Gleichgewichts- und Transporteigenschaften ringförmiger Polymere
Equilibrium and transport properties of ring polymers
Wissenschaftsdisziplinen
Physik, Astronomie (100%)
Keywords
-
Theoretical Physics,
Soft Matter Physics,
Computational Physics,
Polymer Physics,
Statistical Physics,
Topology/Knot Theory
Ziel des vorliegenden Projektes ist die Untersuchung der Schlüsseleigenschaften von verdünnten und konzentrierten Lösungen ringförmiger (zyklischer) Polymere. Wir wollen Aufschluss darüber erlangen, wie die Wechselwirkungen zwischen Biegesteifigkeit, Ladung, Lösungsmittelqualität und Topologie auf die Gleichgewichts- und Transporteigenschaften dieser Makromoleküle Einfluss nehmen. Ein gut etabliertes und erprobtes Modell für flexible ringförmige Polymere unter athermischen Lösungsmittelbedingungen [A. Narros, A.J. Moreno, and C. N. Likos, Soft Matter 6, 2345 (2010)] soll modifiziert werden, um den oben genannten neuen mikroskopischen Eigenschaften Rechnung zu tragen: die einstellbare Biegesteifigkeit zwischen den Verbindungen wird durch eine geeignete Drei-Körper-Interaktion modifiziert, die Lösungsqualität durch attraktive Monomer- Monomer-Interaktionen und elektrische Ladung durch Coulomb`sche Wechselwirkungen. Wir werden effektive Wechselwirkungen zwischen den Massemittelpunkten der modifizierten ringförmigen Polymere ableiten, um den Einfluss der oben genannten Faktoren auf die Form der Ringe, auf die realistische Möglichkeit der Clusterbildung nach Einführung der Biegesteifigkeit und auf die Gleichgewichtsdynamik bei unterschiedlicher Lösungsqualität zu erforschen. In allen Fällen soll der Einfluss der Topologie, die sich anhand von permanent ineinandergreifenden Knoten manifestiert, analysiert werden. Ringförmige Polymere werden auch in eingeschränkter Geometrie betrachtet, um ihre Absorptionseigenschaften im Vergleich zu jenen linearer Ketten zu untersuchen und um die Möglichkeit von oberflächeninduzierter Knotenlokalisierung zu erforschen. Schließlich soll das Ungleichgewichtsverhalten der Ringe unter Scherung und Poiseuille-Fluss untersucht werden, mit dem Ziel, den Einfluss der Knoten auf die Verlagerungsmöglichkeiten entlang von engen Kanälen zu untersuchen. Die Methoden des Projektes decken ein breites Spektrum von Simulationstechniken (Monte Carlo, Molekulare und Brown`sche Dynamik, Multi-Particle Collisional Dynamik) sowie Dichtefunktionaltheorie und Skalentheorie von Polymeren ab.
Das Projekt konzentrierte sich auf die Untersuchung der Eigenschaften zyklischer Polymere, d. H. makromolekularer Ketten ohne freie Enden, die aus der Verbindung der beiden freien Enden der Kette miteinander resultieren. Das allgemeine Thema ist von hohem wissenschaftlichem, technologischem und biologischem Interesse, und zwar aus einer Reihe von Gründen: Erstens führt die einfache Verknüpfung der beiden Enden eines Polymers zu einem starken und irreversiblen topologischen Zwang, nämlich der Einführung des Nicht- Verkettungsbedingung, die effektiv als zusätzliche Abstoßung zwischen den Ringen wirkt. Dies hat weitreichende Konsequenzen für die Formen, die die Ringe in hoher Konzentration annehmen, einschließlich ihrer Organisation in klar definierten Territorien, im Gegensatz zu offenen Ketten, die ausgedehnte Konfigurationen mit mehreren Überlappungen aufweisen. Aus technologischer Sicht unterscheiden sich Ringpolymerlösungen und -Schmelzen in ihren Fließeigenschaften deutlich von ihren linearen Gegenstücken, da ihnen der klassische Mechanismus der Verschränkungen fehlt, die die Fließeigenschaften von Ketten dominieren, und stattdessen zerknitterte Konfigurationen mit mehreren Gewinden aufweisen. Schließlich werden Biomakromoleküle, wie mitochondriale DNA oder virale RNA, häufig in zyklischen oderverknotetenFormen gefunden, unddiesbeeinflusstdrastischihre Reproduktionseigenschaften oder die Mechanismen ihrer Ausstöße von den viralen Kapsiden. Das Projekt förderte unser Verständnis von Ringpolymeren und der Stabilität von Knoten sowohl in der Masse als auch in der geometrischen Anordnung im Gleichgewicht, und brachte neue Einblicke in die Art und Weise, in der Ringe transportiert und geschert werden, wodurch das Zusammenspiel zwischen Topologie und Hydrodynamik aufgeklärt wurde. Es wurde entdeckt, dass im Gegensatz zu naiven Erwartungen ein Knoten an einem Ring unter Spannung sich nicht in der flexibelsten Region des Moleküls lokalisieren lässt. Stattdessen gibt es eine Domäne mit optimaler Steifigkeit, um den Knoten zu finden, verursacht durch ein subtiles Wechselspiel zwischen der Krümmung des Knotens und der Dehnung der Stränge im Bereich der Knotenverschweißung. Dieser Befund hat Konsequenzen für das Verständnis der Lage von Knoten entlang der Rückkette von DNA-Molekülen, die tatsächlich eine Starrheit aufweisen, die von der Basenpaar-Sequenz abhängt. Eine weitere wichtige Entdeckung, die im Rahmen dieses Projekts gemacht wurde, war die Entstehung einer neuartigen makroskopischen Phase von Materie in Lösungen von starren Ringpolymeren, die als Clusterglas bezeichnet wurde. Hier organisieren sich die Ringe in einem amorphen Gerüst aus Territorien oder Clustern, die aus vielen Ringen bestehen, die extrem lange verlangsamt oder sogar eingefroren werden und dadurch einen starren makroskopischen Zustand erzeugen, der als Glas bekannt ist. Im Gegensatz zu gewöhnlichem Glas können einzelne Ringe jedoch von einem Cluster zum anderen springen und dadurch eine Entkopplung zwischen Selbst- und Kollektivrelaxationen im System bewirken. Der dritte wichtige neue Befund in diesem Projekt betrifft schließlich die Eigenschaften von Ringpolymeren (sowohl knotenfrei als auch verknotet) unter Transport oder Scherung. Hier entdeckten wir, dass eine einzigartige Kombination von hydrodynamischen Wechselwirkungen (Rückfluss) und Topologie (geschlossene Form der Ringe) bewirkt, dass die Ringe unter Scherung gestreckte, offene Konfigurationen bilden, im Gegensatz zu den schlanken, stabförmigen Konfigurationen, die von linearen Ketten angenommen werden. Dies eröffnet den Weg zu schnellen und effizienten Filtertechniken, die auf modernen mikrofluidischen Geräten basieren.
- Universität Wien - 100%
- Dimitris Vlassopoulos, Foundation for Research and Technology-Hellas - Griechenland
Research Output
- 533 Zitationen
- 15 Publikationen
-
2018
Titel Trefoil Knot Hydrodynamic Delocalization on Sheared Ring Polymers DOI 10.1021/acsmacrolett.8b00059 Typ Journal Article Autor Liebetreu M Journal ACS Macro Letters Seiten 447-452 -
2015
Titel An Anisotropic Effective Model for the Simulation of Semiflexible Ring Polymers DOI 10.1021/acs.macromol.5b00603 Typ Journal Article Autor Poier P Journal Macromolecules Seiten 4983-4997 Link Publikation -
2014
Titel Multi-blob coarse graining for ring polymer solutions DOI 10.1039/c4sm01904k Typ Journal Article Autor Narros A Journal Soft Matter Seiten 9601-9614 Link Publikation -
2014
Titel Effective Interactions between Multilayered Ionic Microgels DOI 10.3390/ma7127689 Typ Journal Article Autor Hanel C Journal Materials Seiten 7689-7705 Link Publikation -
2014
Titel Cluster Glasses of Semiflexible Ring Polymers DOI 10.1021/mz500117v Typ Journal Article Autor Slimani M Journal ACS Macro Letters Seiten 611-616 Link Publikation -
2016
Titel Anisotropic effective interactions and stack formation in mixtures of semiflexible ring polymers DOI 10.1039/c6sm00430j Typ Journal Article Autor Poier P Journal Soft Matter Seiten 4805-4820 -
2016
Titel Concentration-induced planar-to-homeotropic anchoring transition of stiff ring polymers on hard walls DOI 10.1039/c6sm01453d Typ Journal Article Autor Poier P Journal Soft Matter Seiten 7983-7994 -
2013
Titel Fluids of semiflexible ring polymers : effective potentials and clustering DOI 10.1039/c2sm27199k Typ Journal Article Autor Bernabei M Journal Soft Matter Seiten 1287-1300 Link Publikation -
2013
Titel Hierarchical self-assembly of telechelic star polymers: from soft patchy particles to gels and diamond crystals DOI 10.1088/1367-2630/15/9/095002 Typ Journal Article Autor Capone B Journal New Journal of Physics Seiten 095002 Link Publikation -
2013
Titel Effective interactions of knotted ring polymers DOI 10.1042/bst20120286 Typ Journal Article Autor Narros A Journal Biochemical Society Transactions Seiten 630-634 Link Publikation -
2013
Titel Architecture-Induced Size Asymmetry and Effective Interactions of Ring Polymers: Simulation and Theory DOI 10.1021/ma4016483 Typ Journal Article Autor Narros A Journal Macromolecules Seiten 9437-9445 Link Publikation -
2013
Titel Effects of Knots on Ring Polymers in Solvents of Varying Quality DOI 10.1021/ma400308x Typ Journal Article Autor Narros A Journal Macromolecules Seiten 3654-3668 Link Publikation -
2012
Titel Effect of Bending Rigidity on the Knotting of a Polymer under Tension DOI 10.1021/mz300493d Typ Journal Article Autor Matthews R Journal ACS Macro Letters Seiten 1352-1356 Link Publikation -
2017
Titel Topology-Sensitive Microfluidic Filter for Polymers of Varying Stiffness DOI 10.1021/acsmacrolett.7b00768 Typ Journal Article Autor Weiss L Journal ACS Macro Letters Seiten 1426-1431 Link Publikation -
2014
Titel Influence of Rigidity and Knot Complexity on the Knotting of Confined Polymers DOI 10.1021/ma5006414 Typ Journal Article Autor Poier P Journal Macromolecules Seiten 3394-3400 Link Publikation