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Biodiversität und Evolution mariner Planktonciliaten

Biodiversity and evolution of marine planktonic ciliates

Sabine Agatha (ORCID: 0000-0003-3083-9782)
  • Grant-DOI 10.55776/I3268
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2017
  • Projektende 31.03.2022
  • Bewilligungssumme 265.640 €
  • Projekt-Website

Bilaterale Ausschreibung: China

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Geowissenschaften (20%)

Keywords

    Planktonic Ciliates, Biogeography, Biodiversity, Cladistic Analyses, Ultrastructure, Molecular Phylogeny

Abstract Endbericht

Das marine Plankton umfasst eine artenreiche Gemeinschaft funktionell sehr unterschiedlicher Protisten (einzelliger Eukaryoten). Molekulare Analysen zeigen, dass nur ein kleiner Bruchteil der Arten (~ 1520%) bislang bekannt ist; die Mehrzahl muss noch erforscht und beschrieben werden. Die globale Verbreitung der einzelnen Arten ist ebenfalls unzureichend bekannt. Das Verständnis von der Funktionsweise des Ökosys- tems, insbesondere in Zeiten des Klimawandeln und der Ozeanversauerung, setzt allerdings Wissen über die Vielfalt der Arten und deren Verbreitung bei den wichtigsten Plankton-Gruppen voraus. Die Oligotrichea sind eine solche ökologisch und zahlenmäßig wichtige Wimpertiergruppe (Ciliaten). Sie verbinden das mikrobielle Nahrungsnetz (von Algen abgegebene Polysaccharide über Bakterien über Geißel- tierchen zu Wimpertierchen) mit dem auf Algen basierenden Nahrungsnetz, indem sie von winzigen Krebschen und Fisch-Larven gefressen werden. Die ermittelten Artenzahlen legen nahe, dass es sich beim Südchinesischen Meer um einen Hotspot für Oligotrichea handelt, nicht nur wegen der insgesamt hohen Diversität, sondern auch wegen der Vielzahl nur dort gefundener Arten. In diesem ersten gemeinsamen Pro- jekt österreichischer und chinesischer Ciliaten-Forscher werden daher vermutlich viele weitere neue Arten von Oligotrichea im Südchinesischen Meer entdeckt werden. Anhand ihrer Morphologie, Ultrastruktur, Zellteilungsmuster und genetischer Marker soll ihre Verwandtschaft untersucht werden. Insbesondere die endemischen Arten werden im Fokus stehen, da bei ihnen oft die Morphologie und Genetik widersprüchliche Verwandtschaftsverhältnisse nahelegen. Letztendlich sollen durch die Kombination der Daten bislang falsch interpretierte Zellmerkmale aufgedeckt werden, die z.B. nicht vom gemeinsamen Vorfahren vererbt worden sind, sondern sich konvergent entwickelt haben. Analysen kurzer Gensequenzen aller Oligotrichea aus umfangreichen Wasserproben, die zu verschiedenen Jahreszeiten und in unterschiedlichen Klimazonen (Nordsee, Mittelmeer, Nordwest Pazifik) gesammelt werden, sollen zusammen mit Daten früherer Probenahmen aus bestehenden Datenbanken Abschätzungen der globalen Verbreitung einzelnen Arten erlauben. Damit werden auch Vorhersagen über die Veränderun- gen der Oligotrichea-Gemeinschaft und die Erhaltung der Ökosystemfunktionen bei steigenden Wassertem- peraturen möglich, essentielle Informationen für viele Regionen weltweit, deren Nahrungsmittelversorgung weitgehend von der Produktivität der Meere abhängt.

Wimpertiere (Ciliaten) sind faszinierende mikroskopisch kleine Einzeller (< 1 mm). Die Oligotrichea sind die im marinen Plankton dominierende Wimpertier-Gruppe mit ca. 1000 gehäusebauenden Tintinnen-Arten und etwa 200 gehäuselosen Arten. Sie stellen eine wesentliche Komponente des marinen Nahrungsnetzes dar, indem sie sich von Bakterien und anderen Einzellern ernähren und wiederum von kleinen Krebschen, der Nahrung von Fischlarven, gefressen werden. Viele wichtige Aspekte dieser Organismen sind allerdings noch unerforscht. In einem Gemeinschaftsprojekt mit chinesischen Partnern (NSFB-Projekt 317 611 330 01) wurde die genetische Diversität der Oligotrichea in europäischen und chinesischen Küstengewässern verglichen und die Hypothese bestätigt, dass die chinesischen Küstengewässer ein Biodiversitätshotspot für Oligotrichea sind. Unsere Daten zeigten außerdem, dass sich die Wimpertier-Gemeinschaften an europäischen und chinesischen Küsten sehr deutlich unterscheiden, obgleich sie durch Meeresströmungen verbunden sind. Tatsächlich konnten wir Limitierungen in der Verbreitung für einige Gruppen nachweisen, darunter viele noch unbekannte Arten. Für den Vergleich mit geografischen Verbreitungsmuster im Meer fokussierten wir uns auf eine ökologisch wichtige Wimpertier-Gruppe im Süßwasser-Plankton. Genetische Spuren dieser Wimpertiere konnten wir in 252 Seen in 17 Ländern weltweit nachweisen, darunter wiederum noch unbekannte Arten. Im Gegensatz zu diesen global verbreiteten Taxa, deutete eine umfangreiche Literaturrecherche über einer Süßwasser-Tintinne auf deren endemisches Vorkommen in asiatischen Flüssen und Seen hin. Insgesamt wurden sechs Wimpertier-Arten darunter Tintinnen wiederbeschrieben und eine neue Tintinnen-Gattung errichtet. Basierend auf letzteren Daten konnte das Aussehen des letzten gemeinsamen Tintinnen-Vorfahren rekonstruiert werden, der vor ca. 350 Millionen Jahren lebte. Mithilfe eines benutzerfreundlichen webbasierten Programms können Charakteristika in Gensequenzen detektiert werden, die die traditionell genutzten morphologischen Merkmale der Oligotrichea komplettierten. Unsere transmissionselektronenmikroskopischen Untersuchungen an Tintinnen beleuchteten noch weitere interessante Aspekte dieser ökologisch relevanten Gruppe mariner Plankton-Protisten. So rekonstruierten wir die Evolution der Gehäuse, untersuchten erstmals ihre Miniharpunen im Detail und lieferten die ersten Daten über eine Ruhezyste.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Salzburg - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Weiwei Liu, Chinese Academy of Sciences - China
  • Xiaofeng Lin, South China Normal University - China
  • Thorsten Stoeck, Universität Kaiserslautern - Deutschland

Research Output

  • 153 Zitationen
  • 31 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 2 Datasets & Models
  • 1 Software
  • 5 Disseminationen
  • 13 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2019
    Titel Individual differences in the effect of menstrual cycle on basal ganglia inhibitory control
    DOI 10.1038/s41598-019-47426-8
    Typ Journal Article
    Autor Hidalgo-Lopez E
    Journal Scientific Reports
    Seiten 11063
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Molecular Data Reveal a Cryptic Diversity in the Genus Urotricha (Alveolata, Ciliophora, Prostomatida), a Key Player in Freshwater Lakes, With Remarks on Morphology, Food Preferences, and Distribution
    DOI 10.5167/uzh-218925
    Typ Other
    Autor Agatha
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The importance of type species and their correct identification: A key example from tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    DOI 10.1111/jeu.12865
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
  • 2021
    Titel Genetic diversity in marine planktonic ciliates (Ciliophora, Alveolata) suggests distinct geographical patterns - data from Chinese and European coastal waters
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Forster D.
    Konferenz XL. Congress of the German Society for Protozoology, online
    Seiten 23
  • 2021
    Titel DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Ganser M.
    Konferenz XL. Congress of the German Society for Protozoology, online
    Seiten 47
  • 2021
    Titel Let the weapons speak: extrusome features contribute to a revision of genus Strombidium (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Krischner M.
    Konferenz XL. Congress of the German Society for Protozoology, online
    Seiten 50
  • 2019
    Titel Redescription of Antetintinnidium mucicola (Claparède and Lachmann, 1858) nov. gen., nov. comb. (Alveolata, Ciliophora, Tintinnina)
    DOI 10.1111/jeu.12728
    Typ Journal Article
    Autor Ganser M
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Seiten 802-820
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Capsules - unique organelles characterising specific tintinnid ciliate clades (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna, Austria
    Seiten 59
  • 2019
    Titel DeSigNate: A user-friendly tool to detect signature nucleotides for taxon diagnoses
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Ganser M.
    Konferenz XIII. NOBIS Congress, Salzburg, Austria
    Seiten 17
  • 2019
    Titel A sleeping beauty: morphology and ultrastructure of the resting cyst in the marine planktonic tintinnid Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Ganser M.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 10
  • 2019
    Titel Capsules - unique organelles characterising specific tintinnid ciliate clades (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 184
  • 2019
    Titel The significance of the lorica matrix for inferring tintinnid phylogeny (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 12
  • 2019
    Titel The biology and systematics of oligotrichean ciliates (Alveolata, Ciliophora): new findings and old concepts
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz VIII. European Congress of Protistology - ISOP joint meeting, Rome, Italy
    Seiten 3
  • 2019
    Titel Tricky trees - problematic inference of relationships in Oligotrichea (Alveolata, Ciliophora)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna, Austria
    Seiten 15
  • 2017
    Titel Evaluating information content of molecular phylogenies in tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Choreotrichia)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz 2nd Young Researchers' Day 2017 of NOBIS Austria, Vienna, Austria
    Seiten 11
  • 2017
    Titel Evaluating information content of molecular phylogenies in tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Choreotrichia)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Agatha S.
    Konferenz XV. International Congress of Protistology, Prague, Czech Republic
    Seiten 313
  • 2020
    Titel DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses
    DOI 10.1186/s12859-020-3498-6
    Typ Journal Article
    Autor Hütter T
    Journal BMC Bioinformatics
    Seiten 151
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Symposium on Ciliates in Memory of Denis Lynn
    DOI 10.1016/j.ejop.2020.125694
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal European Journal of Protistology
    Seiten 125694
    Link Publikation
  • 2020
    Titel DeSigNate: Detecting Signature Nucleotides for Taxon Diagnoses
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Ganser M.
    Konferenz XXXIX. Congress of the German Society for Protozoology, Kaiserslautern, Germany
    Seiten 72
  • 2020
    Titel Diversity and distribution of marine planktonic ciliates from coastal waters of the South China Sea and Europe
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Ganser M.
    Konferenz XXXIX. Congress of the German Society for Protozoology, Kaiserslautern, Germany
    Seiten 35
  • 2018
    Titel A sleeping beauty: morphology and ultrastructure of the resting cyst in the marine planktonic tintinnid Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Ganser M.
    Konferenz XXXVII. Congress of the German Society for Protozoology, Cologne, Germany
    Seiten 68
  • 2018
    Titel Redescription of Dexiotricha colpidiopsis (Kahl, 1926) Jankowski, 1964 (Ciliophora, Oligohymenophorea) from a Hot Spring in Iceland with Identification Key for Dexiotricha species
    DOI 10.4467/16890027ap.18.009.8983
    Typ Journal Article
    Autor Qu Z
    Journal Acta Protozoologica
    Seiten 95-106
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A comparative ultrastructural study on the nanoscale extrusomes of tintinnids (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) and their phylogenetic significance
    DOI 10.1016/j.ejop.2022.125953
    Typ Journal Article
    Autor Ganser M
    Journal European Journal of Protistology
    Seiten 125953
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Taxonomy and phylogeny of the freshwater tintinnid Tintinnopsis tubuformis Chiang, 1956 (Ciliophora, Oligotrichea) and a proposed synonymization of T. longa nom. corr. Chiang, 1956
    DOI 10.1111/jeu.12918
    Typ Journal Article
    Autor He J
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
  • 2022
    Titel A comparative ultrastructural study of tintinnid loricae (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha) and a hypothesis on their evolution
    DOI 10.1111/jeu.12877
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Somatic infraciliature in tintinnid ciliates (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha): An ultrastructural comparison*
    DOI 10.1111/jeu.12885
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Molecular signature characters complement taxonomic diagnoses: A bioinformatic approach exemplified by ciliated protists (Ciliophora, Oligotrichea)
    DOI 10.1016/j.ympev.2022.107433
    Typ Journal Article
    Autor Ganser M
    Journal Molecular Phylogenetics and Evolution
    Seiten 107433
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Molecular Data Reveal a Cryptic Diversity in the Genus Urotricha (Alveolata, Ciliophora, Prostomatida), a Key Player in Freshwater Lakes, With Remarks on Morphology, Food Preferences, and Distribution
    DOI 10.3389/fmicb.2021.787290
    Typ Journal Article
    Autor Frantal D
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 787290
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A light and electron microscopical study on the resting cyst of the tintinnid Schmidingerella (Alveolata, Ciliophora) including a phylogeny-aware comparison
    DOI 10.1016/j.ejop.2022.125922
    Typ Journal Article
    Autor Ganser M
    Journal European Journal of Protistology
    Seiten 125922
  • 2021
    Titel Genetic Diversity in Marine Planktonic Ciliates (Alveolata, Ciliophora) Suggests Distinct Geographical Patterns – Data From Chinese and European Coastal Waters
    DOI 10.3389/fmars.2021.643822
    Typ Journal Article
    Autor Ganser M
    Journal Frontiers in Marine Science
    Seiten 643822
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Trichite features contribute to the revision of the genus Strombidium (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    DOI 10.1111/jeu.13001
    Typ Journal Article
    Autor Agatha S
    Journal Journal of Eukaryotic Microbiology
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 0
    Titel Fixation of marine planktonic ciliates for transmission electron microscopy
    Typ Biological samples
    Öffentlich zugänglich
Datasets & Models
  • 2020 Link
    Titel Additional file 1 of DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses
    DOI 10.6084/m9.figshare.12160239
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Additional file 1 of DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses
    DOI 10.6084/m9.figshare.12262484
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Software
  • 2020 Link
    Titel DeSignate
    Link Link
Disseminationen
  • 2017 Link
    Titel Wissensmonat - Jetzt Zukunft erleben
    Typ A talk or presentation
    Link Link
  • 2022
    Titel Lange Nacht der Forschung
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2017
    Titel Open house of the University of Salzburg
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2022
    Titel Open day - Paris Lodron University of Salzburg
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
  • 2019
    Titel Protists Diversity and Ecology in Aquatic and Terrestrial Ecosystems" organized by Université de Neuchâtel, Neuchâtel, Switzerland
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2021
    Titel "Publication of the Month May 2021" Award by Dept. Biosciences, University of Salzburg, for GANSER M.H., FORSTER D., LIU W., LIN X., STOECK T. & AGATHA S. (2021): Genetic diversity in marine planktonic ciliates (Ciliophora, Alveolata) suggests distinct geographical patterns - data from Chinese and European coastal waters. Front. Mar. Sci. 8: 643822.
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2021
    Titel Collecting bits and pieces - an integrative study on marine planktonic ciliates
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel Advisory board of Zoological Botanical Society Vienna
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2021
    Titel First prize for the poster "DeSignate: detecting signature characters in gene sequence alignments for taxon diagnoses" at the XL. Congress of the German Society for Protozoology, online.
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2020
    Titel Publication of the Month May 2020
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2019
    Titel Ciliates (Ciliophora) and other protists in the marine plankton
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2019
    Titel Symposium on Ciliates in Memory of Denis Lynn
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Plenary talk at XXXVIII. Congress of the German Society for Protozoology, Vienna
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel ISOP Systematic Committee
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel A sleeping beauty: morphology and ultrastructure of the resting cyst in the marine planktonic tintinnid Schmidingerella meunieri (Alveolata, Ciliophora, Spirotricha)
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2017
    Titel Award by the International Society of Protistology
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2017
    Titel Associated Editor for Journal of Eukaryotic Microbiology
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2016
    Titel President of the Network of Biological Systematics (NOBIS) Austria
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad National (any country)

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