Physiologische Interaktionen zwischen Salmonella und der Darm-Mikrobiota
Physiological Interactions of Salmonella and the intestinal microbiota
DACH: Österreich - Deutschland - Schweiz
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Intestinal Microbiota,
Salmonella,
Sulfate-Reducing Microorganisms,
Colonization Resistance,
Microbial Ecophysiology,
Genomics
Eine der wichtigsten Funktionen der symbiotischen Darm-Mikrobiota für ihren Wirt ist der Schutz gegen bakterielle Krankheitserreger. Die ökologische Grundlage dieser Schutzwirkung ist die effiziente Nährstoffkonkurrenz der vielen indigenen Mikroorganismen und damit die Besetzung aller ökologischen Nischen im Darm. Störungen der mikrobiellen Ökologie im Darm, zum Beispiel durch Antibiotika-Therapie, führen zu freien Nahrungsnischen und ermöglichen die Besiedelung durch Krankheitserreger. Darüberhinaus manipulieren Krankheitserreger durch die Auslösung von Entzündungen die Nährstoffverfügbarkeit im Darm zusätzlich zu ihrem Vorteil. Das Substratspektrum sowohl der Krankheitserreger als auch der einzelnen Mitglieder der komplexen Darm-Mikrobiota und ihre Nährstoffkonkurrenz während der verschiedenen Infektionsstadien sind somit von grundlegender Bedeutung für das Darm-Ökosystem, aber leider immer noch größtenteils unerforscht. Dieses Projekt zielt daher darauf ab die physiologischen Wechselwirkungen zwischen Salmonellen, wichtigen Erregern von Lebensmittelinfektionen, und den einzelnen Mitglieder der Darm-Mikrobiota im Detail zu verstehen und symbiotische Mikroorganismen zu identifizieren, die vor Infektionen schützen. Durch die genaue Charakterisierung von Mikroorganismen und deren Stoffwechselvorgängen, die eine Besiedelung des Darms durch Krankheitserreger begünstigen bzw. erschweren, werden die Ergebnisse dieser Forschung zur Entwicklung zukünftiger Therapien beitragen.
Eine der wichtigsten Funktionen der symbiotischen Darm-Mikrobiota für ihren Wirt ist der Schutz gegen bakterielle Krankheitserreger. Die ökologische Grundlage dieser Schutzwirkung ist die effiziente Nährstoffkonkurrenz der vielen indigenen Mikroorganismen und damit die Besetzung aller ökologischen Nischen im Darm. Störungen der mikrobiellen Ökologie im Darm zum Beispiel durch Antibiotika-Therapie führen zu freien Nahrungsnischen und ermöglichen die Besiedelung durch Krankheitserreger. Welche Substrate die Krankheitserreger und die einzelnen Mitglieder der komplexen Mikrobiota im Darm nutzen und die effiziente Konkurrenz um Nährstoffe ist somit von grundlegender Bedeutung für das Darm-Ökosystem, aber leider immer noch unzureichend verstanden. Dieses Projekt trug zu einem genaueren Verständnis der Wechselwirkungen zwischen Salmonellen, wichtigen Erregern von Lebensmittelinfektionen, und den einzelnen Mitglieder der Darm-Mikrobiota bei. Zu den Höhepunkten des Projekts gehören die Identifizierung von vor-Salmonellen-Infektion-schützenden, symbiotischen Mikroorganismen, neue Einblicke in die zugrundeliegenden Schutzmechanismen, sowie die Entdeckung eines selektiven Nährstoffs und potenziellen Präbiotikums für Bakterien im humanen Darm.
- Universität Wien - 100%
- Philippe Schmitt-Kopplin, Helmholtz Zentrum München - Deutschland
- Bärbel Stecher, Technische Universität München - Deutschland
Research Output
- 4001 Zitationen
- 21 Publikationen
- 5 Disseminationen
- 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 3 Weitere Förderungen
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2025
Titel Associations between gut microbiota and personality traits: insights from a captive common marmoset (Callithrix jacchus) colony DOI 10.1101/2025.02.12.637913 Typ Preprint Autor Ye H Seiten 2025.02.12.637913 -
2021
Titel Sulfoquinovose is a select nutrient of prominent bacteria and a source of hydrogen sulfide in the human gut DOI 10.1038/s41396-021-00968-0 Typ Journal Article Autor Hanson B Journal The ISME Journal Seiten 2779-2791 Link Publikation -
2020
Titel Microbiome definition re-visited: old concepts and new challenges DOI 10.1186/s40168-020-00875-0 Typ Journal Article Autor Berg G Journal Microbiome Seiten 103 Link Publikation -
2020
Titel Environmental and Intestinal Phylum Firmicutes Bacteria Metabolize the Plant Sugar Sulfoquinovose via a 6-Deoxy-6-sulfofructose Transaldolase Pathway DOI 10.1016/j.isci.2020.101510 Typ Journal Article Autor Frommeyer B Journal iScience Seiten 101510 Link Publikation -
2019
Titel Mucispirillum schaedleri Antagonizes Salmonella Virulence to Protect Mice against Colitis DOI 10.1016/j.chom.2019.03.004 Typ Journal Article Autor Herp S Journal Cell Host & Microbe Link Publikation -
2025
Titel Associations between gut microbiota and personality traits: insights from a captive common marmoset (Callithrix jacchus) colony. DOI 10.1128/spectrum.00443-25 Typ Journal Article Autor Ye H Journal Microbiology spectrum Link Publikation -
2020
Titel Sulfoquinovose is a select nutrient of prominent bacteria and a source of hydrogen sulfide in the human gut DOI 10.21203/rs.3.rs-49676/v1 Typ Preprint Autor Hanson B Link Publikation -
2019
Titel Hair eruption initiates and commensal skin microbiota aggravate adverse events of anti-EGFR therapy DOI 10.1126/scitranslmed.aax2693 Typ Journal Article Autor Klufa J Journal Science Translational Medicine -
2019
Titel A fiber-deprived diet disturbs the fine-scale spatial architecture of the murine colon microbiome DOI 10.1038/s41467-019-12413-0 Typ Journal Article Autor Riva A Journal Nature Communications Seiten 4366 Link Publikation -
2024
Titel Genome-guided design of a defined mouse microbiota that confers colonization resistance against Salmonella enterica serovar Typhimurium. DOI 10.7892/boris.94419 Typ Journal Article Autor Beutler Link Publikation -
2020
Titel Proposal to reclassify the proteobacterial classes Deltaproteobacteria and Oligoflexia, and the phylum Thermodesulfobacteria into four phyla reflecting major functional capabilities. DOI 10.1099/ijsem.0.004213 Typ Journal Article Autor Waite D Journal International journal of systematic and evolutionary microbiology Seiten 5972-6016 Link Publikation -
2023
Titel Ecophysiology and interactions of a taurine-respiring bacterium in the mouse gut DOI 10.1038/s41467-023-41008-z Typ Journal Article Autor Ye H Journal Nature Communications Seiten 5533 Link Publikation -
2016
Titel Genome-guided design of a defined mouse microbiota that confers colonization resistance against Salmonella enterica serovar Typhimurium DOI 10.1038/nmicrobiol.2016.215 Typ Journal Article Autor Brugiroux S Journal Nature Microbiology Seiten 16215 -
2016
Titel Environmental Enteric Dysfunction and Growth Failure/Stunting in Global Child Health DOI 10.1542/peds.2016-0641 Typ Journal Article Autor Owino V Journal Pediatrics -
2018
Titel Stable-Isotope Probing of Human and Animal Microbiome Function DOI 10.1016/j.tim.2018.06.004 Typ Journal Article Autor Berry D Journal Trends in Microbiology Seiten 999-1007 Link Publikation -
2018
Titel Expanded diversity of microbial groups that shape the dissimilatory sulfur cycle DOI 10.1038/s41396-018-0078-0 Typ Journal Article Autor Anantharaman K Journal The ISME Journal Seiten 1715-1728 Link Publikation -
2017
Titel Stable Isotope Techniques for the Assessment of Host and Microbiota Response During Gastrointestinal Dysfunction DOI 10.1097/mpg.0000000000001373 Typ Journal Article Autor Butler R Journal Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition Seiten 8-14 Link Publikation -
2017
Titel Lifestyle and Horizontal Gene Transfer-Mediated Evolution of Mucispirillum schaedleri, a Core Member of the Murine Gut Microbiota DOI 10.1128/msystems.00171-16 Typ Journal Article Autor Loy A Journal mSystems Link Publikation -
2017
Titel Stable Isotope Techniques for the Assessment of Host and Microbiota Response During Gastrointestinal Dysfunction DOI 10.3929/ethz-b-000128266 Typ Other Autor Butler Link Publikation -
2017
Titel Lifestyle and Horizontal Gene Transfer-Mediated Evolution of Mucispirillum schaedleri, a Core Member of the Murine Gut Microbiota. DOI 10.3929/ethz-b-000226787 Typ Other Autor Loy Link Publikation -
2015
Titel probeBase—an online resource for rRNA-targeted oligonucleotide probes and primers: new features 2016 DOI 10.1093/nar/gkv1232 Typ Journal Article Autor Greuter D Journal Nucleic Acids Research Link Publikation
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2021
Titel Educational seminar by Alexander Loy on 'The human microbiome' for Biology School teacher Typ A talk or presentation -
2021
Link
Titel Press release and media response to Hanson et al. [2021] Sulfoquinovose is a select nutrient of prominent bacteria and source of hydrogen sulfide in the human gut. ISME Journal. www.doi.org/10.1038/s41396-021-00968-0 Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2017
Link
Titel Alexander Loy is since 2017 an expert for Open Science - a non-profit association committed to life science communication Typ Participation in an activity, workshop or similar Link Link -
2017
Titel Contributions to the themed week on Austrian TV and Radio Bewusst gesund: Aus dem Bauch/ Consciously healthy: Out of the belly Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press) -
2017
Link
Titel Blog to the University of Vienna "Semester Question": Health from the lab, what is possible? Typ Engagement focused website, blog or social media channel Link Link
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2020
Titel Executive committee member of the Austrian Microbiome Initiative (AMICI, http://www.microbiome.at/, Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad National (any country) -
2020
Titel Senior Editor of The ISME Journal Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series Bekanntheitsgrad Continental/International -
2020
Titel Expert evaluator of the European Research Council (ERC) Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel Keynote at the 10th Annual Meeting of the Austrian Association of Molecular Life Sciences (OeGMBT) Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad National (any country)
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2018
Titel Interspecies hydrogen transfer in the mammalian gut: How interactions between fermenters and hydrogenotrophs influence colonic homeostasis (H2Gut) Typ Fellowship Förderbeginn 2018 -
2019
Titel Microbial symbioses in dynamic environments: Metabolic interplay and novel interactions (MAINTAIN) Typ Other Förderbeginn 2019 -
2020
Titel Secondary Metabolomes of Bacterial Communities (MetaBac) - Research Platform University of Vienna Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2020