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Heterogenität von Flagellatenpopulationen

Population heterogeneity of flagellates

Jens Boenigk (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P21151
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2009
  • Projektende 31.08.2012
  • Bewilligungssumme 288.855 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Diversity, Microbial Ecology, Chrysomonads / Chrysophytes, Protist, Alpine Gradient

Abstract Endbericht

Das Hauptziel dieses Projektes ist die Erfassung and Analyse der räumlichen und zeitlichen Verteilungsmuster und genotypischer Variation innerhalb von Morphospezies. Insbesondere wird in diesem Projekt die Lücke zwischen morphologischen und molekularen Analysen von Freilandgesellschaften, mit Schwerpunkt auf den chrysomonaden Flagellaten, geschlossen. Diese Lücke zu schlissen ist eine zentrale Vorasusetzung zum Verständnis der Einheiten der Biodiversität und der Mechanismen, die zur Entstehung und Erhaltung dieser Diversität beitragen. Chrysomonaden sind weit verbreitet und sind in den meisten Süßwasserhabitaten häufig. Weiterhin sind sie Schlüsselorganismen für die Beurteilung von Umweltgradienten, insbesondere in Paläolimnologischen Untersuchungen. Da die ersten wissenschaftlich beschriebenen Flagellaten auch dieser Gruppe zuzurechnen sind, sind Chrysomonaden auch Schlüsselorganismen für konzeptuelle Fragen der Entwicklung von Arten und Artkonzepten. Basierend auf neu entwickelten Methoden, besonders der Einzelzell-PCR ausgehend von fixierten Planktonproben sowie massiver Parallelsequenzierung, werden in diesem Projekt die intraspezifische molekulare Variation, Verteilungsmuster und die Populationsstruktur der Chrysomonaden in Freilandgesellschaften analysiert. Die molekularen Marker ITS2 und COX1 werden für die Analyse der molekularen intraspezifischen Diversität genutzt, da sie Verteilungsmuster unterhalb der Morphospeziesebene auflösen. Die Verknüpfung molekularer und morphologischer Daten bildet die Grundlage für die molekulare Charakterisierung von Arten. Da die Zielgene auch in den Barcoding`-Initiativen genutzt werden, wird das Projekt auch hier eine Grundlage für die Ananlyse der Chrysomonaden liefern. Die Projektziele werden in vier aufeinander aufbauenden Arbeitspaketen realisiert werden: Die basalen Pakete fokussieren auf die Abschätzung der Diversität und die Identifizierung von Zielorganismen und Zielhabitaten. Darauf aufbauend wird die Populationsstruktur analysiert und die Generalisierbarkeit der Ergebnisse im Hinblick auf andere Eukaryontengruppen untersucht.

Das Hauptziel dieses Projektes war die Erfassung and Analyse der räumlichen und zeitlichen Verteilungsmuster und genotypischer Variation innerhalb von Morphospezies. Insbesondere wurde in diesem Projekt die Lücke zwischen morphologischen und molekularen Analysen von Freilandgesellschaften, mit Schwerpunkt auf den chrysomonaden Flagellaten, geschlossen. Diese Lücke zu schlissen ist eine zentrale Vorasusetzung zum Verständnis der Einheiten der Biodiversität und der Mechanismen, die zur Entstehung und Erhaltung dieser Diversität beitragen. Chrysomonaden sind weit verbreitet und sind in den meisten Süßwasserhabitaten häufig. Weiterhin sind sie Schlüsselorganismen für die Beurteilung von Umweltgradienten, insbesondere in Paläolimnologischen Untersuchungen. Basierend auf neu entwickelten Methoden, besonders der Einzelzell-PCR ausgehend von fixierten Planktonproben sowie massiver Parallelsequenzierung, wurden in diesem Projekt die intraspezifische molekulare Variation, Verteilungsmuster und die Populationsstruktur der Chrysomonaden in Freilandgesellschaften analysiert. In den Gattungen Spumella und Dinobryon wurden Arten durch molekulare Marker aufgelöst. Zudem konnten molekulare Clades innerhalb der mophologischen Arten identifiziert werden. Die Morphologie der Dauerstadien (Stomatocysten) erlaubte eine gewisse Differenzierung der Taxa, molekulare Marker waren aber für eine Identifizierung von Arten essentiell.

Forschungsstätte(n)
  • Veterinärmedizinische Universität Wien - 10%
  • Universität Duisburg-Essen - 90%
Nationale Projektbeteiligte
  • Christian Schlötterer, Veterinärmedizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 149 Zitationen
  • 4 Publikationen
Publikationen
  • 2013
    Titel Differential freshwater flagellate community response to bacterial food quality with a focus on Limnohabitans bacteria
    DOI 10.1038/ismej.2013.57
    Typ Journal Article
    Autor Šimek K
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1519-1530
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Ecology and community structure of ciliated protists in two alkaline–saline Rift Valley lakes in Kenya with special emphasis on Frontonia
    DOI 10.1093/plankt/fbt044
    Typ Journal Article
    Autor Ong'Ondo G
    Journal Journal of Plankton Research
    Seiten 759-771
  • 2010
    Titel CULTIVATION-INDEPENDENT SPECIES IDENTIFICATION OF DINOBRYON SPECIES (CHRYSOPHYCEAE) BY MEANS OF MULTIPLEX SINGLE-CELL PCR1
    DOI 10.1111/j.1529-8817.2010.00871.x
    Typ Journal Article
    Autor Jost S
    Journal Journal of Phycology
    Seiten 901-906
  • 2010
    Titel TAXONOMIC AND ECOLOGICAL CHARACTERIZATION OF STOMATOCYSTS OF SPUMELLA-LIKE FLAGELLATES (CHRYSOPHYCEAE)1
    DOI 10.1111/j.1529-8817.2010.00892.x
    Typ Journal Article
    Autor Findenig B
    Journal Journal of Phycology
    Seiten 868-881

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