Pyranose Dehydrogenase aus Höheren Pilzen
Pyranose Dehydrogenase from litter-decomposing fungi
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Pyranose Dehydrogenase,
Oxidoreductases,
Agaricus,
Sugar Transformation,
Lignocellulose Degradation
Das präsentierte Projekt soll die ersten molekularbiologischen Informationen über ein erst kürzlich entdecktes Enzym liefern, das Protein für detaillierte Studien über seine Struktur und Funktion sowie für mögliche Anwendungen verfügbar machen, und die biologische Funktion dieses und verwandter Enzyme aufklären. Oxidoreduktasen von freien Zuckern sind typisch für eine grosse Zahl höherer Pilze. Pyranose Dehydrogenase (PDH) wurde kürzlich aus Agaricus bisporus isoliert. Das Enzym katalysiert die Oxidation verschiedener Mono- und Oligosaccharide am C-Atom 2 und/oder 3. Es ist erst in wenigen Pilzen beschrieben worden, ein PDH kodierendes Gen wurde noch nicht isoliert. Verschiedene Funktionen im Abbau von Lignozellulose werden fuer PDH und verwandte Enzyme wie CDH oder P2O diskutiert, sind aber noch weitgehend spekulativ. Enzymatische Zuckertransformationen präsentieren ein grosses Potential für die Synthese von, z. B., verschiedenen Keto-Zuckern. Durch die Kombination von enzymatischen und chemischen Reaktionen kann eine grosse Anzahl von Zuckerverbindungen konstruiert werden. PDH kann ein wichtiges Werkzeug für derartige Anwendungen darstellen. Die bislang einzigen Pilze, die als Quelle für PDH dienen können, wachsen sehr langsam, die Präparation von bereits geringen Mengen an Enzym benötigt mehrere Wochen. Die Klonierung des Gens und Heterologe Expression ist daher eine Voraussetzung sowohl für Anwendungen als auch weitere Forschungen. Wir planen die Klonierung und Charakterisierung von PDH-kodierenden Genen aus einigen ausgewählten Quellen. cDNA-Klone sollen isoliert und in P. pastoris expremiert werden. Die Proteine werden hinsichtlich ihrer Spezifität für Elektronenakzeptoren sowie der Strukturanforderungen für Substrate charakterisiert werden (Kooperation mit Prof. J. Volc, Tschechische Akademie der Wissenschaften). Die Kristallstruktur von PDH soll bestimmt werden (Kooperation mit Dr. C. Divne, Königliches Technologie-Institut, Stockholm), sowie. ein PDH-negativer Stamm von Agaricus konstruiert und phänotypisch charakterisiert werden (ultrastrukturelle Untersuchungen von PDH- produzierenden und -defizienten Stämmen beim Wachstum auf Lignozellulose; Kooperation mit Prof. G. Daniel, Schwedische Landwirtschaftliche Universität, Uppsala).
Das präsentierte Projekt soll die ersten molekularbiologischen Informationen über ein erst kürzlich entdecktes Enzym liefern, das Protein für detaillierte Studien über seine Struktur und Funktion sowie für mögliche Anwendungen verfügbar machen, und die biologische Funktion dieses und verwandter Enzyme aufklären. Oxidoreduktasen von freien Zuckern sind typisch für eine grosse Zahl höherer Pilze. Pyranose Dehydrogenase (PDH) wurde kürzlich aus Agaricus bisporus isoliert. Das Enzym katalysiert die Oxidation verschiedener Mono- und Oligosaccharide am C-Atom 2 und/oder 3. Es ist erst in wenigen Pilzen beschrieben worden, ein PDH kodierendes Gen wurde noch nicht isoliert. Verschiedene Funktionen im Abbau von Lignozellulose werden fuer PDH und verwandte Enzyme wie CDH oder P2O diskutiert, sind aber noch weitgehend spekulativ. Enzymatische Zuckertransformationen präsentieren ein grosses Potential für die Synthese von, z. B., verschiedenen Keto-Zuckern. Durch die Kombination von enzymatischen und chemischen Reaktionen kann eine grosse Anzahl von Zuckerverbindungen konstruiert werden. PDH kann ein wichtiges Werkzeug für derartige Anwendungen darstellen. Die bislang einzigen Pilze, die als Quelle für PDH dienen können, wachsen sehr langsam, die Präparation von bereits geringen Mengen an Enzym benötigt mehrere Wochen. Die Klonierung des Gens und Heterologe Expression ist daher eine Voraussetzung sowohl für Anwendungen als auch weitere Forschungen. Wir planen die Klonierung und Charakterisierung von PDH-kodierenden Genen aus einigen ausgewählten Quellen. cDNA-Klone sollen isoliert und in P. pastoris expremiert werden. Die Proteine werden hinsichtlich ihrer Spezifität für Elektronenakzeptoren sowie der Strukturanforderungen für Substrate charakterisiert werden (Kooperation mit Prof. J. Volc, Tschechische Akademie der Wissenschaften). Die Kristallstruktur von PDH soll bestimmt werden (Kooperation mit Dr. C. Divne, Königliches Technologie-Institut, Stockholm), sowie. ein PDH-negativer Stamm von Agaricus konstruiert und phänotypisch charakterisiert werden (ultrastrukturelle Untersuchungen von PDH- produzierenden und -defizienten Stämmen beim Wachstum auf Lignozellulose; Kooperation mit Prof. G. Daniel, Schwedische Landwirtschaftliche Universität, Uppsala).
- Christina Divne, KTH Royal Institute of Technology - Schweden
- Geoffrey Daniel, University Umea - Schweden
- Jindrich Volc, Academy of Sciences of the Czech Republic - Tschechien
Research Output
- 275 Zitationen
- 7 Publikationen
-
2009
Titel Pyranose dehydrogenases: biochemical features and perspectives of technological applications DOI 10.1007/s00253-009-2226-y Typ Journal Article Autor Peterbauer C Journal Applied Microbiology and Biotechnology Seiten 837-848 Link Publikation -
2008
Titel Cloning, sequence analysis and heterologous expression in Pichia pastoris of a gene encoding a thermostable cellobiose dehydrogenase from Myriococcum thermophilum DOI 10.1016/j.pep.2008.02.007 Typ Journal Article Autor Zámocký M Journal Protein Expression and Purification Seiten 258-265 -
2007
Titel Properties of pyranose dehydrogenase purified from the litter-degrading fungus Agaricus xanthoderma DOI 10.1111/j.1742-4658.2007.05634.x Typ Journal Article Autor Kujawa M Journal The FEBS Journal Seiten 879-894 Link Publikation -
2007
Titel Characterization of pyranose dehydrogenase from Agaricus meleagris and its application in the C-2 specific conversion of d-galactose DOI 10.1016/j.jbiotec.2007.10.013 Typ Journal Article Autor Sygmund C Journal Journal of Biotechnology Seiten 334-342 -
2007
Titel Molecular cloning of three pyranose dehydrogenase-encoding genes from Agaricus meleagris and analysis of their expression by real-time RT-PCR DOI 10.1007/s00294-007-0171-9 Typ Journal Article Autor Kittl R Journal Current Genetics Seiten 117-127 -
2019
Titel Pyranose dehydrogenases: Rare enzymes for electrochemistry and biocatalysis DOI 10.1016/j.bioelechem.2019.107399 Typ Journal Article Autor Peterbauer C Journal Bioelectrochemistry Seiten 107399 Link Publikation -
2004
Titel A new enzyme catalysis: 3,4-dioxidation of some aryl ß-d-glycopyranosides by fungal pyranose dehydrogenase DOI 10.1016/j.tetlet.2004.09.149 Typ Journal Article Autor Sedmera P Journal Tetrahedron Letters Seiten 8677-8680