Leguminosen: Multilevelanalyse hin zur Trockenstresstoleranz
Multilevel analysis towards drought tolerance in Legumes
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (40%); Mathematik (10%); Physik, Astronomie (50%)
Keywords
-
Systems Biology,
Proteins and Metabolites,
Mass Spectrometry,
Biomarker,
Medicago truncatula,
Abiotic Stress
Eine der wichtigsten Funktionen der Pflanzenzellen ist die Fähigkeit auf Änderungen ihrer Umwelt zu reagieren. Das Verständnis von Zusammenhängen zwischen Initialantworten und den nachfolgenden Reaktionen, die eine erfolgreiche Anpassung an Umweltschwankungen erzeugen, ist eine der Herausforderungen der Pflanzenphysiologieforschung. Die häufigsten Untersuchen wurden bislang auf Transkriptionsebene durchgeführt. Neben Transkriptomanalysen ermöglichen neuere Technologien wie die der Massenspektrometrie, umfangreiche metabolom und proteome Studien. Bisherige Untersuchungen konzentrierten sich auf unterschiedliche Arten des abiotischen Stresses wie Temperatur, Trockenheit oder Salz mittels verschiedenster Pflanzen und Technologien. Alle diese Daten haben das Verständnis zur Komplexizität der pflanzlichen Antwort, abhängig von Intensität und Dauer der Störung des physiologischen Gleichgewichts, verbessert. Trotzdem sind ein Vergleich und eine Verbindung wegen der Diversität der Daten sowie der experimentellen Bedingungen schwierig oder sogar unmöglich. Daher werden in Zukunft die Kombination verschiedener Technologien und die Vereinheitlichung von Anzuchtsbedingungen nötig sein, um ein besseres Verständnis der komplexen Reaktionen des pflanzlichen Systems zu erhalten. Leguminosen liefern die Hauptquelle pflanzlichen Proteins und sind wegen ihrer Fähigkeit zur Stickstofffixierung über die Symbiose mit Erdrhizobien wichtig für nachhaltige Landwirtschaft. Diese Bakterien kolonisieren die Wurzeln der Leguminosen über die Bildung spezialisierte Organe, den Knöllchen. Der wechselseitige regulatorische Mechanismus zwischen Pflanze und Bakteroid zur erhöhten Stresstoleranz ist bis heute unklar. Stress verursachte, unvorhersehbare Schwankungen von Ertrag und Gewinn sind die Haupthemmnisse für eine nachhaltige Leguminosen-produktion in Europa. Im beantragten Projekt sollen vergleichende Systembiologische technologien eingesetzt werden um zu einem verbesserten Verständnis der Reaktionen von Leguminosen auf Hauptstressfaktoren als Grundvoraussetzung zur wissensbasierten Züchtung für nachhaltige und erhöhte Profitabilität zu gelangen. Dabei sollen neue metabolomische und proteomische Schlüsselmechanismen über bioinformatorische Auswertungsverfahren als regulatorische Marker für eine verbesserte Stresstoleranz identifiziert werden
Mittels mehrstufiger Analyseverfahren und technologischer Weiterentwicklungen innerhalb dieses Projektes ist es der Forschungsgruppe um Stefanie Wienkoop gelungen einen bisher weitestgehend unbekannten molekularen Mechanismus zu beschreiben. Dieser spielt bei Leguminosen, wie z.B. Erbse und Bohne, im Zusammenhang mit verbesserter Trockenstresstoleranz eine wesentliche Rolle. Leguminosen können eine für sie vorteilhafte Interaktion (Symbiose) mit Bodenbakterien (Rhizobien) eingehen. Die Forscher konnten nachweisen, dass diese Pflanzen-Rhizobien- Interaktion hier eine Schlüsselrolle spielt. Ein Alterungsprozess der Blätter, der durch Wassermangel in Pflanzen normalerweise induziert wird, kann durch Interaktion mit Rhizobien, verlangsamt werden. Dieser verlangsamte Alterungsprozess wird auch als stay-green (grün-bleib) Effekt bezeichnet und ist in der Agrarwissenschaft schon länger bekannt, jedoch bisher nicht physiologisch verstanden. Trockenstress ist eine der Hauptursachen für Ernteverluste und spielt im Zuge von Klimaänderungen eine immer bedeutendere Rolle. Leguminosen sind die Hauptnahrungsquelle für die Proteinzufuhr bei Mensch und Tier. Die gezielte Anwendung von spezifischen Bodenbakterien an Stelle von stickstoffhaltiger Fertilisation kann, neben der erhöhten Trockenstresstoleranz, auch Kosten senken ohne Wachstum und Ertrag der Pflanzen zu verringern. Neben einer durch die symbiotische Interaktion beeinflussten, molekularen Grundeinstellung der Pflanzen (ähnlich einer Impfung), fand das Forscherteam potentielle Schlüsselmoleküle, die auch bei biotechnologische Verfahren zur verbesserten Trockenstresstoleranz ihre Anwendung finden könnten. Diese sind möglicherweise auch auf andere Pflanzenfamilien übertragbar. Eines der Schlüsselmoleküle konnte bereits innerhalb des Projektes genauer untersucht werden.
- Universität Wien - 100%
- Stefan Kempa, Helmholtz-Gemeinschaft Deutscher Forschungszentren - Deutschland
- Esther Maria Gonzalez, Public University of Navarre - Spanien
- Michael K. Udvardi, The Samuel Roberts Noble Foundation - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 602 Zitationen
- 12 Publikationen
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2012
Titel Possible Role of Nutritional Priming for Early Salt and Drought Stress Responses in Medicago truncatula DOI 10.3389/fpls.2012.00285 Typ Journal Article Autor Staudinger C Journal Frontiers in Plant Science Seiten 285 Link Publikation -
2015
Titel Leghemoglobin is nitrated in functional legume nodules in a tyrosine residue within the heme cavity by a nitrite/peroxide-dependent mechanism DOI 10.1111/tpj.12762 Typ Journal Article Autor Sainz M Journal The Plant Journal Seiten 723-735 Link Publikation -
2016
Titel Drought and Recovery: Independently Regulated Processes Highlighting the Importance of Protein Turnover Dynamics and Translational Regulation in Medicago truncatula * DOI 10.1074/mcp.m115.049205 Typ Journal Article Autor Lyon D Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 1921-1937 Link Publikation -
2013
Titel Medicago truncatula Proteomics for Systems Biology: Novel Rapid Shotgun LC-MS Approach for Relative Quantification Based on Full-Scan Selective Peptide Extraction (Selpex) DOI 10.1007/978-1-62703-631-3_22 Typ Book Chapter Autor Castillejo M Verlag Springer Nature Seiten 303-313 -
2015
Titel Medicago truncatula and Glycine max: Different Drought Tolerance and Similar Local Response of the Root Nodule Proteome DOI 10.1021/acs.jproteome.5b00617 Typ Journal Article Autor Gil-Quintana E Journal Journal of Proteome Research Seiten 5240-5251 Link Publikation -
2014
Titel Targeted quantitative analysis of a diurnal RuBisCO subunit expression and translation profile in Chlamydomonas reinhardtii introducing a novel Mass Western approach DOI 10.1016/j.jprot.2014.09.026 Typ Journal Article Autor Recuenco-Muñoz L Journal Journal of Proteomics Seiten 143-153 -
2016
Titel Evidence for a rhizobia-induced drought stress response strategy in Medicago truncatula DOI 10.1016/j.jprot.2016.01.006 Typ Journal Article Autor Staudinger C Journal Journal of Proteomics Seiten 202-213 Link Publikation -
2013
Titel Comprehensive Cell-specific Protein Analysis in Early and Late Pollen Development from Diploid Microsporocytes to Pollen Tube Growth* DOI 10.1074/mcp.m113.028100 Typ Journal Article Autor Ischebeck T Journal Molecular & Cellular Proteomics Seiten 295-310 Link Publikation -
2012
Titel Granger causality in integrated GC–MS and LC–MS metabolomics data reveals the interface of primary and secondary metabolism DOI 10.1007/s11306-012-0470-0 Typ Journal Article Autor Doerfler H Journal Metabolomics Seiten 564-574 Link Publikation -
2012
Titel Phytochemical composition of Potentilla anserina L. analyzed by an integrative GC-MS and LC-MS metabolomics platform DOI 10.1007/s11306-012-0473-x Typ Journal Article Autor Mari A Journal Metabolomics Seiten 599-607 Link Publikation -
2014
Titel mzGroupAnalyzer-Predicting Pathways and Novel Chemical Structures from Untargeted High-Throughput Metabolomics Data DOI 10.1371/journal.pone.0096188 Typ Journal Article Autor Doerfler H Journal PLoS ONE Link Publikation -
2014
Titel Automated Protein Turnover Calculations from 15N Partial Metabolic Labeling LC/MS Shotgun Proteomics Data DOI 10.1371/journal.pone.0094692 Typ Journal Article Autor Lyon D Journal PLoS ONE Link Publikation