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Vergleichende Glykomik ausgewählter Nematoden

Comparative Glycomics of Selected Nematodes

Katharina Paschinger (ORCID: 0000-0002-3594-7136)
  • Grant-DOI 10.55776/P21946
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2009
  • Projektende 31.08.2015
  • Bewilligungssumme 241.731 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (70%); Gesundheitswissenschaften (10%); Physik, Astronomie (20%)

Keywords

    Nematode, N-Glycan, Parasite, Oesophagostomum

Abstract Endbericht

Nematoden, nicht-segmentierte Rundwürmer, haben sich im Laufe der Millionen Jahre dauernden Evolution an verschiedene ökologische Nischen angepasst. Viele Mitglieder dieser Organismen sind Parasiten - entweder von Menschen, Wirbellosen, Wirbeltieren oder Pflanzen während einige Nematoden einen frei lebenden Lebensstil aufweisen. Die parasitären Lebensformen haben sich innerhalb der Nematodenfamilie mehrmals unabhängig voneinander entwickelt und sind jetzt in vier der fünf Untergruppen anzutreffen. Oesophagostomum dentatum, der Knötchenwurm des Schweins, ein parasitärer Vertreter der Strongylida, einer Untergruppe des Nematoden Stammbaums, mit wesentlichen Säugetierparasiten und unmittelbaren Verwandten von Caenorhabditis elegans soll im Zentrum dieser Studie stehen. Die Oberfläche von Oesophagostomum dentatum, die großteils aus Glykoproteinen besteht, ist an das Immunsystem des Wirtes angepasst und verhindert die Ausbildung einer Immunität seitens des Wirtes. Besonders seine N-Glykan Epitope, Verzierungen der Proteinoberflächen, werden in Hinsicht auf ihre unterschiedliche Präsentation während der Entwicklung des Parasiten analysiert. Die spezifischen Epitope des invasiven dritten (L3) und des parasitären vierten (L4) Larvenstadiums, deren exkretorischen und sekretorischen Produkte als auch die geschlechtsspezifischen Ausprägungen der Darm bewohnenden adulten Würmer werden im Detail mit Hilfe von immunologischen, chromatographischen und massenspektrometrischen Verfahren untersucht. Im Vergleich von Oesophagostomum dentatum mit seinen frei lebenden nahen Verwandten wie dem Modellorganismus Caenorhabditis elegans, Caenorhabditis briggsae, Caenorhabditis remanei, Caenorhabditis japonica und Pristionchus pacificus sollen Epitope, die den parasitären Lebensstil unterstützen, definiert werden. Diese Studie soll dazu beitragen, die immunogenen und immunmodulierenden Glykane, der Nematoden besser zu verstehen.

Nematoden, nicht-segmentierte Rundwürmer, haben sich im Laufe der Millionen Jahre dauernden Evolution an verschiedene ökologische Nischen angepasst. Viele Mitglieder dieser Organismen sind Parasiten - entweder von Menschen, Wirbellosen, Wirbeltieren oder Pflanzen während einige Nematoden einen frei lebenden Lebensstil aufweisen. Die parasitären Lebensformen haben sich innerhalb der Nematodenfamilie mehrmals unabhängig voneinander entwickelt und sind jetzt in vier der fünf Untergruppen anzutreffen. Oesophagostomum dentatum, der Knötchenwurm des Schweins, ein parasitärer Vertreter der Strongylida, einer Untergruppe des Nematoden Stammbaums, mit wesentlichen Säugetierparasiten und unmittelbaren Verwandten von Caenorhabditis elegans stand im Zentrum dieser Studie. Die Oberfläche von Oesophagostomum dentatum, die großteils aus Glykoproteinen besteht, ist an das Immunsystem des Wirtes angepasst und verhindert die Ausbildung einer Immunität seitens des Wirtes. Besonders seine N-Glykan Epitope, Verzierungen der Proteinoberflächen, wurden in Hinsicht auf ihre unterschiedliche Präsentation während der Entwicklung des Parasiten analysiert. Die spezifischen Epitope des invasiven dritten (L3) und des parasitären vierten (L4) Larvenstadiums als auch die geschlechtsspezifischen Ausprägungen der Darm bewohnenden adulten Würmer wurden im Detail mit Hilfe von chromatographischen und massenspektrometrischen Verfahren untersucht. Im Vergleich von Oesophagostomum dentatum mit seinen frei lebenden nahen Verwandten wie den Modellorganismen Caenorhabditis elegans und Pristionchus pacificus als auch den parasitären Trichuris suis wurden verschiedene Glykanepitope definiert. Diese Studie trägt bei, die immunogenen und immunmodulierenden Glykane, der Nematoden besser zu verstehen.

Forschungsstätte(n)
  • Veterinärmedizinische Universität Wien - 10%
  • Universität für Bodenkultur Wien - 90%
Nationale Projektbeteiligte
  • Anja Joachim, Veterinärmedizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Markus Künzler, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich - Schweiz

Research Output

  • 846 Zitationen
  • 28 Publikationen
Publikationen
  • 2019
    Titel Anionic and zwitterionic moieties as widespread glycan modifications in non-vertebrates
    DOI 10.1007/s10719-019-09874-2
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Glycoconjugate Journal
    Seiten 27-40
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Comparisons of N-glycans across invertebrate phyla
    DOI 10.1017/s0031182019000398
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Parasitology
    Seiten 1733-1742
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Glycomics Studies on Nematodes Elucidate Conserved Functional Epitopes and Biosynthetic Pathways
    DOI 10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.673.17
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal The FASEB Journal
    Seiten 673.17-673.17
  • 2020
    Titel Biochemical Characterization of Oyster and Clam Galectins: Selective Recognition of Carbohydrate Ligands on Host Hemocytes and Perkinsus Parasites
    DOI 10.3389/fchem.2020.00098
    Typ Journal Article
    Autor Vasta G
    Journal Frontiers in Chemistry
    Seiten 98
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Ablation of N-acetylglucosaminyltransferases in Caenorhabditis induces expression of unusual intersected and bisected N-glycans
    DOI 10.1016/j.bbagen.2018.07.002
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects
    Seiten 2191-2203
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Comparisons of Caenorhabditis Fucosyltransferase Mutants Reveal a Multiplicity of Isomeric N-Glycan Structures
    DOI 10.1021/acs.jproteome.5b00746
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 5291-5305
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Sweet secrets of a therapeutic worm: mass-spectrometric N-glycomic analysis of Trichuris suis
    DOI 10.1007/s00216-015-9154-8
    Typ Journal Article
    Autor Wilson I
    Journal Analytical and Bioanalytical Chemistry
    Seiten 461-471
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Comparison of RP-HPLC modes to analyse the N-glycome of the free-living nematode Pristionchus pacificus
    DOI 10.1002/elps.201400528
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal ELECTROPHORESIS
    Seiten 1314-1329
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Two types of galactosylated fucose motifs are present on N-glycans of Haemonchus contortus
    DOI 10.1093/glycob/cwv015
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Glycobiology
    Seiten 585-590
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Structure and biosynthesis of complex N-glycan cores and antennae in nematodes
    DOI 10.1096/fasebj.30.1_supplement.843.4
    Typ Journal Article
    Autor Wilson I
    Journal The FASEB Journal
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Gender and developmental specific N-glycomes of the porcine parasite Oesophagostomum dentatum
    DOI 10.1016/j.bbagen.2016.10.011
    Typ Journal Article
    Autor Jiménez-Castells C
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects
    Seiten 418-430
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Analysis of zwitterionic and anionic N-linked glycans from invertebrates and protists by mass spectrometry
    DOI 10.1007/s10719-016-9650-x
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Glycoconjugate Journal
    Seiten 273-283
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Core Richness of N-Glycans of Caenorhabditis elegans: A Case Study on Chemical and Enzymatic Release
    DOI 10.1021/acs.analchem.7b03898
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 928-935
    Link Publikation
  • 2015
    Titel The fucomic potential of mosquitoes: Fucosylated N-glycan epitopes and their cognate fucosyltransferases
    DOI 10.1016/j.ibmb.2015.11.001
    Typ Journal Article
    Autor Kurz S
    Journal Insect Biochemistry and Molecular Biology
    Seiten 52-63
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Bisecting Galactose as a Feature of N-Glycans of Wild-type and Mutant Caenorhabditis elegans * [S]
    DOI 10.1074/mcp.m115.049817
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Molecular & Cellular Proteomics
    Seiten 2111-2125
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Targeted release and fractionation reveal glucuronylated and sulphated N- and O-glycans in larvae of dipteran insects
    DOI 10.1016/j.jprot.2015.05.030
    Typ Journal Article
    Autor Kurz S
    Journal Journal of Proteomics
    Seiten 172-188
    Link Publikation
  • 2014
    Titel N-glycomic profiling of a glucosidase II mutant of Dictyostelium discoideum by ‘‘off-line’’ liquid chromatography and mass spectrometry
    DOI 10.1002/elps.201300612
    Typ Journal Article
    Autor Hykollari A
    Journal ELECTROPHORESIS
    Seiten 2116-2129
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Comparative Glycobiology
    DOI 10.1007/978-4-431-54836-2_153-1
    Typ Book Chapter
    Autor Paschinger K
    Verlag Springer Nature
    Seiten 1-10
  • 2011
    Titel Glycomarkers in parasitic infections and allergy
    DOI 10.1042/bst0390360
    Typ Journal Article
    Autor Hoffmann-Sommergruber K
    Journal Biochemical Society Transactions
    Seiten 360-364
  • 2011
    Titel The N-glycans of Trichomonas vaginalis contain variable core and antennal modifications
    DOI 10.1093/glycob/cwr149
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Glycobiology
    Seiten 300-313
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Hemocytes and Plasma of the Eastern Oyster (Crassostrea virginica) Display a Diverse Repertoire of Sulfated and Blood Group A-modified N-Glycans*
    DOI 10.1074/jbc.m113.478933
    Typ Journal Article
    Autor Kurz S
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 24410-24428
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Comparative Glycobiology
    DOI 10.1007/978-4-431-54841-6_153
    Typ Book Chapter
    Autor Paschinger K
    Verlag Springer Nature
    Seiten 795-805
  • 2013
    Titel Array-assisted Characterization of a Fucosyltransferase Required for the Biosynthesis of Complex Core Modifications of Nematode N-Glycans*
    DOI 10.1074/jbc.m113.479147
    Typ Journal Article
    Autor Yan ?? S
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 21015-21028
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Mass Spectrometric Analysis of Neutral and Anionic N-Glycans from a Dictyostelium discoideum Model for Human Congenital Disorder of Glycosylation CDG IL
    DOI 10.1021/pr300806b
    Typ Journal Article
    Autor Hykollari A
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 1173-1187
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Mass spectrometric analysis of the immunodominant glycan epitope of Echinococcus granulosus antigen Ag5
    DOI 10.1016/j.ijpara.2012.01.002
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal International Journal for Parasitology
    Seiten 279-285
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Galactosylated Fucose Epitopes in Nematodes INCREASED EXPRESSION IN A CAENORHABDITIS MUTANT ASSOCIATED WITH ALTERED LECTIN SENSITIVITY AND OCCURRENCE IN PARASITIC SPECIES*
    DOI 10.1074/jbc.m112.353128
    Typ Journal Article
    Autor Yan S
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 28276-28290
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Complicated N-linked glycans in simple organisms
    DOI 10.1515/hsz-2012-0150
    Typ Journal Article
    Autor Schiller B
    Journal Biological chemistry
    Seiten 661-673
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Presence of galactosylated core fucose on N-glycans in the planaria Dugesia japonica
    DOI 10.1002/jms.1925
    Typ Journal Article
    Autor Paschinger K
    Journal Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 561-567
    Link Publikation

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