MOCA_Microbial Oceanography of ChemolithoAutotrophic planktonic Communities
MOCA_Microbial Oceanography of ChemolithoAutotrophic planktonic Communities
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Chemoautotrophy,
Molecular ecology,
Bacteria,
Archaea
Durch Simulationsmodelle wird vorhergesagt, dass der Sauerstoffgehalt der Ozeane bis zum Ende des Jahrhunderts aufgrund erhöhter Stratifikation des Oberflächenwassers und der globalen Temperaturerhöhung um 25% absinken wird. Dieser Sauerstoffverlust wird unausweichlich zu einer Vergrößerung der hypoxischen und anoxischen Zonen im Meer führen mit entsprechenden Konsequenzen für die Kohlenstoff- und Stickstoffkreisläufe. In diesem Antrag studieren wir die funktionelle Diversität von chemolithoautotrophen prokaryotischen Gemeinschaften in zwei kontrastierenden Gewässern, einerseits in der Tiefsee des Nord-Atlantiks entlang eines latitudinalen Gradienten, andererseits rund um die Redoxkline in der zentralen Ostsee. In beiden Gewässern wurden zuvor hochaktive chemolithoautotrophe Gemeinschaften nachgewiesen mit Dunkel-Kohlenstofffixierungsraten die denen der phototrophen Produzenten in Oberflächengewässern vergleichbar sind. Besonderer Fokus wird auf die funktionelle Diversität von Prokaryoten in den Kohlenstoff und Stickstoffkreisläufen beider Systeme gelegt, weiters auf den Schwefelkreislauf in der zentralen Ostsee. In dem individuellen Teilprojekt werden Techniken der Metagenomik und Metatranskriptomic verwendet und Aktiväten und genomisches Potential der abundantesten und aktivsten Gruppen von mesp- und bathypelagischen Archaea des Nordatlantik und der Ostsee studiert. Diese stellen einen großen Anteil der Mikroorganismen in diesen Wassertiefen dar. Zusätzlich werden die großen meta- transkriptomischen und meta-genomischen Ressourcen für die anderen Teilprojekte im Konsortium zur Verfügung gestellt, um weitere bakterielle Gruppen studieren zu können. Besonderer Fokus wird in diesem Teilprojekt auf die ökophysiologische Charakterisierung Ammoniak oxidierender Archaea gelegt, deren Genvariabilität und transkriptionelle Aktivität in Abhängigkeit von biogeochemischen Daten studiert werden um ihre Anpassungsfähigkeiten besser zu verstehen.
Die konventionelle Sichtweise der Lebensgemeinschaften der Wassersäule der Tiefsee ist, dass diese von absinkenden organischen Partikeln leben, die in den sonnendurchfluteten Oberflächengewässer von pflanzlichem Plankton produziert werden. Den weitaus größten Anteil der Konsumation an organischem Material in der Tiefsee stellen Mikroorganismen. Spezielle Mikroorganismen sind allerdings auch in der Lage autotroph zu leben, ähnlich den Pflanzen, allerdings verwenden sie im Gegensatz zu den Pflanzen nicht Licht als Energiequelle sondern anorganische reduzierte Substanzen, um Kohlendioxid zu fixieren und somit Biomasse aufzubauen. Die Menge an autotropher mikrobieller Biomasse-Produktion in der Tiefsee war weitgehend unbekannt. Im Rahmen eines internationalen Forschungsverbundes wurde die Konsumation von organischem Material mit der Biomassesproduktion autotropher Mikroorganismen verglichen und die Zusammensetzung dieser chemolithoautotrophen Mikrobengemeinschaften untersucht. Es zeigte sich, dass die chemolithoautrophe Mikrobenproduktion etwa gleich hoch ist wie jene der heterotrophen Mikroben. Diese chemolithoautotrophe Produktion stellt potentiell eine zusätzliche organische Energiequelle für die heterotrophe Tiefseegemeinschaft dar, die bisher in den Kohlenstoffmodellen nicht berücksichtigt wurde. Somit lieferte diese Studie einen wesentlichen Beitrag zur Klärung der Frage des Kohlenstoffbudgets der Tiefsee.
- Universität Wien - 100%
- Christa Schleper, Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
- Klaus Jürgens, Leibniz-Institut für Ostseeforschung Warnemünde - Deutschland
- Jarone Pinhassi, Linnaeus University - Schweden
- José Gonzales, University La Laguna - Spanien
Research Output
- 2937 Zitationen
- 49 Publikationen
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2022
Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324 DOI 10.3390/biology11040599 Typ Journal Article Autor Malfertheiner L Journal Biology Seiten 599 Link Publikation -
2022
Titel Impact of hydrostatic pressure on organic carbon cycling of the deep-sea microbiome DOI 10.1101/2022.03.31.486587 Typ Preprint Autor Amano C Seiten 2022.03.31.486587 Link Publikation -
2022
Titel Novel bacterial group potentially dominates sulfur cycling in the dark ocean DOI 10.21203/rs.3.rs-1561045/v1 Typ Preprint Autor Baltar F Link Publikation -
2019
Titel Global Structuring of Phylogenetic and Functional Diversity of Pelagic Fungi by Depth and Temperature DOI 10.3389/fmars.2019.00131 Typ Journal Article Autor Morales S Journal Frontiers in Marine Science Seiten 131 Link Publikation -
2019
Titel Taurine Is a Major Carbon and Energy Source for Marine Prokaryotes in the North Atlantic Ocean off the Iberian Peninsula DOI 10.1007/s00248-019-01320-y Typ Journal Article Autor Clifford E Journal Microbial Ecology Seiten 299-312 Link Publikation -
2021
Titel Microbes mediating the sulfur cycle in the Atlantic Ocean and their link to chemolithoautotrophy DOI 10.1111/1462-2920.15759 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Seiten 7152-7167 Link Publikation -
2022
Titel Phylogeny and Metabolic Potential of the Candidate Phylum SAR324 DOI 10.3929/ethz-b-000546712 Typ Other Autor Malfertheiner Link Publikation -
2022
Titel Limited carbon cycling due to high-pressure effects on the deep-sea microbiome DOI 10.1038/s41561-022-01081-3 Typ Journal Article Autor Amano C Journal Nature Geoscience Seiten 1041-1047 Link Publikation -
2023
Titel A ubiquitous gammaproteobacterial clade dominates expression of sulfur oxidation genes across the mesopelagic ocean DOI 10.1038/s41564-023-01374-2 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Nature Microbiology Seiten 1137-1148 -
2019
Titel Niche Differentiation of Aerobic and Anaerobic Ammonia Oxidizers in a High Latitude Deep Oxygen Minimum Zone DOI 10.3389/fmicb.2019.02141 Typ Journal Article Autor Muck S Journal Frontiers in Microbiology Seiten 2141 Link Publikation -
2023
Titel Interplay between autotrophic and heterotrophic prokaryotic metabolism in the bathypelagic realm revealed by metatranscriptomic analyses DOI 10.1186/s40168-023-01688-7 Typ Journal Article Autor Srivastava A Journal Microbiome Seiten 239 Link Publikation -
2016
Titel Depth Dependent Relationships between Temperature and Ocean Heterotrophic Prokaryotic Production DOI 10.3389/fmars.2016.00090 Typ Journal Article Autor Lønborg C Journal Frontiers in Marine Science Seiten 90 Link Publikation -
2016
Titel Geographic Distribution of Archaeal Ammonia Oxidizing Ecotypes in the Atlantic Ocean DOI 10.3389/fmicb.2016.00077 Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Frontiers in Microbiology Seiten 77 Link Publikation -
2016
Titel Prokaryotic Responses to Ammonium and Organic Carbon Reveal Alternative CO2 Fixation Pathways and Importance of Alkaline Phosphatase in the Mesopelagic North Atlantic DOI 10.3389/fmicb.2016.01670 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Frontiers in Microbiology Seiten 1670 Link Publikation -
2016
Titel Dragon kings of the deep sea: marine particles deviate markedly from the common number-size spectrum DOI 10.1038/srep22633 Typ Journal Article Autor Bochdansky A Journal Scientific Reports Seiten 22633 Link Publikation -
2016
Titel Connectivity between surface and deep waters determines prokaryotic diversity in the North Atlantic Deep Water DOI 10.1111/1462-2920.13237 Typ Journal Article Autor Frank A Journal Environmental Microbiology Seiten 2052-2063 Link Publikation -
2016
Titel Archaeal and Bacterial Communities Associated with the Surface Mucus of Caribbean Corals Differ in Their Degree of Host Specificity and Community Turnover Over Reefs DOI 10.1371/journal.pone.0144702 Typ Journal Article Autor Frade P Journal PLOS ONE Link Publikation -
2016
Titel The microbiome of coral surface mucus has a key role in mediating holobiont health and survival upon disturbance DOI 10.1038/ismej.2016.9 Typ Journal Article Autor Glasl B Journal The ISME Journal Seiten 2280-2292 Link Publikation -
2016
Titel Erythromycin and GC7 fail as domain-specific inhibitors for bacterial and archaeal activity in the open ocean DOI 10.3354/ame01792 Typ Journal Article Autor Frank A Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 99-110 Link Publikation -
2017
Titel Crustacean zooplankton release copious amounts of dissolved organic matter as taurine in the ocean DOI 10.1002/lno.10603 Typ Journal Article Autor Clifford E Journal Limnology and Oceanography Seiten 2745-2758 Link Publikation -
2017
Titel Microbial proteins for organic material degradation in the deep ocean DOI 10.1073/pnas.1720765115 Typ Journal Article Autor Kirchman D Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 445-447 Link Publikation -
2017
Titel Organic matter processing by microbial communities throughout the Atlantic water column as revealed by metaproteomics DOI 10.1073/pnas.1708779115 Typ Journal Article Autor Bergauer K Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2016
Titel Large-scale distribution of microbial and viral populations in the South Atlantic Ocean DOI 10.1111/1758-2229.12381 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Reports Seiten 305-315 Link Publikation -
2015
Titel Physiological and genomic characterization of two novel marine thaumarchaeal strains indicates niche differentiation DOI 10.1038/ismej.2015.200 Typ Journal Article Autor Bayer B Journal The ISME Journal Seiten 1051-1063 Link Publikation -
2015
Titel Conservation of dissolved organic matter molecular composition during mixing of the deep water masses of the northeast Atlantic Ocean DOI 10.1016/j.marchem.2015.06.001 Typ Journal Article Autor Hansman R Journal Marine Chemistry Seiten 288-297 Link Publikation -
2015
Titel Macroecological patterns of archaeal ammonia oxidizers in the Atlantic Ocean DOI 10.1111/mec.13365 Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Molecular Ecology Seiten 4931-4942 Link Publikation -
2017
Titel Metagenomic insights into zooplankton-associated bacterial communities DOI 10.1111/1462-2920.13944 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Seiten 492-505 Link Publikation -
2017
Titel SAR202 Genomes from the Dark Ocean Predict Pathways for the Oxidation of Recalcitrant Dissolved Organic Matter DOI 10.1128/mbio.00413-17 Typ Journal Article Autor Landry Z Journal mBio Link Publikation -
2022
Titel A device for assessing microbial activity under ambient hydrostatic pressure: The in situ microbial incubator (ISMI) DOI 10.1002/lom3.10528 Typ Journal Article Autor Amano C Journal Limnology and Oceanography: Methods Seiten 69-81 Link Publikation -
2022
Titel Prokaryotic Life in the Deep Ocean's Water Column DOI 10.1146/annurev-marine-032122-115655 Typ Journal Article Autor Herndl G Journal Annual Review of Marine Science Seiten 461-483 Link Publikation -
2022
Titel Extracellular Enzymatic Activities of Oceanic Pelagic Fungal Strains and the Influence of Temperature DOI 10.3390/jof8060571 Typ Journal Article Autor Alekseyeva K Journal Journal of Fungi Seiten 571 Link Publikation -
2012
Titel Bacterial Versus Archaeal Origin of Extracellular Enzymatic Activity in the Northeast Atlantic Deep Waters DOI 10.1007/s00248-012-0126-7 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal Microbial Ecology Seiten 277-288 Link Publikation -
2012
Titel Temporal dynamics in the free-living bacterial community composition in the coastal North Sea DOI 10.1111/1574-6941.12003 Typ Journal Article Autor Eva S Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 413-424 Link Publikation -
2014
Titel Linkage between copepods and bacteria in the North Atlantic Ocean DOI 10.3354/ame01696 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 215-225 Link Publikation -
2014
Titel Seasonal variation in marine-snow-associated and ambient-water prokaryotic communities in the northern Adriatic Sea DOI 10.3354/ame01718 Typ Journal Article Autor Vojvoda J Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 211-224 Link Publikation -
2014
Titel Resolving the abundance and air-sea fluxes of airborne microorganisms in the North Atlantic Ocean DOI 10.3389/fmicb.2014.00557 Typ Journal Article Autor Mayol E Journal Frontiers in Microbiology Seiten 557 Link Publikation -
2014
Titel Fracture zones in the Mid Atlantic Ridge lead to alterations in prokaryotic and viral parameters in deep-water masses DOI 10.3389/fmicb.2014.00264 Typ Journal Article Autor Muck S Journal Frontiers in Microbiology Seiten 264 Link Publikation -
2012
Titel Links between viruses and prokaryotes throughout the water column along a North Atlantic latitudinal transect DOI 10.1038/ismej.2011.214 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal The ISME Journal Seiten 1566-1577 Link Publikation -
2012
Titel Comparison between MICRO–CARD–FISH and 16S rRNA gene clone libraries to assess the active versus total bacterial community in the coastal Arctic DOI 10.1111/1758-2229.12013 Typ Journal Article Autor De Corte D Journal Environmental Microbiology Reports Seiten 272-281 Link Publikation -
2012
Titel Archaeal amoA gene diversity points to distinct biogeography of ammonia-oxidizing Crenarchaeota in the ocean DOI 10.1111/j.1462-2920.2012.02801.x Typ Journal Article Autor Sintes E Journal Environmental Microbiology Seiten 1647-1658 Link Publikation -
2012
Titel Differentiating leucine incorporation of Archaea and Bacteria throughout the water column of the eastern Atlantic using metabolic inhibitors DOI 10.3354/ame01575 Typ Journal Article Autor Yokokawa T Journal Aquatic Microbial Ecology Seiten 247-256 Link Publikation -
2013
Titel Microbial control of the dark end of the biological pump DOI 10.1038/ngeo1921 Typ Journal Article Autor Herndl G Journal Nature Geoscience Seiten 718-724 Link Publikation -
2013
Titel Diversity and distribution of microbial eukaryotes in the deep tropical and subtropical North Atlantic Ocean DOI 10.1016/j.dsr.2013.04.010 Typ Journal Article Autor Morgan-Smith D Journal Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers Seiten 58-69 -
2013
Titel Spatial patterns of bacterial and archaeal communities along the Romanche Fracture Zone (tropical Atlantic) DOI 10.1111/1574-6941.12142 Typ Journal Article Autor Lekunberri I Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 537-552 Link Publikation -
2013
Titel Development and deployment of a point-source digital inline holographic microscope for the study of plankton and particles to a depth of 6000 m DOI 10.4319/lom.2013.11.28 Typ Journal Article Autor Bochdansky A Journal Limnology and Oceanography: Methods Seiten 28-40 Link Publikation -
2013
Titel Major Effect of Hydrogen Peroxide on Bacterioplankton Metabolism in the Northeast Atlantic DOI 10.1371/journal.pone.0061051 Typ Journal Article Autor Baltar F Journal PLoS ONE Link Publikation -
2011
Titel Bacterially derived dissolved organic matter in the microbial carbon pump. Typ Journal Article Autor Benner R Journal Science booklet -
2011
Titel Potential for Chemolithoautotrophy Among Ubiquitous Bacteria Lineages in the Dark Ocean DOI 10.1126/science.1203690 Typ Journal Article Autor Swan B Journal Science Seiten 1296-1300 -
2013
Titel Abundance and distribution of archaeal acetyl-CoA/propionyl-CoA carboxylase genes indicative for putatively chemoautotrophic Archaea in the tropical Atlantic's interior DOI 10.1111/1574-6941.12073 Typ Journal Article Autor Bergauer K Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 461-473 Link Publikation