Integrative Visuelle Abstraktion von Molekularen Daten
Integrative Visual Abstraction of Molecular Data
Bilaterale Ausschreibung: Frankreich
Wissenschaftsdisziplinen
Informatik (100%)
Keywords
-
Illustrative Visualization,
Visual Abstraction,
Molecular Visualization
In den bildenden Künsten ist Abstraktion ein wichtiges Mittel, um die Struktur, die Stimmung, die grobe Form oder die Dynamik einer Szene darzustellen. In der Illustration wird Abstraktion außerdem genutzt, um wichtige Konzepte, Methoden, oder verschiedene physikalische Phänomene zu vermitteln. Mittels computergestützter Visualisierung können wir somit mittels Abstraktion wichtige Einsichten hervorheben, die sonst in komplexen Datensätzen schwer zu entdecken sind. Allerdings haben wir im Moment noch nur ein ungenügendes Verständnis vom Konzept der Abstraktion. Intuitiv verstehen wir darunter, dass wir unwichtige Details entfernen, um uns auf das Wesentliche konzentrieren zu können. In unserm Forschungsprojekt wollen wir uns also damit beschäftigen, Abstraktion besser zu verstehen und seine wesentlichen Prinzipien zu charakterisieren, damit wir sie in der Visualisierung gewinnbringend einsetzen können. Solche Visualisierungen, die von Abstraktion Gebrauch machen, sind besonders für Darstellungen wichtig, in denen mehrere Informationsebenen gleichzeitig dargestellt werden sollen. Ohne ein sorgsames Management der visuellen Ressourcen würde man sonst nur Visualisierungen erhalten, die schwer zu verstehen sind, weil diverse Informationen um die Aufmerksamkeit des Betrachters wetteifern würden. Ein Beispiel für einen solchen Fall ist es, wenn in einem GPS-Navigationssystem zu viele Informationen gleichzeitig dargestellt werden, wie etwa zu viele Marken für Sehenswürdigkeiten in dicht besiedelten Gebieten. Wir wollen uns konkret auf die Abstraktion von molekularen Visualisierungen konzentrieren, um verschiedene Daten in unterschiedlichen räumlichen und zeitlichen Größenordnungen darstellen zu können. Dabei sollen Wissenschaftler bei der Datenanalyse sich trotzdem noch auf die wesentlichen Aspekte konzentrieren können, ohne von den Details abgelenkt zu werden.
In many aspects of our modern lives we face the problem of having to make sense of large amounts of data. This applies to scientists trying to make sense of their experiments and simulations, to bankers and traders trying to understand the dynamics of the financial markets, and to large enterprises which need to understand the principles behind demand and supply-to name just a few examples. The basic problem in all these cases is that people need to identify important and/or unexpected features in large simulated or captured datasets. Visualization is the domain that facilitates this process of sense-making by dramatically simplifying the process of obtaining an understanding of the data-by representing data visually and thus amplifying people's cognition. This inherent capability of (good) visualization techniques to amplify human cognition, however, is no longer enough to be able to make sense of today's huge datasets. To be able to see the essential aspects we need dedicated mechanisms that abstract away the (unnecessary) detail to, in turn, allow the user of the visualization to focus on the important elements. The crucial problem in this context is that it is impossible to know what is important and what is not in a general way-importance changes based on the research question, on the application domain, on the data size, on the user, on the specific situation, etc. Visualization technology therefore needs to support dynamic change of visual abstraction of the data to reflect these contextual changes. The fundamental research challenge in visualization for us is to get an understanding of what (visual) abstraction really is, what it means, how it can be controlled, and how it is, can be, and should be used in visualization.
- Technische Universität Wien - 100%
- Tobias Isenberg, Université Paris-Sud - Frankreich
Research Output
- 351 Zitationen
- 28 Publikationen
- 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
-
2019
Titel Visual Abstraction DOI 10.48550/arxiv.1910.03310 Typ Preprint Autor Viola I -
2019
Titel ScaleTrotter: Illustrative Visual Travels Across Negative Scales DOI 10.48550/arxiv.1907.12352 Typ Preprint Autor Halladjian S -
2019
Titel Geometric Abstraction for Effective Visualization and Modeling Typ PhD Thesis Autor Haichao Miao Link Publikation -
2019
Titel Scale Trotter: Illustrative Visual Travels Across Negative Scales DOI 10.1109/tvcg.2019.2934334 Typ Journal Article Autor Halladjian S Journal IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics Seiten 654-664 Link Publikation -
2023
Titel Molecumentary: Adaptable Narrated Documentaries Using Molecular Visualization DOI 10.1109/tvcg.2021.3130670 Typ Journal Article Autor Kouril D Journal IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics Seiten 1733-1747 Link Publikation -
2021
Titel Interactive Visualization of Dense and Multi-Scale Data for Science Outreach Typ PhD Thesis Autor David Kouril Link Publikation -
2021
Titel Interactive visualization of dense and multi-scale data for science outreach Typ Other Autor Kouril D. Link Publikation -
2021
Titel HyperLabels: Browsing of Dense and Hierarchical Molecular 3D Models DOI 10.1109/tvcg.2020.2975583 Typ Journal Article Autor Kouril D Journal IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics Seiten 3493-3504 Link Publikation -
2019
Titel Cuttlefish: Color Mapping for Dynamic Multi-Scale Visualizations DOI 10.1111/cgf.13611 Typ Journal Article Autor Waldin N Journal Computer Graphics Forum Seiten 150-164 Link Publikation -
2019
Titel Interactive exploded views for molecular structures Typ Conference Proceeding Abstract Autor Miao H. Konferenz Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine 2019 Link Publikation -
2018
Titel DimSUM: Dimension and Scale Unifying Map for Visual Abstraction of DNA Origami Structures DOI 10.1111/cgf.13429 Typ Journal Article Autor Miao H Journal Computer Graphics Forum Seiten 403-413 Link Publikation -
2018
Titel COZOID: contact zone identifier for visual analysis of protein-protein interactions DOI 10.1186/s12859-018-2113-6 Typ Journal Article Autor Furmanová K Journal BMC Bioinformatics Seiten 125 Link Publikation -
2018
Titel Labels on Levels: Labeling of Multi-Scale Multi-Instance and Crowded 3D Biological Environments DOI 10.1109/tvcg.2018.2864491 Typ Journal Article Autor Kouril D Journal IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics Seiten 977-986 Link Publikation -
2020
Titel Molecumentary: Scalable Narrated Documentaries Using Molecular Visualization DOI 10.48550/arxiv.2011.02418 Typ Preprint Autor Kouril D -
2019
Titel Interactive Exploded Views for Molecular Structures DOI 10.2312/vcbm.20191237 Typ Other Autor Miao H Link Publikation -
2020
Titel Spatially Integrated Abstraction of Genetic Molecules Typ Other Autor Halladjian S. -
2018
Titel Multiscale Molecular Visualization DOI 10.1016/j.jmb.2018.09.004 Typ Journal Article Autor Miao H Journal Journal of Molecular Biology Seiten 1049-1070 Link Publikation -
2018
Titel Semantic Screen-Space Occlusion for Multiscale Molecular Visualization DOI 10.2312/vcbm.20181245 Typ Other Autor Koch T Link Publikation -
2018
Titel A Survey of Surface-Based Illustrative Rendering for Visualization DOI 10.1111/cgf.13322 Typ Journal Article Autor Lawonn K Journal Computer Graphics Forum Seiten 205-234 Link Publikation -
2020
Titel Visual Abstraction DOI 10.1007/978-3-030-34444-3_2 Typ Book Chapter Autor Viola I Verlag Springer Nature Seiten 15-37 -
2020
Titel Adenita: interactive 3D modelling and visualization of DNA nanostructures DOI 10.1093/nar/gkaa593 Typ Journal Article Autor De Llano E Journal Nucleic Acids Research Seiten 8269-8275 Link Publikation -
2022
Titel Multiscale Unfolding: Illustratively Visualizing the Whole Genome at a Glance DOI 10.1109/tvcg.2021.3065443 Typ Journal Article Autor Halladjian S Journal IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics Seiten 3456-3470 Link Publikation -
2021
Titel @What does a virus actually look like? DOI 10.1145/3446562.3458551 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Mindek P Seiten 1-1 -
2017
Titel Flicker Observer Effect: Guiding Attention Through High Frequency Flicker in Images DOI 10.1111/cgf.13141 Typ Journal Article Autor Waldin N Journal Computer Graphics Forum Seiten 467-476 -
2017
Titel Metamorphers DOI 10.1145/3154353.3154364 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Mindek P Seiten 1-10 -
2017
Titel Visualization of molecular machinery using agent-based animation DOI 10.1145/3154353.3154360 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Gehrer D Seiten 1-10 -
2017
Titel Pondering the Concept of Abstraction in (Illustrative) Visualization DOI 10.1109/tvcg.2017.2747545 Typ Journal Article Autor Viola I Journal IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics Seiten 2573-2588 Link Publikation -
2017
Titel Multiscale Visualization and Scale-Adaptive Modification of DNA Nanostructures DOI 10.1109/tvcg.2017.2743981 Typ Journal Article Autor Miao H Journal IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics Seiten 1014-1024 Link Publikation
-
2022
Titel EuroVis Best Dissertation Award 2022 Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel IEEE Vis Best Paper Honorable Menion Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International