Theorie des Lichtsammelns in der Photosynthese
Theory of Light-Harvesting in Photosynthesis
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (25%); Chemie (25%); Physik, Astronomie (50%)
Keywords
-
Structure-Function Relationships,
Pigment Protein Complex,
Optical Properties,
Excitation Energy Transfer,
Density Matrix Theory,
Quantum Chemical/ Electrostatic Computation
Ziel dieses Projektes ist die Entschlüsselung von Bauprinzipien photosynthetischer Antennen- und Reaktionszentrenkomplexe, die deren hohe Quanteneffizienz und Robustheit erklären. Zu diesem Zweck werden zum einen die dynamische Theorie zur Berechnung optischer Spektren und des Energietransfers und zum anderen die mikroskopischen Berechnungsmethoden der Parameter der Theorie weiterentwickelt. Bei der Entwicklung der Theorie geht es um eine nichtstörungstheoretische Beschreibung der Pigment-Pigment (exzitonischen) und der Pigment-Protein (Exziton-Schwingungs-) Wechselwirkung, die es erlauben soll, das Wechselspiel aus quantenmechanischer Delokalisierung der Anregungsenergie und ihrer dynamischen Lokalisierung durch die Exziton-Schwingungskopplung in großen Pigment-Proteinkomplexen zu beschreiben. Die existierende Methodik zur Berechnung der Parameter soll erweitert werden durch die Entwicklung einer mikroskopischen Simulationstechnik für die Spektraldichte, die die dynamische Modulation der Pigmentanregungsenergien durch die Proteindynamik charakterisiert (dynamische Unordnung), und für die inhomogene Verbreiterung der optischen Übergänge (statische Unordnung). Basierend auf diesen Entwicklungen und der existierenden Expertise sind Anwendungen auf die Berechnung optischer Spektren und die Analyse der Struktur-Funktionsbeziehungen von Pigment-Proteinkomplexen verschiedener Größe geplant, beginnend mit dem wasserlöslichen chlorophyllbindenden Protein WSCP, welches ein (IIa-WSCP) oder zwei (IIb-WSCP) Chlorophylldimere enthält und dem Fenna-Mathews-Olsen-(FMO)-Protein mit acht exzitonisch gekoppelten Bakteriochlorophyll-a-Pigmenten pro monomerer Untereinheit, über Komplexe von mittlerer Größe (LH2-Komplex der Purpurbakterien und LHC-II Komplex von höheren Pflanzen), bis hin zu Photosystem II-Dimeren und Photosystem I-Trimeren mit 70 bzw. 288 Chlorophyll-pigmenten. Der WSCP- Komplex dient als ein Modellsystem für die Entwicklung der Theorie und Berechnungsmethoden. Von deren Anwendung auf die verschiedenen Lichtsammel- und Reaktionszentren-komplexe versprechen wir uns tiefere Einsichten in die mechanistischen Details des Anregungs- und primären Ladungstransfers in diesen Systemen. Fünf spezielle offene Fragestellungen, die bearbeitet werden, betreffen (i) die relative Zeitskala und die mechanistischen Details des Energie- und primären Ladungstransfers im Photosystem II, (ii) die molekulare Identität der lanwellig- absorbierenden Chlorophylle in Photosystem I-Kern-Komplexen und die mechanistischen Details des durch Anregung dieser Chlorophylle induzierten Ladungstransfers, (iii) mechanistische Details des nicht- photochemischen Löschens von Anregungsenergie im LHC-II-Komplex höherer Pflanzen, (iv) die Ursache und Funktion der langlebigen Quantenkohärenzen, die man mit 2D-Spektroskopie am FMO-Protein gefunden hat und (v) eine Erklärung der ungewöhnlichen optischen Eigenschaften des Ringes stark gekoppelter Pigmente im LH2- Komplex. Die Entschlüsselung von Bauprinzipien dieser photosynthetischen Komplexe kann von grossem Nutzen für die Entwicklung künstlicher Solarenergieumwandlungssysteme wie etwa organischer Solarzellen sein. Letztere werden in einem parallelen Projekt in meiner Arbeitsgruppe im Rahmen eines Christian Doppler Labors untersucht.
Ziel dieses Projektes war das Studium von Bauprinzipien photosynthetischer Antennen- und Reaktionszentrenkomplexe, die deren hohe Quanteneffizienz und Robustheit erklären. Zu diesem Zweck wurden zum einen die dynamische Theorie zur Berechnung optischer Spektren und des Energietransfers und zum anderen die strukturbasierten Berechnungsmethoden der Parameter dieser Theorien weiterentwickelt. Ein Durchbruch gelang bei der Berechnung der Spektraldichte der Pigment-Protein-Wechselwirkung (WW). Diese Größe, welche die durch die Proteindynamik hervorgerufene Fluktuation der Pigment-Pigment-WW und der Pigment-Protein-WW beschreibt, konnte zum ersten Mal in weitgehender Übereinstimmung mit dem Experiment berechnet werden. Auf der Grundlage dieser Rechnungen wurde es möglich, ein mikroskopisches Verständnis für die Dissipation von elektronischer Überschussenergie der Pigmente durch die Proteinschwingungen zu gewinnen. Es zeigte sich, dass die Modulation der Pigment-Pigment-WW durch die Proteindynamik etwa eine Größenordnung schwächer ist als die der Pigment-Protein-WW. Eine detaillierte Analyse der Pigment-Protein-WW ergab, dass es die unkorrelierte Fluktuation der optischen Übergangsenergien der Pigment ist, die es dem Protein erlaubt, die Überschussenergie der Pigmente zu dissipieren. Durch die Pigment-Pigment-WW bilden sich nach Lichtabsorption delokalisierte angeregte elektronische Zustände, die durch die Pigment-Protein-WW beein?usst werden. Dabei unterscheidet man die diagonale WW, welche die Fluktuationen der Energien der delokalisierten Zustände beschreibt, und die nicht-diagonale WW, welche unterschiedliche delokalisierte Zustände verkoppelt. Die Berechnung der Spektraldichte hat nun ergeben, dass die nicht-diagonale WW klein gegenüber der diagonalen WW ist. Dieses Ergebnis ?oss direkt in die Entwicklung dynamischer Theorien der Spektren und des Energietransfers ein, in denen eine exakte Behandlung der diagonalen WW mit einer störungstheoretischen Behandlung der nichtdiagonalen WW verknüpft wurde. Unsere strukturbasierten Berechnungsmethoden und dynamischen Theorien konnten erfolgreich auf verschiedene photosynthetische Pigment-Protein-Komplexe angewendet werden. Dabei wurden Energiesenken in den Lichtsammelantennen CP29, CP43 und CP47 von Photosystem II aufgedeckt und es wurde die molekulare Identität von kontrovers diskutierten funktionellen Zuständen des BLUF Photorezeptors, der für die Genregulation in der Photosynthese verantwortlich ist, o?engelegt. Darüberhinaus gelang es, Theorien zur Beschreibung von optischen Spektren zu entwickeln, die zur Überprüfung der strukturbasierten Parametrisierung dieser Systeme herangezogen wurden. Neben einer Theorie der zirkular polarisierten Fluoreszenz ist besonders eine neuartige Theorie der Lochbrennspekroskopie zu erwähnen, die bisher theoretisch unzugängliche Bereiche des Spektrums beschreiben kann. Damit lassen sich wichtige Informationen wie Lebensdauern angeregter Zustände aus Lochbrennspektren extrahieren, die vorher nur mit zeitaufgelöster Spektroskopie bestimmt werden konnten.
- Universität Linz - 100%
- Marc Brecht, Eberhard-Karls-Universität Tübingen - Deutschland
- Eberhard Schlodder, Technische Universität Berlin - Deutschland
- Martin B. Plenio, Universität Ulm - Deutschland
- Naomi Ginsberg, University of California Berkeley - Vereinigte Staaten von Amerika
- Melih Sener, University of Illinois at Urbana-Champaign - Vereinigte Staaten von Amerika
- Helmut Kirchhof, Washington State University - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 1114 Zitationen
- 27 Publikationen
-
2012
Titel Normal Mode Analysis of the Spectral Density of the Fenna–Matthews–Olson Light-Harvesting Protein: How the Protein Dissipates the Excess Energy of Excitons DOI 10.1021/jp3094935 Typ Journal Article Autor Renger T Journal The Journal of Physical Chemistry B Seiten 14565-14580 Link Publikation -
2016
Titel Lineshape theory of pigment-protein complexes: How the finite relaxation time of nuclei influences the exciton relaxation-induced lifetime broadening DOI 10.1063/1.4958322 Typ Journal Article Autor Dinh T Journal The Journal of Chemical Physics Seiten 034105 -
2016
Titel Challenges facing an understanding of the nature of low-energy excited states in photosynthesis DOI 10.1016/j.bbabio.2016.06.010 Typ Journal Article Autor Reimers J Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics Seiten 1627-1640 Link Publikation -
2016
Titel Ultrafast infrared observation of exciton equilibration from oriented single crystals of photosystem II DOI 10.1038/ncomms13977 Typ Journal Article Autor Kaucikas M Journal Nature Communications Seiten 13977 Link Publikation -
2016
Titel The lowest-energy chlorophyll of photosystem II is adjacent to the peripheral antenna: Emitting states of CP47 assigned via circularly polarized luminescence DOI 10.1016/j.bbabio.2016.06.007 Typ Journal Article Autor Hall J Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics Seiten 1580-1593 Link Publikation -
2015
Titel Towards an exact theory of linear absorbance and circular dichroism of pigment-protein complexes: Importance of non-secular contributions DOI 10.1063/1.4904928 Typ Journal Article Autor Dinh T Journal The Journal of Chemical Physics Seiten 034104 -
2015
Titel Calculating Optical Absorption Spectra of Thin Polycrystalline Organic Films: Structural Disorder and Site-Dependent van der Waals Interaction DOI 10.1021/acs.jpcc.5b01587 Typ Journal Article Autor Megow J Journal The Journal of Physical Chemistry C Seiten 5747-5751 Link Publikation -
2015
Titel The quest for energy traps in the CP43 antenna of photosystem II DOI 10.1016/j.jphotobiol.2015.05.023 Typ Journal Article Autor Müh F Journal Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology Seiten 286-300 -
2015
Titel Circularly polarized luminescence spectroscopy reveals low-energy excited states and dynamic localization of vibronic transitions in CP43 DOI 10.1016/j.bbabio.2015.09.012 Typ Journal Article Autor Hall J Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics Seiten 115-128 Link Publikation -
2017
Titel Electrostatic Asymmetry in the Reaction Center of Photosystem II DOI 10.1021/acs.jpclett.6b02823 Typ Journal Article Autor Mu¨H F Journal The Journal of Physical Chemistry Letters Seiten 850-858 -
2017
Titel Origin of non-conservative circular dichroism of the CP29 antenna complex of photosystem II DOI 10.1039/c6cp08778g Typ Journal Article Autor Lindorfer D Journal Physical Chemistry Chemical Physics Seiten 7524-7536 -
2016
Titel Structure Prediction of Self-Assembled Dye Aggregates from Cryogenic Transmission Electron Microscopy, Molecular Mechanics, and Theory of Optical Spectra DOI 10.1021/acs.jpcc.6b05856 Typ Journal Article Autor Friedl C Journal The Journal of Physical Chemistry C Seiten 19416-19433 Link Publikation -
2014
Titel Long-Wavelength Limit of Photochemical Energy Conversion in Photosystem I DOI 10.1021/ja412375j Typ Journal Article Autor Schlodder E Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 3904-3918 Link Publikation -
2014
Titel Revealing the Functional States in the Active Site of BLUF Photoreceptors from Electrochromic Shift Calculations DOI 10.1021/jp506400y Typ Journal Article Autor Collette F Journal The Journal of Physical Chemistry B Seiten 11109-11119 Link Publikation -
2014
Titel Towards a structure-based exciton Hamiltonian for the CP29 antenna of photosystem II DOI 10.1039/c3cp55166k Typ Journal Article Autor Müh F Journal Physical Chemistry Chemical Physics Seiten 11848-11863 Link Publikation -
2014
Titel Mixed Quantum-Classical Description of Excitation Energy Transfer in Supramolecular Complexes: Screening of the Excitonic Coupling DOI 10.1002/cphc.201300625 Typ Journal Article Autor Megow J Journal ChemPhysChem Seiten 478-485 -
2016
Titel Hole-Burning Spectroscopy on Excitonically Coupled Pigments in Proteins: Theory Meets Experiment DOI 10.1021/jacs.5b08246 Typ Journal Article Autor Adolphs J Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 2993-3001 Link Publikation -
2015
Titel Site-dependence of van der Waals interaction explains exciton spectra of double-walled tubular J-aggregates DOI 10.1039/c4cp05945j Typ Journal Article Autor Megow J Journal Physical Chemistry Chemical Physics Seiten 6741-6747 Link Publikation -
2015
Titel Variation of Exciton-Vibrational Coupling in Photosystem II Core Complexes from Thermosynechococcus elongatus As Revealed by Single-Molecule Spectroscopy DOI 10.1021/jp510631x Typ Journal Article Autor Skandary S Journal The Journal of Physical Chemistry B Seiten 4203-4210 Link Publikation -
2015
Titel Towards an ab initio description of the optical spectra of light-harvesting antennae: application to the CP29 complex of photosystem II DOI 10.1039/c4cp05647g Typ Journal Article Autor Jurinovich S Journal Physical Chemistry Chemical Physics Seiten 14405-14416 Link Publikation -
2013
Titel Photosystem II Does Not Possess a Simple Excitation Energy Funnel: Time-Resolved Fluorescence Spectroscopy Meets Theory DOI 10.1021/ja312586p Typ Journal Article Autor Shibata Y Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 6903-6914 Link Publikation -
2013
Titel Understanding photosynthetic light-harvesting: a bottom up theoretical approach DOI 10.1039/c3cp43439g Typ Journal Article Autor Renger T Journal Physical Chemistry Chemical Physics Seiten 3348-3371 Link Publikation -
2013
Titel Structure-based modeling of energy transfer in photosynthesis DOI 10.1007/s11120-013-9893-3 Typ Journal Article Autor Renger T Journal Photosynthesis Research Seiten 367-388 -
2014
Titel Structure-Based Calculation of Pigment–Protein and Excitonic Pigment–Pigment Coupling in Photosynthetic Light-Harvesting Complexes DOI 10.1007/978-1-4939-1148-6_1 Typ Book Chapter Autor Müh F Verlag Springer Nature Seiten 3-44 -
2014
Titel Calculating optical absorption spectra of thin polycrystalline films: Structural disorder and site-dependent van der Waals interaction DOI 10.48550/arxiv.1411.2818 Typ Preprint Autor Megow J -
2014
Titel Site-dependence of van der Waals interaction explains exciton spectra of double-walled tubular J-aggregates DOI 10.48550/arxiv.1412.3554 Typ Preprint Autor Megow J -
2018
Titel Photoinduced electron transfer in the reaction centers DOI 10.1201/9781351242899-15 Typ Book Chapter Verlag Taylor & Francis Seiten 327-357