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Charakterisierung des Flippasemechanismus von Rhodopsin

Characterization of the scramblase mechanism of rhodopsin

Birgit Ploier-Brandauer (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/J3686
  • Förderprogramm Erwin Schrödinger
  • Status beendet
  • Projektbeginn 24.11.2014
  • Projektende 23.05.2017
  • Bewilligungssumme 150.040 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (20%)

Keywords

    Flip-flop, Rhodopsin, Flippase, Membranes, Lipids, Scramblase

Abstract Endbericht

Rhodopsin ist eines der Netzpigmente von Photorezeptorzellen der Netzhaut und ist für die ersten Prozesse nach der Wahrnehmung von Licht zuständig. Es besteht aus dem Apoprotein Opsin, einem TransmembranProtein mit mehreren Transmembrandomänen und dem reversibel gebundenen Cofaktor Retinal. Erst kürzlich wurde gezeigt, dass Rhodopsin eine ATP - unabhängige Phospholipid-Flippase ist, die sehr schnell Phospholipide über eine Membran-Doppelschicht transportieren kann. Diese Entdeckung lieferte die molekulare Erklärung für schon früher gemachte Beobachtungen des bidirektionalen, ATP - unabhängigen Phospholipid-Flip-Flops in Photorezeptor-Diskmembranen und führte zu einer weiteren anerkannten Funktion von Rhodopsin neben seiner bekannten Funktion als Phototransduktor. Der Transport von Lipiden innerhalb der Netzhaut ist entscheidend für das Sehvermögen. Retinoide müssen sich schnell zwischen Photorezeptorzellen der Netzhaut und Epithelzellen bewegen, um Rhodopsin nach der Photoaktivierung zu regenerieren. Defekte im Lipidtransport können zu Retinopathien führen. Ein Beispiel ist die Stargardt-Makula-Dystrophie, die durch die Unfähigkeit verursacht wird, ein Retinoid- Phospholipid-Addukt über Photorezeptor-Discs zu transportieren. Bidirektionaler Flip-flop, mittlerweile bekannt durch Rhodopsin katalysiert, löst das Problem der Expansion einer Phospholipid-Monoschicht auf Kosten der anderen, hervorgerufen durch die unidirektionale Bewegung der Lipide durch die zwei ATP- abhängigen unidirektionalen Flippasen ABCA4 (Quazi et al., 2012 ; Weng et al, 1999) und Atp8a2 (Coleman et al., 2009). Obwohl Rhodopsin ein ausführlich untersuchtes Protein ist, ist bis dato kaum etwas über seine strukturellen oder dynamischen Funktionen bekannt, die zum flip-flop von Phospholipiden führen. Das hier vorgestellte Projekt konzentriert sich auf die Identifikation von strukturellen und dynamischen Eigenschaften von Transmembrandomänen Rhodopsins, die für die Funktion als Flippase erforderlich sind. Wir vermuten, dass der Lipidtransport ermöglicht wird durch spezielle Strukturelemente im Transmembran-Helixbündel von Rhodopsin und durch dynamische Bewegungen der Transmembran-Helices. Um diese Hypothese zu testen, werden wir die Wirkung des Austausches von spezifischen Aminosäuren innerhalb des Transmembran-Helixbündels untersuchen, insbesondere derjenigen, die sehr nah zu Membranlipiden stehen. Die mutagenisierten Rhodopsin- Varianten werden in COS7- Zellkulturen exprimiert und nach Affinitätsaufreinigung charakterisiert. Die Flippase Aktivität wird mittels eines gut etablierten Fluoreszenz-Ansatzes mit 7-Nitrobenz-2-oxa-1,3- diazol (NBD)-markierten Lipiden untersucht werden, und deren Orientierung in der Membran wird mit dem impermeablen Reduktionsmittel Dithionit getestet werden. Darüber hinaus werden die fluoreszenzbasierten Daten durch die Etablierung eines neuen Flippase-Assays unter Verwendung von natürlichen Phospholipiden ergänzt werden.

Retinitis pigmentosa (RP) ist eine erbliche Augenerkrankung die zu peripherem Sehverlust und Nachtblindheit führt, hervorgerufen durch eine Zerstörung der Photorezeptorzellen. Über 1.5 Millionen Menschen weltweit leiden an RP. Die molekulare Ursache dieser Erkrankung sind Punkmutationen des Photorezeptors Rhodopsin, dem in der Retina ansässigen Sehpigment, das auch als strukturelle Komponente von Photorezeptorzellen dient. Unsere Forschung untersuchte die mechanistische Grundlage der Photorezeptorzerstörung die der Netzhautdegeneration von RP- Patienten zugrunde liegt. Die meisten Mutationen, die mit RP assoziiert werden, beeinträchtigten entweder die Stabilität, Aktivität oder die Lokalisierung von Rhodopsin. Allerdings gibt es auch eine Gruppe von RP-Mutationen die keines dieser Probleme aufweist, und trotzdem die Erkrankung hervorruft. Wir analysierten drei dieser Mutationen: F45L, V209M und F220C. Unsere Daten führten zu der Schluss-folgerung, dass, ungleich dem Wildtyp Rhodopsin, das selbstassoziiert um Dimere und auch höher organisierte Strukturen zu bilden, F45L, V209M und F220C nicht dimerisieren können. Dieses Ergebnis bildet die Basis einer neuen mechanistischen Erklärung für das Ausbrechen von RP in bisher ungeklärten Fällen. Unsere Hypothese ist, dass durch die fehlende Dimerisierung, die normale Photorezeptorfunktion nicht mehr erfüllt wird, und damit die hochorganisierte Architektur dieser Zellen nicht aufrecht erhalten werden kann.

Forschungsstätte(n)
  • Weill Medical College of Cornell University - 100%

Research Output

  • 112 Zitationen
  • 3 Publikationen
Publikationen
  • 2016
    Titel Dimerization deficiency of enigmatic retinitis pigmentosa-linked rhodopsin mutants
    DOI 10.1038/ncomms12832
    Typ Journal Article
    Autor Ploier B
    Journal Nature Communications
    Seiten 12832
    Link Publikation
  • 2016
    Titel A Fluorescence-based Assay of Phospholipid Scramblase Activity.
    DOI 10.3791/54635
    Typ Journal Article
    Autor Ploier B
    Journal Journal of visualized experiments : JoVE
    Link Publikation
  • 2017
    Titel flippant–An R package for the automated analysis of fluorescence-based scramblase assays
    DOI 10.1186/s12859-017-1542-y
    Typ Journal Article
    Autor Cotton R
    Journal BMC Bioinformatics
    Seiten 146
    Link Publikation

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