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Schnelle Aufnahme & metabolische Modellierung für deut. MRI

Fast acquisition and metabolic modelling for deuterium MRI

Bernhard Strasser (ORCID: 0000-0001-9542-3855)
  • Grant-DOI 10.55776/I6037
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.10.2022
  • Projektende 30.09.2027
  • Bewilligungssumme 586.585 €
  • Projekt-Website

Weave: Österreich - Belgien - Deutschland - Luxemburg - Polen - Schweiz - Slowenien - Tschechien

Wissenschaftsdisziplinen

Klinische Medizin (100%)

Keywords

    Proton Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging, Metabolic Modelling, Ultra-High Field Mrsi (7T And 14.1T), Deuterium Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging, Carbon 13 Mrs, Accelerated Mrsi Encoding

Abstract

Das menschliche Gehirn ist das Organ mit dem höchsten Energieverbrauch im Verhältnis zu seinem Gewicht. Diese Energie wird hauptsächlich in Form von Glukose verbraucht, die auf oxidativem oder nichtoxidativem Weg verstoffwechselt wird. Auf dem oxidativen Weg spielt Glutamat eine entscheidende Rolle, während auf dem nichtoxidativen Weg Laktat von Bedeutung ist. Bei verschiedenen Krankheiten wie Hirntumoren oder Epilepsie ist dieser Energiestoffwechsel gestört, z. B. in Form eines gestörten Gleichgewichts zwischen dem oxidativen und dem nichtoxidativen Stoffwechselweg. Daher kann die Untersuchung des Energiestoffwechsels im Gehirn wertvolle Erkenntnisse zum Verständnis und zur Erkennung von Krankheiten liefern. Die Magnetresonanzspektroskopische Bildgebung (MRSI) ist eine Methode zur Untersuchung der Konzentrationen bestimmter Metaboliten mit einem MR-Scanner. Eine besondere Form der MRSI ist Deuterium-MRSI, bei der nur das Signal des Wasserstoffisotops Deuterium gemessen wird. Vor der Einnahme von deuterierter Glukose, bei der einige Wasserstoffatome durch Deuterium ersetzt werden, werden mit Deuterium-MRSI keine Glutamat- und Laktatsignale gemessen, da natürliches Glutamat und Laktat fast kein Deuterium enthalten. Nach dem Verzehr von deuterierter Glukose wird diese in Glutamat und Laktat metabolisiert, so dass während des Experiments Signale gemessen werden. Dadurch lassen sich die oxidativen und nichtoxidativen Stoffwechselraten quantifizieren. Leider ist die Deuterium-MRSI Methode noch nicht vollständig etabliert und hinkt einigen Entwicklungen, die bei der MRT oder der herkömmlichen MRSI erreicht wurden hinterher. Ziel dieses Projekts ist daher die Verbesserung der Deuterium-MRSI-Methoden an einem MRI-Scanner für Menschen und Tiere. Dazu gehört die Entwicklung eines Modells zur Quantifizierung der oxidativen und nicht-oxidativen Stoffwechselraten von Glukose sowie Verbesserungen bei der Datenaufnahme und Rekonstruktion. Ziel ist es, die Datenaufnahme zu beschleunigen und das Rauschen in den Daten zu reduzieren. Dies kann erreicht werden, indem die Daten in konzentrischen Ringen anstelle einzelner Punkte im Messraum gemessen werden und indem ein bestimmtes Modell angewendet wird, das von einer "Niederrangigkeit" der Daten ausgeht, um zwischen Signal und Rauschen zu unterscheiden. Diese entwickelten Methoden sollen dann auf Epilepsiepatienten und Rattenmodelle für Epilepsie angewendet werden. Dies wird es uns ermöglichen, die Vorteile der entwickelten Methodik in einer realen Anwendung zu untersuchen, und kann zu einem besseren Verständnis der Epilepsie beitragen. Die Ergebnisse werden mit der Standardmethode zur Bewertung des Energiestoffwechsels bei Epilepsie, FDG-PET, verglichen.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Ekaterina Pataraia, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Gilbert Hangel, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Karl Rössler, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Siegfried Trattnig, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Thomas Scherer, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Wolfgang Bogner, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Bernard Lanz, École polytechnique fédérale de Lausanne - Schweiz
  • Cristina Cudalbu, École polytechnique fédérale de Lausanne - Schweiz

Research Output

  • 91 Zitationen
  • 15 Publikationen
Publikationen
  • 2025
    Titel Exploring in vivo human brain metabolism at 10.5 T: Initial insights from MR spectroscopic imaging
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2025.121015
    Typ Journal Article
    Autor Hingerl L
    Journal NeuroImage
    Seiten 121015
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Deep-ER: Deep Learning ECCENTRIC Reconstruction for fast high-resolution neurometabolic imaging
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2025.121045
    Typ Journal Article
    Autor Weiser P
    Journal NeuroImage
    Seiten 121045
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Topographical mapping of metabolic abnormalities in multiple sclerosis using rapid echo-less 3D-MR spectroscopic imaging at 7T
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2025.121043
    Typ Journal Article
    Autor Niess E
    Journal NeuroImage
    Seiten 121043
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Comparison of Low-Rank Denoising Methods for Dynamic Deuterium MRSI at 7 T
    DOI 10.1002/nbm.70125
    Typ Journal Article
    Autor Duguid A
    Journal NMR in Biomedicine
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Myo-Inositol Deficiency, Structural Brain Changes, and Cerebral Perfusion Alterations in Classic Galactosemia: Preliminary Insights From a Multiparametric MRI Study
    DOI 10.1002/jimd.70097
    Typ Journal Article
    Autor Niess E
    Journal Journal of Inherited Metabolic Disease
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Feasibility of High-Resolution Deuterium Metabolic Imaging of the Human Kidney Using Concentric Ring Trajectory Sampling at 7T
    DOI 10.1002/nbm.70139
    Typ Journal Article
    Autor Niess F
    Journal NMR in Biomedicine
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Balanced steady state free precession enables high-resolution dynamic 3D Deuterium Metabolic Imaging of the human brain at 7T
    DOI 10.1101/2025.02.06.25321580
    Typ Preprint
    Autor Frese S
    Seiten 2025.02.06.25321580
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Whole-brain deuterium metabolic imaging via concentric ring trajectory readout enables assessment of regional variations in neuronal glucose metabolism
    DOI 10.1002/hbm.26686
    Typ Journal Article
    Autor Niess F
    Journal Human Brain Mapping
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Proton-free induction decay MRSI at 7 T in the human brain using an egg-shaped modified rosette K-space trajectory
    DOI 10.1002/mrm.30368
    Typ Journal Article
    Autor Blömer S
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 1443-1457
    Link Publikation
  • 2023
    Titel 1H magnetic resonance spectroscopic imaging of deuterated glucose and of neurotransmitter metabolism at 7 T in the human brain
    DOI 10.1038/s41551-023-01035-z
    Typ Journal Article
    Autor Bednarik P
    Journal Nature Biomedical Engineering
    Seiten 1001-1013
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Reproducibility of 3D MRSI for imaging human brain glucose metabolism using direct (2H) and indirect (1H) detection of deuterium labeled compounds at 7T and clinical 3T
    DOI 10.1101/2023.04.17.23288672
    Typ Preprint
    Autor Niess F
    Seiten 2023.04.17.23288672
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Reproducibility of 3D MRSI for imaging human brain glucose metabolism using direct (2H) and indirect (1H) detection of deuterium labeled compounds at 7T and clinical 3T
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2023.120250
    Typ Journal Article
    Autor Niess F
    Journal NeuroImage
    Seiten 120250
    Link Publikation
  • 2024
    Titel WALINET: A water and lipid identification convolutional neural network for nuisance signal removal in 1H$$ {}^1\mathrm{H} $$ MR spectroscopic imaging
    DOI 10.1002/mrm.30402
    Typ Journal Article
    Autor Weiser P
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 1430-1442
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Concentric Ring Trajectory Sampling With k-Space Reordering Enables Assessment of Tissue-Specific T1 and T2 Relaxation for 2H-Labeled Substrates in the Human Brain at 7 T
    DOI 10.1002/nbm.5311
    Typ Journal Article
    Autor Bader V
    Journal NMR in Biomedicine
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Noninvasive 3-Dimensional 1 H-Magnetic Resonance Spectroscopic Imaging of Human Brain Glucose and Neurotransmitter Metabolism Using Deuterium Labeling at 3T : Feasibility and Interscanner Reproducibility.
    DOI 10.1097/rli.0000000000000953
    Typ Journal Article
    Autor Hingerl L
    Journal Investigative radiology
    Seiten 431-437

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