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Bioklebstoffe und Funktionelle Genomik in Plattwürmern

BIOADHESION MEETS FUNCTIONAL GENOMICS IN FLATWORMS

Peter Ladurner (ORCID: 0000-0002-0323-9266)
  • Grant-DOI 10.55776/P25404
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.02.2013
  • Projektende 30.11.2017
  • Bewilligungssumme 330.857 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (85%); Physik, Astronomie (15%)

Keywords

    Duo Gland System, Flatworms, Adhesion, Biological adhesives, Bio-Inspired Adhesives

Abstract Endbericht

Klebstoffe werde heutzutage in vielen Bereichen der Industrie und Medizin verwendet. Klebstoffe in der Medizin werden u.a. für Implantate, als Gewebekleber, in der Zahnmedizin und für Wundverschlüsse eingesetzt. Diese Klebstoffe sind nicht biokompatibel und können giftige Substanzen in den Köper entlassen und Hautschäden, allergische Reaktionen und Atmungsprobleme verursachen. Daher ist die Biokompatibilität von Klebstoffen eine kritische Eigenschaft in der Entwicklung neuer medizinischer Kleber. Neue biomimetische Klebstoffe die auf natürliche Kleber von Pflanzen oder Tieren basieren sind daher von großer Wichtigkeit. Die meisten Organismen produzieren jedoch nur kleine Mengen an Klebstoffen die dadurch schwer zu identifizieren und analysieren sind. Darüber hinaus sind diese Organismen keine Modellsysteme die entsprechende detaillierte Untersuchungen erlauben würden. Im vorgeschlagenen Projekt ist es das Ziel Moleküle zu identifizieren die für die Anheftung und Loslösung des Plattwurmes Macrostomum lignano eine zentrale Rolle spielen. M. lignano eignet sich besonders für die Forschungen an neuen Klebsoffen. Die Tiere besitzen ein Zwei-Drüsen-Klebesystem das es den Tieren erlaubt sich im Meerwasser sehr schnell anzuheften und wieder loszulassen. Für M. lignano haben wir eine wichtige Sammlung von Methoden entwickelt die es erlauben das Klebesystem zu untersuchen. Darüber hinaus haben wir uns eine hervorragende Kenntnis der Morphologie der Schwanzplatte, dem Sitz des Zwei-Drüsen-Klebesystems, erarbeitet. Im vorgeschlagenen Projekt wird die Anzahl der Gene die für die Anheftung und Loslösung eine Rolle spielen können graduell eingeengt. Zuerst werden wir ein Schwanzplatten-spezifisches Transkriptom erstellt und dann wird die Expression dieser Gene untersucht. Im nächsten Schritt werden diese Gene mit RNA Interferenz ausgeschaltet um ihre Funktion zu festzustellen. Von den entsprechenden Genen werden Proteine hergestellt und polykonale Antikörper produziert um die Proteine von M. lignano zu isolieren. Mit Massenspektrometrie werden anschließend Modifikationen dieser Proteine untersucht. Darüber hinaus werden Lectinfärbungen durchgeführt um Kohlenhydrat Komponenten im Klebesystem nachzuweisen. In einem Pilotversuch habe wir die Expression von 50 Genen untersucht. Wir konnten fünf Gene identifizieren die im Zwei-Drüsen-Klebesystem eine Rolle spielen dürften. Ein Gen davon, das für Intermediär-Filamente codiert, haben wir mit RNAi ausgeschaltet wodurch die Tiere sich nicht mehr anheften konnten. Ultrastrukturelle Untersuchungen zeigten, daß das Zytoskelett dieser Zellen stark modifiziert ist. Mit diesem funktionellen Genomik Ansatz ist dieses Projekt in vorderster Reihe auf dem Gebiet der Erforschung von Bioklebstoffen. Wir verbinden die Vorteile der Biologie der Tiere und deren besonderen Klebe-Loslasssystems mit den entwickelten Methode für M. lignano und der Expertise internationale Kooperationspartner um in Zukunft neuartige Klebstoffe basierend auf dem M. lignano Anheftungs-Loslass-Mechanismus entwickeln zu können.

Klebstoffe, die vom Menschen produziert werde finden breite Verwendung in unserem Leben, unter anderem in der Medizin und in der Industrie. Diese Kleber beinhalten jedoch toxische und karzinogene Komponenten. Im Gegensatz dazu sind biologische Klebstoffe von Tieren nicht toxisch, gewebekompatibel, und funktionieren unter feuchten oder nassen Bedingungen. Über die Klebemechanismen von Tieren ist jedoch nur sehr wenig bekannt. In diesem Projekt war es das Ziel, die Funktionsweise der Klebe- und Loslass-Moleküle vom Plattwurm Macrostomum lignano aufzuklären. Macrostomum lignano besitzt ein Zwei-Drüsen Klebesystem mit dem sich die Tiere an jeder beliebigen Oberfläche im Meerwasser festhalten und wieder loslassen kann. Dieses Klebesystem besteht aus 130 Klebeorganen. Jedes dieser Klebeorgane besteht aus drei Zellen: eine Klebedrüse, einer Loslassdrüse und einer Stützzelle, genannt Ankerzelle. Wir haben die Morphologie der Klebeorgane im Detail beschrieben und die involvierten Proteine mit modernsten zell- und molekularbiologischen Methoden identifiziert. Die gewonnenen Daten erlauben es, eine erste Beschreibung der Mechanismen die bei der Anheftung und dem Loslassen eine Rolle spielen, abzugeben. Zukünftige Arbeiten sollen es ermöglichen, einen Macrostomum-basierten Klebstoff zu entwickeln, der in der Biomedizin oder in der Industrie eingesetzt werden kann.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 95%
  • Medizinische Universität Innsbruck - 5%
Nationale Projektbeteiligte
  • Herbert Lindner, Medizinische Universität Innsbruck , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Patrick Flammang, Université de Mons - Belgien
  • Eugene Berezikov, European Research Institute for the Biology of Ageing - Niederlande
  • Lukas Schärer, Universität Basel - Schweiz

Research Output

  • 877 Zitationen
  • 20 Publikationen
Publikationen
  • 2018
    Titel A targeted in situ hybridization screen identifies putative seminal fluid proteins in a simultaneously hermaphroditic flatworm
    DOI 10.1186/s12862-018-1187-0
    Typ Journal Article
    Autor Weber M
    Journal BMC Evolutionary Biology
    Seiten 81
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Profiling of adhesive-related genes in the freshwater cnidarian Hydra magnipapillata by transcriptomics and proteomics
    DOI 10.1080/08927014.2016.1233325
    Typ Journal Article
    Autor Rodrigues M
    Journal Biofouling
    Seiten 1115-1129
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Salinity stress from the perspective of the energy-redox axis: Lessons from a marine intertidal flatworm
    DOI 10.1016/j.redox.2016.09.012
    Typ Journal Article
    Autor Rivera-Ingraham G
    Journal Redox Biology
    Seiten 53-64
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Adhesive organ regeneration in Macrostomum lignano
    DOI 10.1186/s12861-016-0121-1
    Typ Journal Article
    Autor Lengerer B
    Journal BMC Developmental Biology
    Seiten 20
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Experimental strategies for the identification and characterization of adhesive proteins in animals: a review
    DOI 10.1098/rsfs.2014.0064
    Typ Journal Article
    Autor Hennebert E
    Journal Interface Focus
    Seiten 20140064
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Efficient transgenesis and annotated genome sequence of the regenerative flatworm model Macrostomum lignano
    DOI 10.1038/s41467-017-02214-8
    Typ Journal Article
    Autor Wudarski J
    Journal Nature Communications
    Seiten 2120
    Link Publikation
  • 2017
    Titel A platform for efficient transgenesis in Macrostomum lignano, a flatworm model organism for stem cell research
    DOI 10.1101/151654
    Typ Preprint
    Autor Wudarski J
    Seiten 151654
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Mechanical adaptability of sea cucumber Cuvierian tubules involves a mutable collagenous tissue
    DOI 10.1242/jeb.145706
    Typ Journal Article
    Autor Demeuldre M
    Journal Journal of Experimental Biology
    Seiten 2108-2119
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Organ specific gene expression in the regenerating tail of Macrostomum lignano
    DOI 10.1016/j.ydbio.2017.07.021
    Typ Journal Article
    Autor Lengerer B
    Journal Developmental Biology
    Seiten 448-460
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Papillae revisited and the nature of the adhesive secreting collocytes
    DOI 10.1016/j.ydbio.2018.11.012
    Typ Journal Article
    Autor Zeng F
    Journal Developmental Biology
    Seiten 183-198
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Integrative Transcriptome and Proteome Analysis of the Tube Foot and Adhesive Secretions of the Sea Urchin Paracentrotus lividus
    DOI 10.3390/ijms21030946
    Typ Journal Article
    Autor Pjeta R
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 946
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Sex allocation plasticity on a transcriptome scale: Socially sensitive gene expression in a simultaneous hermaphrodite
    DOI 10.1111/mec.15077
    Typ Journal Article
    Autor Ramm S
    Journal Molecular Ecology
    Seiten 2321-2341
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A mechanism for temporary bioadhesion
    DOI 10.1073/pnas.1814230116
    Typ Journal Article
    Autor Wunderer J
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 4297-4306
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Sea star tenacity mediated by a protein that fragments, then aggregates
    DOI 10.1073/pnas.1400089111
    Typ Journal Article
    Autor Hennebert E
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 6317-6322
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Biological adhesion of the flatworm Macrostomum lignano relies on a duo-gland system and is mediated by a cell type-specific intermediate filament protein
    DOI 10.1186/1742-9994-11-12
    Typ Journal Article
    Autor Lengerer B
    Journal Frontiers in Zoology
    Seiten 12
    Link Publikation
  • 2016
    Titel The cellular basis of bioadhesion of the freshwater polyp Hydra
    DOI 10.1186/s40850-016-0005-7
    Typ Journal Article
    Autor Rodrigues M
    Journal BMC Zoology
    Seiten 3
    Link Publikation
  • 2015
    Titel An integrated transcriptomic and proteomic analysis of sea star epidermal secretions identifies proteins involved in defense and adhesion
    DOI 10.1016/j.jprot.2015.07.002
    Typ Journal Article
    Autor Hennebert E
    Journal Journal of Proteomics
    Seiten 83-91
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Positional RNA-Seq identifies candidate genes for phenotypic engineering of sexual traits
    DOI 10.1186/s12983-015-0106-0
    Typ Journal Article
    Autor Arbore R
    Journal Frontiers in Zoology
    Seiten 14
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Genome and transcriptome of the regeneration-competent flatworm, Macrostomum lignano
    DOI 10.1073/pnas.1516718112
    Typ Journal Article
    Autor Wasik K
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 12462-12467
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Molecular biology approaches in bioadhesion research
    DOI 10.3762/bjnano.5.112
    Typ Journal Article
    Autor Rodrigues M
    Journal Beilstein Journal of Nanotechnology
    Seiten 983-993
    Link Publikation

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