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Klasse III Cellobiosedehydrogenase: das fehlende Bindeglied?

Class III cellobiose dehydrogenases: the missing link?

Roland Ludwig (ORCID: 0000-0002-5058-5874)
  • Grant-DOI 10.55776/I5299
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2021
  • Projektende 31.03.2025
  • Bewilligungssumme 379.512 €

Bilaterale Ausschreibung: Russland

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (70%); Industrielle Biotechnologie (30%)

Keywords

    Cellobiose Dehydrogenase, Fungal Enzymes, Hemoflavoenzymes, Substrate Specificity, Screening, Protein Characterization

Abstract Endbericht

Die Cellobiosedehydrogenase (CDH) istein Enzym,das von Pilzen zum Abbau lignozellulosehältiger Biomasse sekretiert wird. Die genaue Funktion dieses Enzyms war lange Zeit unbekannt und erst in den letzten Jahren konnte ein e Verbindung mit einem anderen im Lignozelluloseabbau verwendeten Enzym, der lytischen Polysaccharidmonooxygenase (LPMO), bewiesen werden. Die CDH unterstützt die Funktion der LPMO durch die Übertragung von Elektronen und der Bereitstellung von Wasserstoffperoxid. Die LPMO spaltet pflanzliche Polysaccharide wie Zellulose, Stärke oder Hemizellulosen. Laufend werden neue Polysaccharide entdeckt, die von der LPMO in Oligosaccharide gespalten werden können, jedoch sind nur CDHs bekannt, die als bestes Substrat Cellooligosaccharide wie z.B. Cellobiose verwenden. Die durch LPMO gebildeten Oligosaccharide aus Hemizellulosen können von den bisher identifizierten CDHs nicht verwendet werden. Die Frage ist daher: wie können CDHs mit den neuentdeckten hemizelluloseabbauenden LPMO interagieren? Die seit längerem bekannten CDH-Sequenzen die phylogenetisch als Klasse III CDHs bezeichnet werden, könnten das fehlende Bindeglied zu hemizelluloseabbauenden LPMOs darstellen. Diese CDHs konnten bisher weder aus Pilzen isoliert, noch rekombinant hergestellt werden. Eine Kooperation österreichischer Forscher und Forscherinnen der Universität für Bodenkultur Wien und des Skryabin Instituts der Russischen Akademie der Wissenschaften in Moskau untersucht in diesem Projekt die Verbreitung von Klasse III CDHs in holzabbauenden Pilzen und versucht diese in einem breit angelegtem Screening zu isolieren, oder in verschiedenen Expressionsorganismen wie Hefen oder Pilzen rekombinant herzustellen. Die hergestellten CDH werden biochemisch untersucht um die folgende Hypothese zu testen: Klasse III CDHs verwenden die Abbauprodukte von hemizelluloseabbauendenLPMOs alsSubstrat undkönnen dadurchihrerseits Wasserstoffperoxid und Elektronen für die LPMO bereitstellen. Sollte dieses Projekt erfolgreich sein, so ergeben sich neue Möglichkeiten zur Verwendung von Biomasse für eine auf erneuerbaren Ressourcen aufbauende Wirtschaft der Bioökonomie.

Die Cellobiosedehydrogenase (CDH) ist ein Enzym, das von Pilzen zum Abbau lignozellulosehältiger Biomasse sekretiert wird. Die genaue Funktion dieses Enzyms war lange Zeit unbekannt und erst in den letzten Jahren konnte eine Verbindung mit einem anderen im Lignozelluloseabbau verwendeten Enzym, der lytischen Polysaccharidmonooxygenase (LPMO), bewiesen werden. Die CDH unterstützt die Funktion der LPMO durch die Übertragung von Elektronen und der Bereitstellung von Wasserstoffperoxid. Die LPMO spaltet pflanzliche Polysaccharide wie Zellulose, Stärke oder Hemizellulosen. Laufend werden neue Polysaccharide entdeckt, die von der LPMO in Oligosaccharide gespalten werden können, jedoch sind nur CDHs bekannt, die als bestes Substrat Cellooligosaccharide wie z.B. Cellobiose verwenden. Die durch LPMO gebildeten Oligosaccharide aus Hemizellulosen können von den bisher identifizierten CDHs nicht verwendet werden. Die Frage war daher: wie können CDHs mit den neuentdeckten hemizelluloseabbauenden LPMO interagieren? Die seit längerem bekannten CDH-Sequenzen die phylogenetisch als Klasse III CDHs bezeichnet werden, stellen das fehlende Bindeglied zu hemizelluloseabbauenden LPMOs dar. Eine CDH aus dem pflanzenpathogenen Pilz Fusarium solani wurde rekombinant hergestellt, biochemisch und elektrochemisch charakterisiert. Eine Kooperation österreichischer Forscher und Forscherinnen der Universität für Bodenkultur Wien untersuchte in diesem vom Österreichischen Wissenschaftsfonds FWF finanzierten Projekt die Verbreitung von Klasse III CDHs in holzabbauenden Pilzen und versuchte diese in einem breit angelegtem Screening zu isolieren, oder in verschiedenen Expressionsorganismen wie Hefen oder Pilzen rekombinant herzustellen. Es war jedoch nur möglich enen Vertreter dieser schwer zu isolierenden Enzymfamilie herzustellen. Die CDH von Fusarium solani kann einige LPMO Abbauprodukte aus Zellulose und beta-Glukan als Substrat verwenden, jedoch ist die Substratspezifität nich anders als in Klasse II CDHs. Eine neugefundene Eigenschaft der Fusarium solani CDH im Gegensatz zu anderen CDH Klassen ist die kaum vorhandene Reaktivität von Sauerstoff, was auf einen neuen Mechanismus der Interaktion mit LPMO hinweist.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Florian Csarman, Universität für Bodenkultur Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Marina P. Kolomytseva, Russian Academy of Sciences - Russland

Research Output

  • 27 Zitationen
  • 8 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 1 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Interaction of class III cellobiose dehydrogenase with lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.1002/2211-5463.70067
    Typ Journal Article
    Autor Giorgianni A
    Journal FEBS Open Bio
    Seiten 1618-1628
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Screening and Characterization of a Class III Cellobiose Dehydrogenase
    Typ PhD Thesis
    Autor Angela Giorgianni
  • 2024
    Titel Exploring class III cellobiose dehydrogenase: sequence analysis and optimized recombinant expression
    DOI 10.1186/s12934-024-02420-2
    Typ Journal Article
    Autor Giorgianni A
    Journal Microbial Cell Factories
    Seiten 146
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Kinetic and Substrate Specificity Determination of Bacterial LPMOs
    DOI 10.1021/acscatal.4c04510
    Typ Journal Article
    Autor Carletti A
    Journal ACS Catalysis
    Seiten 14586-14594
  • 2024
    Titel Electron transfer of haemoflavoenzymes and cytochromes on electrodes, in polymer films and in solution
    Typ PhD Thesis
    Autor Kwankao Karnpakdee
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Electron Transfer of Cellobiose Dehydrogenase in Polyethyleneimine Films
    DOI 10.1002/celc.202300679
    Typ Journal Article
    Autor Karnpakdee K
    Journal ChemElectroChem
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Electrochemical Monitoring of Heterogeneous Peroxygenase Reactions Unravels LPMO Kinetics
    DOI 10.1021/acscatal.3c05194
    Typ Journal Article
    Autor Schwaiger L
    Journal ACS Catalysis
    Seiten 1205-1219
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Electrochemical Methods for the Characterization of Enzymatic Activity on Lignocellulose
    Typ PhD Thesis
    Autor Hucheng Chang
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 2024 Link
    Titel Electrochemical determination of hydrogen peroxide consuming enzymes
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 2024
    Titel Long Night of Research
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2024
    Titel Green Conference on Natural Resources, Green Technology & Sustainable Development 2024 in Zagreb, Croatia
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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