Architektur von Meeresschnee-assoziierten Mikroben
Architecture of marine snow microbial communities
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (75%); Geowissenschaften (25%)
Keywords
-
Marine Snow,
Adriatic Sea,
Microbial Oceanography,
Marine Biogeochemistry,
Marine Microbial Ecology
In der Wassersäule der Ozeane finden sich unbelebte polymere Strukturen deren Erscheinungsbild Ähnlichkeiten mit Schneeflocken haben, daher ihr Name Meeresschnee. Im Meeresschnee finden wir eine hohe Bakteriendichte und hohe bakterielle Stoffwechselaktivitäten, bis zu 1000x höher als im Umgebungswasser. Meeresschnee ist besonders in der Adria in den Sommermonaten sehr häufig anzutreffen. Bei besonders stabilem und ruhigem Hochdruckwetter kann dieser Meeresschnee auch an die Oberfläche aufsteigen und den Badegenuss stark einschränken. Obwohl das Phänomen der Bildung von Meeresschnee in der Adria gut untersucht ist, blieb die Interaktion zwischen den einzelnen Bakterienzellen im Meeresschnee unerforscht. Die Kenntnis dieser Interaktionen ist aber wichtig für die Abbauprozesse. Daher wird das vorliegende Projekt dies untersuchen mit Hilfe einer Kombination aus molekularbiologischen Untersuchungen und Stoffwechselaktivitätsmessungen. Durch genaue Kenntnis dieser Interaktionen zwischen einzelnen Bakterienzellen sollten wir Aufschluss erlangen, wie stark ausgeprägt die Stoffwechselabhänigkeiten einzelner Zellen voneinander sind.
Im Projekt ARTEMIS wurde die mikrobielle Besiedlung von Detritus-Partikel in der Adria untersucht. Dabei handelte es sich um natürlichen Meeresschnee, der vorwiegend von absterbenden pflanzlichen Planktonblüten gebildet wird und von Plastikpartikel, die häufig vorhanden sind. Die Zusammensetzung der Mikroorganismen-Gemeinschaft im Meeresschnee unterscheidet sich stark von jener auf Plastik-Partikel. Auf Plastik-Partikel finden sich häufig Mikroben, die auch Erdöl abbauen können.
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 2189 Zitationen
- 66 Publikationen
- 6 Datasets & Models
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2023
Titel Seasonal patterns in microbial carbon and iron transporter expression in the Southern Ocean DOI 10.1186/s40168-023-01600-3 Typ Journal Article Autor Debeljak P Journal Microbiome Seiten 187 Link Publikation -
2022
Titel Microbial Consortiums of Putative Degraders of Low-Density Polyethylene-Associated Compounds in the Ocean DOI 10.1128/msystems.01415-21 Typ Journal Article Autor Pinto M Journal mSystems Link Publikation -
2022
Titel Phylogenetically and functionally diverse microorganisms reside under the Ross Ice Shelf DOI 10.3929/ethz-b-000527662 Typ Other Autor Greening Link Publikation -
2022
Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324 DOI 10.3929/ethz-b-000546712 Typ Other Autor Malfertheiner Link Publikation -
2022
Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324 DOI 10.3390/biology11040599 Typ Journal Article Autor Malfertheiner L Journal Biology Seiten 599 Link Publikation -
2022
Titel Impact of hydrostatic pressure on organic carbon cycling of the deep-sea microbiome DOI 10.1101/2022.03.31.486587 Typ Preprint Autor Amano C Seiten 2022.03.31.486587 Link Publikation -
2022
Titel Additional file 1 of Global contribution of pelagic fungi to protein degradation in the ocean DOI 10.6084/m9.figshare.20786846.v1 Typ Other Autor Breyer E Link Publikation -
2022
Titel Additional file 1 of Global contribution of pelagic fungi to protein degradation in the ocean DOI 10.6084/m9.figshare.20786846 Typ Other Autor Breyer E Link Publikation -
2023
Titel Metaproteomic analysis decodes the trophic basis of microbes in the dark ocean DOI 10.21203/rs.3.rs-2727130/v1 Typ Preprint Autor Zhao Z Link Publikation -
2023
Titel A ubiquitous gammaproteobacterial clade dominates expression of sulfur oxidation genes across the mesopelagic ocean DOI 10.1038/s41564-023-01374-2 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Nature Microbiology Seiten 1137-1148 -
2023
Titel Release of cell-free enzymes by marine pelagic fungal strains DOI 10.3389/ffunb.2023.1209265 Typ Journal Article Autor Salazar-Alekseyeva K Journal Frontiers in Fungal Biology Seiten 1209265 Link Publikation -
2021
Titel The importance of jellyfish–microbe interactions for biogeochemical cycles in the ocean DOI 10.1002/lno.11741 Typ Journal Article Autor Tinta T Journal Limnology and Oceanography Seiten 2011-2032 Link Publikation -
2021
Titel Homeostasis drives intense microbial trace metal processing on marine particles DOI 10.1002/lno.11923 Typ Journal Article Autor Debeljak P Journal Limnology and Oceanography Seiten 3842-3855 Link Publikation -
2024
Titel Metaproteomic analysis decodes trophic interactions of microorganisms in the dark ocean DOI 10.1038/s41467-024-50867-z Typ Journal Article Autor Zhao Z Journal Nature Communications Seiten 6411 Link Publikation -
2024
Titel Decoupling between the genetic potential and the metabolic regulation and expression in microbial organic matter cleavage across microbiomes DOI 10.1128/spectrum.03036-23 Typ Journal Article Autor Zhao Z Journal Microbiology Spectrum Link Publikation -
2024
Titel Influence of Salinity on the Extracellular Enzymatic Activities of Marine Pelagic Fungi DOI 10.3390/jof10020152 Typ Journal Article Autor Salazar-Alekseyeva K Journal Journal of Fungi Seiten 152 Link Publikation -
2024
Titel Diel variation of seawater volatile organic compounds, DMSP-related compounds, and microbial plankton inside and outside a tropical coral reef ecosystem DOI 10.3389/fmars.2024.1341619 Typ Journal Article Autor Masdeu-Navarro M Journal Frontiers in Marine Science Seiten 1341619 Link Publikation -
2020
Titel Seasonality combined with the orientation of surfaces influences the microbial community structure of biofilms in the deep Mediterranean Sea DOI 10.1016/j.dsr2.2019.104703 Typ Journal Article Autor Bellou N Journal Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography Seiten 104703 Link Publikation -
2020
Titel Prokaryotic communities and plastic pollution in the ocean DOI 10.25365/thesis.64850 Typ Other Autor Gomes Ribeiro Teixeira Pinto M Link Publikation -
2022
Titel Global contribution of pelagic fungi to protein degradation in the ocean DOI 10.1186/s40168-022-01329-5 Typ Journal Article Autor Breyer E Journal Microbiome Seiten 143 Link Publikation -
2022
Titel Compositional stability of sediment microbial communities during a seagrass meadow decline DOI 10.3389/fmars.2022.966070 Typ Journal Article Autor Markovski M Journal Frontiers in Marine Science Seiten 966070 Link Publikation -
2021
Titel Microbial iron and carbon metabolism as revealed by taxonomy-specific functional diversity in the Southern Ocean DOI 10.1038/s41396-021-00973-3 Typ Journal Article Autor Sun Y Journal The ISME Journal Seiten 2933-2946 Link Publikation -
2021
Titel What Is Refractory Organic Matter in the Ocean? DOI 10.3389/fmars.2021.642637 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Frontiers in Marine Science Seiten 642637 Link Publikation -
2021
Titel Enzyme promiscuity in natural environments: alkaline phosphatase in the ocean DOI 10.1038/s41396-021-01013-w Typ Journal Article Autor Srivastava A Journal The ISME Journal Seiten 3375-3383 Link Publikation -
2021
Titel Potential and expression of carbohydrate utilization by marine fungi in the global ocean DOI 10.1186/s40168-021-01063-4 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Microbiome Seiten 106 Link Publikation -
2021
Titel Selective DNA and Protein Isolation From Marine Macrophyte Surfaces DOI 10.3389/fmicb.2021.665999 Typ Journal Article Autor Korlevic M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 665999 Link Publikation -
2021
Titel Reviews and syntheses: Heterotrophic fixation of inorganic carbon – significant but invisible flux in environmental carbon cycling DOI 10.5194/bg-18-3689-2021 Typ Journal Article Autor Braun A Journal Biogeosciences Seiten 3689-3700 Link Publikation -
2022
Titel Phylogenetically and functionally diverse microorganisms reside under the Ross Ice Shelf DOI 10.1038/s41467-021-27769-5 Typ Journal Article Autor Martínez-Pérez C Journal Nature Communications Seiten 117 Link Publikation -
2022
Titel Decoupling of respiration rates and abundance in marine prokaryoplankton DOI 10.1038/s41586-022-05505-3 Typ Journal Article Autor Munson-Mcgee J Journal Nature Seiten 764-770 Link Publikation -
2022
Titel Microbial Inhabitants of the Dark Ocean DOI 10.1007/978-3-030-90383-1_10 Typ Book Chapter Autor Baltar F Verlag Springer Nature Seiten 425-459 -
2022
Titel Temporal variation in the prokaryotic community of a nearshore marine environment DOI 10.1038/s41598-022-20954-6 Typ Journal Article Autor Korlevic M Journal Scientific Reports Seiten 16859 Link Publikation -
2022
Titel Limited carbon cycling due to high-pressure effects on the deep-sea microbiome DOI 10.1038/s41561-022-01081-3 Typ Journal Article Autor Amano C Journal Nature Geoscience Seiten 1041-1047 Link Publikation -
2020
Titel Mesozooplankton taurine production and prokaryotic uptake in the northern Adriatic Sea DOI 10.1002/lno.11544 Typ Journal Article Autor Clifford E Journal Limnology and Oceanography Seiten 2730-2747 Link Publikation -
2020
Titel Nitrifier adaptation to low energy flux controls inventory of reduced nitrogen in the dark ocean DOI 10.1073/pnas.1912367117 Typ Journal Article Autor Zhang Y Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 4823-4830 Link Publikation -
2020
Titel Putative degraders of low-density polyethylene-derived compounds are ubiquitous members of plastic-associated bacterial communities in the marine environment DOI 10.1111/1462-2920.15232 Typ Journal Article Autor Pinto M Journal Environmental Microbiology Seiten 4779-4793 Link Publikation -
2019
Titel Resolving the paradox: Continuous cell-free alkaline phosphatase activity despite high phosphate concentrations DOI 10.1016/j.marchem.2019.103671 Typ Journal Article Autor Thomson B Journal Marine Chemistry Seiten 103671 -
2021
Titel Microbial consortiums of putative degraders of low-density polyethylene-associated compounds in the ocean DOI 10.1101/2021.11.23.469798 Typ Preprint Autor Pinto M Seiten 2021.11.23.469798 Link Publikation -
2021
Titel Microbes mediating the sulfur cycle in the Atlantic Ocean and their link to chemolithoautotrophy DOI 10.1111/1462-2920.15759 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Seiten 7152-7167 Link Publikation -
2021
Titel Seasonal Dynamics of Epiphytic Microbial Communities on Marine Macrophyte Surfaces DOI 10.3389/fmicb.2021.671342 Typ Journal Article Autor Korlevic M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 671342 Link Publikation -
2022
Titel Prokaryotic Life in the Deep Ocean's Water Column DOI 10.1146/annurev-marine-032122-115655 Typ Journal Article Autor Herndl G Journal Annual Review of Marine Science Seiten 461-483 Link Publikation -
2022
Titel Novel bacterial group potentially dominates sulfur cycling in the dark ocean DOI 10.21203/rs.3.rs-1561045/v1 Typ Preprint Autor Baltar F Link Publikation -
2022
Titel Extracellular Enzymatic Activities of Oceanic Pelagic Fungal Strains and the Influence of Temperature DOI 10.3390/jof8060571 Typ Journal Article Autor Alekseyeva K Journal Journal of Fungi Seiten 571 Link Publikation -
2019
Titel Microbial iron metabolism as revealed by gene expression profiles in contrasted Southern Ocean regimes DOI 10.1111/1462-2920.14621 Typ Journal Article Autor Debeljak P Journal Environmental Microbiology Seiten 2360-2374 Link Publikation -
2019
Titel Jellyfish-Associated Microbiome in the Marine Environment: Exploring Its Biotechnological Potential DOI 10.3390/md17020094 Typ Journal Article Autor Tinta T Journal Marine Drugs Seiten 94 Link Publikation -
2019
Titel Ammonia-oxidizing archaea release a suite of organic compounds potentially fueling prokaryotic heterotrophy in the ocean DOI 10.1101/558726 Typ Preprint Autor Bayer B Seiten 558726 Link Publikation -
2019
Titel Towards Integrating Evolution, Metabolism, and Climate Change Studies of Marine Ecosystems DOI 10.1016/j.tree.2019.07.003 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Trends in Ecology & Evolution Seiten 1022-1033 Link Publikation -
2019
Titel Ammonia-oxidizing archaea release a suite of organic compounds potentially fueling prokaryotic heterotrophy in the ocean DOI 10.1111/1462-2920.14755 Typ Journal Article Autor Bayer B Journal Environmental Microbiology Seiten 4062-4075 Link Publikation -
2019
Titel Ideas and perspectives: Is dark carbon fixation relevant for oceanic primary production estimates? DOI 10.5194/bg-16-3793-2019 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Biogeosciences Seiten 3793-3799 Link Publikation -
2019
Titel Niche Differentiation of Aerobic and Anaerobic Ammonia Oxidizers in a High Latitude Deep Oxygen Minimum Zone DOI 10.3389/fmicb.2019.02141 Typ Journal Article Autor Muck S Journal Frontiers in Microbiology Seiten 2141 Link Publikation -
2019
Titel Uneven host cell growth causes lysogenic virus induction in the Baltic Sea DOI 10.1371/journal.pone.0220716 Typ Journal Article Autor Köstner N Journal PLOS ONE Link Publikation -
2019
Titel Is dark carbon fixation relevant for oceanic primary production estimates? DOI 10.5194/bg-2019-223 Typ Preprint Autor Baltar F Seiten 1-12 Link Publikation -
2019
Titel The composition of bacterial communities associated with plastic biofilms differs between different polymers and stages of biofilm succession DOI 10.1371/journal.pone.0217165 Typ Journal Article Autor Pinto M Journal PLOS ONE Link Publikation -
2019
Titel Proteomic Response of Three Marine Ammonia-Oxidizing Archaea to Hydrogen Peroxide and Their Metabolic Interactions with a Heterotrophic Alphaproteobacterium DOI 10.1128/msystems.00181-19 Typ Journal Article Autor Bayer B Journal mSystems Link Publikation -
2019
Titel Seasonal dynamics of marine snow-associated and free-living demethylating bacterial communities in the coastal northern Adriatic Sea DOI 10.1111/1758-2229.12783 Typ Journal Article Autor Steiner P Journal Environmental Microbiology Reports Seiten 699-707 Link Publikation -
2019
Titel Highly variable mRNA half-life time within marine bacterial taxa and functional genes DOI 10.1111/1462-2920.14737 Typ Journal Article Autor Steiner P Journal Environmental Microbiology Seiten 3873-3884 Link Publikation -
2016
Titel Correlation between Cardiorespiratory Fitness and Platelet Function in Healthy Women DOI 10.1249/mss.0000000000000882 Typ Journal Article Autor Heber S Journal Medicine & Science in Sports & Exercise Seiten 1101-1110 -
2018
Titel Differential Response of Cafeteria roenbergensis to Different Bacterial and Archaeal Prey Characteristics DOI 10.1007/s00248-018-1293-y Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Microbial Ecology Seiten 1-5 Link Publikation -
2018
Titel Host Differentiation and Compartmentalization of Microbial Communities in the Azooxanthellate Cupcorals Tubastrea coccinea and Rhizopsammia goesi in the Caribbean DOI 10.3389/fmars.2018.00391 Typ Journal Article Autor Engelen A Journal Frontiers in Marine Science Seiten 391 Link Publikation -
2020
Titel Effects of the Invasion of Caulerpa cylindracea in a Cymodocea nodosa Meadow in the Northern Adriatic Sea DOI 10.3389/fmars.2020.602055 Typ Journal Article Autor Najdek M Journal Frontiers in Marine Science Seiten 602055 Link Publikation -
2020
Titel Reviews and syntheses: Heterotrophic fixation of inorganic carbon – significant but invisible flux in global carbon cycling DOI 10.5194/bg-2020-465 Typ Preprint Autor Braun A Seiten 1-18 Link Publikation -
2020
Titel Functional Seasonality of Free-Living and Particle-Associated Prokaryotic Communities in the Coastal Adriatic Sea DOI 10.3389/fmicb.2020.584222 Typ Journal Article Autor Steiner P Journal Frontiers in Microbiology Seiten 584222 Link Publikation -
2020
Titel Microbial Processing of Jellyfish Detritus in the Ocean DOI 10.3389/fmicb.2020.590995 Typ Journal Article Autor Tinta T Journal Frontiers in Microbiology Seiten 590995 Link Publikation -
2020
Titel Hiding in Plain Sight: The Globally Distributed Bacterial Candidate Phylum PAUC34f DOI 10.3389/fmicb.2020.00376 Typ Journal Article Autor Chen M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 376 Link Publikation -
2020
Titel Linking extracellular enzymes to phylogeny indicates a predominantly particle-associated lifestyle of deep-sea prokaryotes DOI 10.1126/sciadv.aaz4354 Typ Journal Article Autor Zhao Z Journal Science Advances Link Publikation -
2018
Titel Dissolved organic carbon leaching from plastics stimulates microbial activity in the ocean DOI 10.1038/s41467-018-03798-5 Typ Journal Article Autor Romera-Castillo C Journal Nature Communications Seiten 1430 Link Publikation -
2017
Titel Extracting DNA from ocean microplastics: a method comparison study DOI 10.1039/c6ay03119f Typ Journal Article Autor Debeljak P Journal Analytical Methods Seiten 1521-1526 Link Publikation
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2022
Link
Titel Additional file 2 of Global contribution of pelagic fungi to protein degradation in the ocean DOI 10.6084/m9.figshare.20786849 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
Link
Titel Additional file 3 of Global contribution of pelagic fungi to protein degradation in the ocean DOI 10.6084/m9.figshare.20786852 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel Additional file 3 of Potential and expression of carbohydrate utilization by marine fungi in the global ocean DOI 10.6084/m9.figshare.14576637.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel Additional file 3 of Potential and expression of carbohydrate utilization by marine fungi in the global ocean DOI 10.6084/m9.figshare.14576637 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel Additional file 2 of Potential and expression of carbohydrate utilization by marine fungi in the global ocean DOI 10.6084/m9.figshare.14576634.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel Additional file 2 of Potential and expression of carbohydrate utilization by marine fungi in the global ocean DOI 10.6084/m9.figshare.14576634 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link