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Gleichgewichts- und Transporteigenschaften ringförmiger Polymere

Equilibrium and transport properties of ring polymers

Christos N. Likos (ORCID: 0000-0003-3550-4834)
  • Grant-DOI 10.55776/P23400
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.06.2011
  • Projektende 31.05.2018
  • Bewilligungssumme 300.510 €

Wissenschaftsdisziplinen

Physik, Astronomie (100%)

Keywords

    Theoretical Physics, Soft Matter Physics, Computational Physics, Polymer Physics, Statistical Physics, Topology/Knot Theory

Abstract Endbericht

Ziel des vorliegenden Projektes ist die Untersuchung der Schlüsseleigenschaften von verdünnten und konzentrierten Lösungen ringförmiger (zyklischer) Polymere. Wir wollen Aufschluss darüber erlangen, wie die Wechselwirkungen zwischen Biegesteifigkeit, Ladung, Lösungsmittelqualität und Topologie auf die Gleichgewichts- und Transporteigenschaften dieser Makromoleküle Einfluss nehmen. Ein gut etabliertes und erprobtes Modell für flexible ringförmige Polymere unter athermischen Lösungsmittelbedingungen [A. Narros, A.J. Moreno, and C. N. Likos, Soft Matter 6, 2345 (2010)] soll modifiziert werden, um den oben genannten neuen mikroskopischen Eigenschaften Rechnung zu tragen: die einstellbare Biegesteifigkeit zwischen den Verbindungen wird durch eine geeignete Drei-Körper-Interaktion modifiziert, die Lösungsqualität durch attraktive Monomer- Monomer-Interaktionen und elektrische Ladung durch Coulomb`sche Wechselwirkungen. Wir werden effektive Wechselwirkungen zwischen den Massemittelpunkten der modifizierten ringförmigen Polymere ableiten, um den Einfluss der oben genannten Faktoren auf die Form der Ringe, auf die realistische Möglichkeit der Clusterbildung nach Einführung der Biegesteifigkeit und auf die Gleichgewichtsdynamik bei unterschiedlicher Lösungsqualität zu erforschen. In allen Fällen soll der Einfluss der Topologie, die sich anhand von permanent ineinandergreifenden Knoten manifestiert, analysiert werden. Ringförmige Polymere werden auch in eingeschränkter Geometrie betrachtet, um ihre Absorptionseigenschaften im Vergleich zu jenen linearer Ketten zu untersuchen und um die Möglichkeit von oberflächeninduzierter Knotenlokalisierung zu erforschen. Schließlich soll das Ungleichgewichtsverhalten der Ringe unter Scherung und Poiseuille-Fluss untersucht werden, mit dem Ziel, den Einfluss der Knoten auf die Verlagerungsmöglichkeiten entlang von engen Kanälen zu untersuchen. Die Methoden des Projektes decken ein breites Spektrum von Simulationstechniken (Monte Carlo, Molekulare und Brown`sche Dynamik, Multi-Particle Collisional Dynamik) sowie Dichtefunktionaltheorie und Skalentheorie von Polymeren ab.

Das Projekt konzentrierte sich auf die Untersuchung der Eigenschaften zyklischer Polymere, d. H. makromolekularer Ketten ohne freie Enden, die aus der Verbindung der beiden freien Enden der Kette miteinander resultieren. Das allgemeine Thema ist von hohem wissenschaftlichem, technologischem und biologischem Interesse, und zwar aus einer Reihe von Gründen: Erstens führt die einfache Verknüpfung der beiden Enden eines Polymers zu einem starken und irreversiblen topologischen Zwang, nämlich der Einführung des Nicht- Verkettungsbedingung, die effektiv als zusätzliche Abstoßung zwischen den Ringen wirkt. Dies hat weitreichende Konsequenzen für die Formen, die die Ringe in hoher Konzentration annehmen, einschließlich ihrer Organisation in klar definierten Territorien, im Gegensatz zu offenen Ketten, die ausgedehnte Konfigurationen mit mehreren Überlappungen aufweisen. Aus technologischer Sicht unterscheiden sich Ringpolymerlösungen und -Schmelzen in ihren Fließeigenschaften deutlich von ihren linearen Gegenstücken, da ihnen der klassische Mechanismus der Verschränkungen fehlt, die die Fließeigenschaften von Ketten dominieren, und stattdessen zerknitterte Konfigurationen mit mehreren Gewinden aufweisen. Schließlich werden Biomakromoleküle, wie mitochondriale DNA oder virale RNA, häufig in zyklischen oderverknotetenFormen gefunden, unddiesbeeinflusstdrastischihre Reproduktionseigenschaften oder die Mechanismen ihrer Ausstöße von den viralen Kapsiden. Das Projekt förderte unser Verständnis von Ringpolymeren und der Stabilität von Knoten sowohl in der Masse als auch in der geometrischen Anordnung im Gleichgewicht, und brachte neue Einblicke in die Art und Weise, in der Ringe transportiert und geschert werden, wodurch das Zusammenspiel zwischen Topologie und Hydrodynamik aufgeklärt wurde. Es wurde entdeckt, dass im Gegensatz zu naiven Erwartungen ein Knoten an einem Ring unter Spannung sich nicht in der flexibelsten Region des Moleküls lokalisieren lässt. Stattdessen gibt es eine Domäne mit optimaler Steifigkeit, um den Knoten zu finden, verursacht durch ein subtiles Wechselspiel zwischen der Krümmung des Knotens und der Dehnung der Stränge im Bereich der Knotenverschweißung. Dieser Befund hat Konsequenzen für das Verständnis der Lage von Knoten entlang der Rückkette von DNA-Molekülen, die tatsächlich eine Starrheit aufweisen, die von der Basenpaar-Sequenz abhängt. Eine weitere wichtige Entdeckung, die im Rahmen dieses Projekts gemacht wurde, war die Entstehung einer neuartigen makroskopischen Phase von Materie in Lösungen von starren Ringpolymeren, die als Clusterglas bezeichnet wurde. Hier organisieren sich die Ringe in einem amorphen Gerüst aus Territorien oder Clustern, die aus vielen Ringen bestehen, die extrem lange verlangsamt oder sogar eingefroren werden und dadurch einen starren makroskopischen Zustand erzeugen, der als Glas bekannt ist. Im Gegensatz zu gewöhnlichem Glas können einzelne Ringe jedoch von einem Cluster zum anderen springen und dadurch eine Entkopplung zwischen Selbst- und Kollektivrelaxationen im System bewirken. Der dritte wichtige neue Befund in diesem Projekt betrifft schließlich die Eigenschaften von Ringpolymeren (sowohl knotenfrei als auch verknotet) unter Transport oder Scherung. Hier entdeckten wir, dass eine einzigartige Kombination von hydrodynamischen Wechselwirkungen (Rückfluss) und Topologie (geschlossene Form der Ringe) bewirkt, dass die Ringe unter Scherung gestreckte, offene Konfigurationen bilden, im Gegensatz zu den schlanken, stabförmigen Konfigurationen, die von linearen Ketten angenommen werden. Dies eröffnet den Weg zu schnellen und effizienten Filtertechniken, die auf modernen mikrofluidischen Geräten basieren.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Dimitris Vlassopoulos, Foundation for Research and Technology-Hellas - Griechenland

Research Output

  • 533 Zitationen
  • 15 Publikationen
Publikationen
  • 2018
    Titel Trefoil Knot Hydrodynamic Delocalization on Sheared Ring Polymers
    DOI 10.1021/acsmacrolett.8b00059
    Typ Journal Article
    Autor Liebetreu M
    Journal ACS Macro Letters
    Seiten 447-452
  • 2015
    Titel An Anisotropic Effective Model for the Simulation of Semiflexible Ring Polymers
    DOI 10.1021/acs.macromol.5b00603
    Typ Journal Article
    Autor Poier P
    Journal Macromolecules
    Seiten 4983-4997
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Multi-blob coarse graining for ring polymer solutions
    DOI 10.1039/c4sm01904k
    Typ Journal Article
    Autor Narros A
    Journal Soft Matter
    Seiten 9601-9614
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Effective Interactions between Multilayered Ionic Microgels
    DOI 10.3390/ma7127689
    Typ Journal Article
    Autor Hanel C
    Journal Materials
    Seiten 7689-7705
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Cluster Glasses of Semiflexible Ring Polymers
    DOI 10.1021/mz500117v
    Typ Journal Article
    Autor Slimani M
    Journal ACS Macro Letters
    Seiten 611-616
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Anisotropic effective interactions and stack formation in mixtures of semiflexible ring polymers
    DOI 10.1039/c6sm00430j
    Typ Journal Article
    Autor Poier P
    Journal Soft Matter
    Seiten 4805-4820
  • 2016
    Titel Concentration-induced planar-to-homeotropic anchoring transition of stiff ring polymers on hard walls
    DOI 10.1039/c6sm01453d
    Typ Journal Article
    Autor Poier P
    Journal Soft Matter
    Seiten 7983-7994
  • 2013
    Titel Fluids of semiflexible ring polymers : effective potentials and clustering
    DOI 10.1039/c2sm27199k
    Typ Journal Article
    Autor Bernabei M
    Journal Soft Matter
    Seiten 1287-1300
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Hierarchical self-assembly of telechelic star polymers: from soft patchy particles to gels and diamond crystals
    DOI 10.1088/1367-2630/15/9/095002
    Typ Journal Article
    Autor Capone B
    Journal New Journal of Physics
    Seiten 095002
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Effective interactions of knotted ring polymers
    DOI 10.1042/bst20120286
    Typ Journal Article
    Autor Narros A
    Journal Biochemical Society Transactions
    Seiten 630-634
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Architecture-Induced Size Asymmetry and Effective Interactions of Ring Polymers: Simulation and Theory
    DOI 10.1021/ma4016483
    Typ Journal Article
    Autor Narros A
    Journal Macromolecules
    Seiten 9437-9445
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Effects of Knots on Ring Polymers in Solvents of Varying Quality
    DOI 10.1021/ma400308x
    Typ Journal Article
    Autor Narros A
    Journal Macromolecules
    Seiten 3654-3668
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Effect of Bending Rigidity on the Knotting of a Polymer under Tension
    DOI 10.1021/mz300493d
    Typ Journal Article
    Autor Matthews R
    Journal ACS Macro Letters
    Seiten 1352-1356
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Topology-Sensitive Microfluidic Filter for Polymers of Varying Stiffness
    DOI 10.1021/acsmacrolett.7b00768
    Typ Journal Article
    Autor Weiss L
    Journal ACS Macro Letters
    Seiten 1426-1431
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Influence of Rigidity and Knot Complexity on the Knotting of Confined Polymers
    DOI 10.1021/ma5006414
    Typ Journal Article
    Autor Poier P
    Journal Macromolecules
    Seiten 3394-3400
    Link Publikation

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