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Elektronentransfer zelluloseabbauerender Enzyme

Electron Transfer in Cellulose Degrading Enzymes

Roland Ludwig (ORCID: 0000-0002-5058-5874)
  • Grant-DOI 10.55776/I2385
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2016
  • Projektende 30.04.2019
  • Bewilligungssumme 228.406 €
  • Projekt-Website

Bilaterale Ausschreibung: Tschechien

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (60%); Chemie (30%); Industrielle Biotechnologie (10%)

Keywords

    Cellobiose Dehydrogenase, Cellulose Depolymerization, Lytic Polysaccharide Monooxygenase, Mass Spectrometry, Hydrogen/Deuterium Exchange, Chemical Cross-Linking

Abstract Endbericht

Die Zusammenarbeit zweier Enzyme, der lytischen Polysaccharidmomooxygenase (LPMO) und Cellobiosedehydrogenase (CDH), bewirkt eine Effizienzsteigerung bei der enzymatischen Zellulosehydrolyse. Die Rolle der CDH ist es, Elektronen an die LPMO weiterzuleiten und sie dadurch zu reduzieren um sie für die Katalyse zu aktivieren. Der exakte Ablauf dieses Elektronentransferprozesses ist jedoch unbekannt, auch ist seine Relevanz gegenüber kleinen Reduktionsmitteln wie Gallussäure abzuschätzen. Die vorliegende Studie bedient sich verschiedener CDHs und LPMOs aus holzabbauenden Pilzen um den Mechanismus und die Kinetik des Elektronentransferprozesses aufzuklären. Dazu wird die CDH/LPMO Interaktion sowohl in homogener Lösung, wie auch im physiologisch relevantem, an Zellulose gebundenen, heterogenen Zustand untersucht. Zur Untersuchung der Interaktion in Lösung werden schnelle kinetische sowie kalorimetrische Methoden eingesetzt. Zur Untersuchung der Protein-Protein und Protein-Zellulose Interaktionen in gebundenem Zustand werden HPLCund Massenspektrometrie herangezogen. Das Projekt testet die Hypothese, dass die natürliche Funktion der CDH die einer LPMO- Reduktase ist. Drei Fragen sollen dabei im Besonderen beantwortet werden: 1) Gibt die CDH Elektronen schnell an LPMO weiter und wie schnell ist sie im Vergleich zu niedermolekularen Reduktionsmitteln? 2) Interagieren CDH und LPMO über eine spezifischen Proteinschnittstelle (Proteinoberfläche) oder basiert der Elektronentransfer zwischen den Enzymen auf zufälligen Kontakten? 3) Variiert die Interaktion von CDH und LPMO Enzymen mit und ohne Kohlenhydratbindungsstelle? Diese Studie soll die Grundlagen extrazellulärer Redoxprozesse im Bereich des Holzabbaus erarbeiten. Die Ergebnisse sind für die annwendungsnahe Forschung wichtig, um den Abbau von Pflanzenstoffen zur Gewinnung von Biotreibstoffen oder Rohstoffen in Grünen Bioraffinerien zu verbessern.

Die Zusammenarbeit zweier Enzyme, der lytischen Polysaccharidmomooxygenase (LPMO) und Cellobiosedehydrogenase (CDH), bewirkt eine Effizienzsteigerung bei der enzymatischen Zellulosehydrolyse. Die Rolle der CDH ist es, Elektronen an die LPMO weiterzuleiten und sie dadurch zu reduzieren um sie für die Katalyse zu aktivieren. Der exakte Ablauf dieses Elektronentransferprozesses ist jedoch unbekannt, auch ist seine Relevanz gegenüber kleinen Reduktionsmitteln wie Gallussäure abzuschätzen. Die durchgeführten Versuche zeigten, dass CDH nicht nur Elektronen zur Aktivierung des Redoxzentrums der LPMO liefert, sondern auch das Kosubstrat Wasserstoffperoxid zur Verfügung stellt und so die Katalyserate der LPMO dramatisch steigert. Die vorliegende Studie bediente sich verschiedener CDHs und LPMOs aus holzabbauenden Pilzen um den Mechanismus und die Kinetik des Elektronentransferprozesses aufzuklären. Dazu wurdr die CDH-LPMO Interaktion sowohl in homogener Lösung, wie auch im physiologisch relevantem, an Zellulose gebundenen, heterogenen Zustand untersucht. Zur Untersuchung der Interaktion in Lösung werden schnelle kinetische sowie kalorimetrische Methoden eingesetzt. Zur Untersuchung der Protein-Protein und Protein-Zellulose Interaktionen in gebundenem Zustand werden HPLC und Massenspektrometrie herangezogen. Das Projekt zeigte, das die natürliche Funktion der CDH tatsächlich die einer LPMO-Reduktase ist. CDH und LPMO interagieren über eine spezifischen Proteinschnittstelle an der Proteinoberfläche um einen effizienten Elektronentransfer zwischen den Enzymen zu gewährleisten. Ebenso wurde ein Unterschied in der Interaktion beobachtet, wenn eine Kohlenhydratbindungsmodul im Enzym vorhanden war. Diese Studie vertieft die Grundlagen extrazellulärer Redoxprozesse im Bereich des Holzabbaus. Die Ergebnisse sind für die annwendungsnahe Forschung interessant um den Abbau von Pflanzenstoffen zur Gewinnung von Biotreibstoffen oder Rohstoffen in Grünen Bioraffinerien zu verbessern.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Sarah Cianferani, Université de Strasbourg - Frankreich
  • Christina Divne, KTH Royal Institute of Technology - Schweden
  • Petr Halada, Academy of Sciences of the Czech Republic - Tschechien
  • Petr Man, Academy of Sciences of the Czech Republic - Tschechien
  • Carol V. Robinson, The University of Oxford - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 491 Zitationen
  • 26 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 3 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2020
    Titel Additional file 1 of The H2O2-dependent activity of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase investigated with a turbidimetric assay
    DOI 10.6084/m9.figshare.11945853
    Typ Other
    Autor Frantisek Filandr
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Additional file 1 of The H2O2-dependent activity of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase investigated with a turbidimetric assay
    DOI 10.6084/m9.figshare.11945853.v1
    Typ Other
    Autor Frantisek Filandr
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Inhibition of the Peroxygenase Lytic Polysaccharide Monooxygenase by Carboxylic Acids and Amino Acids
    DOI 10.3390/antiox11061096
    Typ Journal Article
    Autor Breslmayr E
    Journal Antioxidants
    Seiten 1096
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Polysaccharide oxidation by lytic polysaccharide monooxygenase is enhanced by engineered cellobiose dehydrogenase
    DOI 10.1111/febs.15067
    Typ Journal Article
    Autor Kracher D
    Journal The FEBS Journal
    Seiten 897-908
    Link Publikation
  • 2019
    Titel MOESM1 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.11330105.v1
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2019
    Titel MOESM1 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.11330105
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2019
    Titel MOESM2 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.11330108
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2019
    Titel MOESM2 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.11330108.v1
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2019
    Titel MOESM3 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.11330111
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2019
    Titel MOESM3 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.11330111.v1
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.1186/s13068-019-1624-3
    Typ Journal Article
    Autor Breslmayr E
    Journal Biotechnology for Biofuels
    Seiten 283
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Wheat bran biodegradation by edible Pleurotus fungi – A sustainable perspective for food and feed
    DOI 10.1016/j.lwt.2017.07.051
    Typ Journal Article
    Autor Wanzenböck E
    Journal LWT - Food Science and Technology
    Seiten 123-131
  • 2017
    Titel Active-site copper reduction promotes substrate binding of fungal lytic polysaccharide monooxygenase and reduces stability
    DOI 10.1074/jbc.ra117.000109
    Typ Journal Article
    Autor Kracher D
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 1676-1687
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM1 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024731
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM1 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024731.v1
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM2 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024752
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM2 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024752.v1
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM3 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024770
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM3 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024770.v1
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM4 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024791
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2018
    Titel MOESM4 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.6084/m9.figshare.6024791.v1
    Typ Other
    Autor Breslmayr E
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Chimeric Cellobiose Dehydrogenases Reveal the Function of Cytochrome Domain Mobility for the Electron Transfer to Lytic Polysaccharide Monooxygenase
    DOI 10.1021/acscatal.0c05294
    Typ Journal Article
    Autor Felice A
    Journal ACS Catalysis
    Seiten 517-532
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The H2O2-dependent activity of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase investigated with a turbidimetric assay
    DOI 10.1186/s13068-020-01673-4
    Typ Journal Article
    Autor Filandr F
    Journal Biotechnology for Biofuels
    Seiten 37
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Structural Dynamics of Lytic Polysaccharide Monooxygenase during Catalysis
    DOI 10.3390/biom10020242
    Typ Journal Article
    Autor Filandr F
    Journal Biomolecules
    Seiten 242
    Link Publikation
  • 2018
    Titel A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
    DOI 10.1186/s13068-018-1063-6
    Typ Journal Article
    Autor Breslmayr E
    Journal Biotechnology for Biofuels
    Seiten 79
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Engineering of Cellobiose Dehydrogenases for Improved Glucose Sensitivity and Reduced Maltose Affinity
    DOI 10.1002/celc.201600781
    Typ Journal Article
    Autor Ortiz R
    Journal ChemElectroChem
    Seiten 846-855
Methoden & Materialien
  • 2018
    Titel Enymatic activity assay for LPMO
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel BioTrans 2019, July 7-11, 2019, Groningen, The Netherlands
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel 43rd FEBS Conference, Jul. 7-12, 2018, Prague, Czech Republic
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel International Symposium on Artificial Cell Reactor Science and Technology, Apr. 5-6, 2018, Tokyo, Japan
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel 9th International Congress of Food Technologists, Biotechnologists and Nutritionists, Oct. 3-5, 2018, Zagreb, Croatia
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2018
    Titel Electron flow during oxidative cellulose degradation
    Typ Other
    Förderbeginn 2018
  • 2018
    Titel Routing the flow of electrons...
    Typ Other
    Förderbeginn 2018
  • 2017
    Titel (OXIDISE) - Interaction and Kinetics of Oxidative Biomass Degrading Enzymes Resolved by High-Resolution Techniques
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2017

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