Globale Genexpression in Umweltchlamydien
The Environmental Chlamydia Transcriptome Project
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Gesundheitswissenschaften (20%)
Keywords
-
Parachlamydia,
New Emerging Pathogen,
Environmental Chlamydia,
Transcriptome,
Free-Living Amoebae,
DNA microarray
Chlamydien sind bedeutende bakterielle Krankheitserreger des Menschen. Deren wichtigste Vertreter zählen zu den am häufigsten sexuell übertragenen, pathogenen Bakterien (Chlamydia trachomatis) oder verursachen weit verbreitete Atemwegerkrankungen (Chlamydophila pneumoniae). In letzter Zeit gerieten Chlamydien verstärkt ins öffentliche Interesse, nachdem sie zudem mit der Entstehung von Artheriosklerose und Asthma in Zusammenhang gebracht wurden. Erst seit wenigen Jahren ist bekannt, dass Chlamydien auch in der Umwelt weit verbreitet sind, wo sie vorwiegend innerhalb frei lebender Amöben vorkommen. Serologische sowie molekularbiologische Untersuchungen lassen vermuten, dass auch diese so genannten Umweltchlamydien möglicherweise an respiratorischen Erkrankungen des Menschen beteiligt sind. Kürzlich konnten wir im Rahmen des Environmental Chlamydiae Genome Projects (EDGE, http://www.microbial-ecology.net) das Genom eines Vertreters der Umweltchlamydien entschlüsseln. Basierend auf diesen Daten soll nun im Rahmen des vorliegenden Projektes ein DNS-Mikrochip zur Untersuchung des Transkriptoms der Umweltchlamydien entwickelt und für umfassende Expressionsanalysen eingesetzt werden. Diese Studien werden neue Erkenntnisse über die Entwicklung der Virulenz und die Evolution der Chlamydien, sowie über die Anpassungen dieser wichtigen Bakteriengruppe an das intrazelluläre Leben in ihren Wirtszellen liefern.
Chlamydien sind bedeutende bakterielle Krankheitserreger des Menschen. Deren wichtigste Vertreter zählen zu den am häufigsten sexuell übertragenen, pathogenen Bakterien (Chlamydia trachomatis) oder verursachen weit verbreitete Atemwegerkrankungen (Chlamydophila pneumoniae). In letzter Zeit gerieten Chlamydien verstärkt ins öffentliche Interesse, nachdem sie zudem mit der Entstehung von Artheriosklerose und Asthma in Zusammenhang gebracht wurden. Erst seit wenigen Jahren ist bekannt, dass Chlamydien auch in der Umwelt weit verbreitet sind, wo sie vorwiegend innerhalb frei lebender Amöben vorkommen. Serologische sowie molekularbiologische Untersuchungen lassen vermuten, dass auch diese so genannten Umweltchlamydien möglicherweise an respiratorischen Erkrankungen des Menschen beteiligt sind. Kürzlich konnten wir im Rahmen des Environmental Chlamydiae Genome Projects (EDGE, http://www.microbial-ecology.net) das Genom eines Vertreters der Umweltchlamydien entschlüsseln. Basierend auf diesen Daten soll nun im Rahmen des vorliegenden Projektes ein DNS-Mikrochip zur Untersuchung des Transkriptoms der Umweltchlamydien entwickelt und für umfassende Expressionsanalysen eingesetzt werden. Diese Studien werden neue Erkenntnisse über die Entwicklung der Virulenz und die Evolution der Chlamydien, sowie über die Anpassungen dieser wichtigen Bakteriengruppe an das intrazelluläre Leben in ihren Wirtszellen liefern.
- Universität Wien - 100%
- Thomas F. Meyer, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
Research Output
- 933 Zitationen
- 7 Publikationen
-
2008
Titel Diversity of Bacterial Endosymbionts of Environmental Acanthamoeba Isolates DOI 10.1128/aem.01093-08 Typ Journal Article Autor Schmitz-Esser S Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 5822-5831 Link Publikation -
2007
Titel An Acanthamoeba sp. containing two phylogenetically different bacterial endosymbionts DOI 10.1111/j.1462-2920.2007.01268.x Typ Journal Article Autor Heinz E Journal Environmental Microbiology Seiten 1604-1609 Link Publikation -
2006
Titel Tapping the nucleotide pool of the host: novel nucleotide carrier proteins of Protochlamydia amoebophila DOI 10.1111/j.1365-2958.2006.05193.x Typ Journal Article Autor Haferkamp I Journal Molecular Microbiology Seiten 1534-1545 Link Publikation -
2006
Titel “Candidatus Thiobios zoothamnicoli,” an Ectosymbiotic Bacterium Covering the Giant Marine Ciliate Zoothamnium niveum DOI 10.1128/aem.72.3.2014-2021.2006 Typ Journal Article Autor Rinke C Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 2014-2021 Link Publikation -
2011
Titel Systematic Spatial Bias in DNA Microarray Hybridization Is Caused by Probe Spot Position-Dependent Variability in Lateral Diffusion DOI 10.1371/journal.pone.0023727 Typ Journal Article Autor Steger D Journal PLoS ONE Link Publikation -
2005
Titel Amoebae as Training Grounds for Intracellular Bacterial Pathogens DOI 10.1128/aem.71.1.20-28.2005 Typ Journal Article Autor Molmeret M Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 20-28 Link Publikation -
2004
Titel Bacterial Endosymbionts of Free-living Amoebae1 DOI 10.1111/j.1550-7408.2004.tb00278.x Typ Journal Article Autor Horn M Journal Journal of Eukaryotic Microbiology Seiten 509-514