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Mikrobielle aktivität im inneren Ozean

Microbial activity in the ocean´s interior

Gerhard J. Herndl (ORCID: 0000-0002-2223-2852)
  • Grant-DOI 10.55776/P23234
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.02.2011
  • Projektende 31.01.2014
  • Bewilligungssumme 495.674 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Bacteria, Hydrostatic Pressure, Archaea, Microbial Activity, Deep Sea, Carbon Flux

Abstract Endbericht

Mit dem Forschungsvorhaben wollen wir eines der größten ungelösten Probleme der Mikrobiellen Ozeanographie und der marinen Biogeochemie einer Lösung näher bringen, nämlich die Diskrepanz zwischen dem Angebot an organischem Kohlenstoff und dem Kohlenstoffbedarf heterotropher Organismen im Ozean unterhalb der euphotischen Zone. Eine der größten Unsicherheiten in den Modellen des Kohlenstoffflusses der aphotischen Zone der Ozeane ist, daß bisher mikrobielle Umsatzraten fast ausschließlich unter Oberflächendruckbedingungen gemessen wurden. Wir werden in dem vorliegenden Forschungsvorhaben mikrobielle Kohlenstoffumsatzraten unter in situ Druckbedingungen entlang eines Transektes im Nordatlantik messen, wobei wir dem Fluß des Nordatlantischen Tiefenwassers folgen. Wir werden die mikrobielle Biomasseproduktion, Respiration und die Ektoenzymaktivität unter in situ in Druckbedingungen an Proben aus dem Tiefwasser messen und mit denen vergleichen, die unter Oberflächendruckbedingungen erhoben werden, wie allgemein üblich. Weiters werden die interspezifischen Unterschiede in der Sensitivität einzelner Prokaryotengruppen auf Druckänderungen erfasst, ebenso wie der Anteil piezophiler (`druckliebender`) Prokaryoten an der Gesamt-Prokaryotenzahl entlang des Breitengradienten. Dieses Forschungsvorhaben wurde durch extensive Vorarbeiten über Planung und Bau von Hochdruckinkubationsgefässen aus Titan ermöglicht. Nach mehrjähriger Vorbereitung und intensivem Testen sind die Hochdrucksysteme nun funktionstüchtig und frei von jeglicher Kontamination. Diese Hochdrucksysteme werden anstelle herkömmlicher Sammel-Flaschen in den CTD-Rahmen montiert und gesteuert wie die herkömmlichen Sammelsysteme, etwa Niskin-Flaschen. Wir haben daher die technischen Möglichkeiten den potentiellen Fehler bei der Messung der mikrobiellen Aktivitäten im Tiefwasser unter realistischen Druckbedinungen zu messen. Kombiniert mit Aktivitätsmessungen an Einzelzellen durch Mikroautoradiographie und Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung einerseits und mit stabilen Isotopen und Halogen-in-situ-Hybridisierung und NanoSIMS andererseits, wird es möglich sein, das Problem der in situ-Aktivität der Prokaryotengemeinschaften im ozeanischen Tiefenwassser zu klären. Durch dieses Forschungsvorhaben werden neue Erkenntnisse gewonnen, die nicht nur für die Marine Mikrobielle Ökologie außerordentlich bedeutsam sind, sondern auch in die Modelle des ozeanischen Kohlenstoffflusses eingehen werden.

Die Rolle der Druckverhältnisse in der Tiefsee auf die dort lebenden Mikroorganismen wurde in diesem Projekt untersucht. Generell hat der hohe hydrostatische Druck, der in der Tiefsee herrscht und auf die Mikroorganismen einwirkt, relativ wenig Einfluss auf deren Aktivität. Die Stoffwechselaktivität der Tiefseemikroben unter Tiefseedruckbedingungen beträgt ca. 80% der Aktivität gemessen unter dekomprimierten, also drucklosen Bedingungen. Das impliziert, dass der überwiegende Teil der mikrobiellen Gemeinschaft in der Tiefsee relativ unempfindlich gegenüber Druck bis zu 700 bar ist. Dieses Ergebnis ist unerwartet, da seit mehr als 50 Jahre bekannt ist, dass es drucksensitive Bakterien gibt, die nur unter hohem Druck, wie er in der Tiefsee herrscht, wachsen können, nicht aber unter Druckbedingungen, wie er an der Meeresoberfläche herrscht. Diese, an hohen Druck angepassten, Mikroorganismen würden den Großteil der mikrobiellen Gemeinschaft der Tiefsee ausmachen, vermutete man. In dem vorliegenden Projekt konnte allerdings gezeigt werden, dass drucksensitive Mikroben in der Tiefsee nur einen kleinen Teil der Mikroben-Gemeinschaft darstellen. Um diese Experimente durchführen zu können wurden Hochdruck-Sammelgefäße und Inkubatoren verwendet, die eigens für dieses Projekt zum Einsatz kamen. Mit diesen Sammelgefäßen war es möglich Wasserproben aus bis zu 7000 m Tiefe zu sammeln und die Stoffwechselaktivitäten der Mikroben unter dem dort herrschenden Druck (ca 700 bar) zu messen und mit Proben zu vergleichen, die vor der Aktivitätsmessung dekomprimiert wurden. Die Messungen wurden während einer Forschungsfahrt im Mittelmeer und zwei Fahrten im Nordatlantik gemacht. Aufgrund dieser Messungen konnten wir nun schlüssig nachweisen, dass der in der Tiefsee herrschende Druck den überwiegenden Teil der dort lebenden Mikrobengemeinschaft nicht wesentlich beeinflusst. Da diese Mikroben den wesentlichen Teil des Stoffwechsels und somit der biogeochemischen Zyklen im Meer betreibt ist es außerordentlich wichtig verlässliche Messungen der Stoffumsatzraten der Mikroorganismen auch aus der Tiefsee zu haben. Um diese Messungen durchzuführen, ist es somit nicht notwendig aufwendige Sammelgefäße zu haben, um den Umgebungsdruck der Mikroben beizubehalten.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Hendrick M. Van Aken, Royal Netherlands Institute for Sea Research - Niederlande

Research Output

  • 1874 Zitationen
  • 32 Publikationen
Publikationen
  • 2012
    Titel Differentiating leucine incorporation of Archaea and Bacteria throughout the water column of the eastern Atlantic using metabolic inhibitors
    DOI 10.3354/ame01575
    Typ Journal Article
    Autor Yokokawa T
    Journal Aquatic Microbial Ecology
    Seiten 247-256
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Archaeal amoA gene diversity points to distinct biogeography of ammonia-oxidizing Crenarchaeota in the ocean
    DOI 10.1111/j.1462-2920.2012.02801.x
    Typ Journal Article
    Autor Sintes E
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 1647-1658
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Macroecological patterns of archaeal ammonia oxidizers in the Atlantic Ocean
    DOI 10.1111/mec.13365
    Typ Journal Article
    Autor Sintes E
    Journal Molecular Ecology
    Seiten 4931-4942
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Niche Differentiation of Aerobic and Anaerobic Ammonia Oxidizers in a High Latitude Deep Oxygen Minimum Zone
    DOI 10.3389/fmicb.2019.02141
    Typ Journal Article
    Autor Muck S
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 2141
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324
    DOI 10.3929/ethz-b-000546712
    Typ Other
    Autor Malfertheiner
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Interplay between autotrophic and heterotrophic prokaryotic metabolism in the bathypelagic realm revealed by metatranscriptomic analyses
    DOI 10.1186/s40168-023-01688-7
    Typ Journal Article
    Autor Srivastava A
    Journal Microbiome
    Seiten 239
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Extracellular Enzymatic Activities of Oceanic Pelagic Fungal Strains and the Influence of Temperature
    DOI 10.3390/jof8060571
    Typ Journal Article
    Autor Alekseyeva K
    Journal Journal of Fungi
    Seiten 571
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Microbial Inhabitants of the Dark Ocean
    DOI 10.1007/978-3-030-90383-1_10
    Typ Book Chapter
    Autor Baltar F
    Verlag Springer Nature
    Seiten 425-459
  • 2022
    Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324
    DOI 10.3390/biology11040599
    Typ Journal Article
    Autor Malfertheiner L
    Journal Biology
    Seiten 599
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Dragon kings of the deep sea: marine particles deviate markedly from the common number-size spectrum
    DOI 10.1038/srep22633
    Typ Journal Article
    Autor Bochdansky A
    Journal Scientific Reports
    Seiten 22633
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Prokaryotic Responses to Ammonium and Organic Carbon Reveal Alternative CO2 Fixation Pathways and Importance of Alkaline Phosphatase in the Mesopelagic North Atlantic
    DOI 10.3389/fmicb.2016.01670
    Typ Journal Article
    Autor Baltar F
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 1670
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Large-scale distribution of microbial and viral populations in the South Atlantic Ocean
    DOI 10.1111/1758-2229.12381
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal Environmental Microbiology Reports
    Seiten 305-315
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Geographic Distribution of Archaeal Ammonia Oxidizing Ecotypes in the Atlantic Ocean
    DOI 10.3389/fmicb.2016.00077
    Typ Journal Article
    Autor Sintes E
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 77
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Major Effect of Hydrogen Peroxide on Bacterioplankton Metabolism in the Northeast Atlantic
    DOI 10.1371/journal.pone.0061051
    Typ Journal Article
    Autor Baltar F
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Abundance and distribution of archaeal acetyl-CoA/propionyl-CoA carboxylase genes indicative for putatively chemoautotrophic Archaea in the tropical Atlantic's interior
    DOI 10.1111/1574-6941.12073
    Typ Journal Article
    Autor Bergauer K
    Journal FEMS Microbiology Ecology
    Seiten 461-473
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Spatial patterns of bacterial and archaeal communities along the Romanche Fracture Zone (tropical Atlantic)
    DOI 10.1111/1574-6941.12142
    Typ Journal Article
    Autor Lekunberri I
    Journal FEMS Microbiology Ecology
    Seiten 537-552
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Impact of water mass mixing on the biogeochemistry and microbiology of the Northeast Atlantic Deep Water
    DOI 10.1002/2013gb004634
    Typ Journal Article
    Autor Reinthaler T
    Journal Global Biogeochemical Cycles
    Seiten 1151-1162
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Microbial control of the dark end of the biological pump
    DOI 10.1038/ngeo1921
    Typ Journal Article
    Autor Herndl G
    Journal Nature Geoscience
    Seiten 718-724
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Development and deployment of a point-source digital inline holographic microscope for the study of plankton and particles to a depth of 6000 m
    DOI 10.4319/lom.2013.11.28
    Typ Journal Article
    Autor Bochdansky A
    Journal Limnology and Oceanography: Methods
    Seiten 28-40
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Diversity and distribution of microbial eukaryotes in the deep tropical and subtropical North Atlantic Ocean
    DOI 10.1016/j.dsr.2013.04.010
    Typ Journal Article
    Autor Morgan-Smith D
    Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers
    Seiten 58-69
  • 2015
    Titel Production and degradation of fluorescent dissolved organic matter in surface waters of the eastern north Atlantic ocean
    DOI 10.1016/j.dsr.2014.11.001
    Typ Journal Article
    Autor Lønborg C
    Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers
    Seiten 28-37
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Dilution limits dissolved organic carbon utilization in the deep ocean
    DOI 10.1126/science.1258955
    Typ Journal Article
    Autor Arrieta J
    Journal Science
    Seiten 331-333
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Seasonal variation in marine-snow-associated and ambient-water prokaryotic communities in the northern Adriatic Sea
    DOI 10.3354/ame01718
    Typ Journal Article
    Autor Vojvoda J
    Journal Aquatic Microbial Ecology
    Seiten 211-224
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Fracture zones in the Mid Atlantic Ridge lead to alterations in prokaryotic and viral parameters in deep-water masses
    DOI 10.3389/fmicb.2014.00264
    Typ Journal Article
    Autor Muck S
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 264
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Archaeal and Bacterial Communities Associated with the Surface Mucus of Caribbean Corals Differ in Their Degree of Host Specificity and Community Turnover Over Reefs
    DOI 10.1371/journal.pone.0144702
    Typ Journal Article
    Autor Frade P
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
  • 2016
    Titel The microbiome of coral surface mucus has a key role in mediating holobiont health and survival upon disturbance
    DOI 10.1038/ismej.2016.9
    Typ Journal Article
    Autor Glasl B
    Journal The ISME Journal
    Seiten 2280-2292
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Erythromycin and GC7 fail as domain-specific inhibitors for bacterial and archaeal activity in the open ocean
    DOI 10.3354/ame01792
    Typ Journal Article
    Autor Frank A
    Journal Aquatic Microbial Ecology
    Seiten 99-110
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Comparison between MICRO–CARD–FISH and 16S rRNA gene clone libraries to assess the active versus total bacterial community in the coastal Arctic
    DOI 10.1111/1758-2229.12013
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal Environmental Microbiology Reports
    Seiten 272-281
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Links between viruses and prokaryotes throughout the water column along a North Atlantic latitudinal transect
    DOI 10.1038/ismej.2011.214
    Typ Journal Article
    Autor De Corte D
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1566-1577
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Bacterial Versus Archaeal Origin of Extracellular Enzymatic Activity in the Northeast Atlantic Deep Waters
    DOI 10.1007/s00248-012-0126-7
    Typ Journal Article
    Autor Baltar F
    Journal Microbial Ecology
    Seiten 277-288
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Resolving the abundance and air-sea fluxes of airborne microorganisms in the North Atlantic Ocean
    DOI 10.3389/fmicb.2014.00557
    Typ Journal Article
    Autor Mayol E
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 557
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Feedbacks between protistan single-cell activity and bacterial physiological structure reinforce the predator/prey link in microbial foodwebs
    DOI 10.3389/fmicb.2014.00453
    Typ Journal Article
    Autor Sintes E
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 453
    Link Publikation

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