Mikrobielle aktivität im inneren Ozean
Microbial activity in the ocean´s interior
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Bacteria,
Hydrostatic Pressure,
Archaea,
Microbial Activity,
Deep Sea,
Carbon Flux
Mit dem Forschungsvorhaben wollen wir eines der größten ungelösten Probleme der Mikrobiellen Ozeanographie und der marinen Biogeochemie einer Lösung näher bringen, nämlich die Diskrepanz zwischen dem Angebot an organischem Kohlenstoff und dem Kohlenstoffbedarf heterotropher Organismen im Ozean unterhalb der euphotischen Zone. Eine der größten Unsicherheiten in den Modellen des Kohlenstoffflusses der aphotischen Zone der Ozeane ist, daß bisher mikrobielle Umsatzraten fast ausschließlich unter Oberflächendruckbedingungen gemessen wurden. Wir werden in dem vorliegenden Forschungsvorhaben mikrobielle Kohlenstoffumsatzraten unter in situ Druckbedingungen entlang eines Transektes im Nordatlantik messen, wobei wir dem Fluß des Nordatlantischen Tiefenwassers folgen. Wir werden die mikrobielle Biomasseproduktion, Respiration und die Ektoenzymaktivität unter in situ in Druckbedingungen an Proben aus dem Tiefwasser messen und mit denen vergleichen, die unter Oberflächendruckbedingungen erhoben werden, wie allgemein üblich. Weiters werden die interspezifischen Unterschiede in der Sensitivität einzelner Prokaryotengruppen auf Druckänderungen erfasst, ebenso wie der Anteil piezophiler (`druckliebender`) Prokaryoten an der Gesamt-Prokaryotenzahl entlang des Breitengradienten. Dieses Forschungsvorhaben wurde durch extensive Vorarbeiten über Planung und Bau von Hochdruckinkubationsgefässen aus Titan ermöglicht. Nach mehrjähriger Vorbereitung und intensivem Testen sind die Hochdrucksysteme nun funktionstüchtig und frei von jeglicher Kontamination. Diese Hochdrucksysteme werden anstelle herkömmlicher Sammel-Flaschen in den CTD-Rahmen montiert und gesteuert wie die herkömmlichen Sammelsysteme, etwa Niskin-Flaschen. Wir haben daher die technischen Möglichkeiten den potentiellen Fehler bei der Messung der mikrobiellen Aktivitäten im Tiefwasser unter realistischen Druckbedinungen zu messen. Kombiniert mit Aktivitätsmessungen an Einzelzellen durch Mikroautoradiographie und Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung einerseits und mit stabilen Isotopen und Halogen-in-situ-Hybridisierung und NanoSIMS andererseits, wird es möglich sein, das Problem der in situ-Aktivität der Prokaryotengemeinschaften im ozeanischen Tiefenwassser zu klären. Durch dieses Forschungsvorhaben werden neue Erkenntnisse gewonnen, die nicht nur für die Marine Mikrobielle Ökologie außerordentlich bedeutsam sind, sondern auch in die Modelle des ozeanischen Kohlenstoffflusses eingehen werden.
Die Rolle der Druckverhältnisse in der Tiefsee auf die dort lebenden Mikroorganismen wurde in diesem Projekt untersucht. Generell hat der hohe hydrostatische Druck, der in der Tiefsee herrscht und auf die Mikroorganismen einwirkt, relativ wenig Einfluss auf deren Aktivität. Die Stoffwechselaktivität der Tiefseemikroben unter Tiefseedruckbedingungen beträgt ca. 80% der Aktivität gemessen unter dekomprimierten, also drucklosen Bedingungen. Das impliziert, dass der überwiegende Teil der mikrobiellen Gemeinschaft in der Tiefsee relativ unempfindlich gegenüber Druck bis zu 700 bar ist. Dieses Ergebnis ist unerwartet, da seit mehr als 50 Jahre bekannt ist, dass es drucksensitive Bakterien gibt, die nur unter hohem Druck, wie er in der Tiefsee herrscht, wachsen können, nicht aber unter Druckbedingungen, wie er an der Meeresoberfläche herrscht. Diese, an hohen Druck angepassten, Mikroorganismen würden den Großteil der mikrobiellen Gemeinschaft der Tiefsee ausmachen, vermutete man. In dem vorliegenden Projekt konnte allerdings gezeigt werden, dass drucksensitive Mikroben in der Tiefsee nur einen kleinen Teil der Mikroben-Gemeinschaft darstellen. Um diese Experimente durchführen zu können wurden Hochdruck-Sammelgefäße und Inkubatoren verwendet, die eigens für dieses Projekt zum Einsatz kamen. Mit diesen Sammelgefäßen war es möglich Wasserproben aus bis zu 7000 m Tiefe zu sammeln und die Stoffwechselaktivitäten der Mikroben unter dem dort herrschenden Druck (ca 700 bar) zu messen und mit Proben zu vergleichen, die vor der Aktivitätsmessung dekomprimiert wurden. Die Messungen wurden während einer Forschungsfahrt im Mittelmeer und zwei Fahrten im Nordatlantik gemacht. Aufgrund dieser Messungen konnten wir nun schlüssig nachweisen, dass der in der Tiefsee herrschende Druck den überwiegenden Teil der dort lebenden Mikrobengemeinschaft nicht wesentlich beeinflusst. Da diese Mikroben den wesentlichen Teil des Stoffwechsels und somit der biogeochemischen Zyklen im Meer betreibt ist es außerordentlich wichtig verlässliche Messungen der Stoffumsatzraten der Mikroorganismen auch aus der Tiefsee zu haben. Um diese Messungen durchzuführen, ist es somit nicht notwendig aufwendige Sammelgefäße zu haben, um den Umgebungsdruck der Mikroben beizubehalten.
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 1874 Zitationen
- 32 Publikationen
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2012
Titel Differentiating leucine incorporation of Archaea and Bacteria throughout the water column of the eastern Atlantic using metabolic inhibitors DOI 10.3354/ame01575 Typ Journal Article Autor Yokokawa T Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 247-256 Link Publikation -
2012
Titel Archaeal amoA gene diversity points to distinct biogeography of ammonia-oxidizing Crenarchaeota in the ocean DOI 10.1111/j.1462-2920.2012.02801.x Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Environmental Microbiology Seiten 1647-1658 Link Publikation -
2015
Titel Macroecological patterns of archaeal ammonia oxidizers in the Atlantic Ocean DOI 10.1111/mec.13365 Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Molecular Ecology Seiten 4931-4942 Link Publikation -
2019
Titel Niche Differentiation of Aerobic and Anaerobic Ammonia Oxidizers in a High Latitude Deep Oxygen Minimum Zone DOI 10.3389/fmicb.2019.02141 Typ Journal Article Autor Muck S Journal Frontiers in Microbiology Seiten 2141 Link Publikation -
2022
Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324 DOI 10.3929/ethz-b-000546712 Typ Other Autor Malfertheiner Link Publikation -
2023
Titel Interplay between autotrophic and heterotrophic prokaryotic metabolism in the bathypelagic realm revealed by metatranscriptomic analyses DOI 10.1186/s40168-023-01688-7 Typ Journal Article Autor Srivastava A Journal Microbiome Seiten 239 Link Publikation -
2022
Titel Extracellular Enzymatic Activities of Oceanic Pelagic Fungal Strains and the Influence of Temperature DOI 10.3390/jof8060571 Typ Journal Article Autor Alekseyeva K Journal Journal of Fungi Seiten 571 Link Publikation -
2022
Titel Microbial Inhabitants of the Dark Ocean DOI 10.1007/978-3-030-90383-1_10 Typ Book Chapter Autor Baltar F Verlag Springer Nature Seiten 425-459 -
2022
Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324 DOI 10.3390/biology11040599 Typ Journal Article Autor Malfertheiner L Journal Biology Seiten 599 Link Publikation -
2016
Titel Dragon kings of the deep sea: marine particles deviate markedly from the common number-size spectrum DOI 10.1038/srep22633 Typ Journal Article Autor Bochdansky A Journal Scientific Reports Seiten 22633 Link Publikation -
2016
Titel Prokaryotic Responses to Ammonium and Organic Carbon Reveal Alternative CO2 Fixation Pathways and Importance of Alkaline Phosphatase in the Mesopelagic North Atlantic DOI 10.3389/fmicb.2016.01670 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Frontiers in Microbiology Seiten 1670 Link Publikation -
2016
Titel Large-scale distribution of microbial and viral populations in the South Atlantic Ocean DOI 10.1111/1758-2229.12381 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Reports Seiten 305-315 Link Publikation -
2016
Titel Geographic Distribution of Archaeal Ammonia Oxidizing Ecotypes in the Atlantic Ocean DOI 10.3389/fmicb.2016.00077 Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Frontiers in Microbiology Seiten 77 Link Publikation -
2013
Titel Major Effect of Hydrogen Peroxide on Bacterioplankton Metabolism in the Northeast Atlantic DOI 10.1371/journal.pone.0061051 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal PLoS ONE Link Publikation -
2013
Titel Abundance and distribution of archaeal acetyl-CoA/propionyl-CoA carboxylase genes indicative for putatively chemoautotrophic Archaea in the tropical Atlantic's interior DOI 10.1111/1574-6941.12073 Typ Journal Article Autor Bergauer K Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 461-473 Link Publikation -
2013
Titel Spatial patterns of bacterial and archaeal communities along the Romanche Fracture Zone (tropical Atlantic) DOI 10.1111/1574-6941.12142 Typ Journal Article Autor Lekunberri I Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 537-552 Link Publikation -
2013
Titel Impact of water mass mixing on the biogeochemistry and microbiology of the Northeast Atlantic Deep Water DOI 10.1002/2013gb004634 Typ Journal Article Autor Reinthaler T Journal Global Biogeochemical Cycles Seiten 1151-1162 Link Publikation -
2013
Titel Microbial control of the dark end of the biological pump DOI 10.1038/ngeo1921 Typ Journal Article Autor Herndl G Journal Nature Geoscience Seiten 718-724 Link Publikation -
2013
Titel Development and deployment of a point-source digital inline holographic microscope for the study of plankton and particles to a depth of 6000 m DOI 10.4319/lom.2013.11.28 Typ Journal Article Autor Bochdansky A Journal Limnology and Oceanography: Methods Seiten 28-40 Link Publikation -
2013
Titel Diversity and distribution of microbial eukaryotes in the deep tropical and subtropical North Atlantic Ocean DOI 10.1016/j.dsr.2013.04.010 Typ Journal Article Autor Morgan-Smith D Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers Seiten 58-69 -
2015
Titel Production and degradation of fluorescent dissolved organic matter in surface waters of the eastern north Atlantic ocean DOI 10.1016/j.dsr.2014.11.001 Typ Journal Article Autor Lønborg C Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers Seiten 28-37 Link Publikation -
2015
Titel Dilution limits dissolved organic carbon utilization in the deep ocean DOI 10.1126/science.1258955 Typ Journal Article Autor Arrieta J Journal Science Seiten 331-333 Link Publikation -
2014
Titel Seasonal variation in marine-snow-associated and ambient-water prokaryotic communities in the northern Adriatic Sea DOI 10.3354/ame01718 Typ Journal Article Autor Vojvoda J Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 211-224 Link Publikation -
2014
Titel Fracture zones in the Mid Atlantic Ridge lead to alterations in prokaryotic and viral parameters in deep-water masses DOI 10.3389/fmicb.2014.00264 Typ Journal Article Autor Muck S Journal Frontiers in Microbiology Seiten 264 Link Publikation -
2016
Titel Archaeal and Bacterial Communities Associated with the Surface Mucus of Caribbean Corals Differ in Their Degree of Host Specificity and Community Turnover Over Reefs DOI 10.1371/journal.pone.0144702 Typ Journal Article Autor Frade P Journal PLOS ONE Link Publikation -
2016
Titel The microbiome of coral surface mucus has a key role in mediating holobiont health and survival upon disturbance DOI 10.1038/ismej.2016.9 Typ Journal Article Autor Glasl B Journal The ISME Journal Seiten 2280-2292 Link Publikation -
2016
Titel Erythromycin and GC7 fail as domain-specific inhibitors for bacterial and archaeal activity in the open ocean DOI 10.3354/ame01792 Typ Journal Article Autor Frank A Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 99-110 Link Publikation -
2012
Titel Comparison between MICRO–CARD–FISH and 16S rRNA gene clone libraries to assess the active versus total bacterial community in the coastal Arctic DOI 10.1111/1758-2229.12013 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Reports Seiten 272-281 Link Publikation -
2012
Titel Links between viruses and prokaryotes throughout the water column along a North Atlantic latitudinal transect DOI 10.1038/ismej.2011.214 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal The ISME Journal Seiten 1566-1577 Link Publikation -
2012
Titel Bacterial Versus Archaeal Origin of Extracellular Enzymatic Activity in the Northeast Atlantic Deep Waters DOI 10.1007/s00248-012-0126-7 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Microbial Ecology Seiten 277-288 Link Publikation -
2014
Titel Resolving the abundance and air-sea fluxes of airborne microorganisms in the North Atlantic Ocean DOI 10.3389/fmicb.2014.00557 Typ Journal Article Autor Mayol E Journal Frontiers in Microbiology Seiten 557 Link Publikation -
2014
Titel Feedbacks between protistan single-cell activity and bacterial physiological structure reinforce the predator/prey link in microbial foodwebs DOI 10.3389/fmicb.2014.00453 Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Frontiers in Microbiology Seiten 453 Link Publikation