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Mathematische Modellierung der Exhalationskinetik von Spurengasen

Mathematical modeling of trace gas exhalation kinetics

Karl Unterkofler (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P24736
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2012
  • Projektende 31.12.2015
  • Bewilligungssumme 359.263 €

Wissenschaftsdisziplinen

Mathematik (100%)

Keywords

    Mathematical Modeling, Breath Gas Analysis, PTR-MS, VOC, Blood-Gas Kinetics, Isoprene, Acetone

Abstract Endbericht

Aufgrund ihrer universellen Anwendbarkeit (z.B. durch nicht-invasive, unkomplizierte Probenabnahme) birgt die Atemgasanalyse ein großes Potential als vielseitiges Instrument für die medizinische Diagnostik sowie für allgemeine Biomonitoring-Anwendungen in Echtzeit. Parallel zur immer schneller fortschreitenden Entwicklung von diesbezüglichen chemischen Analysetechniken ist die Klärung einiger wesentlicher methodischen Fragen entscheidend, um die Atemgasanalyse im Standardrepertoire klinischer Tests zu etablieren. Wesentlich ist hierbei etwa der noch immer unterschätzte Einfluss von Blut-Gas-Kinetiken und systemischen Verteilungen der zu untersuchenden Spurengase (volatile organic compounds (VOCs)) auf die entsprechenden Atemgaskonzentrationen. Letztere werden vor allem beeinflusst durch: Atemfrequenz (bzw. Atemfluss), dem pulmonalen Blutfluss und den Gasaustausch im Alveolarraum Diffusionsmechanismen in den oberen Atemwegen Systemischen Konzentrationen dieser Substanzen, welche durch endogene Produktion, den Stoffwechsel und die Zirkulation bestimmt werden. In zwei kürzlich publizierten Artikeln 1,2 haben wir zwei mathematische Modelle für die Blut-Gas-Kinetik und die systemische Verteilung von zwei spezifischen Spurengasen, Aceton und Isopren, entwickelt. Aufgrund der Tatsache, dass diese beiden Stoffe ein relativ breites Spektrum von unterschiedlichen physikalisch-chemischen Eigenschaften abdecken, sind die bisherigen Ergebnisse ein hervorragender Ausgangspunkt für eine Verallgemeinerung unserer quantitativen Kenntnisse auf weitere experimentelle Szenarien sowie auf andere Klassen von endogenen und exogen verabreichten Spurengasen. Im Rahmen des vorgeschlagenen Projekts beabsichtigen wir zunächst das 3-Kompartiment-Modell für Isopren zu einem detaillierteren pharmakokinetischen Kompartiment-Modell zu erweitern, etwa durch Berücksichtigung von zusätzlichen Gewebe-Kompartimenten wie, Leber, Fett, reich durchblutetes Gewebe, ruhende Muskeln und arbeitende Muskeln. Im Zusammenspiel mit den begleitenden experimentellen Untersuchungen wird erwartet, dass hierdurch weitere Erkenntnisse zur Herkunft und Funktion von Isopren im Körper gewonnen werden können. Unsere durch Vorarbeiten untermauerte Arbeitshypothese besagt, dass eine periphere (Muskel-)Gewebegruppe als explizite extrahepatische Produktionsquelle von Isopren im Körper wirkt. Dies deutet insbesondere auf einen neuen, noch völlig unbekannten Stoffwechselweg für diesen am häufigsten im menschlichen Atem vorkommenden Kohlenwasserstoff hin. Schließlich planen wir das oben genannte Modell mit unserem bestehenden Aceton-Modell zu vereinen, mit dem Ziel ein allgemein gültiges, globales mechanistisches Modell für die quantitative Atemgasanalyse zu erhalten. Letzteres ermöglicht dann die Abschätzung von endogenen Produktions- und Stoffwechselraten oder die Rekonstruktion von Blut- und Gewebe-Konzentrationen aus den beobachtbaren Atemgaskonzentrationen. Als prototypischen Testfall innerhalb eines realistischen klinischen Anwendungsrahmens verwenden wir dieses globale Modell dann für die Echtzeit-Beurteilung des Narkose-Status auf Grundlage der ausgeatmeten Atemgaskonzentrationen des betreffenden Narkotikums. Die Arbeitspakete umfassen mehrere theoretische und experimentelle Untersuchungen zur Erreichung dieser Ziele. Unsere mathematischen Simulationsmodelle beruhen auf kausalen physikalischen Gesetzen, insbesondere Massenbilanz mittels Differentialgleichungen. Weitere in diesem Kontext eingesetzte mathematische Methoden umfassen unter anderem Identifizierbarkeit/Beobachtbarkeit, Hermann-Krener Rang-Kriterium, multiple shooting und Sensitivitätsanalyse. J. King, H. Koc, K. Unterkofler, P. Mochalski, A. Kupferthaler, G. Teschl, S. Teschl, H. Hinterhuber, and A. Amann: Physiological modeling of isoprene dynamics in exhaled breath, J. Theoret. Biol. 267 (2010) 626-637. J. King, K. Unterkofler, G. Teschl, S. Teschl, H. Koc, H. Hinterhuber, and A. Amann, A mathematical model for breath gas analysis of volatile organic compounds with special emphasis on acetone, J. Math. Biol 63 (2011), 959- 999.

Im menschlichen Körper werden verschiedenste flüchtige organische Substanzen (volatile organic compounds (VOCs)) freigesetzt, entweder körpereigen (endogen) erzeugt oder in Folge einer Erkrankung. Diese Substanzen gelangen in den Blutkreislauf, werden verstoffwechselt (metabolisiert) oder über die Atmung, Haut, Urin, etc. ausgeschieden.Die Analyse der Ausatemluft bietet eine einzigartige Möglichkeit auf verletzungsfreie (nichtinvasive) Weise Informationen über diese flüchtigen organischen Substanzen zu bekommen. Von Vorteil ist auch die Tatsache, dass Atemgasanalyse beliebig oft beziehungsweise fortlaufend und sogar in Echtzeit durchgeführt werden kann.All diese Fakten zeigen, dass Atemgasanalyse die ideale Wahl ist, um laufende Informationen über den augenblicklichen metabolischen und physiologischen Zu stand eines Individuums zu erhalten.In diesem Prozess ist die Identifizierung und mengenmäßige Bestimmung (Quantifizierung) von möglichen Krankheitsbiomarkern die treibende Kraft bei der Analyse der Ausatemluft. Weiters sind zukünftige Anwendungen für die medizinische Diagnostik und Therapiekontrolle mit laufender Beurteilung der normalen physiologischen Funktion beabsichtigt. Darüber hinaus können exogene VOCs, Substanzen, die in den Körper als Folge einer Umweltexposition eindringen, benutzt werden um die Körperbelastung zu quantifizieren. Schließlich kann mit Hilfe der Aufnahme von markierten Molekülen, die im Atem markiertes Kohlendioxid ergeben, die individuelle Stoffwechselrate (Metabolismusrate) von Patienten für verschiedene Medikamente (z.B. in der Krebstherapie) ermittelt werden, um die optimale Dosis zu bestimmen.Doch aufgrund einer ganzen Reihe von Störfaktoren, die die Konzentration von flüchtigen Stoffen in der Ausatemluft beeinflussen, ist die Atemgasanalyse derzeit, bis auf wenige Ausnahmen, noch weit von einem standardisierten Verfahren entfernt. Diese Faktoren beziehen sich sowohl auf die Verfahrensregeln der Atemprobenentnahme sowie auf die komplexen physiologischen Mechanismen des Gasaustausches in der Lunge. Selbst unter Ruhebedingungen kann die Ausatemluftkonzentrationen von VOCs stark von spezifischen physiologischen Parametern wie Pulsfrequenz und Atemfrequenz beeinflusst werden und des weiteren auch noch von den physikalisch-chemischen Eigenschaften der jeweiligen Substanz.Den Einfluss all dieser Faktoren auf die ausgeatmete Luft zu verstehen, ist daher fundamental für die genaue Standardisierung der Messung von Atem proben, um die entsprechenden Blutkonzentrationswerte berechnen zu können.Durch diese Standardisierung soll schlussendlich der Weg zur Routineanwendung von Atemgasanalyse in der Praxis geebnet werden.In diesem Projekt erweiterten wir zwei kürzlich von uns entwickelte Modelle, um den Einfluss der Umgebungsluft auf die Ausatemluft zu berücksichtigen. Des weiteren entwickelten wir auch ein vollständig neues Modell, das die Produktion von Methan im menschlichen Darm beschreibt. Diese Modelle wurden durch Ergometerversuche auch experimentell bestätigt. Sie erlauben die Bestimmung von Blutkonzentrationen aus den entsprechenden Ausatemkonzentrationen und ermöglichen auch die Berechnung der Produktionsraten und Stoffwechselraten aus der Ausatemkonzentration.Darüber hinaus wurde das Wissen in einer Reihe von Untersuchungen des menschlichen Volatilomes" (das ist die Summe aller ausgeschiedenen flüchtigen organischen Substanzen) stark erweitert:(i) In einer Untersuchung quantifizierten wir insgesamt 74 flüchtige organische Verbindungen, die sowohl im Blut als auch im Atem der Probanden nachweisbar waren.(ii) In mehreren weiteren Arbeiten wurde eine Datenbank von über die Haut emittierten flüchtigen organischen Substanzen erstellt. Diese Stoffe haben ein hohes Potential als Marker der menschlichen Anwesenheit, und sind hervorragend geeignet, um die Lage von verschütteten Erdbebenopfern zu ermitteln.(iii) Schließlich wurde das Vorhandensein von Biomarkern in der Ausatemluft auf ihre Brauchbarkeit als Marker für Krebserkrankungen evaluiert.Insgesamt wurden 25 Artikel in renommierten Zeitschriften veröffentlicht.

Forschungsstätte(n)
  • FH Vorarlberg - 49%
  • Universität Innsbruck - 51%
Nationale Projektbeteiligte
  • Karl Unterkofler, FH Vorarlberg , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Wolfram Miekisch, Universität Rostock - Deutschland
  • Gunnar Johanson, Karolinska Institutet - Schweden

Research Output

  • 2317 Zitationen
  • 33 Publikationen
Publikationen
  • 2019
    Titel PTR-MS studies of the reactions of H3O+ with a number of deuterated volatile organic compounds and the subsequent sequential reactions of the primary product ions with water under normal and humid drift tube conditions: Implications for use of deuter
    DOI 10.1016/j.ijms.2018.11.007
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal International Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 65-70
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Ex vivo emission of volatile organic compounds from gastric cancer and non-cancerous tissue
    DOI 10.1088/1752-7163/aacbfb
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 046005
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Prediction of blood:air and fat:air partition coefficients of volatile organic compounds for the interpretation of data in breath gas analysisDedicated to the memory of our friend, colleague, and mentor Anton Amann.
    DOI 10.1088/1752-7155/10/1/017103
    Typ Journal Article
    Autor Kramer C
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 017103
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Potential of volatile organic compounds as markers of entrapped humans for use in urban search-and-rescue operations
    DOI 10.1016/j.trac.2015.02.013
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal TrAC Trends in Analytical Chemistry
    Seiten 88-106
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Exhaled methane concentration profiles during exercise on an ergometer
    DOI 10.1088/1752-7155/9/1/016009
    Typ Journal Article
    Autor Szabó A
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 016009
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Modeling-based determination of physiological parameters of systemic VOCs by breath gas analysis: a pilot study
    DOI 10.1088/1752-7155/9/3/036002
    Typ Journal Article
    Autor Unterkofler K
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 036002
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Non-contact breath sampling for sensor-based breath analysis
    DOI 10.1088/1752-7163/ab0b8d
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 036001
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Assessment, origin, and implementation of breath volatile cancer markers
    DOI 10.1039/c3cs60329f
    Typ Journal Article
    Autor Haick H
    Journal Chemical Society Reviews
    Seiten 1423-1449
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Assessment of the exhalation kinetics of volatile cancer biomarkers based on their physicochemical properties
    DOI 10.1088/1752-7155/8/1/016003
    Typ Journal Article
    Autor Amann A
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 016003
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Monitoring of Selected Skin-Borne Volatile Markers of Entrapped Humans by Selective Reagent Ionization Time of Flight Mass Spectrometry in NO+ Mode
    DOI 10.1021/ac404242q
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 3915-3923
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Product ion distributions for the reactions of NO+ with some physiologically significant volatile organosulfur and organoselenium compounds obtained using a selective reagent ionization time-of-flight mass spectrometer
    DOI 10.1002/rcm.6947
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Rapid Communications in Mass Spectrometry
    Seiten 1683-1690
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Chapter 3 Physiological Modeling for Analysis of Exhaled Breath
    DOI 10.1016/b978-0-44-462613-4.00003-9
    Typ Book Chapter
    Autor King J
    Verlag Elsevier
    Seiten 26-46
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Volatile organic compounds in exhaled breath: real-time measurements, modeling, and bio-monitoring applications.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor King J
    Konferenz The 1st International Workshop on Innovative Simulation for Health Care, W. Backfrieder et al. (eds), Proceedings of IWISH 2012
  • 2014
    Titel Emission rates of selected volatile organic compounds from skin of healthy volunteers
    DOI 10.1016/j.jchromb.2014.04.006
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Journal of Chromatography B
    Seiten 62-70
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Product ion distributions for the reactions of NO+ with some physiologically significant aldehydes obtained using a SRI-TOF-MS instrument
    DOI 10.1016/j.ijms.2014.02.016
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal International Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 23-31
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Blood and breath profiles of volatile organic compounds in patients with end-stage renal disease
    DOI 10.1186/1471-2369-15-43
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal BMC Nephrology
    Seiten 43
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Breath isoprene: Muscle dystrophy patients support the concept of a pool of isoprene in the periphery of the human body
    DOI 10.1016/j.bbrc.2012.05.159
    Typ Journal Article
    Autor King J
    Journal Biochemical and Biophysical Research Communications
    Seiten 526-530
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Modeling of breath methane concentration profiles during exercise on an ergometer*
    DOI 10.1088/1752-7155/10/1/017105
    Typ Journal Article
    Autor Szabó A
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 017105
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Quantification of selected volatile organic compounds in human urine by gas chromatography selective reagent ionization time of flight mass spectrometry (GC-SRI-TOF-MS) coupled with head-space solid-phase microextraction (HS-SPME)
    DOI 10.1039/c6an00825a
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Analyst
    Seiten 4796-4803
    Link Publikation
  • 2016
    Titel A Compendium of Volatile Organic Compounds (VOCs) Released By Human Cell Lines
    DOI 10.2174/0929867323666160510122913
    Typ Journal Article
    Autor Filipiak W
    Journal Current Medicinal Chemistry
    Seiten 2112-2131
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Hybrid Volatolomics and Disease Detection
    DOI 10.1002/anie.201500153
    Typ Journal Article
    Autor Broza Y
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 11036-11048
  • 2015
    Titel Trace detection of endogenous human volatile organic compounds for search, rescue and emergency applications
    DOI 10.1016/j.trac.2014.11.018
    Typ Journal Article
    Autor Agapiou A
    Journal TrAC Trends in Analytical Chemistry
    Seiten 158-175
  • 2015
    Titel Hybride Volatolomik und der Nachweis von Krankheiten
    DOI 10.1002/ange.201500153
    Typ Journal Article
    Autor Broza Y
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 11188-11201
  • 2013
    Titel Stability of selected volatile breath constituents in Tedlar, Kynar and Flexfilm sampling bags
    DOI 10.1039/c2an36193k
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Analyst
    Seiten 1405-1418
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Release and uptake of volatile organic compounds by human hepatocellular carcinoma cells (HepG2) in vitro
    DOI 10.1186/1475-2867-13-72
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Cancer Cell International
    Seiten 72
    Link Publikation
  • 2013
    Titel ABA-Cloud: support for collaborative breath research
    DOI 10.1088/1752-7155/7/2/026007
    Typ Journal Article
    Autor Elsayed I
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 026007
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Blood and breath levels of selected volatile organic compounds in healthy volunteers
    DOI 10.1039/c3an36756h
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Analyst
    Seiten 2134-2145
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Product ion distributions for the reactions of NO+ with some N-containing and O-containing heterocyclic compounds obtained using SRI-TOF-MS
    DOI 10.1016/j.ijms.2015.06.003
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal International Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 42-46
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Analysis of Volatile Organic Compounds Liberated and Metabolised by Human Umbilical Vein Endothelial Cells (HUVEC) In Vitro
    DOI 10.1007/s12013-014-0201-4
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Cell Biochemistry and Biophysics
    Seiten 323-329
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Quantitative analysis of volatile organic compounds released and consumed by rat L6 skeletal muscle cells in vitro
    DOI 10.1088/1752-7155/8/4/046003
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 046003
    Link Publikation
  • 2018
    Titel In vitro profiling of volatile organic compounds released by Simpson-Golabi-Behmel syndrome adipocytes
    DOI 10.1016/j.jchromb.2018.11.028
    Typ Journal Article
    Autor Mochalski P
    Journal Journal of Chromatography B
    Seiten 256-261
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Sniffing Entrapped Humans with Sensor Arrays
    DOI 10.1021/acs.analchem.8b00237
    Typ Journal Article
    Autor Gu¨Ntner A
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 4940-4945
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Modeling-based determination of physiological parameters of systemic VOCs by breath gas analysis, part 2
    DOI 10.1088/1752-7163/aab2b6
    Typ Journal Article
    Autor Ager C
    Journal Journal of Breath Research
    Seiten 036011
    Link Publikation

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