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Analysen von Opsinen im Wirbeltiergehirn

Analyses of inner brain Opsins in the vertebrate CNS

Kristin Tessmar-Raible (ORCID: 0000-0002-8038-1741)
  • Grant-DOI 10.55776/P28970
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2016
  • Projektende 31.12.2019
  • Bewilligungssumme 345.146 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Photoreceptors, Opsin, Brain, Zebrafish, Medaka, Evolution

Abstract

Opsine sind am besten bekannt als lichtsensorische Proteine im Auge der Wirbeltiere, wo sie das Sehen ermöglichen. Zusätzlich kommen Opsine aber auch in verschiedenen anderen Zellen vor, insbesondere im Gehirn der Wirbeltiere. Die wissenschaftlichen Arbeiten mehrerer Gruppen haben einerseits gezeigt, dass viele- wenn nicht sogar die Mehrheit- dieser nicht-visuellen Opsine auch als Lichtrezeptoren agieren können. Zusätzlich haben ebenfalls mehrere Studien gemessen, dass Licht bis tief in das Gehirn der Wirbeltiere nachweisbar ist. Aber warum sollten Zellen mitten im Wirbeltiergehirn Licht messen? Um eine Antwort auf diese Frage zu finden, unternehmen wir die funktionelle Charakterisierung von einer bestimmten Klasse von Opsinen in Medakafisch und Zebrafisch. Diese Opsinklasse zeichnet sich durch eine besonders langsame Sequenzevolution aus. Mitglieder gibt es auch in Säugetieren. Unsere bisherigen Daten haben gezeigt, dass Mitglieder dieser Familien in Fischen in spezifischen Inter- und Motorneuronen im Gehirn vorhanden sind. Erste Datenanalysen von Mutanten in diesen Opsinen zeigen einen Verhaltensänderung, wenn die Fische auf Objekte unterschiedlicher Größe reagieren. Ausserdem haben wir erste Hinweise auf molekulare Veränderungen im Hormonhaushalt dieser Mutanten. Diese Daten zeigen, dass Mutationen in diesen Opsinen zu nachweisbaren Veränderungen führen. Ausgehend davon, planen wir nun eine umfassendere Verhaltensanalyse, die Reaktionen auf verschiedene sensorische Stimuli, sowie auch circadiane Bewegungsmusteranalysen umfasst. Auf der molekularen Ebene wollen wir die Veränderungen zwischen unterschiedlichen Opsinmutanten vergleichen. Auf der zellulären Ebene planen wir die Opsin+ Nervenzellen im lebenden Tier zu markieren. Das erlaubt uns dann einerseits elektrophysiologische Messungen, bei denen wir direkt sehen können, wie genau diese Opsin+ Neuronen auf Licht reagieren. Andererseits erlaubt uns die Markierung dieser Zellen auch die Projektionsbahnen und damit die Eingangs- und Zielgebiete besser zu verstehen. Mit dieser umfassenden Analyse hoffen wir neben einem grundsätzlichen biologischen Phänomen auch besser verstehen zu können, wie Lichtverschmutzung (d.h. artifzielles Licht am falschen Ort zur falschen Zeit) auf Tiere und Menschen wirken kann. Zusätzlich können diese Opsine auch für neue optogenetische Anwendungen zur Verfügung stehen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%

Research Output

  • 780 Zitationen
  • 30 Publikationen
  • 3 Künstlerischer Output
  • 4 Datasets & Models
  • 3 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2022
    Titel Melanopsin elevates locomotor activity during the wake state of the diurnal zebrafish
    DOI 10.15252/embr.202051528
    Typ Journal Article
    Autor Dekens M
    Journal The EMBO Reports
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The Nereid on the rise: Platynereis as a model system.
    DOI 10.17863/cam.78076
    Typ Journal Article
    Autor Randel N
    Link Publikation
  • 2021
    Titel TMT-Opsins differentially modulate medaka brain function in a context-dependent manner.
    DOI 10.1371/journal.pbio.3001012
    Typ Journal Article
    Autor Fontinha Bm
    Journal PLoS biology
  • 2021
    Titel The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.17863/cam.76093
    Typ Other
    Autor Randel N
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The Nereid on the rise: Platynereis as a model system.
    DOI 10.17863/cam.77524
    Typ Other
    Autor Randel N
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.5281/zenodo.4907399
    Typ Other
    Autor Ozpolat B
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.5281/zenodo.4907400
    Typ Other
    Autor Ozpolat B
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Timing requires the right amount and type of light
    DOI 10.1038/s41559-020-01373-0
    Typ Journal Article
    Autor Hüppe L
    Journal Nature Ecology & Evolution
  • 2021
    Titel Seasonal variation in UVA light drives hormonal and behavioural changes in a marine annelid via a ciliary opsin.
    DOI 10.1038/s41559-020-01356-1
    Typ Journal Article
    Autor Häfker Ns
    Journal Nature ecology & evolution
    Seiten 204-218
  • 2021
    Titel Characterization of cephalic and non-cephalic sensory cell types provides insight into joint photo- and mechanoreceptor evolution
    DOI 10.1101/2021.01.10.426124
    Typ Preprint
    Autor Revilla-I-Domingo R
    Seiten 2021.01.10.426124
    Link Publikation
  • 2020
    Titel A versatile depigmentation, clearing, and labeling method for exploring nervous system diversity
    DOI 10.1126/sciadv.aba0365
    Typ Journal Article
    Autor Pende M
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.1186/s13227-021-00180-3
    Typ Journal Article
    Autor Özpolat B
    Journal EvoDevo
    Seiten 10
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Characterization of tmt-opsin2 in Medaka Fish Provides Insight Into the Interplay of Light and Temperature for Behavioral Regulation
    DOI 10.3389/fphys.2021.726941
    Typ Journal Article
    Autor Zekoll T
    Journal Frontiers in Physiology
    Seiten 726941
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Characterization of cephalic and non-cephalic sensory cell types provides insight into joint photo- and mechanoreceptor evolution
    DOI 10.7554/elife.66144
    Typ Journal Article
    Autor Revilla-I-Domingo R
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The cation exchanger Letm1, circadian rhythms, and NAD(H) levels interconnect in diurnal zebrafish
    DOI 10.26508/lsa.202101194
    Typ Journal Article
    Autor Dao P
    Journal Life Science Alliance
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Differential impacts of the head on Platynereis dumerilii peripheral circadian rhythms
    DOI 10.1101/593772
    Typ Preprint
    Autor Arboleda E
    Seiten 593772
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Combined transcriptome and proteome profiling reveals specific molecular brain signatures for sex, maturation and circalunar clock phase
    DOI 10.7554/elife.41556
    Typ Journal Article
    Autor Schenk S
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Rhythms of behavior: are the times changin’?
    DOI 10.1016/j.conb.2019.10.005
    Typ Journal Article
    Autor Häfker N
    Journal Current Opinion in Neurobiology
    Seiten 55-66
    Link Publikation
  • 2019
    Titel TMT-Opsins differentially modulate medaka brain function in a context-dependent manner
    DOI 10.1101/698480
    Typ Preprint
    Autor Fontinha B
    Seiten 698480
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Differential Impacts of the Head on Platynereis dumerilii Peripheral Circadian Rhythms
    DOI 10.3389/fphys.2019.00900
    Typ Journal Article
    Autor Arboleda E
    Journal Frontiers in Physiology
    Seiten 900
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Instrument design and protocol for the study of light controlled processes in aquatic organisms, and its application to examine the effect of infrared light on zebrafish
    DOI 10.5445/ir/1000067302
    Typ Other
    Autor Dekens M
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Additional file 5: of A Go-type opsin mediates the shadow reflex in the annelid Platynereis dumerilii
    DOI 10.6084/m9.figshare.6158174
    Typ Other
    Autor Ayers T
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Additional file 6: of A Go-type opsin mediates the shadow reflex in the annelid Platynereis dumerilii
    DOI 10.6084/m9.figshare.6158189.v1
    Typ Other
    Autor Ayers T
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Ciliary and rhabdomeric photoreceptor-cell circuits form a spectral depth gauge in marine zooplankton
    DOI 10.1101/251686
    Typ Preprint
    Autor Verasztó C
    Seiten 251686
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Ciliary and rhabdomeric photoreceptor-cell circuits form a spectral depth gauge in marine zooplankton
    DOI 10.7554/elife.36440
    Typ Journal Article
    Autor Verasztó C
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The Still Dark Side of the Moon: Molecular Mechanisms of Lunar-Controlled Rhythms and Clocks
    DOI 10.1016/j.jmb.2020.03.009
    Typ Journal Article
    Autor Andreatta G
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 3525-3546
    Link Publikation
  • 2018
    Titel A Go-type opsin mediates the shadow reflex in the annelid Platynereis dumerilii
    DOI 10.1186/s12915-018-0505-8
    Typ Journal Article
    Autor Ayers T
    Journal BMC Biology
    Seiten 41
    Link Publikation
  • 2017
    Titel An Overview of Monthly Rhythms and Clocks
    DOI 10.3389/fneur.2017.00189
    Typ Journal Article
    Autor Raible F
    Journal Frontiers in Neurology
    Seiten 189
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Instrument design and protocol for the study of light controlled processes in aquatic organisms, and its application to examine the effect of infrared light on zebrafish
    DOI 10.1371/journal.pone.0172038
    Typ Journal Article
    Autor Dekens M
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Virtual reality for freely moving animals
    DOI 10.1038/nmeth.4399
    Typ Journal Article
    Autor Stowers J
    Journal Nature Methods
    Seiten 995-1002
    Link Publikation
Künstlerischer Output
  • 2018 Link
    Titel Additional file 4: of A Go-type opsin mediates the shadow reflex in the annelid Platynereis dumerilii
    DOI 10.6084/m9.figshare.6158165
    Typ Image
    Link Link
  • 2018 Link
    Titel Additional file 3: of A Go-type opsin mediates the shadow reflex in the annelid Platynereis dumerilii
    DOI 10.6084/m9.figshare.6158144
    Typ Image
    Link Link
  • 2018 Link
    Titel Additional file 2: of A Go-type opsin mediates the shadow reflex in the annelid Platynereis dumerilii
    DOI 10.6084/m9.figshare.6158129
    Typ Image
    Link Link
Datasets & Models
  • 2021 Link
    Titel Additional file 2 of The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.6084/m9.figshare.16689648.v1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 2 of The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.6084/m9.figshare.16689648
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 1 of The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.6084/m9.figshare.16689645.v1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Additional file 1 of The Nereid on the rise: Platynereis as a model system
    DOI 10.6084/m9.figshare.16689645
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel Board of Reviewing Editors eLife
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel 21st Stephen M. Schütze Memorial Award, Columbia University, New York
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Associate editor: Frontiers in Physiology, special section Chronobiology
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2020
    Titel ERC-CoG2018 Mari.Time
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2020
  • 2020
    Titel SFB #78, Project: The impact of circadian clock genes on progenitor differentiation and adult stem cells
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2020

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