Biodiversität und Evolution mariner Planktonciliaten
Biodiversity and evolution of marine planktonic ciliates
Bilaterale Ausschreibung: China
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Geowissenschaften (20%)
Keywords
-
Planktonic Ciliates,
Biogeography,
Biodiversity,
Cladistic Analyses,
Ultrastructure,
Molecular Phylogeny
Das marine Plankton umfasst eine artenreiche Gemeinschaft funktionell sehr unterschiedlicher Protisten (einzelliger Eukaryoten). Molekulare Analysen zeigen, dass nur ein kleiner Bruchteil der Arten (~ 1520%) bislang bekannt ist; die Mehrzahl muss noch erforscht und beschrieben werden. Die globale Verbreitung der einzelnen Arten ist ebenfalls unzureichend bekannt. Das Verständnis von der Funktionsweise des Ökosys- tems, insbesondere in Zeiten des Klimawandeln und der Ozeanversauerung, setzt allerdings Wissen über die Vielfalt der Arten und deren Verbreitung bei den wichtigsten Plankton-Gruppen voraus. Die Oligotrichea sind eine solche ökologisch und zahlenmäßig wichtige Wimpertiergruppe (Ciliaten). Sie verbinden das mikrobielle Nahrungsnetz (von Algen abgegebene Polysaccharide über Bakterien über Geißel- tierchen zu Wimpertierchen) mit dem auf Algen basierenden Nahrungsnetz, indem sie von winzigen Krebschen und Fisch-Larven gefressen werden. Die ermittelten Artenzahlen legen nahe, dass es sich beim Südchinesischen Meer um einen Hotspot für Oligotrichea handelt, nicht nur wegen der insgesamt hohen Diversität, sondern auch wegen der Vielzahl nur dort gefundener Arten. In diesem ersten gemeinsamen Pro- jekt österreichischer und chinesischer Ciliaten-Forscher werden daher vermutlich viele weitere neue Arten von Oligotrichea im Südchinesischen Meer entdeckt werden. Anhand ihrer Morphologie, Ultrastruktur, Zellteilungsmuster und genetischer Marker soll ihre Verwandtschaft untersucht werden. Insbesondere die endemischen Arten werden im Fokus stehen, da bei ihnen oft die Morphologie und Genetik widersprüchliche Verwandtschaftsverhältnisse nahelegen. Letztendlich sollen durch die Kombination der Daten bislang falsch interpretierte Zellmerkmale aufgedeckt werden, die z.B. nicht vom gemeinsamen Vorfahren vererbt worden sind, sondern sich konvergent entwickelt haben. Analysen kurzer Gensequenzen aller Oligotrichea aus umfangreichen Wasserproben, die zu verschiedenen Jahreszeiten und in unterschiedlichen Klimazonen (Nordsee, Mittelmeer, Nordwest Pazifik) gesammelt werden, sollen zusammen mit Daten früherer Probenahmen aus bestehenden Datenbanken Abschätzungen der globalen Verbreitung einzelnen Arten erlauben. Damit werden auch Vorhersagen über die Veränderun- gen der Oligotrichea-Gemeinschaft und die Erhaltung der Ökosystemfunktionen bei steigenden Wassertem- peraturen möglich, essentielle Informationen für viele Regionen weltweit, deren Nahrungsmittelversorgung weitgehend von der Produktivität der Meere abhängt.
Wimpertiere (Ciliaten) sind faszinierende mikroskopisch kleine Einzeller (< 1 mm). Die Oligotrichea sind die im marinen Plankton dominierende Wimpertier-Gruppe mit ca. 1000 gehäusebauenden Tintinnen-Arten und etwa 200 gehäuselosen Arten. Sie stellen eine wesentliche Komponente des marinen Nahrungsnetzes dar, indem sie sich von Bakterien und anderen Einzellern ernähren und wiederum von kleinen Krebschen, der Nahrung von Fischlarven, gefressen werden. Viele wichtige Aspekte dieser Organismen sind allerdings noch unerforscht. In einem Gemeinschaftsprojekt mit chinesischen Partnern (NSFB-Projekt 317 611 330 01) wurde die genetische Diversität der Oligotrichea in europäischen und chinesischen Küstengewässern verglichen und die Hypothese bestätigt, dass die chinesischen Küstengewässer ein Biodiversitätshotspot für Oligotrichea sind. Unsere Daten zeigten außerdem, dass sich die Wimpertier-Gemeinschaften an europäischen und chinesischen Küsten sehr deutlich unterscheiden, obgleich sie durch Meeresströmungen verbunden sind. Tatsächlich konnten wir Limitierungen in der Verbreitung für einige Gruppen nachweisen, darunter viele noch unbekannte Arten. Für den Vergleich mit geografischen Verbreitungsmuster im Meer fokussierten wir uns auf eine ökologisch wichtige Wimpertier-Gruppe im Süßwasser-Plankton. Genetische Spuren dieser Wimpertiere konnten wir in 252 Seen in 17 Ländern weltweit nachweisen, darunter wiederum noch unbekannte Arten. Im Gegensatz zu diesen global verbreiteten Taxa, deutete eine umfangreiche Literaturrecherche über einer Süßwasser-Tintinne auf deren endemisches Vorkommen in asiatischen Flüssen und Seen hin. Insgesamt wurden sechs Wimpertier-Arten darunter Tintinnen wiederbeschrieben und eine neue Tintinnen-Gattung errichtet. Basierend auf letzteren Daten konnte das Aussehen des letzten gemeinsamen Tintinnen-Vorfahren rekonstruiert werden, der vor ca. 350 Millionen Jahren lebte. Mithilfe eines benutzerfreundlichen webbasierten Programms können Charakteristika in Gensequenzen detektiert werden, die die traditionell genutzten morphologischen Merkmale der Oligotrichea komplettierten. Unsere transmissionselektronenmikroskopischen Untersuchungen an Tintinnen beleuchteten noch weitere interessante Aspekte dieser ökologisch relevanten Gruppe mariner Plankton-Protisten. So rekonstruierten wir die Evolution der Gehäuse, untersuchten erstmals ihre Miniharpunen im Detail und lieferten die ersten Daten über eine Ruhezyste.
- Universität Salzburg - 100%
- Weiwei Liu, Chinese Academy of Sciences - China
- Xiaofeng Lin, South China Normal University - China
- Thorsten Stoeck, Universität Kaiserslautern - Deutschland
Research Output
- 153 Zitationen
- 31 Publikationen
- 1 Methoden & Materialien
- 2 Datasets & Models
- 1 Software
- 5 Disseminationen
- 13 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2019
Titel Individual differences in the effect of menstrual cycle on basal ganglia inhibitory control DOI 10.1038/s41598-019-47426-8 Typ Journal Article Autor Hidalgo-Lopez E Journal Scientific Reports Seiten 11063 Link Publikation -
2022
Titel Molecular Data Reveal a Cryptic Diversity in the Genus Urotricha (Alveolata, Ciliophora, Prostomatida), a Key Player in Freshwater Lakes, With Remarks on Morphology, Food Preferences, and Distribution DOI 10.5167/uzh-218925 Typ Other Autor Agatha Link Publikation -
2021
Titel The importance of type species and their correct identification: A key example from tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) DOI 10.1111/jeu.12865 Typ Journal Article Autor Agatha S Journal Journal of Eukaryotic Microbiology -
2021
Titel Genetic diversity in marine planktonic ciliates (Ciliophora, Alveolata) suggests distinct geographical patterns - data from Chinese and European coastal waters Typ Conference Proceeding Abstract Autor Forster D. Konferenz XL. Congress of the German Society for Protozoology, online Seiten 23 -
2021
Titel DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses Typ Conference Proceeding Abstract Autor Ganser M. Konferenz XL. Congress of the German Society for Protozoology, online Seiten 47 -
2021
Titel Let the weapons speak: extrusome features contribute to a revision of genus Strombidium (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Krischner M. Konferenz XL. Congress of the German Society for Protozoology, online Seiten 50 -
2019
Titel Redescription of Antetintinnidium mucicola (Claparède and Lachmann, 1858) nov. gen., nov. comb. (Alveolata, Ciliophora, Tintinnina) DOI 10.1111/jeu.12728 Typ Journal Article Autor Ganser M Journal Journal of Eukaryotic Microbiology Seiten 802-820 Link Publikation -
2019
Titel Capsules - unique organelles characterising specific tintinnid ciliate clades (Alveolata, Ciliophora) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Agatha S. Konferenz XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna, Austria Seiten 59 -
2019
Titel DeSigNate: A user-friendly tool to detect signature nucleotides for taxon diagnoses Typ Conference Proceeding Abstract Autor Ganser M. Konferenz XIII. NOBIS Congress, Salzburg, Austria Seiten 17 -
2019
Titel A sleeping beauty: morphology and ultrastructure of the resting cyst in the marine planktonic tintinnid Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Ganser M. Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy Seiten 10 -
2019
Titel Capsules - unique organelles characterising specific tintinnid ciliate clades (Alveolata, Ciliophora) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Agatha S. Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy Seiten 184 -
2019
Titel The significance of the lorica matrix for inferring tintinnid phylogeny (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Agatha S. Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy Seiten 12 -
2019
Titel The biology and systematics of oligotrichean ciliates (Alveolata, Ciliophora): new findings and old concepts Typ Conference Proceeding Abstract Autor Agatha S. Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy Seiten 3 -
2019
Titel Tricky trees - problematic inference of relationships in Oligotrichea (Alveolata, Ciliophora) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Agatha S. Konferenz XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna, Austria Seiten 15 -
2017
Titel Evaluating information content of molecular phylogenies in tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Choreotrichia) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Agatha S. Konferenz 2nd Young Researchers' Day 2017 of NOBIS Austria, Vienna, Austria Seiten 11 -
2017
Titel Evaluating information content of molecular phylogenies in tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Choreotrichia) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Agatha S. Konferenz XV. International Congress of Protistology, Prague, Czech Republic Seiten 313 -
2020
Titel DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses DOI 10.1186/s12859-020-3498-6 Typ Journal Article Autor Hütter T Journal BMC Bioinformatics Seiten 151 Link Publikation -
2020
Titel Symposium on Ciliates in Memory of Denis Lynn DOI 10.1016/j.ejop.2020.125694 Typ Journal Article Autor Agatha S Journal European Journal of Protistology Seiten 125694 Link Publikation -
2020
Titel DeSigNate: Detecting Signature Nucleotides for Taxon Diagnoses Typ Conference Proceeding Abstract Autor Ganser M. Konferenz XXXIX. Congress of the German Society for Protozoology, Kaiserslautern, Germany Seiten 72 -
2020
Titel Diversity and distribution of marine planktonic ciliates from coastal waters of the South China Sea and Europe Typ Conference Proceeding Abstract Autor Ganser M. Konferenz XXXIX. Congress of the German Society for Protozoology, Kaiserslautern, Germany Seiten 35 -
2018
Titel A sleeping beauty: morphology and ultrastructure of the resting cyst in the marine planktonic tintinnid Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Ganser M. Konferenz XXXVII. Congress of the German Society for Protozoology, Cologne, Germany Seiten 68 -
2018
Titel Redescription of Dexiotricha colpidiopsis (Kahl, 1926) Jankowski, 1964 (Ciliophora, Oligohymenophorea) from a Hot Spring in Iceland with Identification Key for Dexiotricha species DOI 10.4467/16890027ap.18.009.8983 Typ Journal Article Autor Qu Z Journal Acta Protozoologica Seiten 95-106 Link Publikation -
2022
Titel A comparative ultrastructural study on the nanoscale extrusomes of tintinnids (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) and their phylogenetic significance DOI 10.1016/j.ejop.2022.125953 Typ Journal Article Autor Ganser M Journal European Journal of Protistology Seiten 125953 Link Publikation -
2022
Titel Taxonomy and phylogeny of the freshwater tintinnid Tintinnopsis tubuformis Chiang, 1956 (Ciliophora, Oligotrichea) and a proposed synonymization of T. longa nom. corr. Chiang, 1956 DOI 10.1111/jeu.12918 Typ Journal Article Autor He J Journal Journal of Eukaryotic Microbiology -
2022
Titel A comparative ultrastructural study of tintinnid loricae (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) and a hypothesis on their evolution DOI 10.1111/jeu.12877 Typ Journal Article Autor Agatha S Journal Journal of Eukaryotic Microbiology Link Publikation -
2022
Titel Somatic infraciliature in tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha): An ultrastructural comparison* DOI 10.1111/jeu.12885 Typ Journal Article Autor Agatha S Journal Journal of Eukaryotic Microbiology Link Publikation -
2022
Titel Molecular signature characters complement taxonomic diagnoses: A bioinformatic approach exemplified by ciliated protists (Ciliophora, Oligotrichea) DOI 10.1016/j.ympev.2022.107433 Typ Journal Article Autor Ganser M Journal Molecular Phylogenetics and Evolution Seiten 107433 Link Publikation -
2022
Titel Molecular Data Reveal a Cryptic Diversity in the Genus Urotricha (Alveolata, Ciliophora, Prostomatida), a Key Player in Freshwater Lakes, With Remarks on Morphology, Food Preferences, and Distribution DOI 10.3389/fmicb.2021.787290 Typ Journal Article Autor Frantal D Journal Frontiers in Microbiology Seiten 787290 Link Publikation -
2022
Titel A light and electron microscopical study on the resting cyst of the tintinnid Schmidingerella (Alveolata, Ciliophora) including a phylogeny-aware comparison DOI 10.1016/j.ejop.2022.125922 Typ Journal Article Autor Ganser M Journal European Journal of Protistology Seiten 125922 -
2021
Titel Genetic Diversity in Marine Planktonic Ciliates (Alveolata, Ciliophora) Suggests Distinct Geographical Patterns – Data From Chinese and European Coastal Waters DOI 10.3389/fmars.2021.643822 Typ Journal Article Autor Ganser M Journal Frontiers in Marine Science Seiten 643822 Link Publikation -
2023
Titel Trichite features contribute to the revision of the genus Strombidium (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) DOI 10.1111/jeu.13001 Typ Journal Article Autor Agatha S Journal Journal of Eukaryotic Microbiology Link Publikation
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0
Titel Fixation of marine planktonic ciliates for transmission electron microscopy Typ Biological samples Öffentlich zugänglich
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2020
Link
Titel Additional file 1 of DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses DOI 10.6084/m9.figshare.12160239 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel Additional file 1 of DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses DOI 10.6084/m9.figshare.12262484 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2017
Link
Titel Wissensmonat - Jetzt Zukunft erleben Typ A talk or presentation Link Link -
2022
Titel Lange Nacht der Forschung Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2017
Titel Open house of the University of Salzburg Typ Participation in an open day or visit at my research institution -
2022
Titel Open day - Paris Lodron University of Salzburg Typ Participation in an open day or visit at my research institution -
2019
Titel Protists Diversity and Ecology in Aquatic and Terrestrial Ecosystems" organized by Université de Neuchâtel, Neuchâtel, Switzerland Typ Participation in an activity, workshop or similar
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2021
Titel "Publication of the Month May 2021" Award by Dept. Biosciences, University of Salzburg, for GANSER M.H., FORSTER D., LIU W., LIN X., STOECK T. & AGATHA S. (2021): Genetic diversity in marine planktonic ciliates (Ciliophora, Alveolata) suggests distinct geographical patterns - data from Chinese and European coastal waters. Front. Mar. Sci. 8: 643822. Typ Research prize Bekanntheitsgrad Regional (any country) -
2021
Titel Collecting bits and pieces - an integrative study on marine planktonic ciliates Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2021
Titel Advisory board of Zoological Botanical Society Vienna Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad National (any country) -
2021
Titel First prize for the poster "DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses" at the XL. Congress of the German Society for Protozoology, online. Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2020
Titel Publication of the Month May 2020 Typ Research prize Bekanntheitsgrad Regional (any country) -
2019
Titel Ciliates (Ciliophora) and other protists in the marine plankton Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad National (any country) -
2019
Titel Symposium on Ciliates in Memory of Denis Lynn Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2019
Titel Plenary talk at XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2019
Titel ISOP Systematic Committee Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel A sleeping beauty: morphology and ultrastructure of the resting cyst in the marine planktonic tintinnid Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2017
Titel Award by the International Society of Protistology Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2017
Titel Associated Editor for Journal of Eukaryotic Microbiology Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series Bekanntheitsgrad Continental/International -
2016
Titel President of the Network of Biological Systematics (NOBIS) Austria Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad National (any country)