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Strukturelle Charakterisierung von Typ 3-Kupferproteinen

Structural studies of type 3 copper proteins

Annette Rompel (ORCID: 0000-0002-5919-0553)
  • Grant-DOI 10.55776/P25217
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2013
  • Projektende 31.12.2017
  • Bewilligungssumme 281.610 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (75%); Chemie (25%)

Keywords

    Type 3 Copper Center, Activation Of Enzymes, Polyphenol Oxidases, Reaction Mechnaism, X-ray structure analysis, Food Industry

Abstract Endbericht

Polyphenoloxidasen sind allgegenwärtig in vielen Organismen, wie Bakterien, Pilzen Pflanzen und auch Menschen vorhanden. Die Funktion dieser Proteine (Tyrosinase, Catecholoxidase und Aureusidinsynthase) besteht in der Oxidation von phenolischen Substraten. Die Enzyme beinhalten ein Typ III Kupferzentrum. Polyphenoloxidasen werden in vivo in ihrer latenten Form hergestellt und weiter in eine aktive Form prozessiert. Tyrosinase katalysiert zwei Reaktionen (Hydroxilierung und Oxidation) im Rahmen der Bildung von braunen Pigmenten (z.B. Melanine). Aureusidinsynthase katalysiert eine Hydroxilierung und Oxidation von o- diphenolischen Chalkonen zu den zugehörigen Auronen. Diese Aurone sind verantwortlich für die gelbe Blütenfärbung in Asteraceae. Das Projekt soll einen fundamentalen Beitrag zum molekularen Verständnis der Funktion der Polyphenoloxidasen leisten. Die Ziele des Antrages sind die Kristallstrukturen von mehreren unterschiedlichen Polyphenoloxidasen- Isoformen (hier Tyrosinase aus Champignons und Aureusidinsynthase aus Mädchenauge) in ihren latenten und ihren proteolytisch aktivierten Formen zu untersuchen. Zur Untersuchung der Struktur und des Aktivierungsprozesses von Polyphenoloxidasen wird eine Kombination von Proteinisolierung, biochemischer Charakterisierung, molekularbiologischen Methoden und der Röntgenstrukturanalyse eingesetzt. Rekombinant hergestellte Tyrosinase und Aureusidinsynthase soll hohe Konzentrationen an reinem Protein liefern. Gegenwärtig sind fünf Gensequenzen (PPO 1 - 5) der Tyrosinase aus Champignons bekannt. Nur die aktive Form (bestehend aus den Aminosäureresten 2-392 von insgesamt 576) von PPO3 ist derzeit kristallographisch bekannt. Demzufolge gibt es keine ausreichende Charakterisierung von PPO 1, 2, 4 und 5 in der aktiven Form und von allen latenten Formen der PPO 1 bis 5. Die Sequenzanalyse der fünf PPOs aus Champignons zeigt große Unterschiede was Sequenzlänge und Glykolysierung betrifft. Insbesondere zeigt PPO4 ein um 35 Aminosäuren längeres C-Ende. Diese 35 Aminosäuren sind sehr hydrophob. PPO4 gilt unser größtes Interesse. Eine röntgenographische Charakterisierung der Ausreusidinsynthase liegt bis heute nicht vor. Neben dem Aktivierungsprozess sollen Aureusdinsynthasekristalle mit unterschiedlichen Substraten co-kristallisiert werden, um die hohe Substratspezifität des Enzyms zu studieren und zu verstehen, wie Selektivität in enzymatischen Reaktionen realisiert wird. Zudem erwarten wir über dieses Projekt Reaktionsmechanismen für Polyphenoloxidasen favorisieren oder ausschließen zu können.

Polyphenoloxidasen (PPOs) sind eine Gruppe von Typ 3-Kupfer Metalloenzymen zu denen Tyosinasen (Tyrs), Catecholoxidasen (COs) und Auronsynthase (AUS) gehören. Tyrs katalysieren die ortho-Hydroxylierung von Monophenolen (Monophenolase Aktivität) und die da- rauffolgende Oxidation der entstehenden ortho-Diphenole zu ortho-Chinone (Diphenolase Aktivität), wohingegen COs nur die letztere Reaktion katalysieren können. Die ortho-Chinone sind hochreaktiv Ausgangsverbindungen für die Biosynthese von Melanin. AUS katalysiert die Synthese von Auronen ausgehend von Chalkonen und ist somit an der Gelbfärbung von einigen Zierpflanzen beteiligt. Unsere Forschungsziele waren die Produktion der Pilztyrosi- nase aus Agaricus bisporus (abPPO4) und der Auronsynthase aus Coreopsis grandiflora (cgAUS1) in möglichst hoher Ausbeute und deren biochemische und strukturelle Charakterisierung, um Erkenntnisse über den katalytischen Mechanismus von PPOs zu erhalten. Wir haben effiziente Extraktions- und Reinigungsprotokolle für die Isolierung beider Enzyme aus ihrer jeweiligen natürlichen Quellen entwickelt. Später haben wir Protokolle für die hocheffiziente Expression und Aufreinigung der Enzyme in rekombinanter Form erstellt, die ausreichende Mengen an Enzym für weitere Charakterisierungen lieferten. Beide Enzyme wurden sowohl in ihrer latenten als auch aktiven Form biochemisch charakterisiert und die Ergebnisse lieferten die exakte Schnittstelle an der Domäne, die das aktive Zentrum abdeckt. Die kinetische Charakterisierung der Substratspezifität von cgAUS ergab, dass sich cgAUS in mehrerer Hinsicht von anderen Enzymklassen unterscheidet und deswegen wurde cgAUS letztendlich als Auronsynthase klassifiziert, was diese zu einer neuen, speziellen Untergruppe der PPOs macht. Interessanterweise, war cgAUS, von der man glaubte sie besäße ähnlich wie COs keine Hydroxylase-Aktivität, da sie keine typischen Substrate der Tyrosinase (z.B. Tyrosin) umsetzen kann, aktiv auf das natürliche Monphenol-Substrat Isoliquiritigenin. Kristallisationsexperimente lieferten die Kristallstruktur einer latenten pflanzlichen PPO (cgAUS1) und führten zur ersten Veröffentlichung eines heterogenen Kristalls, der die aktive als auch latente Form einer Pilztyrosinase (abPPO4) in einer einzigen Kristallstruktur enthält. Die Analyse ergab, dass alle strukturell bekannten PPOs sehr ähnliche aktive Zentren besitzen, weshalb es schwierig ist, strukturelle Merkmale für die Substratspezifizität zu bestimmen. Jedoch zeigten Molecular Dynamics Studien mit verschiedenen Substraten an cgAUS, dass Aminosäuren, die am Eingang zum aktiven Zentrum liegen, eine entscheidende Rolle bei der Substratspezifizität spielen, da sie abhängig von der Struktur des Substrats dessen Position innerhalb des aktiven Zentrums entweder stabilisieren oder destabilisieren. Wir haben einen neuen Mechanismus für die katalytische Reaktion von PPOs vorgeschlagen, der sich auf diese Substrat-stabilisierenden/destabilisierenden Reste konzentriert.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 3%
  • Universität Wien - 97%
Nationale Projektbeteiligte
  • Kristina Djinovic-Carugo, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 1540 Zitationen
  • 35 Publikationen
Publikationen
  • 2016
    Titel Aurone synthase is a catechol oxidase with hydroxylase activity and provides insights into the mechanism of plant polyphenol oxidases
    DOI 10.1073/pnas.1523575113
    Typ Journal Article
    Autor Molitor C
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2016
    Titel In situ formation of the first proteinogenically functionalized [TeW 6 O 24 O 2 (Glu)] 7- structure reveals unprecedented chemical and geometrical features of the Anderson-type cluster
    DOI 10.1039/c6cc07004c
    Typ Journal Article
    Autor Molitor C
    Journal Chemical Communications
    Seiten 12286-12289
    Link Publikation
  • 2015
    Titel The Structure of a Plant Tyrosinase from Walnut Leaves Reveals the Importance of “Substrate-Guiding Residues” for Enzymatic Specificity
    DOI 10.1002/anie.201506994
    Typ Journal Article
    Autor Bijelic A
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 14677-14680
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Crystallization and preliminary crystallographic analysis of latent, active and recombinantly expressed aurone synthase, a polyphenol oxidase, from Coreopsis grandiflora
    DOI 10.1107/s2053230x15007542
    Typ Journal Article
    Autor Molitor C
    Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications
    Seiten 746-751
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Fungal Tyrosinases: Why Mushrooms Turn Brown
    DOI 10.1016/b978-0-12-409547-2.11521-5
    Typ Book Chapter
    Autor Pretzler M
    Verlag Elsevier
  • 2017
    Titel The potential of hexatungstotellurate(VI) to induce a significant entropic gain during protein crystallization
    DOI 10.1107/s2052252517012349
    Typ Journal Article
    Autor Molitor C
    Journal IUCrJ
    Seiten 734-740
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Heterologous expression and characterization of functional mushroom tyrosinase (AbPPO4)
    DOI 10.1038/s41598-017-01813-1
    Typ Journal Article
    Autor Pretzler M
    Journal Scientific Reports
    Seiten 1810
    Link Publikation
  • 2017
    Titel In crystallo activity tests with latent apple tyrosinase and two mutants reveal the importance of the mutated sites for polyphenol oxidase activity
    DOI 10.1107/s2053230x17010822
    Typ Journal Article
    Autor Kampatsikas I
    Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications
    Seiten 491-499
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Purification and Characterization of Latent Polyphenol Oxidase from Apricot (Prunus armeniaca L.)
    DOI 10.1021/acs.jafc.7b03210
    Typ Journal Article
    Autor Derardja A
    Journal Journal of Agricultural and Food Chemistry
    Seiten 8203-8212
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Three recombinantly expressed apple tyrosinases suggest the amino acids responsible for mono- versus diphenolase activity in plant polyphenol oxidases
    DOI 10.1038/s41598-017-08097-5
    Typ Journal Article
    Autor Kampatsikas I
    Journal Scientific Reports
    Seiten 8860
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Ten Good Reasons for the Use of the Tellurium-Centered Anderson–Evans Polyoxotungstate in Protein Crystallography
    DOI 10.1021/acs.accounts.7b00109
    Typ Journal Article
    Autor Bijelic A
    Journal Accounts of Chemical Research
    Seiten 1441-1448
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Purification and Characterization of Latent Polyphenol Oxidase from Apricot (Prunus armeniaca L.)
    DOI 10.60692/q9e97-3y004
    Typ Other
    Autor Ala Eddine Derardja
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Purification and Characterization of Latent Polyphenol Oxidase from Apricot (Prunus armeniaca L.)
    DOI 10.60692/37w64-w1x08
    Typ Other
    Autor Ala Eddine Derardja
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Inside back cover
    DOI 10.1039/c6cc90463g
    Typ Journal Article
    Journal Chemical Communications
  • 2016
    Titel In situ formation of the first proteinogenically functionalized [TeW 6 O 24 O 2 (Glu)] 7- structure reveals unprecedented chemical and geometrical features of the Anderson-type cluster
    DOI 10.3204/pubdb-2016-03725
    Typ Other
    Autor Bijelic A
    Link Publikation
  • 2018
    Titel What causes the different functionality in type-III-copper enzymes? A state of the art perspective
    DOI 10.1016/j.ica.2017.04.041
    Typ Journal Article
    Autor Pretzler M
    Journal Inorganica Chimica Acta
    Seiten 25-31
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Polymerizing Like Mussels Do: Toward Synthetic Mussel Foot Proteins and Resistant Glues
    DOI 10.1002/anie.201809587
    Typ Journal Article
    Autor Horsch J
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 15728-15732
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Polymerizing Like Mussels Do: Toward Synthetic Mussel Foot Proteins and Resistant Glues
    DOI 10.1002/ange.201809587
    Typ Journal Article
    Autor Horsch J
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 15954-15958
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Die Erzeugung von Tyrosinaseaktivität in einer Catecholoxidase erlaubt die Identifizierung der für die C-H-Aktivierung in Typ-III-Kupferenzymen verantwortlichen Aminosäurereste
    DOI 10.1002/ange.202008859
    Typ Journal Article
    Autor Kampatsikas I
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 21126-21131
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Identification of Amino Acid Residues Responsible for C-H Activation in Type-III Copper Enzymes by Generating Tyrosinase Activity in a Catechol Oxidase
    DOI 10.1002/anie.202008859
    Typ Journal Article
    Autor Kampatsikas I
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 20940-20945
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Polyphenol oxidases exhibit promiscuous proteolytic activity
    DOI 10.1038/s42004-020-0305-2
    Typ Journal Article
    Autor Biundo A
    Journal Communications Chemistry
    Seiten 62
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Keggin-type polyoxotungstates as mushroom tyrosinase inhibitors - A speciation study
    DOI 10.1038/s41598-019-41261-7
    Typ Journal Article
    Autor Breibeck J
    Journal Scientific Reports
    Seiten 5183
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Variational approaches to quantum impurities: from the Fröhlich polaron to the angulon
    DOI 10.1080/00268976.2019.1567852
    Typ Journal Article
    Autor Li X
    Journal Molecular Physics
    Seiten 1981-1988
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Inhibition of apricot polyphenol oxidase by combinations of plant proteases and ascorbic acid
    DOI 10.1016/j.fochx.2019.100053
    Typ Journal Article
    Autor Derardja A
    Journal Food Chemistry: X
    Seiten 100053
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of polyphenol oxidase from Juglans regia (jrPPO1)
    DOI 10.1107/s2053230x1400884x
    Typ Journal Article
    Autor Zekiri F
    Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications
    Seiten 832-834
    Link Publikation
  • 2014
    Titel High level protein-purification allows the unambiguous polypeptide determination of latent isoform PPO4 of mushroom tyrosinase
    DOI 10.1016/j.phytochem.2013.12.016
    Typ Journal Article
    Autor Mauracher S
    Journal Phytochemistry
    Seiten 14-25
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of latent isoform PPO4 mushroom (Agaricus bisporus) tyrosinase
    DOI 10.1107/s2053230x14000582
    Typ Journal Article
    Autor Mauracher S
    Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications
    Seiten 263-266
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Purification and characterization of tyrosinase from walnut leaves (Juglans regia)
    DOI 10.1016/j.phytochem.2014.02.010
    Typ Journal Article
    Autor Zekiri F
    Journal Phytochemistry
    Seiten 5-15
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Chapter One Type-3 Copper Proteins Recent Advances on Polyphenol Oxidases
    DOI 10.1016/bs.apcsb.2014.07.001
    Typ Book Chapter
    Autor Kaintz C
    Verlag Elsevier
    Seiten 1-35
  • 2014
    Titel Latent and active abPPO4 mushroom tyrosinase cocrystallized with hexatungstotellurate(VI) in a single crystal
    DOI 10.1107/s1399004714013777
    Typ Journal Article
    Autor Mauracher S
    Journal Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography
    Seiten 2301-2315
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Cloning and functional expression in E. coli of a polyphenol oxidase transcript from Coreopsis grandiflora involved in aurone formation
    DOI 10.1016/j.febslet.2014.07.034
    Typ Journal Article
    Autor Kaintz C
    Journal FEBS Letters
    Seiten 3417-3426
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Kristallstruktur einer pflanzlichen Tyrosinase aus Walnussblättern: die Bedeutung “substratlenkender Aminosäurereste” für die Enzymspezifität
    DOI 10.1002/ange.201506994
    Typ Journal Article
    Autor Bijelic A
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 14889-14893
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Latent and active aurone synthase from petals of C. grandiflora: a polyphenol oxidase with unique characteristics
    DOI 10.1007/s00425-015-2261-0
    Typ Journal Article
    Autor Molitor C
    Journal Planta
    Seiten 519-537
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Site-directed mutagenesis around the CuA site of a polyphenol oxidase from Coreopsis grandiflora (cgAUS1)
    DOI 10.1016/j.febslet.2015.02.009
    Typ Journal Article
    Autor Kaintz C
    Journal FEBS Letters
    Seiten 789-797
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Similar but Still Different: Which Amino Acid Residues Are Responsible for Varying Activities in Type-III Copper Enzymes?
    DOI 10.1002/cbic.202000647
    Typ Journal Article
    Autor Kampatsikas I
    Journal ChemBioChem
    Seiten 1161-1175
    Link Publikation

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