Struktur und Funktion von Arzneistoff-Effluxpumpen
Structure and Function of Multidrug Transporters
Wissenschaftsdisziplinen
Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (100%)
Keywords
-
Multidrug Resistance,
P-glycoprotein,
Photoaffinity Labeling,
Propafenones,
Site Directed Mutagenesis,
Mass Spectrometry
Als Arzneistoffmultiresistenz wird das gleichzeitige Auftreten von Therapieresistenz gegen eine Reihe strukturell und funktionell nicht verwandter Arzneistoffe bezeichnet. Diese wird in einer Reihe onkologischer Patienten bereits zum Zeitpunkt der Diagnosestellung oder als Folge der Verabreichung von Zytostatika beobachtet. Einen wesentlichen Grund fĂŒr Multiresistenz stellt die Expression von plasmamembranstĂ€ndigen Effluxpumpen dar, die Arzneistoffe aus der Zelle pumpen, bevor diese ihre intrazellulĂ€re Zielstruktur erreichen können. Eine der am besten untersuchten Effluxpumpen ist P-Glycoprotein (ABCB1), das in einer Reihe von humanen Tumorzellen exprimiert wird. In unserem Labor wurde die Rolle dieses Transportproteins nĂ€her untersucht. Wir identifizierten Verbindungen, die als Pumpenhemmstoffe wirken und damit zu einer Wiederherstellung der SensitivitĂ€t von Tumorzellen gegenĂŒber Zytostatika fĂŒhren. Ein VerstĂ€ndnis der Funktion und die VerfĂŒgbarkeit einer atomaren Struktur des Proteines stellen Grundvoraussetzungen fĂŒr das hypothesengetriebene Design von Pumpenhemmstoffen dar. Andererseits können Zytostatika strukturell modifiziert werden, um nicht mehr als Pumpensubstrate erkannt zu werden. Trotz wesentlicher Fortschritte in der Kristallisierung von Membranproteinen und elektronenmikroskopischer Techniken konnte die Struktur von ATP-abhĂ€ngigen Arzneistoffeffluxpumpen auf atomarem Niveau bis jetzt nicht aufgeklĂ€rt werden. P-Glycoproptein besitzt Homologie zu mikrobiellen Pumpen, die Resistenz gegen Antibiotika, Antimykotika und Antiparasitika vermitteln. Die AufklĂ€rung der Struktur und Funktion dieser Pumpen ist durch die Zunahme der klinischen Multiresistenzen von wesentlicher medizinischer Bedeutung. Eine kombinatorische Bibliothek von mehr als 200 Substanzen, die von der Leitsubstanz Propafenon, einem Klasse 1c Antiarrhythmikum abgeleitet sind, wurden entworfen, synthetisiert und auf ihre biologische AktivitĂ€t untersucht. Diese Substanzen sind sowohl Hemmer als auch Substrate von P-Glycoprotein. Einige Analoge sind photoaktivierbar und werden in Studien zur molekularen Architektur und Funktion des Effluxtransporters verwendet. Die AffinitĂ€tsmarkierung von P-Glycoprotein stellt in Kombination mit hochauflösender Massenspektrometrie eine Möglichkeit dar, die SustratbindungsdomĂ€ne nĂ€her zu charakterisieren. Bifunktionelle Liganden werden als molekulare MaĂstĂ€be in Quervernetzungsstudien eingesetzt, um die relative Positionierung von Proteinregionen, die an der SubstratbindungsdomĂ€ne beteiligt sind, zu charakterisieren. Der gezielte Austausch von AminosĂ€ureresten des Proteins bietet die Möglichkeit, AminosĂ€urereste zu identifizieren die fĂŒr die Substratbindung eine Rolle spielen. Wir erwarten, dass diese Daten EinschrĂ€nkungen fĂŒr die Erstellung eines Proteinmodelles von P-Glycoprotein, basierend auf der kĂŒrzlich publizierten Röntgenstruktur des LipidA Transporters aus E.coli, liefern werden.
Als Arzneistoffmultiresistenz wird das gleichzeitige Auftreten von Therapieresistenz gegen eine Reihe strukturell und funktionell nicht verwandter Arzneistoffe bezeichnet. Diese wird in einer Reihe onkologischer Patienten bereits zum Zeitpunkt der Diagnosestellung oder als Folge der Verabreichung von Zytostatika beobachtet. Einen wesentlichen Grund fĂŒr Multiresistenz stellt die Expression von plasmamembranstĂ€ndigen Effluxpumpen dar, die Arzneistoffe aus der Zelle pumpen, bevor diese ihre intrazellulĂ€re Zielstruktur erreichen können. Eine der am besten untersuchten Effluxpumpen ist P-Glycoprotein (ABCB1), das in einer Reihe von humanen Tumorzellen exprimiert wird. In unserem Labor wurde die Rolle dieses Transportproteins nĂ€her untersucht. Wir identifizierten Verbindungen, die als Pumpenhemmstoffe wirken und damit zu einer Wiederherstellung der SensitivitĂ€t von Tumorzellen gegenĂŒber Zytostatika fĂŒhren. Ein VerstĂ€ndnis der Funktion und die VerfĂŒgbarkeit einer atomaren Struktur des Proteines stellen Grundvoraussetzungen fĂŒr das hypothesengetriebene Design von Pumpenhemmstoffen dar. Andererseits können Zytostatika strukturell modifiziert werden, um nicht mehr als Pumpensubstrate erkannt zu werden. Trotz wesentlicher Fortschritte in der Kristallisierung von Membranproteinen und elektronenmikroskopischer Techniken konnte die Struktur von ATP-abhĂ€ngigen Arzneistoffeffluxpumpen auf atomarem Niveau bis jetzt nicht aufgeklĂ€rt werden. P-Glycoproptein besitzt Homologie zu mikrobiellen Pumpen, die Resistenz gegen Antibiotika, Antimykotika und Antiparasitika vermitteln. Die AufklĂ€rung der Struktur und Funktion dieser Pumpen ist durch die Zunahme der klinischen Multiresistenzen von wesentlicher medizinischer Bedeutung. Eine kombinatorische Bibliothek von mehr als 200 Substanzen, die von der Leitsubstanz Propafenon, einem Klasse 1c Antiarrhythmikum abgeleitet sind, wurden entworfen, synthetisiert und auf ihre biologische AktivitĂ€t untersucht. Diese Substanzen sind sowohl Hemmer als auch Substrate von P-Glycoprotein. Einige Analoge sind photoaktivierbar und werden in Studien zur molekularen Architektur und Funktion des Effluxtransporters verwendet. Die AffinitĂ€tsmarkierung von P-Glycoprotein stellt in Kombination mit hochauflösender Massenspektrometrie eine Möglichkeit dar, die SustratbindungsdomĂ€ne nĂ€her zu charakterisieren. Bifunktionelle Liganden werden als molekulare MaĂstĂ€be in Quervernetzungsstudien eingesetzt, um die relative Positionierung von Proteinregionen, die an der SubstratbindungsdomĂ€ne beteiligt sind, zu charakterisieren. Der gezielte Austausch von AminosĂ€ureresten des Proteins bietet die Möglichkeit, AminosĂ€urereste zu identifizieren die fĂŒr die Substratbindung eine Rolle spielen. Wir erwarten, dass diese Daten EinschrĂ€nkungen fĂŒr die Erstellung eines Proteinmodelles von P-Glycoprotein, basierend auf der kĂŒrzlich publizierten Röntgenstruktur des LipidA Transporters aus E.coli, liefern werden.
- Roberto Pellicciari, Universita degli Studi di Perugia - Italien
- Victor Ling, University of British Columbia - Kanada
- Susan E. Bates, Columbia University New York - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 372 Zitationen
- 11 Publikationen
-
2008
Titel Computational models for prediction of interactions with ABC-transporters DOI 10.1016/j.drudis.2007.12.012 Typ Journal Article Autor Ecker G Journal Drug Discovery Today Seiten 311-317 -
2007
Titel Self-Organizing Maps for Identification of New Inhibitors of P-Glycoprotein DOI 10.1021/jm060604z Typ Journal Article Autor Kaiser D Journal Journal of Medicinal Chemistry Seiten 1698-1702 -
2007
Titel Multispecificity of Drug Transporters: Probing Inhibitor Selectivity for the Human Drug Efflux Transporters ABCB1 and ABCG2 DOI 10.1002/cmdc.200700160 Typ Journal Article Autor Cramer J Journal ChemMedChem Seiten 1783-1788 -
2006
Titel Role of transmembrane domain/transmembrane domain interfaces of P-glycoprotein (ABCB1) in solute transport. Convergent information from photoaffinity labeling, site directed mutagenesis and in silico importance prediction. DOI 10.2174/092986706776055607 Typ Journal Article Autor Chiba P Journal Current medicinal chemistry Seiten 793-805 -
2005
Titel Photoaffinity labeling of P-glycoprotein. DOI 10.2174/1389557053402738 Typ Journal Article Autor Peer M Journal Mini reviews in medicinal chemistry Seiten 165-72 -
2005
Titel Targeting drug-efflux pumps -- a pharmacoinformatic approach. DOI 10.18388/abp.2005_3439 Typ Journal Article Autor Pleban K Journal Acta biochimica Polonica Seiten 737-40 Link Publikation -
2004
Titel A Three-Dimensional Model for the Substrate Binding Domain of the Multidrug ATP Binding Cassette Transporter LmrA DOI 10.1124/mol.104.001420 Typ Journal Article Autor Ecker G Journal Molecular Pharmacology Seiten 1169-1179 -
2004
Titel P-Glycoprotein Substrate Binding Domains Are Located at the Transmembrane Domain/Transmembrane Domain Interfaces: A Combined Photoaffinity Labeling-Protein Homology Modeling Approach DOI 10.1124/mol.104.006973 Typ Journal Article Autor Pleban K Journal Molecular Pharmacology Seiten 365-374 -
2004
Titel Lead Identification for Modulators of Multidrug Resistance based on in silico Screening with a Pharmacophoric Feature Model DOI 10.1002/ardp.200300817 Typ Journal Article Autor Langer T Journal Archiv der Pharmazie Seiten 317-327 -
2004
Titel Intramolecular Distribution of Hydrophobicity Influences Pharmacological Activity of Propafenone-type MDR Modulators DOI 10.1002/ardp.200300862 Typ Journal Article Autor Pleban K Journal Archiv der Pharmazie Seiten 328-334 -
2004
Titel Homology model of the multidrug transporter LmrA from Lactococcus lactis DOI 10.1016/j.bmcl.2004.09.040 Typ Journal Article Autor Pleban K Journal Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters Seiten 5823-5826