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Theorie des Lichtsammelns in der Photosynthese

Theory of Light-Harvesting in Photosynthesis

Thomas Renger (ORCID: 0000-0001-9245-3805)
  • Grant-DOI 10.55776/P24774
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2012
  • Projektende 31.03.2016
  • Bewilligungssumme 336.661 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (25%); Chemie (25%); Physik, Astronomie (50%)

Keywords

    Structure-Function Relationships, Pigment Protein Complex, Optical Properties, Excitation Energy Transfer, Density Matrix Theory, Quantum Chemical/ Electrostatic Computation

Abstract Endbericht

Ziel dieses Projektes ist die Entschlüsselung von Bauprinzipien photosynthetischer Antennen- und Reaktionszentrenkomplexe, die deren hohe Quanteneffizienz und Robustheit erklären. Zu diesem Zweck werden zum einen die dynamische Theorie zur Berechnung optischer Spektren und des Energietransfers und zum anderen die mikroskopischen Berechnungsmethoden der Parameter der Theorie weiterentwickelt. Bei der Entwicklung der Theorie geht es um eine nichtstörungstheoretische Beschreibung der Pigment-Pigment (exzitonischen) und der Pigment-Protein (Exziton-Schwingungs-) Wechselwirkung, die es erlauben soll, das Wechselspiel aus quantenmechanischer Delokalisierung der Anregungsenergie und ihrer dynamischen Lokalisierung durch die Exziton-Schwingungskopplung in großen Pigment-Proteinkomplexen zu beschreiben. Die existierende Methodik zur Berechnung der Parameter soll erweitert werden durch die Entwicklung einer mikroskopischen Simulationstechnik für die Spektraldichte, die die dynamische Modulation der Pigmentanregungsenergien durch die Proteindynamik charakterisiert (dynamische Unordnung), und für die inhomogene Verbreiterung der optischen Übergänge (statische Unordnung). Basierend auf diesen Entwicklungen und der existierenden Expertise sind Anwendungen auf die Berechnung optischer Spektren und die Analyse der Struktur-Funktionsbeziehungen von Pigment-Proteinkomplexen verschiedener Größe geplant, beginnend mit dem wasserlöslichen chlorophyllbindenden Protein WSCP, welches ein (IIa-WSCP) oder zwei (IIb-WSCP) Chlorophylldimere enthält und dem Fenna-Mathews-Olsen-(FMO)-Protein mit acht exzitonisch gekoppelten Bakteriochlorophyll-a-Pigmenten pro monomerer Untereinheit, über Komplexe von mittlerer Größe (LH2-Komplex der Purpurbakterien und LHC-II Komplex von höheren Pflanzen), bis hin zu Photosystem II-Dimeren und Photosystem I-Trimeren mit 70 bzw. 288 Chlorophyll-pigmenten. Der WSCP- Komplex dient als ein Modellsystem für die Entwicklung der Theorie und Berechnungsmethoden. Von deren Anwendung auf die verschiedenen Lichtsammel- und Reaktionszentren-komplexe versprechen wir uns tiefere Einsichten in die mechanistischen Details des Anregungs- und primären Ladungstransfers in diesen Systemen. Fünf spezielle offene Fragestellungen, die bearbeitet werden, betreffen (i) die relative Zeitskala und die mechanistischen Details des Energie- und primären Ladungstransfers im Photosystem II, (ii) die molekulare Identität der lanwellig- absorbierenden Chlorophylle in Photosystem I-Kern-Komplexen und die mechanistischen Details des durch Anregung dieser Chlorophylle induzierten Ladungstransfers, (iii) mechanistische Details des nicht- photochemischen Löschens von Anregungsenergie im LHC-II-Komplex höherer Pflanzen, (iv) die Ursache und Funktion der langlebigen Quantenkohärenzen, die man mit 2D-Spektroskopie am FMO-Protein gefunden hat und (v) eine Erklärung der ungewöhnlichen optischen Eigenschaften des Ringes stark gekoppelter Pigmente im LH2- Komplex. Die Entschlüsselung von Bauprinzipien dieser photosynthetischen Komplexe kann von grossem Nutzen für die Entwicklung künstlicher Solarenergieumwandlungssysteme wie etwa organischer Solarzellen sein. Letztere werden in einem parallelen Projekt in meiner Arbeitsgruppe im Rahmen eines Christian Doppler Labors untersucht.

Ziel dieses Projektes war das Studium von Bauprinzipien photosynthetischer Antennen- und Reaktionszentrenkomplexe, die deren hohe Quanteneffizienz und Robustheit erklären. Zu diesem Zweck wurden zum einen die dynamische Theorie zur Berechnung optischer Spektren und des Energietransfers und zum anderen die strukturbasierten Berechnungsmethoden der Parameter dieser Theorien weiterentwickelt. Ein Durchbruch gelang bei der Berechnung der Spektraldichte der Pigment-Protein-Wechselwirkung (WW). Diese Größe, welche die durch die Proteindynamik hervorgerufene Fluktuation der Pigment-Pigment-WW und der Pigment-Protein-WW beschreibt, konnte zum ersten Mal in weitgehender Übereinstimmung mit dem Experiment berechnet werden. Auf der Grundlage dieser Rechnungen wurde es möglich, ein mikroskopisches Verständnis für die Dissipation von elektronischer Überschussenergie der Pigmente durch die Proteinschwingungen zu gewinnen. Es zeigte sich, dass die Modulation der Pigment-Pigment-WW durch die Proteindynamik etwa eine Größenordnung schwächer ist als die der Pigment-Protein-WW. Eine detaillierte Analyse der Pigment-Protein-WW ergab, dass es die unkorrelierte Fluktuation der optischen Übergangsenergien der Pigment ist, die es dem Protein erlaubt, die Überschussenergie der Pigmente zu dissipieren. Durch die Pigment-Pigment-WW bilden sich nach Lichtabsorption delokalisierte angeregte elektronische Zustände, die durch die Pigment-Protein-WW beein?usst werden. Dabei unterscheidet man die diagonale WW, welche die Fluktuationen der Energien der delokalisierten Zustände beschreibt, und die nicht-diagonale WW, welche unterschiedliche delokalisierte Zustände verkoppelt. Die Berechnung der Spektraldichte hat nun ergeben, dass die nicht-diagonale WW klein gegenüber der diagonalen WW ist. Dieses Ergebnis ?oss direkt in die Entwicklung dynamischer Theorien der Spektren und des Energietransfers ein, in denen eine exakte Behandlung der diagonalen WW mit einer störungstheoretischen Behandlung der nichtdiagonalen WW verknüpft wurde. Unsere strukturbasierten Berechnungsmethoden und dynamischen Theorien konnten erfolgreich auf verschiedene photosynthetische Pigment-Protein-Komplexe angewendet werden. Dabei wurden Energiesenken in den Lichtsammelantennen CP29, CP43 und CP47 von Photosystem II aufgedeckt und es wurde die molekulare Identität von kontrovers diskutierten funktionellen Zuständen des BLUF Photorezeptors, der für die Genregulation in der Photosynthese verantwortlich ist, o?engelegt. Darüberhinaus gelang es, Theorien zur Beschreibung von optischen Spektren zu entwickeln, die zur Überprüfung der strukturbasierten Parametrisierung dieser Systeme herangezogen wurden. Neben einer Theorie der zirkular polarisierten Fluoreszenz ist besonders eine neuartige Theorie der Lochbrennspekroskopie zu erwähnen, die bisher theoretisch unzugängliche Bereiche des Spektrums beschreiben kann. Damit lassen sich wichtige Informationen wie Lebensdauern angeregter Zustände aus Lochbrennspektren extrahieren, die vorher nur mit zeitaufgelöster Spektroskopie bestimmt werden konnten.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Marc Brecht, Eberhard-Karls-Universität Tübingen - Deutschland
  • Eberhard Schlodder, Technische Universität Berlin - Deutschland
  • Martin B. Plenio, Universität Ulm - Deutschland
  • Naomi Ginsberg, University of California Berkeley - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Melih Sener, University of Illinois at Urbana-Champaign - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Helmut Kirchhof, Washington State University - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 1114 Zitationen
  • 27 Publikationen
Publikationen
  • 2012
    Titel Normal Mode Analysis of the Spectral Density of the Fenna–Matthews–Olson Light-Harvesting Protein: How the Protein Dissipates the Excess Energy of Excitons
    DOI 10.1021/jp3094935
    Typ Journal Article
    Autor Renger T
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 14565-14580
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Lineshape theory of pigment-protein complexes: How the finite relaxation time of nuclei influences the exciton relaxation-induced lifetime broadening
    DOI 10.1063/1.4958322
    Typ Journal Article
    Autor Dinh T
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 034105
  • 2016
    Titel Challenges facing an understanding of the nature of low-energy excited states in photosynthesis
    DOI 10.1016/j.bbabio.2016.06.010
    Typ Journal Article
    Autor Reimers J
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics
    Seiten 1627-1640
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Ultrafast infrared observation of exciton equilibration from oriented single crystals of photosystem II
    DOI 10.1038/ncomms13977
    Typ Journal Article
    Autor Kaucikas M
    Journal Nature Communications
    Seiten 13977
    Link Publikation
  • 2016
    Titel The lowest-energy chlorophyll of photosystem II is adjacent to the peripheral antenna: Emitting states of CP47 assigned via circularly polarized luminescence
    DOI 10.1016/j.bbabio.2016.06.007
    Typ Journal Article
    Autor Hall J
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics
    Seiten 1580-1593
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Towards an exact theory of linear absorbance and circular dichroism of pigment-protein complexes: Importance of non-secular contributions
    DOI 10.1063/1.4904928
    Typ Journal Article
    Autor Dinh T
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 034104
  • 2015
    Titel Calculating Optical Absorption Spectra of Thin Polycrystalline Organic Films: Structural Disorder and Site-Dependent van der Waals Interaction
    DOI 10.1021/acs.jpcc.5b01587
    Typ Journal Article
    Autor Megow J
    Journal The Journal of Physical Chemistry C
    Seiten 5747-5751
    Link Publikation
  • 2015
    Titel The quest for energy traps in the CP43 antenna of photosystem II
    DOI 10.1016/j.jphotobiol.2015.05.023
    Typ Journal Article
    Autor Müh F
    Journal Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology
    Seiten 286-300
  • 2015
    Titel Circularly polarized luminescence spectroscopy reveals low-energy excited states and dynamic localization of vibronic transitions in CP43
    DOI 10.1016/j.bbabio.2015.09.012
    Typ Journal Article
    Autor Hall J
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics
    Seiten 115-128
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Electrostatic Asymmetry in the Reaction Center of Photosystem II
    DOI 10.1021/acs.jpclett.6b02823
    Typ Journal Article
    Autor Mu¨H F
    Journal The Journal of Physical Chemistry Letters
    Seiten 850-858
  • 2017
    Titel Origin of non-conservative circular dichroism of the CP29 antenna complex of photosystem II
    DOI 10.1039/c6cp08778g
    Typ Journal Article
    Autor Lindorfer D
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 7524-7536
  • 2016
    Titel Structure Prediction of Self-Assembled Dye Aggregates from Cryogenic Transmission Electron Microscopy, Molecular Mechanics, and Theory of Optical Spectra
    DOI 10.1021/acs.jpcc.6b05856
    Typ Journal Article
    Autor Friedl C
    Journal The Journal of Physical Chemistry C
    Seiten 19416-19433
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Long-Wavelength Limit of Photochemical Energy Conversion in Photosystem I
    DOI 10.1021/ja412375j
    Typ Journal Article
    Autor Schlodder E
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 3904-3918
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Revealing the Functional States in the Active Site of BLUF Photoreceptors from Electrochromic Shift Calculations
    DOI 10.1021/jp506400y
    Typ Journal Article
    Autor Collette F
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 11109-11119
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Towards a structure-based exciton Hamiltonian for the CP29 antenna of photosystem II
    DOI 10.1039/c3cp55166k
    Typ Journal Article
    Autor Müh F
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 11848-11863
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Mixed Quantum-Classical Description of Excitation Energy Transfer in Supramolecular Complexes: Screening of the Excitonic Coupling
    DOI 10.1002/cphc.201300625
    Typ Journal Article
    Autor Megow J
    Journal ChemPhysChem
    Seiten 478-485
  • 2016
    Titel Hole-Burning Spectroscopy on Excitonically Coupled Pigments in Proteins: Theory Meets Experiment
    DOI 10.1021/jacs.5b08246
    Typ Journal Article
    Autor Adolphs J
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 2993-3001
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Site-dependence of van der Waals interaction explains exciton spectra of double-walled tubular J-aggregates
    DOI 10.1039/c4cp05945j
    Typ Journal Article
    Autor Megow J
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 6741-6747
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Variation of Exciton-Vibrational Coupling in Photosystem II Core Complexes from Thermosynechococcus elongatus As Revealed by Single-Molecule Spectroscopy
    DOI 10.1021/jp510631x
    Typ Journal Article
    Autor Skandary S
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 4203-4210
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Towards an ab initio description of the optical spectra of light-harvesting antennae: application to the CP29 complex of photosystem II
    DOI 10.1039/c4cp05647g
    Typ Journal Article
    Autor Jurinovich S
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 14405-14416
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Photosystem II Does Not Possess a Simple Excitation Energy Funnel: Time-Resolved Fluorescence Spectroscopy Meets Theory
    DOI 10.1021/ja312586p
    Typ Journal Article
    Autor Shibata Y
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 6903-6914
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Understanding photosynthetic light-harvesting: a bottom up theoretical approach
    DOI 10.1039/c3cp43439g
    Typ Journal Article
    Autor Renger T
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 3348-3371
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Structure-based modeling of energy transfer in photosynthesis
    DOI 10.1007/s11120-013-9893-3
    Typ Journal Article
    Autor Renger T
    Journal Photosynthesis Research
    Seiten 367-388
  • 2014
    Titel Structure-Based Calculation of Pigment–Protein and Excitonic Pigment–Pigment Coupling in Photosynthetic Light-Harvesting Complexes
    DOI 10.1007/978-1-4939-1148-6_1
    Typ Book Chapter
    Autor Müh F
    Verlag Springer Nature
    Seiten 3-44
  • 2014
    Titel Calculating optical absorption spectra of thin polycrystalline films: Structural disorder and site-dependent van der Waals interaction
    DOI 10.48550/arxiv.1411.2818
    Typ Preprint
    Autor Megow J
  • 2014
    Titel Site-dependence of van der Waals interaction explains exciton spectra of double-walled tubular J-aggregates
    DOI 10.48550/arxiv.1412.3554
    Typ Preprint
    Autor Megow J
  • 2018
    Titel Photoinduced electron transfer in the reaction centers
    DOI 10.1201/9781351242899-15
    Typ Book Chapter
    Verlag Taylor & Francis
    Seiten 327-357

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