Proteins with in vivo RNA Chaperone Activity
Proteins with in vivo RNA Chaperone Activity
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (85%); Chemie (15%)
Ribonukleinsäuren (RNA) sind an allen relevanten Stoffwechselreaktionen von Zellen beteiligt. RNA wird für die Synthese der Erbsubstanz (DNA), für die Umschreibung der in der DNA kodierten Information in Proteine, sowie für die Genregulation bis hin zur Steuerung von entwicklungsbiologischen Vorgängen benötigt. Die vielfältigen katalytischen Funktionen der RNA führte zur Postulierung einer präbiotischen RNA-Welt, die als Vorläufer der heutigen DNA- und Protein-Welt angesehen wird. In vielen biologischen Prozessen werden Proteine benötigt, damit RNA eine bestimmte Struktur einnehmen und funktionell wirksam werden kann. Erst diese Gestaltsänderung ermöglicht die Realisierung der in der RNA vorhandenen Information. Seit Errichtung des Biozentrums der Universität Wien wurde die RNA Forschung in Österreich durch Unterstützung des FWF intensiviert und hat mittlerweile internationale Anerkennung gefunden. Zur Zeit besteht ein Defizit im Verständnis darüber, wie Proteine die strukturelle Faltung und Stabilität von RNA, sowie deren Prozessierung und Transport beeinflussen. Das Ziel der am Spezialforschungsbereich beteiligten 9 Arbeitsgruppen ist es diese grundlegenden Fragen in einem längeren zeitlichen Rahmen am Biozentrum zu untersuchen. Insbesondere sollen gemeinsame Prinzipien von RNA- Protein Wechselwirkungen in unterschiedlichen Organismen, wie Bakterien, Hefen und höheren tierischen und pflanzlichen Zellen erforscht werden. Der Spezialforschungsbereich ist thematisch in drei Forschungsrichtungen gegliedert, die stark vernetzt sind: Proteine, die an der RNA Faltung und der Translation der RNA in Proteine beteiligt sind. Im Rahmen dieser Projekte sollen Gemeinsamkeiten und Unterschiede von "RNA- Faltungsproteinen" erforscht werden mit dem Ziel diese zu klassifizieren. Weiters wird der Einfluß von solchen RNA Umfaltungen auf die Proteinbiosynthese untersucht. Proteine, die am RNA Transport und deren Stabilität beteiligt sind. Diese Forschungsarbeiten umfassen die Aufklärung der Interaktion von Enzymen mit dem Substrat RNA, sowie die Suche nach zusätzlichen Faktoren, die diese Interaktion beeinflussen. Ebenso werden Enzyme untersucht, welche die Sequenz von RNAs nach deren Synthese verändern. Proteine, die an der Prozessierung von Boten-RNA im Zellkern und Zellorganellen beteilgt sind. Im Mittelpunkt dieser Arbeiten steht die Suche nach Faktoren, die an dem Herausschneiden von Introns aus der Vorläufer Boten-RNA beteilgt sind. Erst diese Prozessierung ermöglicht die sinnvolle Übersetzung vieler RNAs in Proteine.
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Konsortiumsmitglied (01.02.2001 - 31.01.2011)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2004 - 30.09.2009)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2004 - 31.01.2011)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2001 - 31.10.2008)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2001 - 31.01.2007)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2001 - 31.01.2004)
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Kristina Djinovic-Carugo, EMBL GrenobleKonsortiumsmitglied (01.02.2007 - 31.01.2011)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2004 - 31.01.2011)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2001 - 31.01.2011)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2004 - 31.01.2011)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2001 - 31.01.2004)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2004 - 31.01.2011)
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Konsortiumsmitglied (01.02.2001 - 31.01.2007)
- Universität Wien
Research Output
- 230 Zitationen
- 5 Publikationen
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2012
Titel Structural flexibility of RNA as molecular basis for Hfq chaperone function DOI 10.1093/nar/gks510 Typ Journal Article Autor De Almeida Ribeiro E Journal Nucleic Acids Research Seiten 8072-8084 Link Publikation -
2012
Titel Structural and Biochemical Studies on ATP Binding and Hydrolysis by the Escherichia coli RNA Chaperone Hfq DOI 10.1371/journal.pone.0050892 Typ Journal Article Autor Hämmerle H Journal PLoS ONE Link Publikation -
2011
Titel Structural insights into the dynamics and function of the C-terminus of the E. coli RNA chaperone Hfq DOI 10.1093/nar/gkq1346 Typ Journal Article Autor Beich-Frandsen M Journal Nucleic Acids Research Seiten 4900-4915 Link Publikation -
2011
Titel Transient RNA–protein interactions in RNA folding DOI 10.1111/j.1742-4658.2011.08094.x Typ Journal Article Autor Doetsch M Journal The FEBS Journal Seiten 1634-1642 Link Publikation -
2008
Titel Translational activation by the noncoding RNA DsrA involves alternative RNase III processing in the rpoS 5'-leader DOI 10.1261/rna.603108 Typ Journal Article Autor Resch A Journal RNA Seiten 454-459 Link Publikation