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Physiologische Interaktionen zwischen Salmonella und der Darm-Mikrobiota

Physiological Interactions of Salmonella and the intestinal microbiota

Alexander Loy (ORCID: 0000-0001-8923-5882)
  • Grant-DOI 10.55776/I2320
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.08.2016
  • Projektende 31.07.2021
  • Bewilligungssumme 449.768 €
  • Projekt-Website

DACH: Österreich - Deutschland - Schweiz

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Intestinal Microbiota, Salmonella, Sulfate-Reducing Microorganisms, Colonization Resistance, Microbial Ecophysiology, Genomics

Abstract Endbericht

Eine der wichtigsten Funktionen der symbiotischen Darm-Mikrobiota für ihren Wirt ist der Schutz gegen bakterielle Krankheitserreger. Die ökologische Grundlage dieser Schutzwirkung ist die effiziente Nährstoffkonkurrenz der vielen indigenen Mikroorganismen und damit die Besetzung aller ökologischen Nischen im Darm. Störungen der mikrobiellen Ökologie im Darm, zum Beispiel durch Antibiotika-Therapie, führen zu freien Nahrungsnischen und ermöglichen die Besiedelung durch Krankheitserreger. Darüberhinaus manipulieren Krankheitserreger durch die Auslösung von Entzündungen die Nährstoffverfügbarkeit im Darm zusätzlich zu ihrem Vorteil. Das Substratspektrum sowohl der Krankheitserreger als auch der einzelnen Mitglieder der komplexen Darm-Mikrobiota und ihre Nährstoffkonkurrenz während der verschiedenen Infektionsstadien sind somit von grundlegender Bedeutung für das Darm-Ökosystem, aber leider immer noch größtenteils unerforscht. Dieses Projekt zielt daher darauf ab die physiologischen Wechselwirkungen zwischen Salmonellen, wichtigen Erregern von Lebensmittelinfektionen, und den einzelnen Mitglieder der Darm-Mikrobiota im Detail zu verstehen und symbiotische Mikroorganismen zu identifizieren, die vor Infektionen schützen. Durch die genaue Charakterisierung von Mikroorganismen und deren Stoffwechselvorgängen, die eine Besiedelung des Darms durch Krankheitserreger begünstigen bzw. erschweren, werden die Ergebnisse dieser Forschung zur Entwicklung zukünftiger Therapien beitragen.

Eine der wichtigsten Funktionen der symbiotischen Darm-Mikrobiota für ihren Wirt ist der Schutz gegen bakterielle Krankheitserreger. Die ökologische Grundlage dieser Schutzwirkung ist die effiziente Nährstoffkonkurrenz der vielen indigenen Mikroorganismen und damit die Besetzung aller ökologischen Nischen im Darm. Störungen der mikrobiellen Ökologie im Darm zum Beispiel durch Antibiotika-Therapie führen zu freien Nahrungsnischen und ermöglichen die Besiedelung durch Krankheitserreger. Welche Substrate die Krankheitserreger und die einzelnen Mitglieder der komplexen Mikrobiota im Darm nutzen und die effiziente Konkurrenz um Nährstoffe ist somit von grundlegender Bedeutung für das Darm-Ökosystem, aber leider immer noch unzureichend verstanden. Dieses Projekt trug zu einem genaueren Verständnis der Wechselwirkungen zwischen Salmonellen, wichtigen Erregern von Lebensmittelinfektionen, und den einzelnen Mitglieder der Darm-Mikrobiota bei. Zu den Höhepunkten des Projekts gehören die Identifizierung von vor-Salmonellen-Infektion-schützenden, symbiotischen Mikroorganismen, neue Einblicke in die zugrundeliegenden Schutzmechanismen, sowie die Entdeckung eines selektiven Nährstoffs und potenziellen Präbiotikums für Bakterien im humanen Darm.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Philippe Schmitt-Kopplin, Helmholtz Zentrum München - Deutschland
  • Bärbel Stecher, Technische Universität München - Deutschland

Research Output

  • 4001 Zitationen
  • 21 Publikationen
  • 5 Disseminationen
  • 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 3 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Associations between gut microbiota and personality traits: insights from a captive common marmoset (Callithrix jacchus) colony
    DOI 10.1101/2025.02.12.637913
    Typ Preprint
    Autor Ye H
    Seiten 2025.02.12.637913
  • 2021
    Titel Sulfoquinovose is a select nutrient of prominent bacteria and a source of hydrogen sulfide in the human gut
    DOI 10.1038/s41396-021-00968-0
    Typ Journal Article
    Autor Hanson B
    Journal The ISME Journal
    Seiten 2779-2791
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Microbiome definition re-visited: old concepts and new challenges
    DOI 10.1186/s40168-020-00875-0
    Typ Journal Article
    Autor Berg G
    Journal Microbiome
    Seiten 103
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Environmental and Intestinal Phylum Firmicutes Bacteria Metabolize the Plant Sugar Sulfoquinovose via a 6-Deoxy-6-sulfofructose Transaldolase Pathway
    DOI 10.1016/j.isci.2020.101510
    Typ Journal Article
    Autor Frommeyer B
    Journal iScience
    Seiten 101510
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Mucispirillum schaedleri Antagonizes Salmonella Virulence to Protect Mice against Colitis
    DOI 10.1016/j.chom.2019.03.004
    Typ Journal Article
    Autor Herp S
    Journal Cell Host & Microbe
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Associations between gut microbiota and personality traits: insights from a captive common marmoset (Callithrix jacchus) colony.
    DOI 10.1128/spectrum.00443-25
    Typ Journal Article
    Autor Ye H
    Journal Microbiology spectrum
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Sulfoquinovose is a select nutrient of prominent bacteria and a source of hydrogen sulfide in the human gut
    DOI 10.21203/rs.3.rs-49676/v1
    Typ Preprint
    Autor Hanson B
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Hair eruption initiates and commensal skin microbiota aggravate adverse events of anti-EGFR therapy
    DOI 10.1126/scitranslmed.aax2693
    Typ Journal Article
    Autor Klufa J
    Journal Science Translational Medicine
  • 2019
    Titel A fiber-deprived diet disturbs the fine-scale spatial architecture of the murine colon microbiome
    DOI 10.1038/s41467-019-12413-0
    Typ Journal Article
    Autor Riva A
    Journal Nature Communications
    Seiten 4366
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Genome-guided design of a defined mouse microbiota that confers colonization resistance against Salmonella enterica serovar Typhimurium.
    DOI 10.7892/boris.94419
    Typ Journal Article
    Autor Beutler
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Proposal to reclassify the proteobacterial classes Deltaproteobacteria and Oligoflexia, and the phylum Thermodesulfobacteria into four phyla reflecting major functional capabilities.
    DOI 10.1099/ijsem.0.004213
    Typ Journal Article
    Autor Waite D
    Journal International journal of systematic and evolutionary microbiology
    Seiten 5972-6016
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Ecophysiology and interactions of a taurine-respiring bacterium in the mouse gut
    DOI 10.1038/s41467-023-41008-z
    Typ Journal Article
    Autor Ye H
    Journal Nature Communications
    Seiten 5533
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Genome-guided design of a defined mouse microbiota that confers colonization resistance against Salmonella enterica serovar Typhimurium
    DOI 10.1038/nmicrobiol.2016.215
    Typ Journal Article
    Autor Brugiroux S
    Journal Nature Microbiology
    Seiten 16215
  • 2016
    Titel Environmental Enteric Dysfunction and Growth Failure/Stunting in Global Child Health
    DOI 10.1542/peds.2016-0641
    Typ Journal Article
    Autor Owino V
    Journal Pediatrics
  • 2018
    Titel Stable-Isotope Probing of Human and Animal Microbiome Function
    DOI 10.1016/j.tim.2018.06.004
    Typ Journal Article
    Autor Berry D
    Journal Trends in Microbiology
    Seiten 999-1007
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Expanded diversity of microbial groups that shape the dissimilatory sulfur cycle
    DOI 10.1038/s41396-018-0078-0
    Typ Journal Article
    Autor Anantharaman K
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1715-1728
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Stable Isotope Techniques for the Assessment of Host and Microbiota Response During Gastrointestinal Dysfunction
    DOI 10.1097/mpg.0000000000001373
    Typ Journal Article
    Autor Butler R
    Journal Journal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition
    Seiten 8-14
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Lifestyle and Horizontal Gene Transfer-Mediated Evolution of Mucispirillum schaedleri, a Core Member of the Murine Gut Microbiota
    DOI 10.1128/msystems.00171-16
    Typ Journal Article
    Autor Loy A
    Journal mSystems
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Stable Isotope Techniques for the Assessment of Host and Microbiota Response During Gastrointestinal Dysfunction
    DOI 10.3929/ethz-b-000128266
    Typ Other
    Autor Butler
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Lifestyle and Horizontal Gene Transfer-Mediated Evolution of Mucispirillum schaedleri, a Core Member of the Murine Gut Microbiota.
    DOI 10.3929/ethz-b-000226787
    Typ Other
    Autor Loy
    Link Publikation
  • 2015
    Titel probeBase—an online resource for rRNA-targeted oligonucleotide probes and primers: new features 2016
    DOI 10.1093/nar/gkv1232
    Typ Journal Article
    Autor Greuter D
    Journal Nucleic Acids Research
    Link Publikation
Disseminationen
  • 2021
    Titel Educational seminar by Alexander Loy on 'The human microbiome' for Biology School teacher
    Typ A talk or presentation
  • 2021 Link
    Titel Press release and media response to Hanson et al. [2021] Sulfoquinovose is a select nutrient of prominent bacteria and source of hydrogen sulfide in the human gut. ISME Journal. www.doi.org/10.1038/s41396-021-00968-0
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
    Link Link
  • 2017 Link
    Titel Alexander Loy is since 2017 an expert for Open Science - a non-profit association committed to life science communication
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
    Link Link
  • 2017
    Titel Contributions to the themed week on Austrian TV and Radio Bewusst gesund: Aus dem Bauch/ Consciously healthy: Out of the belly
    Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press)
  • 2017 Link
    Titel Blog to the University of Vienna "Semester Question": Health from the lab, what is possible?
    Typ Engagement focused website, blog or social media channel
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2020
    Titel Executive committee member of the Austrian Microbiome Initiative (AMICI, http://www.microbiome.at/,
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad National (any country)
  • 2020
    Titel Senior Editor of The ISME Journal
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2020
    Titel Expert evaluator of the European Research Council (ERC)
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Keynote at the 10th Annual Meeting of the Austrian Association of Molecular Life Sciences (OeGMBT)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad National (any country)
Weitere Förderungen
  • 2018
    Titel Interspecies hydrogen transfer in the mammalian gut: How interactions between fermenters and hydrogenotrophs influence colonic homeostasis (H2Gut)
    Typ Fellowship
    Förderbeginn 2018
  • 2019
    Titel Microbial symbioses in dynamic environments: Metabolic interplay and novel interactions (MAINTAIN)
    Typ Other
    Förderbeginn 2019
  • 2020
    Titel Secondary Metabolomes of Bacterial Communities (MetaBac) - Research Platform University of Vienna
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2020

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