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Pyranose Dehydrogenase aus Höheren Pilzen

Pyranose Dehydrogenase from litter-decomposing fungi

Clemens K. Peterbauer (ORCID: 0000-0002-8033-198X)
  • Grant-DOI 10.55776/P16836
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.12.2003
  • Projektende 31.07.2007
  • Bewilligungssumme 232.281 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Pyranose Dehydrogenase, Oxidoreductases, Agaricus, Sugar Transformation, Lignocellulose Degradation

Abstract Endbericht

Das präsentierte Projekt soll die ersten molekularbiologischen Informationen über ein erst kürzlich entdecktes Enzym liefern, das Protein für detaillierte Studien über seine Struktur und Funktion sowie für mögliche Anwendungen verfügbar machen, und die biologische Funktion dieses und verwandter Enzyme aufklären. Oxidoreduktasen von freien Zuckern sind typisch für eine grosse Zahl höherer Pilze. Pyranose Dehydrogenase (PDH) wurde kürzlich aus Agaricus bisporus isoliert. Das Enzym katalysiert die Oxidation verschiedener Mono- und Oligosaccharide am C-Atom 2 und/oder 3. Es ist erst in wenigen Pilzen beschrieben worden, ein PDH kodierendes Gen wurde noch nicht isoliert. Verschiedene Funktionen im Abbau von Lignozellulose werden fuer PDH und verwandte Enzyme wie CDH oder P2O diskutiert, sind aber noch weitgehend spekulativ. Enzymatische Zuckertransformationen präsentieren ein grosses Potential für die Synthese von, z. B., verschiedenen Keto-Zuckern. Durch die Kombination von enzymatischen und chemischen Reaktionen kann eine grosse Anzahl von Zuckerverbindungen konstruiert werden. PDH kann ein wichtiges Werkzeug für derartige Anwendungen darstellen. Die bislang einzigen Pilze, die als Quelle für PDH dienen können, wachsen sehr langsam, die Präparation von bereits geringen Mengen an Enzym benötigt mehrere Wochen. Die Klonierung des Gens und Heterologe Expression ist daher eine Voraussetzung sowohl für Anwendungen als auch weitere Forschungen. Wir planen die Klonierung und Charakterisierung von PDH-kodierenden Genen aus einigen ausgewählten Quellen. cDNA-Klone sollen isoliert und in P. pastoris expremiert werden. Die Proteine werden hinsichtlich ihrer Spezifität für Elektronenakzeptoren sowie der Strukturanforderungen für Substrate charakterisiert werden (Kooperation mit Prof. J. Volc, Tschechische Akademie der Wissenschaften). Die Kristallstruktur von PDH soll bestimmt werden (Kooperation mit Dr. C. Divne, Königliches Technologie-Institut, Stockholm), sowie. ein PDH-negativer Stamm von Agaricus konstruiert und phänotypisch charakterisiert werden (ultrastrukturelle Untersuchungen von PDH- produzierenden und -defizienten Stämmen beim Wachstum auf Lignozellulose; Kooperation mit Prof. G. Daniel, Schwedische Landwirtschaftliche Universität, Uppsala).

Das präsentierte Projekt soll die ersten molekularbiologischen Informationen über ein erst kürzlich entdecktes Enzym liefern, das Protein für detaillierte Studien über seine Struktur und Funktion sowie für mögliche Anwendungen verfügbar machen, und die biologische Funktion dieses und verwandter Enzyme aufklären. Oxidoreduktasen von freien Zuckern sind typisch für eine grosse Zahl höherer Pilze. Pyranose Dehydrogenase (PDH) wurde kürzlich aus Agaricus bisporus isoliert. Das Enzym katalysiert die Oxidation verschiedener Mono- und Oligosaccharide am C-Atom 2 und/oder 3. Es ist erst in wenigen Pilzen beschrieben worden, ein PDH kodierendes Gen wurde noch nicht isoliert. Verschiedene Funktionen im Abbau von Lignozellulose werden fuer PDH und verwandte Enzyme wie CDH oder P2O diskutiert, sind aber noch weitgehend spekulativ. Enzymatische Zuckertransformationen präsentieren ein grosses Potential für die Synthese von, z. B., verschiedenen Keto-Zuckern. Durch die Kombination von enzymatischen und chemischen Reaktionen kann eine grosse Anzahl von Zuckerverbindungen konstruiert werden. PDH kann ein wichtiges Werkzeug für derartige Anwendungen darstellen. Die bislang einzigen Pilze, die als Quelle für PDH dienen können, wachsen sehr langsam, die Präparation von bereits geringen Mengen an Enzym benötigt mehrere Wochen. Die Klonierung des Gens und Heterologe Expression ist daher eine Voraussetzung sowohl für Anwendungen als auch weitere Forschungen. Wir planen die Klonierung und Charakterisierung von PDH-kodierenden Genen aus einigen ausgewählten Quellen. cDNA-Klone sollen isoliert und in P. pastoris expremiert werden. Die Proteine werden hinsichtlich ihrer Spezifität für Elektronenakzeptoren sowie der Strukturanforderungen für Substrate charakterisiert werden (Kooperation mit Prof. J. Volc, Tschechische Akademie der Wissenschaften). Die Kristallstruktur von PDH soll bestimmt werden (Kooperation mit Dr. C. Divne, Königliches Technologie-Institut, Stockholm), sowie. ein PDH-negativer Stamm von Agaricus konstruiert und phänotypisch charakterisiert werden (ultrastrukturelle Untersuchungen von PDH- produzierenden und -defizienten Stämmen beim Wachstum auf Lignozellulose; Kooperation mit Prof. G. Daniel, Schwedische Landwirtschaftliche Universität, Uppsala).

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Christina Divne, KTH Royal Institute of Technology - Schweden
  • Geoffrey Daniel, University Umea - Schweden
  • Jindrich Volc, Academy of Sciences of the Czech Republic - Tschechien

Research Output

  • 275 Zitationen
  • 7 Publikationen
Publikationen
  • 2009
    Titel Pyranose dehydrogenases: biochemical features and perspectives of technological applications
    DOI 10.1007/s00253-009-2226-y
    Typ Journal Article
    Autor Peterbauer C
    Journal Applied Microbiology and Biotechnology
    Seiten 837-848
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Cloning, sequence analysis and heterologous expression in Pichia pastoris of a gene encoding a thermostable cellobiose dehydrogenase from Myriococcum thermophilum
    DOI 10.1016/j.pep.2008.02.007
    Typ Journal Article
    Autor Zámocký M
    Journal Protein Expression and Purification
    Seiten 258-265
  • 2007
    Titel Properties of pyranose dehydrogenase purified from the litter-degrading fungus Agaricus xanthoderma
    DOI 10.1111/j.1742-4658.2007.05634.x
    Typ Journal Article
    Autor Kujawa M
    Journal The FEBS Journal
    Seiten 879-894
    Link Publikation
  • 2007
    Titel Characterization of pyranose dehydrogenase from Agaricus meleagris and its application in the C-2 specific conversion of d-galactose
    DOI 10.1016/j.jbiotec.2007.10.013
    Typ Journal Article
    Autor Sygmund C
    Journal Journal of Biotechnology
    Seiten 334-342
  • 2007
    Titel Molecular cloning of three pyranose dehydrogenase-encoding genes from Agaricus meleagris and analysis of their expression by real-time RT-PCR
    DOI 10.1007/s00294-007-0171-9
    Typ Journal Article
    Autor Kittl R
    Journal Current Genetics
    Seiten 117-127
  • 2019
    Titel Pyranose dehydrogenases: Rare enzymes for electrochemistry and biocatalysis
    DOI 10.1016/j.bioelechem.2019.107399
    Typ Journal Article
    Autor Peterbauer C
    Journal Bioelectrochemistry
    Seiten 107399
    Link Publikation
  • 2004
    Titel A new enzyme catalysis: 3,4-dioxidation of some aryl ß-d-glycopyranosides by fungal pyranose dehydrogenase
    DOI 10.1016/j.tetlet.2004.09.149
    Typ Journal Article
    Autor Sedmera P
    Journal Tetrahedron Letters
    Seiten 8677-8680

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