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Kontrolle der epigenetischen Rekonfiguration in Pollen

Control and function of epigenetic reconfiguration in pollen

Hisashi Tamaru (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P24918
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.08.2012
  • Projektende 30.09.2014
  • Bewilligungssumme 448.906 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    DNA methylation, Heterochromatin, DNA demethylation, Male gametophyte, Gene silencing, Plant reproduction

Abstract Endbericht

Ein einzigartiges Merkmal der Gametogenese ist das Zurücksetzen der genetischen und epigenetischen Prägungen der Keimzellen in den ursprünglichen Zustand der Totipotenz. Die korrekte Weitergabe der epigenetischen Modifikationen des Genoms und die Weiterreichung von "small RNAs" an die nächste Generation ist essentiell für die Entwicklung von Säugetieren und Pflanzen. Nach neuesten Erkenntnissen finden genomweite, epigenetische Reprogrammierungsvorgänge in den Keimzellen von Säugern und Pflanzen statt, welche erhebliche Veränderungen des DNA-Methylierungsgrades sowie auch Veränderungen in der Dynamik des Chromatins bewirken. Die Zielsetzung der im Projektantrag beschriebenen Experimente ist es herauszufinden, wie diese Reprogrammierungsereignisse kontrolliert werden und welche Rolle sie im männlichen Gametophyten, dem Pollen, von Arabidopsis thaliana spielen. Insbesondere ist das Forschungsvorhaben darauf ausgerichtet, (1) die Funktion von aktiver DNA-Demethylierung im Pollen aufzuklären und (2) die Mechanismen zu beleuchten, welche die Dynamik des Chromatins im männlichen Gametophyten kontrollieren. Durch die genetischen und genomischen Forschungsansätze im 1. Teil des Projektantrages werden neue Erkenntnisse über die Funktion der DANN- Demethylierung während der Pflanzenreproduktion gewonnen. Teil 2 des Projektantrages beinhaltet die Charakterisierung der in unserem Labor isolierten A. thalianana Mutante hdd1 - heterochromatin decondensation defective 1 - mit dem Ziel Suppressor-Mutanten von hdd1 zu isolieren. Dadurch sollen die Funktionen und Kontrollmechanismen der Rekonfigurationsvorgänge des Chromatins aufgeklärt werden, welche während der Pflanzen-Gametogenese in dramatischem Umfang beobachtet werden können

Das Zentromer ist die grundlegende Einheit für die Aufteilung der Chromosomen während der Zellteilung. Die zentromerspezifische Histon-H3-Variante (CenH3) ist an der Zentromer-DNA gebunden und ist für die Funktion des Zentromers grundlegend. Die Entfernung des CenH3 aus Zentromeren ist eine allgemeine Eigenschaft von terminal differenzierten Zellen, und ein unangebrachter Verbleib von restlichem CenH3 an den Zentromeren erhöht das Risiko für defekte Zellteilungen und dadurch Krankheiten wie Krebs. Im Gegensatz zu dem bereits relativ gut verstandenen Prozess des CenH3-Einbaus an den Zentromeren, ist nur wenig darüber bekannt, wie Zellen die CenH3-Zentromere aktiv abbauen um letztendlich Krankheiten wie Krebs zu verhindern. In unserer Studie konnten wir einen aktiven Mechanismus aufdecken, in welchem mittels der evolutionär konservierten AAA-ATPase Chaperon CDC48A eine proteolytische Demontage des Zentromers bewirkt wird, mit CenH3 als Zielmolekül. Die terminal differenzierte vegetative Zelle des Pollen der Blütenpflanze Arabidopsis thaliana unterzieht sich einer Eliminierung von CenH3, einer Dekondensation von zentromerischem Heterochromatin, und der Translokation von rDNA mit den ribosomalen RNA (rRNA) Gen-Loci aus Bereichen mit zentromerischem Heterochromatin in ein subnukleares Kompartment - dem so genannten Nukleolus, in welchem die rRNA-Gentranskription stattfindet um die Machinerie für Proteinsynthese zu bilden. Wir fanden, dass Mutationen im Gen CDC48A diese dynamischen Prozesse am Chromosom blockieren. Zellwachstum und metabolismus sind abhängig von der rRNA Gentranskriptionsaktivität in der Zelle. Die vegetative Zelle des Pollen bildet einen Schlauch, welcher, geleitet durch kräftiges, rasches und fortdauerndes Spitzenwuchs, zwei Samenzellen über eine weite Entfernung zur Eizelle für deren Befruchtung transportiert. Das Pollenschlauchwachstum verlangt dabei ein hohes Mass an Zellaktivität und rRNA Gentranskriptionsaktivität. Dementsprechend blockieren cdc48a-Mutationen ebenso das durch den vegetativen Kern angetriebene Pollenschlauchwachstum, und verursachen somit männliche Sterilität. Wir schlagen daher folgendes Modell vor: Das CDC48A Chaperon entfernt CenH3 von den Zentromeren und löst infolge das zentromerische Heterochromatin auf um die Gesamtheit aller rRNA Gene transkribieren zu können. Diese Chromosomenreorganisation ist essentiell für die Pollenschlauchbildung, und folglich für die Pflanzenreproduktion. Zukünftige Arbeiten werden zeigen, ob die CDC48A-dirigierte, aktive Zentromerdemontage ein universeller Mechanismus terminal differenzierter Zellen höherer Eukaryoten ist um Zellteilung und Zellwachstum zu kontrollieren. Neuronen, in welchen analog zum Pollenschlauchwachstum ein einzelner Kern das Zellspitzenwachstum auf weite Distanzen antreibt, bieten sich als naheliegende Kandidaten an, diese Vorhersage zu testen.

Forschungsstätte(n)
  • Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Daniel Zilberman, Institute of Science and Technology Austria - ISTA , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Mark E. Johnson, Brown University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Robert L. Fischer, University of California Berkeley - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 1063 Zitationen
  • 7 Publikationen
Publikationen
  • 2015
    Titel Sample Preparation and Fractionation of Arabidopsis thaliana Sperm and Vegetative Cell Nuclei by FACS.
    DOI 10.21769/bioprotoc.1664
    Typ Journal Article
    Autor Chumak N
    Journal Bio-protocol
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Hypomethylated Pollen Bypasses the Interploidy Hybridization Barrier in Arabidopsis
    DOI 10.1105/tpc.114.130120
    Typ Journal Article
    Autor Schatlowski N
    Journal The Plant Cell
    Seiten 3556-3568
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Active DNA Demethylation in Plant Companion Cells Reinforces Transposon Methylation in Gametes
    DOI 10.1126/science.1224839
    Typ Journal Article
    Autor Ibarra C
    Journal Science
    Seiten 1360-1364
    Link Publikation
  • 2014
    Titel The AAA-ATPase molecular chaperone Cdc48/p97 disassembles sumoylated centromeres, decondenses heterochromatin, and activates ribosomal RNA genes
    DOI 10.1073/pnas.1418564111
    Typ Journal Article
    Autor Mérai Z
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 16166-16171
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Induction of RNA-directed DNA methylation upon decondensation of constitutive heterochromatin
    DOI 10.1038/embor.2009.152
    Typ Journal Article
    Autor Schoft V
    Journal The EMBO Reports
    Seiten 1015-1021
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Function of the DEMETER DNA glycosylase in the Arabidopsis thaliana male gametophyte
    DOI 10.1073/pnas.1105117108
    Typ Journal Article
    Autor Schoft V
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 8042-8047
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Confining euchromatin/heterochromatin territory: jumonji crosses the line
    DOI 10.1101/gad.1941010
    Typ Journal Article
    Autor Tamaru H
    Journal Genes & Development
    Seiten 1465-1478
    Link Publikation

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