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Leguminosen: Multilevelanalyse hin zur Trockenstresstoleranz

Multilevel analysis towards drought tolerance in Legumes

Stefanie Wienkoop (ORCID: 0000-0003-3575-813X)
  • Grant-DOI 10.55776/P23441
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.05.2011
  • Projektende 31.05.2014
  • Bewilligungssumme 378.483 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (40%); Mathematik (10%); Physik, Astronomie (50%)

Keywords

    Systems Biology, Proteins and Metabolites, Mass Spectrometry, Biomarker, Medicago truncatula, Abiotic Stress

Abstract Endbericht

Eine der wichtigsten Funktionen der Pflanzenzellen ist die Fähigkeit auf Änderungen ihrer Umwelt zu reagieren. Das Verständnis von Zusammenhängen zwischen Initialantworten und den nachfolgenden Reaktionen, die eine erfolgreiche Anpassung an Umweltschwankungen erzeugen, ist eine der Herausforderungen der Pflanzenphysiologieforschung. Die häufigsten Untersuchen wurden bislang auf Transkriptionsebene durchgeführt. Neben Transkriptomanalysen ermöglichen neuere Technologien wie die der Massenspektrometrie, umfangreiche metabolom und proteome Studien. Bisherige Untersuchungen konzentrierten sich auf unterschiedliche Arten des abiotischen Stresses wie Temperatur, Trockenheit oder Salz mittels verschiedenster Pflanzen und Technologien. Alle diese Daten haben das Verständnis zur Komplexizität der pflanzlichen Antwort, abhängig von Intensität und Dauer der Störung des physiologischen Gleichgewichts, verbessert. Trotzdem sind ein Vergleich und eine Verbindung wegen der Diversität der Daten sowie der experimentellen Bedingungen schwierig oder sogar unmöglich. Daher werden in Zukunft die Kombination verschiedener Technologien und die Vereinheitlichung von Anzuchtsbedingungen nötig sein, um ein besseres Verständnis der komplexen Reaktionen des pflanzlichen Systems zu erhalten. Leguminosen liefern die Hauptquelle pflanzlichen Proteins und sind wegen ihrer Fähigkeit zur Stickstofffixierung über die Symbiose mit Erdrhizobien wichtig für nachhaltige Landwirtschaft. Diese Bakterien kolonisieren die Wurzeln der Leguminosen über die Bildung spezialisierte Organe, den Knöllchen. Der wechselseitige regulatorische Mechanismus zwischen Pflanze und Bakteroid zur erhöhten Stresstoleranz ist bis heute unklar. Stress verursachte, unvorhersehbare Schwankungen von Ertrag und Gewinn sind die Haupthemmnisse für eine nachhaltige Leguminosen-produktion in Europa. Im beantragten Projekt sollen vergleichende Systembiologische technologien eingesetzt werden um zu einem verbesserten Verständnis der Reaktionen von Leguminosen auf Hauptstressfaktoren als Grundvoraussetzung zur wissensbasierten Züchtung für nachhaltige und erhöhte Profitabilität zu gelangen. Dabei sollen neue metabolomische und proteomische Schlüsselmechanismen über bioinformatorische Auswertungsverfahren als regulatorische Marker für eine verbesserte Stresstoleranz identifiziert werden

Mittels mehrstufiger Analyseverfahren und technologischer Weiterentwicklungen innerhalb dieses Projektes ist es der Forschungsgruppe um Stefanie Wienkoop gelungen einen bisher weitestgehend unbekannten molekularen Mechanismus zu beschreiben. Dieser spielt bei Leguminosen, wie z.B. Erbse und Bohne, im Zusammenhang mit verbesserter Trockenstresstoleranz eine wesentliche Rolle. Leguminosen können eine für sie vorteilhafte Interaktion (Symbiose) mit Bodenbakterien (Rhizobien) eingehen. Die Forscher konnten nachweisen, dass diese Pflanzen-Rhizobien- Interaktion hier eine Schlüsselrolle spielt. Ein Alterungsprozess der Blätter, der durch Wassermangel in Pflanzen normalerweise induziert wird, kann durch Interaktion mit Rhizobien, verlangsamt werden. Dieser verlangsamte Alterungsprozess wird auch als stay-green (grün-bleib) Effekt bezeichnet und ist in der Agrarwissenschaft schon länger bekannt, jedoch bisher nicht physiologisch verstanden. Trockenstress ist eine der Hauptursachen für Ernteverluste und spielt im Zuge von Klimaänderungen eine immer bedeutendere Rolle. Leguminosen sind die Hauptnahrungsquelle für die Proteinzufuhr bei Mensch und Tier. Die gezielte Anwendung von spezifischen Bodenbakterien an Stelle von stickstoffhaltiger Fertilisation kann, neben der erhöhten Trockenstresstoleranz, auch Kosten senken ohne Wachstum und Ertrag der Pflanzen zu verringern. Neben einer durch die symbiotische Interaktion beeinflussten, molekularen Grundeinstellung der Pflanzen (ähnlich einer Impfung), fand das Forscherteam potentielle Schlüsselmoleküle, die auch bei biotechnologische Verfahren zur verbesserten Trockenstresstoleranz ihre Anwendung finden könnten. Diese sind möglicherweise auch auf andere Pflanzenfamilien übertragbar. Eines der Schlüsselmoleküle konnte bereits innerhalb des Projektes genauer untersucht werden.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Stefan Kempa, Helmholtz-Gemeinschaft Deutscher Forschungszentren - Deutschland
  • Esther Maria Gonzalez, Public University of Navarre - Spanien
  • Michael K. Udvardi, The Samuel Roberts Noble Foundation - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 602 Zitationen
  • 12 Publikationen
Publikationen
  • 2012
    Titel Possible Role of Nutritional Priming for Early Salt and Drought Stress Responses in Medicago truncatula
    DOI 10.3389/fpls.2012.00285
    Typ Journal Article
    Autor Staudinger C
    Journal Frontiers in Plant Science
    Seiten 285
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Leghemoglobin is nitrated in functional legume nodules in a tyrosine residue within the heme cavity by a nitrite/peroxide-dependent mechanism
    DOI 10.1111/tpj.12762
    Typ Journal Article
    Autor Sainz M
    Journal The Plant Journal
    Seiten 723-735
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Drought and Recovery: Independently Regulated Processes Highlighting the Importance of Protein Turnover Dynamics and Translational Regulation in Medicago truncatula *
    DOI 10.1074/mcp.m115.049205
    Typ Journal Article
    Autor Lyon D
    Journal Molecular & Cellular Proteomics
    Seiten 1921-1937
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Medicago truncatula Proteomics for Systems Biology: Novel Rapid Shotgun LC-MS Approach for Relative Quantification Based on Full-Scan Selective Peptide Extraction (Selpex)
    DOI 10.1007/978-1-62703-631-3_22
    Typ Book Chapter
    Autor Castillejo M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 303-313
  • 2015
    Titel Medicago truncatula and Glycine max: Different Drought Tolerance and Similar Local Response of the Root Nodule Proteome
    DOI 10.1021/acs.jproteome.5b00617
    Typ Journal Article
    Autor Gil-Quintana E
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 5240-5251
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Targeted quantitative analysis of a diurnal RuBisCO subunit expression and translation profile in Chlamydomonas reinhardtii introducing a novel Mass Western approach
    DOI 10.1016/j.jprot.2014.09.026
    Typ Journal Article
    Autor Recuenco-Muñoz L
    Journal Journal of Proteomics
    Seiten 143-153
  • 2016
    Titel Evidence for a rhizobia-induced drought stress response strategy in Medicago truncatula
    DOI 10.1016/j.jprot.2016.01.006
    Typ Journal Article
    Autor Staudinger C
    Journal Journal of Proteomics
    Seiten 202-213
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Comprehensive Cell-specific Protein Analysis in Early and Late Pollen Development from Diploid Microsporocytes to Pollen Tube Growth*
    DOI 10.1074/mcp.m113.028100
    Typ Journal Article
    Autor Ischebeck T
    Journal Molecular & Cellular Proteomics
    Seiten 295-310
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Granger causality in integrated GC–MS and LC–MS metabolomics data reveals the interface of primary and secondary metabolism
    DOI 10.1007/s11306-012-0470-0
    Typ Journal Article
    Autor Doerfler H
    Journal Metabolomics
    Seiten 564-574
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Phytochemical composition of Potentilla anserina L. analyzed by an integrative GC-MS and LC-MS metabolomics platform
    DOI 10.1007/s11306-012-0473-x
    Typ Journal Article
    Autor Mari A
    Journal Metabolomics
    Seiten 599-607
    Link Publikation
  • 2014
    Titel mzGroupAnalyzer-Predicting Pathways and Novel Chemical Structures from Untargeted High-Throughput Metabolomics Data
    DOI 10.1371/journal.pone.0096188
    Typ Journal Article
    Autor Doerfler H
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Automated Protein Turnover Calculations from 15N Partial Metabolic Labeling LC/MS Shotgun Proteomics Data
    DOI 10.1371/journal.pone.0094692
    Typ Journal Article
    Autor Lyon D
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation

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