Bioorthogonale zeitgesteuerte Elimination in Mitochondrien
Bioorthogonal time-controlled intramitochondrial elimination
Bilaterale Ausschreibung: Tschechien
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (10%); Chemie (90%)
Keywords
-
Bioorthogonal Chemistry,
Mitochondrial Dna,
Reaction Kinetics,
Fluorogenic Probes
Unter bioorthogonalen Reaktionen versteht man chemische Umsetzungen, die kontrolliert in biologischen Systemen durchgeführt werden können. Die miteinander reagierenden Stoffe müssen daher nicht nur biokompatibel sein und keinerlei Auswirkungen auf das biologische System haben, sondern unter diesen Bedingungen auch äußerst selektiv und schnell miteinander reagieren. Auf diese Weise können zum Beispiel zwei Verbindungen im Inneren einer lebenden Zelle miteinander verbunden und dadurch markiert werden. In den letzten Jahren ist es zudem möglich geworden, Verbindungen auch bioorthogonal zu spalten, wodurch Substanzen selektiv an bestimmten Orten eines lebenden Systems bzw. eines Organismus freigesetzt werden können. Dies wird zum Beispiel mehr und mehr für die selektive Freisetzung von Wirkstoffen in Krebszellen verwendet. Im Rahmen dieses Projektes sollen derartige Reaktionen zur Spaltung von Bindungen entwickelt und untersucht werden, die eine zeitkontrollierte Freisetzung von Verbindungen im Inneren von Zellen ermöglichen. Dadurch soll es erreicht werden, im Inneren von Mitochondrien, den Kraftwerken der Zelle, eine modifizierte Substanz selektiv in die mitochondriale DNA (mtDNA) einzubauen. Diese Substanz kann in weiterer Folge verwendet werden, um die mtDNA sichtbar zu machen und dieses wichtige Biomolekül damit besser untersuchen zu können. Die gezielte Freisetzung im Inneren der Mitochondrien verhindert den Einbau in die DNA im Zellkern, was in normalen Verfahren eine Visualisierung der mtDNA erheblich erschwert.
Im Rahmen dieses Projekts ist es gelungen, das Gebiet der bioorthogonalen Chemie entscheidend weiterzuentwickeln, insbesondere um chemische Spaltungsreaktionen präzise in lebenden Zellen durchführen zu können. Ausgehend von einer neuen Strategie zur effizienten Freisetzung von aromatischen Alkoholen, ausgelöst durch eine Click-Reaktion, konnte die kontrollierte Aktivierung von Wirkstoffvorstufen demonstriert werden. Darüber hinaus wurden neue bioorthogonale Werkzeuge entwickelt, insbesondere eine Reihe von Tetrazinen, die als äußerst wirksame chemische 'Scheren' fungieren. Dadurch konnten frühere Limitierungen bioorthogonaler Spaltungsreaktionen umgangen und somit die click-ausgelöste Freisetzung erheblich beschleunigt werden. Die gesteigerte Reaktivität und Effizienz dieser Tetrazine ermöglichen eine präzisere Kontrolle über chemische Reaktionen in lebenden Zellen und eröffnen neue Wege für die Forschung und zukünftige Anwendungen. Des Weiteren wurden neue Methoden zur Synthese von modifizierten trans-Cyclooctenen entwickelt. Diese click-spaltbaren Linker dienen als vielseitige Werkzeuge für verschiedene bioorthogonale Anwendungen. Neue Ansätze zur Einbindung von Strukturelementen, die nach Aktivierung in einer vorprogrammierten Zeit zerfallen, in bioorthogonal spaltbare Verbindungen ermöglichen die präzise, zeitgesteuerte Freisetzung von Molekülen nach einer click-ausgelösten Bindungsspaltung. Diese Kontrollebene ist für Anwendungen wie die Untersuchung dynamischer Zellprozesse von entscheidender Bedeutung. Darüber hinaus wurde eine gezielte bioorthogonale Click-Freisetzung innerhalb von Mitochondrien erreicht, wodurch die spezifische Aktivierung von Substanzen in diesen zellulären Kraftwerken ermöglicht wurde. Obwohl das Projekt erfolgreich abgeschlossen wurde, bauen laufende Studien unverändert auf den erzielten Resultaten und entwickelten Methoden auf. Derzeit wird der selektive Einbau von modifizierten Substanzen in die mitochondriale DNA (mtDNA) unter Verwendung einer zeitgesteuerten bioorthogonalen Freisetzung untersucht, um die Rolle der mtDNA in zellulären Prozessen weiter erforschen zu können. Zusammenfassend repräsentieren die erzielten Ergebnisse signifikante Fortschritte in der bioorthogonalen Chemie. Die entwickelten chemischen Werkzeuge und molekularen Strategien ermöglichen eine zeitgesteuerte chemische Bindungsspaltung, ausgelöst durch eine Click-Reaktion in lebenden Zellen. Dadurch konnte nicht nur das Repertoire an Techniken zur Untersuchung zellulärer Prozesse erweitert, sondern auch vielseitige Methoden für verschiedene Herausforderungen in den Bereichen der bioorthogonalen Chemie und chemischen Biologie realisiert werden.
- Technische Universität Wien - 100%
- Milan Vrabel, Academy of Sciences of the Czech Republic - Tschechien
- Jiri Neuzil, Czech Academy of Sciences - Tschechien
Research Output
- 25 Zitationen
- 15 Publikationen
- 1 Methoden & Materialien
- 4 Datasets & Models
- 1 Disseminationen
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 2 Weitere Förderungen
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2022
Titel Front Cover: Tetrazine-Triggered Bioorthogonal Cleavage of trans-Cyclooctene-Caged Phenols Using a Minimal Self-Immolative Linker Strategy (ChemBioChem 20/2022) DOI 10.1002/cbic.202200542 Typ Journal Article Autor Keppel P Journal ChemBioChem -
2022
Titel Oxidative Desymmetrization Enables the Concise Synthesis of a trans-Cyclooctene Linker for Bioorthogonal Bond Cleavage DOI 10.1002/chem.202203069 Typ Journal Article Autor Kuba W Journal Chemistry – A European Journal Link Publikation -
2024
Titel Transforming Aryl-Tetrazines into Bioorthogonal Scissors for Systematic Cleavage of trans-Cyclooctenes DOI 10.26434/chemrxiv-2024-gh8fz Typ Preprint Autor Wilkovitsch M Link Publikation -
2024
Titel Sulfonated Hydroxyaryl-Tetrazines with Increased pKa for Accelerated Bioorthogonal Click-to-Release Reactions in Cells DOI 10.1002/anie.202411713 Typ Journal Article Autor Rahm M Journal Angewandte Chemie International Edition Link Publikation -
2024
Titel Transforming Aryl-Tetrazines into Bioorthogonal Scissors for Systematic Cleavage of trans-Cyclooctenes DOI 10.26434/chemrxiv-2024-gh8fz-v2 Typ Preprint Autor Wilkovitsch M Link Publikation -
2024
Titel Transforming Aryl-Tetrazines into Bioorthogonal Scissors for Systematic Cleavage of trans-Cyclooctenes DOI 10.26434/chemrxiv-2024-gh8fz-v3 Typ Preprint Autor Wilkovitsch M -
2024
Titel Hydroxylierte Aryl-Tetrazine als bioorthogonale Scheren zur systematischen Spaltung von trans-Cyclooctenen DOI 10.1002/ange.202411707 Typ Journal Article Autor Wilkovitsch M Journal Angewandte Chemie Link Publikation -
2024
Titel Transforming Aryl-Tetrazines into Bioorthogonal Scissors for Systematic Cleavage of trans-Cyclooctenes DOI 10.1002/anie.202411707 Typ Journal Article Autor Wilkovitsch M Journal Angewandte Chemie International Edition Link Publikation -
2024
Titel Sulfonated Hydroxyaryl-Tetrazines with Increased pKa for Accelerated Bioorthogonal Click-to-Release Reactions in Cells DOI 10.1002/ange.202411713 Typ Journal Article Autor Rahm M Journal Angewandte Chemie Link Publikation -
2022
Titel Readily Accessible Strained Difunctionalized trans-Cyclooctenes with Fast Click and Release Capabilities DOI 10.26434/chemrxiv-2022-klj4d Typ Preprint Autor Maartense L -
2020
Titel When the Chemistry is Right - Towards Bioorthogonal Prodrug Activation Typ PhD Thesis Autor Barbara Sohr -
2022
Titel Tetrazine-Triggered Bioorthogonal Cleavage of trans-Cyclooctene-Caged Phenols Using a Minimal Self-Immolative Linker Strategy** DOI 10.1002/cbic.202200363 Typ Journal Article Autor Keppel P Journal ChemBioChem Link Publikation -
2022
Titel Tetrazine-Triggered Bioorthogonal Cleavage of trans-Cyclooctene-Caged Phenols Using a Minimal Self-Immolative Linker Strategy DOI 10.26434/chemrxiv-2022-nt32f Typ Preprint Autor Keppel P Link Publikation -
2022
Titel The Perfect Match: Chemical Tools for Next-Level Bioorthogonal Bond-Cleavage Typ PhD Thesis Autor Walter Kuba -
2022
Titel Click Chemistry & Bioorthogonal Reactions: Molecular Tools for Diagnostics and Therapeutics Typ Postdoctoral Thesis Autor Hannes Mikula
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2024
Link
Titel Fluorescence microscopy data DOI 10.48436/mdh8d-77d32 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel NMR and fluorescence microscopy data DOI 10.48436/ff85m-pj092 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2023
Link
Titel CCDC 2108332: Experimental Crystal Structure Determination DOI 10.5517/ccdc.csd.cc28rwqn Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2023
Link
Titel CCDC 2108333: Experimental Crystal Structure Determination DOI 10.5517/ccdc.csd.cc28rwrp Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2022
Titel European Researchers' Night Typ Participation in an activity, workshop or similar
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2023
Titel Elisabeth Lutz Award Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country)
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2023
Titel bioTARGET Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2023 Geldgeber European Research Council (ERC) -
2021
Titel Bioorthogonal Cascade-Targeting Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2021 Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)