mutationen im SDR5C1-kodierenden Gen verursachen eine kombinierte schwere Erkrankung des Zentralnervensystems und des Herzens; diese seltene Erkrankung wird heute als HSD10-Erkranknung bezeichnet. Im Rahmen dieses Projekts untersuchten wir die Auswirkung ausgewählter Mutationen auf die verschiedenen Funktionen von SDR5C1. So konnten wir zeigen, dass pathogene (Erkrankungen verursachende) Mutationen nicht nur, wie bereits zuvor bekannt, den SDR5C1-abhängigen Abbau von bestimmten Aminosäuren und Fettsäuren beeinträchtigen, sondern auch die in der tRNA-Biosynthese wichtige Spaltung und chemische Modifikation von tRNA-Vorstufen. Letztere, neu entdeckte Störung vermag nun tatsächlich viel besser den molekularen Mechanismus zu erklären, welcher offenbar der Fehlfunktion der Mitochondrien in HSD10-Patienten zugrunde liegt, als das die schon zuvor beobachtete Störung des Aminosäure- und Fettsäure-Abbaus vermochte. Genauer betrachtet zeigte sich, dass die untersuchten Mutationen die Struktur von SDR5C1 verändern und/oder seine Interaktion mit den anderen Untereinheiten des mitochondrialen RNase P-Komplexes stören oder unterbinden, was die Beeinträchtigung der Enzymaktivitäten nach sich zieht und letztlich zu der in den Patienten beobachteten mitochondrialen Fehlfunktion führt. Abgesehen davon führte das Projekt auch zu wichtigen konzeptionellen Fortschritten im Verständnis der molekularen Mechanismen des mitochondrialen RNase P-Multienzymkomplexes, nämlich wie und warum drei Proteine mit völlig verschiedenen enzymatischen Aktivitäten nur gemeinsam ihr tRNA-bezogenen katalytischen Funktionen wahrnehmen können.
Research Output
- 750 Zitationen
- 8 Publikationen
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2019
Titel YBEY is an essential biogenesis factor for mitochondrial ribosomes DOI 10.1101/2019.12.13.874362 Typ Preprint Autor Summer S Seiten 2019.12.13.874362 Link Publikation -
2016
Titel A novel HSD17B10 mutation impairing the activities of the mitochondrial RNase P complex causes X-linked intractable epilepsy and neurodevelopmental regression DOI 10.1080/15476286.2016.1159381 Typ Journal Article Autor Falk M Journal RNA Biology Seiten 477-485 Link Publikation -
2015
Titel Molecular insights into HSD10 disease: impact of SDR5C1 mutations on the human mitochondrial RNase P complex DOI 10.1093/nar/gkv408 Typ Journal Article Autor Vilardo E Journal Nucleic Acids Research Seiten 5112-5119 Link Publikation -
2017
Titel The m1A landscape on cytosolic and mitochondrial mRNA at single-base resolution DOI 10.1038/nature24456 Typ Journal Article Autor Safra M Journal Nature Seiten 251-255 -
2017
Titel A homozygous variant in mitochondrial RNase P subunit PRORP is associated with Perrault syndrome characterized by hearing loss and primary ovarian insufficiency DOI 10.1101/168252 Typ Preprint Autor Hochberg I Seiten 168252 Link Publikation -
2023
Titel Cleavage kinetics of human mitochondrial RNase P and contribution of its non-nuclease subunits DOI 10.1093/nar/gkad713 Typ Journal Article Autor Vilardo E Journal Nucleic Acids Research Seiten 10536-10550 Link Publikation -
2020
Titel Functional characterization of the human tRNA methyltransferases TRMT10A and TRMT10B DOI 10.1093/nar/gkaa353 Typ Journal Article Autor Vilardo E Journal Nucleic Acids Research Link Publikation -
2020
Titel YBEY is an essential biogenesis factor for mitochondrial ribosomes DOI 10.1093/nar/gkaa148 Typ Journal Article Autor Summer S Journal Nucleic Acids Research Seiten 9762-9786 Link Publikation