Glykoepitope von N-Glykanen in Echinodermata
Glycoepitopes of N-glycans in Echinodermata
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Physik, Astronomie (20%)
Keywords
-
Glycomics,
Carbohydrate Epitopes,
N-Glycans,
Echinodermata,
Mass Spectrometry,
Oligosaccharide Analysis
In den vergangenen Jahren führten rapide Erkenntnisgewinne aus der Genomsequenzierung verschiedener Organismen und die daraus resultierenden Vergleichsmöglichkeiten zu einer geänderten Sichtweise über die Entwicklung und Verwandtschaft der Lebewesen. Im Gegensatz dazu ist der Vergleich von proteingebundenen Kohlenhydraten der Organismen aufgrund der komplexen Analytik ins Hintertreffen geraten und das obwohl Glykane in ihren verschiedenen Ausprägungen Schlüsselrollen in der (Zell)-Entwicklung spielen; speziell durch die Lokalisation an der Zelloberfäche sind sie an vielen primären Zell-Zell Wechselwirkungen beteiligt. Dieses Projekt befaßt sich mit den N-Glykanen der Echinodermaten, einer Gruppe mariner wirbelloser Organismen, die Seesterne und Seeigel umfaßt und im Stammbaum des Lebens in naher Verwandschaft zu den Chordata, zu denen die Wirbeltiere inklusive des Menschen gehören, steht. Trotz der wichtigen Stellung am Übergang zu den Wirbeltieren, der sicher durch neue ZellZell-wechselwirkungen markiert ist, existieren nur wenige Daten, die sich mit den Glykanen dieser Tiere beschäftigen, die sich in einer Grauzone zwischen den typisch Wirbellosen (wie Würmern und Insekten) und den Wirbeltieren befinden. Basierend auf den genomischen Daten des Seeigels (Strongylocentrotus purpuratus) und Lektinbindungsdaten von einer Seegurke kann man davon ausgehen, daß die Glykane auch der anderen Echinodermaten die Zuckerpitope Fucose und Sialinsäure enthalten. Speziell der letztgenannte Zucker wird sonst mit Wirbeltieren assoziert. Um die N-Glykane ausgewählter Echinodermaten in Detail zu studieren sollen diese nach verschiedenen Reinigungsschritten mittels Massenspektrometrie, MS/MS und HPLC- Analytik in Kombination mit enzymatischen und chemischen Behandlungen analysiert werden. Die neugewonnenen Daten über vorhandene Glykanepitope werden dann mit den phylogenetischen Daten in Verbindung gebracht um weitere Rückschlüsse auf die Entwicklung des Lebens am Schnittpunkt zu den Wirbeltieren zu ermöglichen.
In den vergangenen Jahren führten rapide Erkenntnisgewinne aus der Genomsequenzierung verschiedener Organismen und die daraus resultierenden Vergleichsmöglichkeiten zu einer geänderten Sichtweise über die Entwicklung und Verwandtschaft der Lebewesen. Im Gegensatz dazu ist der Vergleich von proteingebundenen Kohlenhydraten der Organismen aufgrund der komplexen Analytik ins Hintertreffen geraten und das obwohl Glykane in ihren verschiedenen Ausprägungen Schlüsselrollen in der (Zell)-Entwicklung spielen; speziell durch die Lokalisation an der Zelloberfläche sind sie an vielen primären Zell-Zell Wechselwirkungen beteiligt. Dieses Projekt befasste sich mit den N-Glykanen der Echinodermaten, einer Gruppe mariner wirbelloser Organismen, die Seesterne und Seeigel umfasst und im Stammbaum des Lebens in naher Verwandtschaft zu den Chordata, zu denen die Wirbeltiere inklusive des Menschen gehören, steht. Trotz der wichtigen Stellung am Übergang zu den Wirbeltieren, der sicher durch neue Zell-Zell-Wechselwirkungen markiert ist, existierten nur wenige Daten, die sich mit den Glykanen dieser Tiere beschäftigen, die sich in dieser Grauzone zwischen den typisch Wirbellosen (wie Würmern und Insekten) und den Wirbeltieren befinden. Basierend auf genomischen Daten und Lektinbindungsdaten wurde angenommen, dass die Glykane auch der anderen Echinodermaten die Zuckerepitope Fucose und Sialinsäure enthalten, wobei der letztgenannte Zucker sonst mit Wirbeltieren assoziiert wird. Um die N-Glykane ausgewählter Echinodermaten im Detail zu studieren wurden diese nach verschiedenen Reinigungsschritten mittels Massenspektrometrie, MS/MS und HPLC- Analytik in Kombination mit enzymatischen und chemischen Behandlungen analysiert. Die oben erwähnte Hypothese wurde mehr als bestätigt - sogar die Vielfalt der Strukturen in verschiedenen Spezies ist eigentlich überwältigend. Die analytische Vorgangsweise wurde optimiert und mit Proben von Insekten und Nematoden auch angewandt. Die neugewonnenen Daten über vorhandene Glykanepitope können nun mit den phylogenetischen Daten in Verbindung gebracht um weitere Rückschlüsse auf die Entwicklung des Lebens am Schnittpunkt zu den Wirbeltieren zu ermöglichen.
Research Output
- 521 Zitationen
- 23 Publikationen
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2015
Titel More Than Just Oligomannose: An N-glycomic Comparison of Penicillium Species* DOI 10.1074/mcp.m115.055061 Typ Journal Article Autor Hykollari A Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 73-92 Link Publikation -
2015
Titel Multistep Fractionation and Mass Spectrometry Reveal Zwitterionic and Anionic Modifications of the N- and O-glycans of a Marine Snail* DOI 10.1074/mcp.m115.051573 Typ Journal Article Autor Eckmair B Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 573-597 Link Publikation -
2017
Titel The underestimated N-glycomes of lepidopteran species DOI 10.1016/j.bbagen.2017.01.009 Typ Journal Article Autor Stanton R Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 699-714 Link Publikation -
2017
Titel Core Richness of N-Glycans of Caenorhabditis elegans: A Case Study on Chemical and Enzymatic Release DOI 10.1021/acs.analchem.7b03898 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Analytical Chemistry Seiten 928-935 Link Publikation -
2017
Titel The expanding glycouniverse: diverse glycan modifications in lower eukaryotes DOI 10.1096/fasebj.31.1_supplement.784.5 Typ Journal Article Autor Wilson I Journal The FASEB Journal Link Publikation -
2017
Titel Hydrophilic interaction anion exchange for separation of multiply modified neutral and anionic Dictyostelium N-glycans DOI 10.1002/elps.201700073 Typ Journal Article Autor Hykollari A Journal ELECTROPHORESIS Seiten 2175-2183 Link Publikation -
2016
Titel Analysis of Invertebrate and Protist N-Glycans DOI 10.1007/978-1-4939-6493-2_13 Typ Book Chapter Autor Hykollari A Verlag Springer Nature Seiten 167-184 Link Publikation -
2018
Titel Ablation of N-acetylglucosaminyltransferases in Caenorhabditis induces expression of unusual intersected and bisected N-glycans DOI 10.1016/j.bbagen.2018.07.002 Typ Journal Article Autor Yan S Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 2191-2203 Link Publikation -
2018
Titel The parasitic nematode Oesophagostomum dentatum synthesizes unusual glycosaminoglycan-like O-glycans DOI 10.1093/glycob/cwy045 Typ Journal Article Autor Vanbeselaere J Journal Glycobiology Seiten 474-481 Link Publikation -
2018
Titel Isomeric Separation and Recognition of Anionic and Zwitterionic N-glycans from Royal Jelly Glycoproteins* DOI 10.1074/mcp.ra117.000462 Typ Journal Article Autor Hykollari A Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 2177-2196 Link Publikation -
2018
Titel Protein-Specific Analysis of Invertebrate Glycoproteins DOI 10.1007/978-1-4939-8814-3_24 Typ Book Chapter Autor Hykollari A Verlag Springer Nature Seiten 421-435 Link Publikation -
2020
Titel Sulfated and sialylated N-glycans in the echinoderm Holothuria atra reflect its marine habitat and phylogeny DOI 10.1074/jbc.ra119.011701 Typ Journal Article Autor Vanbeselaere J Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 3159-3172 Link Publikation -
2019
Titel Comparisons of N-glycans across invertebrate phyla DOI 10.1017/s0031182019000398 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Parasitology Seiten 1733-1742 Link Publikation -
2019
Titel Anionic and zwitterionic moieties as widespread glycan modifications in non-vertebrates DOI 10.1007/s10719-019-09874-2 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycoconjugate Journal Seiten 27-40 Link Publikation -
2019
Titel N-glycomic Complexity in Anatomical Simplicity: Caenorhabditis elegans as a Non-model Nematode? DOI 10.3389/fmolb.2019.00009 Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Frontiers in Molecular Biosciences Seiten 9 Link Publikation -
2019
Titel Highly modified and immunoactive N-glycans of the canine heartworm DOI 10.1038/s41467-018-07948-7 Typ Journal Article Autor Martini F Journal Nature Communications Seiten 75 Link Publikation -
2019
Titel Tissue-specific glycosylation in the honeybee: Analysis of the N-glycomes of Apis mellifera larvae and venom DOI 10.1016/j.bbagen.2019.08.002 Typ Journal Article Autor Hykollari A Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 129409 Link Publikation -
2014
Titel Comparative Glycobiology DOI 10.1007/978-4-431-54836-2_153-1 Typ Book Chapter Autor Paschinger K Verlag Springer Nature Seiten 1-10 -
2014
Titel Comparative Glycobiology DOI 10.1007/978-4-431-54841-6_153 Typ Book Chapter Autor Paschinger K Verlag Springer Nature Seiten 795-805 -
2016
Titel Analysis of zwitterionic and anionic N-linked glycans from invertebrates and protists by mass spectrometry DOI 10.1007/s10719-016-9650-x Typ Journal Article Autor Paschinger K Journal Glycoconjugate Journal Seiten 273-283 Link Publikation -
2015
Titel Targeted release and fractionation reveal glucuronylated and sulphated N- and O-glycans in larvae of dipteran insects DOI 10.1016/j.jprot.2015.05.030 Typ Journal Article Autor Kurz S Journal Journal of Proteomics Seiten 172-188 Link Publikation -
2018
Titel Glycomics Studies on Nematodes Elucidate Conserved Functional Epitopes and Biosynthetic Pathways DOI 10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.673.17 Typ Journal Article Autor Yan S Journal The FASEB Journal Seiten 673.17-673.17 -
2020
Titel Glycosylation at an evolutionary nexus: the brittle star Ophiactis savignyi expresses both vertebrate and invertebrate N-glycomic features DOI 10.1074/jbc.ra119.011703 Typ Journal Article Autor Eckmair B Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 3173-3188 Link Publikation