Lipidmembranen über nanoporösen Sensoren
Platforms for nanopore membrane sensing
Bilaterale Ausschreibung: Tschechien
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (20%); Nanotechnologie (80%)
Keywords
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Supported Lipid Bilayer,
Nanopore,
Nanoplasmonics,
Nanofabrication,
Biosensor,
Membrane Protein Channel
Unser Ziel ist die Entwicklung einer Chip-basierten Plattform zur Untersuchung von Funktion und Interaktion von Membranproteinen. Während der letzten Jahrzehnten hat das Wirkstoff-Screening mit zwei Problemen zu kämpfen: rasant steigende Kosten pro erfolgreich entwickeltem Medikament und sinkende Erfolgsraten in der Wirkstoffentwicklung. Teil dieses Problems ist die Tatsache, dass Arzneimittel zunehmend komplexe Funktionen zum Ziel haben, die an Membranproteine gekoppelt sind. Dafür fehlen Tools sowohl für effiziente Forschung als auch für Hochdurchsatz-Screening. Mehr als 50% aller Wirkstoffziele sind in Zellmembranen angesiedelt. Wir werden kürzlich erzielte Fortschritte auf dem Gebiet der Sensorherstellung mittels Nanotechnologie nutzen, die einen kontrollierten Aufbau artifizieller Zellmembranen inklusive Membranproteinen erlauben. Das ermöglicht uns, die Interaktion mit Wirkstoffen bis auf Einzelproteinniveau zu untersuchen. Das wird durch eine Zusammenarbeit führender Forscher sowohl der Technische Universität Brünn, welche die Nanosensoren herstellen, als auch der BOKU in Wien, die den molekularen Aufbau der Zellmembrankomponenten kontrollieren, ermöglicht. Durch die Entwicklung von Sensorelementen, welche Licht soweit einengen, dass es mit dem Maßstab von Molekülen und Zellmembranen korrespondiert, können wir diejenigen Veränderungen an Membran und Wirkstoffziel studieren, die durch die Interaktion mit dem Medikament und auch anderen Molekülen entstehen. Durch die Verwendung nanoporöser Chips können wir stabile artifizielle Membranen mit Zellkomponenten realer Zellen herstellen. Untersucht werden diese Membranen mit den sensitivsten Biosensoren, die für Forscher erhältlich sind. Diese liefern besonders viele Informationen, wie beispielsweise Daten über den Stromfluss durch Membranen. Wir sind bestrebt, sowohl schnelle Messungen an vielen Membrankomponenten, als auch sensitive und gezielte Messungen zur Untersuchung einzelner Proteine zu erzielen. Um dieses Ziel zu erreichen nutzen wir einen entscheidenden Vorteil. Wir sind in der Lage, Polymerschichten auf Nanosensorelemente aufzubringen und dadurch zu kontrollieren, wo Membranmoleküle binden und sich bewegen. Nur wenn Membrankomponenten in jene Bereiche geführt werden, in denen sie sich wie in einer realen Zellmembran verhalten und sich gleichzeitig nahe des Sensors befinden, kann die erforderliche Sensitivität und Vielseitigkeit erreicht werden. Die konvergierenden Forschungsfelder der Nanobiotechnologie erlauben uns diese gleichzeitige Entwicklung von Methoden zum Bau von Instrumenten der nächsten Generation für molekularbiologische Forschung und Wirkstoffanalyse.
Nanostrukturen werden zunehmend für Hightech-Anwendungen in der Medizin, Diagnostik, Wirkstoff-Freisetzung und medizinischen Forschung eingesetzt. Sie bieten Vorteile wie extrem empfindliche Sensoren, die in der Lage sind, einzelne Moleküle zu erfassen und zu identifizieren, gezielte Bildgebung bis auf die molekulare Ebene im Körper und intelligente Strukturen, die bei Bedarf Medikamente freisetzen oder Schadstoffe einfangen können. Um diese Funktionen zu erreichen, benötigen Nanostrukturen im Kontakt mit biologischen Systemen Beschichtungen, die verhindern, dass Biomoleküle wie Proteine und Lipide an sie binden. Wenn Biomoleküle ungehindert an ihre Oberflächen binden, werden die Nanostrukturen schnell aggregieren und ihre Empfindlichkeit und andere gewünschte Eigenschaften verlieren. Die Nanostrukturen mit molekularen Beschichtungen zu versehen, ist die beste uns bekannte Möglichkeit, die Adsorption von Biomolekülen zu verhindern. Diese Beschichtungen ahmen die Polymer- und Lipidbeschichtungen biologischer Oberflächen, wie z. B. Zellmembranen, nach. Von denen ist bekannt, dass sie die zufällige Adsorption von Biomolekülen verhindern, aber die spezifische Bindung von gezielten Biomolekülen ermöglichen. In diesem Projekt ist es uns gelungen, Methoden mit der bisher höchsten Empfindlichkeit anzuwenden, um im Detail zu erfassen, welche Art von Proteinen an polymerfunktionalisierte Nanostrukturen binden und warum sie das tun. Durch die Messung der Wärme, die benötigt wird, um Wasser von den Partikeloberflächen zu verdrängen, wenn Proteine binden, konnten wir herausfinden, welche Proteine am ehesten binden und wie die Polymerhülle am ehesten gestaltet sein muss, damit sie nicht binden. Dabei konnten wir zeigen, dass Polymere, die dicht auf die Oberfläche der Nanostruktur Schlaufen bilden, als einzige so genannte Polymerbürsten die Bindung von Proteinen vollständig verhindern können. In Zukunft wollen wir diese Erkenntnis nutzen, um Nanopartikel in einer neuen Sensorplattform zu funktionalisieren, die Licht in Nanoporen einfängt. Dieser Sensor wird es uns ermöglichen, Moleküle, die von Bakterien abgesondert werden, auch in "schmutzigen" Umgebungen zu detektieren, in denen solche Biosensoren heute nicht funktionieren, z. B. in Blut, Bioreaktoren oder anderen Bioflüssigkeiten. Unsere tschechischen Partner haben diese Sensorchips im Rahmen dieses Projekts entwickelt, aber sie wurden noch nicht für den Nachweis von Bakterien funktionalisiert und getestet. Darüber hinaus haben wir gezeigt, dass dieselben Plattformen und Methoden für verschiedene Anwendungen wie die Extraktion von Schwermetallverunreinigungen aus Lösungen und die Funktionalisierung von Oberflächen mit Membranen, die Zellmembranen nachahmen, sich aber die robusten Eigenschaften synthetischer Polymere ausleihen, verwendet werden können.
- Tomas Sikola, Brno University of Technology - Tschechien
Research Output
- 209 Zitationen
- 17 Publikationen
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2019
Titel Low temperature selective growth of GaN single crystals on pre-patterned Si substrates DOI 10.1016/j.apsusc.2019.143705 Typ Journal Article Autor Mach J Journal Applied Surface Science Seiten 143705 Link Publikation -
2019
Titel Whole Genome Sequencing-Based Comparison of Food Isolates of Cronobacter sakazakii DOI 10.3389/fmicb.2019.01464 Typ Journal Article Autor Aly M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 1464 Link Publikation -
2019
Titel Silver Amalgam Nanoparticles and Microparticles: A Novel Plasmonic Platform for Spectroelectrochemistry DOI 10.1021/acs.jpcc.9b04124 Typ Journal Article Autor Ligmajer F Journal The Journal of Physical Chemistry C Seiten 16957-16964 Link Publikation -
2019
Titel Biocompatible Glyconanoparticles by Grafting Sophorolipid Monolayers on Monodispersed Iron Oxide Nanoparticles DOI 10.1021/acsabm.9b00427 Typ Journal Article Autor Lassenberger A Journal ACS Applied Bio Materials Seiten 3095-3107 Link Publikation -
2018
Titel Immunogold Nanoparticles for Rapid Plasmonic Detection of C. sakazakii DOI 10.3390/s18072028 Typ Journal Article Autor Aly M Journal Sensors Seiten 2028 Link Publikation -
2020
Titel Effect of deposition angle on fabrication of plasmonic gold nanocones and nanodiscs DOI 10.1016/j.mee.2020.111326 Typ Journal Article Autor Liška J Journal Microelectronic Engineering Seiten 111326 Link Publikation -
2020
Titel Nanoporous thin films in optical waveguide spectroscopy for chemical analytics DOI 10.1007/s00216-020-02452-8 Typ Journal Article Autor Knoll W Journal Analytical and Bioanalytical Chemistry Seiten 3299-3315 Link Publikation -
2020
Titel Effect of deposition angle on fabrication of plasmonic gold nanocones and nanodiscs DOI 10.60692/5f3an-x0s21 Typ Other Autor Filip Ligmajer Link Publikation -
2020
Titel Effect of deposition angle on fabrication of plasmonic gold nanocones and nanodiscs DOI 10.60692/f6jm1-jrt32 Typ Other Autor Filip Ligmajer Link Publikation -
2018
Titel Formation and Characteristics of Lipid-Blended Block Copolymer Bilayers on a Solid Support Investigated by Quartz Crystal Microbalance and Atomic Force Microscopy DOI 10.1021/acs.langmuir.8b03597 Typ Journal Article Autor Virk M Journal Langmuir Seiten 739-749 -
2020
Titel Effect of deposition angle on fabrication of plasmonic gold nanocones and nanodiscs DOI 10.5281/zenodo.4139742 Typ Other Autor Jiří Liška Link Publikation -
2020
Titel Effect of deposition angle on fabrication of plasmonic gold nanocones and nanodiscs DOI 10.5281/zenodo.4139743 Typ Other Autor Jiří Liška Link Publikation -
2020
Titel Effect of deposition angle on fabrication of plasmonic gold nanocones and nanodiscs DOI 10.5281/zenodo.4724983 Typ Other Autor Jiří Liška Link Publikation -
2020
Titel Polymer Topology Determines the Formation of Protein Corona on Core–Shell Nanoparticles DOI 10.1021/acsnano.0c02358 Typ Journal Article Autor Schroffenegger M Journal ACS Nano Seiten 12708-12718 Link Publikation -
2020
Titel Polymer Brush-Grafted Nanoparticles Preferentially Interact with Opsonins and Albumin DOI 10.1021/acsabm.0c01355 Typ Journal Article Autor Leitner N Journal ACS Applied Bio Materials Seiten 795-806 Link Publikation -
2021
Titel Hybrid lipopolymer vesicle drug delivery and release systems DOI 10.7555/jbr.35.20200206 Typ Journal Article Autor Reimhult E Journal The Journal of Biomedical Research Seiten 301-309 Link Publikation -
2021
Titel Theoretical and Experimental Design of Heavy Metal-Mopping Magnetic Nanoparticles DOI 10.1021/acsami.0c17759 Typ Journal Article Autor Roma E Journal ACS Applied Materials & Interfaces Seiten 1386-1397 Link Publikation