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Entwicklung von Arginin selektiven Analysemethoden

Development of arginine selective analysis principles

Wolfgang F. Lindner (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P15482
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 10.10.2002
  • Projektende 09.01.2006
  • Bewilligungssumme 525.472 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (5%); Chemie (85%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (10%)

Keywords

    ARGININE, PEPTIDE, TAGGING REAGENT, PROTEOMICS, LIQUID CHROMATOGRAPHY-MASS SPECTROMETRY, AFFINITY MATERIAL

Abstract Endbericht

Proteine und Peptide, die in iher Aminosäuresequenz zwei oder mehrere benachbarte Argininreste (Arg) enthalten, können durch einen besonders aktiv unterstützenden Transportmechanismus (twin-arginine transloctation, Tat pathway) durch die Zellmembran in die Zelle gelangen. Ein wichtiges Beispiel für diesen Effekt ist korreliert mit der benötigten Vervielfältigung eines Proteins des HIV Virus. Es konnte zudem gezeigt werden, daß dieser Mechanismus generell zu sein scheint, das heißt daß Peptidsequenzen mit mehreren benachbarten Argininresten, welche gegebenenfalls auch an nicht peptidische Wirkstoffe geknüpft sind, mit hoher Effizienz durch die Zellmembran in die Zelle, d. h. an den eigentlichen Wirkort, transportiert werden können. Damit eröffnet sich ein weites Feld für neue Wirkstoffforschung unter Einbeziehung von effizienten Transport- und Bioverfügbarkeitskriterien. Basierend auf der potentiell großen Bedeutung dieser Arg-Gruppen in Proteinen und Peptiden, bzw. der Guanidin-Gruppe in peptidomimetischen Verbindungen, definiert sich als Ziel des gegenständlichen Projektes analytische Methoden bereitzustellen, die die selektive Anreicherung, Abtrennung, Identifizierung und Quantifizierung dieser bioaktiven Substanzen mittels flüssig-chromatographischer und massenspektrometrischer Techniken erlauben. Die formulierten analytischen Konzepte, welche auf mehrdimensional aufgebauten Molekülerkennungs- bzw. Trennkriterien fußen, ermöglichen eine gezielte Vereinfachung der sehr komplex zusammengesetzten Probenmatrix (Protein- bzw. Peptid-Gemische vor und nach einem z.B. tryptischen Verdau), was entscheidend ist um Moleküle auch in sehr gringen Konzentrationen zweifelsfrei zu identifizieren. Damit sollte ein interessanter Beitrag auf dem Gebiet der Analytik in den Life Sciences gelingen, welcher in dieser Konzeption neuartig ist. Die hohe Gruppen- und/oder Substanzselektivität der zu entwickelnden Methoden beruht auf dem Konzept der molekularen Erkennung der Argininreste durch geeignete komplementäre Selektormoleküle bzw. Liganden, die in einem Falle als Additive in der Massenspektrometrie zum Einsatz kommen, um dieserart eine hochselektive Erkennung der Vebindungen zu ermöglichen. Auf ähnlichem Prinzip aufbauend werden parallel dazu Polymermaterialien als hochselektive chromatographische Phasen entwickelt, welche eine effektive Abtrennung unerwünschter Analyte aus einer komplexen Mischung bzw. eine gezielte Anreicherung der Arginin-hältigen Zielkomponenten ermöglichen. Ein wesentlicher Fokus all der geplanten Methoden liegt auf der Etablierung von quantitativen LC-MS/MS Methoden basierend auf den oben erwähnten Arginin-Affinitätsprinzipien, um damit auch die Auf- und Abregulierung von biologisch wichtigen Leitverbindungen erfassen zu können. Hierzu ist Synthese und Einsatz von kalten isotopenmarkierten Reagenzien im Zusammenhang mit MS/MS Detektion geplant.

Die Zielsetzung des FWF Projektes mit dem Titel "Entwicklung von Arginin selektiven Analysenmethoden" orientiert sind an der Erforschung von molekularen Erkennungs- und Wechselwirkungsmechanismen von Molekülen am Beispiel der stark basischen Guanidin Gruppe in der Seitenkette der Aminosäure Arginin, welche in Peptiden und Proteinen eingebaut ist, mit chemoselektiven und/oder sauren Reaktionspartnern. Dieserart können entweder chemoselektiv kovalent gebundene Reaktionsprodukte entstehen oder nicht-kovalent gebundene Komplexe oder Assoziate über intermolekular wirkende Wechselwirkungskräfte. Schwerpunktsmäßig wurden drei Forschungsrichtungen verfolgt: (a) Die chemoselektive pH-kontrollierte quantitative Derivatisierung der Guanidin Gruppe mit 2,3-Butandion (BD) und Phenylboronsäure (PBA) für eine verbesserte massenspektrometrische Analytik von Arginin-haltigen Peptiden und Proteinen. (b) Parallel dazu gelang es einen chemoselektiven Sorptionsprozess zu entwickeln, unter Zuziehung von Phenylboronsäure enthaltenden Materialien mit deren Hilfe nun selektiv Arginin-hältige Peptide aus einem komplexen Gemisch von Peptiden, wie z.B. aus einem Verdau von Proteinen, von anderen Peptiden abgetrennt und angereichert werden konnten, was zu einer wesentlichen Vereinfachung der Peptid- und Protein-Analytik führt. (c) Als weiteren Meilenstein sehen wir die Etablierung von schnellen ESI-MS/MS Verfahren zum Studium von Molekülassoziaten von Arg-hältigen Verbindungen mit verschiedenen Säuren in wässriger Lösung. Dieserart erhielt man wertvolle Information im Bezug auf qualitative und quantitative Struktur-Wechselwirkungsbeziehungen, welche für die Weiterentwicklung neuer Materialien und Methoden in der Bioanalytik wichtig sind.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Milton T. W. Hearn, The University of Melbourne - Australien
  • Klaus Albert, Eberhard-Karls-Universität Tübingen - Deutschland

Research Output

  • 341 Zitationen
  • 13 Publikationen
Publikationen
  • 2007
    Titel Use of the arginine-specific butanedione/phenylboronic acid tag for analysis of peptides and protein digests using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry
    DOI 10.1002/rcm.2967
    Typ Journal Article
    Autor Leitner A
    Journal Rapid Communications in Mass Spectrometry
    Seiten 1321-1330
  • 2007
    Titel Improving fragmentation of poorly fragmenting peptides and phosphopeptides during collision-induced dissociation by malondialdehyde modification of arginine residues
    DOI 10.1002/jms.1233
    Typ Journal Article
    Autor Leitner A
    Journal Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 950-959
  • 2007
    Titel Selective Enrichment of Tryptophan-Containing Peptides from Protein Digests Employing a Reversible Derivatization with Malondialdehyde and Solid-Phase Capture on Hydrazide Beads
    DOI 10.1021/pr0702767
    Typ Journal Article
    Autor Foettinger A
    Journal Journal of Proteome Research
    Seiten 3827-3834
  • 2007
    Titel Reaction of the Indole Group with Malondialdehyde: Application for the Derivatization of Tryptophan Residues in Peptides
    DOI 10.1021/bc070001h
    Typ Journal Article
    Autor Foettinger A
    Journal Bioconjugate Chemistry
    Seiten 1678-1683
  • 2006
    Titel Derivatisation of arginine residues with malondialdehyde for the analysis of peptides and protein digests by LC-ESI-MS/MS
    DOI 10.1002/jms.1020
    Typ Journal Article
    Autor Foettinger A
    Journal Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 623-632
  • 2006
    Titel Deuterium isotope effects observed during competitive binding chiral recognition electrospray ionization—mass spectrometry of cinchona alkaloid-based systems
    DOI 10.1002/jms.983
    Typ Journal Article
    Autor Schug K
    Journal Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 157-161
  • 2005
    Titel Solid-phase capture and release of arginine peptides by selective tagging and boronate affinity chromatography
    DOI 10.1016/j.chroma.2005.03.038
    Typ Journal Article
    Autor Foettinger A
    Journal Journal of Chromatography A
    Seiten 187-196
  • 2005
    Titel Effects of an arginine-selective tagging procedure on the fragmentation behavior of peptides studied by electrospray ionization tandem mass spectrometry (ESI-MS/MS)
    DOI 10.1016/j.aca.2004.09.067
    Typ Journal Article
    Autor Leitner A
    Journal Analytica Chimica Acta
    Seiten 165-173
  • 2005
    Titel Peptide enantiomer separations: Influence of sequential isomerism and the introduction of achiral glycine moieties on chiral recognition
    DOI 10.1016/j.chroma.2005.07.068
    Typ Journal Article
    Autor Czerwenka C
    Journal Journal of Chromatography A
    Seiten 81-88
  • 2005
    Titel Functional Probing of Arginine Residues in Proteins Using Mass Spectrometry and an Arginine-Specific Covalent Tagging Concept
    DOI 10.1021/ac050217h
    Typ Journal Article
    Autor Leitner A
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 4481-4488
  • 2005
    Titel Measurement of Solution-Phase Chiral Molecular Recognition in the Gas Phase Using Electrospray Ionization-Mass Spectrometry
    DOI 10.1021/ac050137d
    Typ Journal Article
    Autor Schug K
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 3660-3670
  • 2005
    Titel Using electrospray ionization-mass spectrometry/tandem mass spectrometry and small molecules to study guanidinium–anion interactions
    DOI 10.1016/j.ijms.2004.10.019
    Typ Journal Article
    Autor Schug K
    Journal International Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 11-23
  • 2004
    Titel Development of a screening technique for noncovalent complex formation between guanidinium- and phosphonate-functionalized amino acids by electrospray ionization ion trap mass spectrometry: assessing ionization and functional group interaction
    DOI 10.1016/j.ijms.2004.04.012
    Typ Journal Article
    Autor Schug K
    Journal International Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 213-222

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