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Ganzkörperbildanalyse zur Diagnostik von Patienten mit monoklonalen Zellerkrankungen

Whole body image analysis for diagnosing patients with monoclonal plasma cell disorders

Georg Langs (ORCID: 0000-0002-5536-6873)
  • Grant-DOI 10.55776/I2714
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2016
  • Projektende 29.02.2020
  • Bewilligungssumme 218.956 €
  • Projekt-Website

DACH: Österreich - Deutschland - Schweiz

Wissenschaftsdisziplinen

Informatik (70%); Klinische Medizin (30%)

Keywords

    Medical Image Analysis, Oncological Imaging, Image Processing, Radiology, Computer Aided Diagnosis

Abstract Endbericht

Die Ganzkörper-Bildgebung mithilfe von Computertomographie (CT) und Magnetresonanztomographie (MRT) entwickelt sich zu einem wichtigen Hilfsmittel in der Diagnose und bei der Therapie von Patienten mit monoklonalen Plasmazellerkrankungen. Diese modernen Bildgebungsverfahren erlauben Rückschlüsse auf die Erkrankung, und ist eine unverzichtbare Ergänzung zu systemischen Blut- und Gewebeparametern. Die enorme Datenmenge, und die Notwendigkeit den Krankheitsfortschritt an einzelnen Körperstellen zu verfolgen, stellt Radiologen vor große Herausforderungen. Im Rahmen des Projektes werden rechnerbasierte Verfahren entwickelt, die erlauben die Krankheitsentwicklung von Patienten mit Multiplen Myelom genau zu bestimmen. Die Läsionen werden detektiert und durch den gesamten Krankheitsverlauf, und über mehrere Patienten hinweg vergleichbar gemacht. Das unterstützt einerseits die Diagnose, andererseits erlaubt es die Bilddaten mit klinischen- molekularen- und genetischen Parametern in Verbindung zu bringen.

Das vom FWF (Österreich) und der DFG (Deutschland) kofinanzierte DACH-Projekt Ganzkörperbildanalyse für Plasmazellstörungen umfasste die Medizinische Universität Wien, die Technische Universität München, die Universität Heidelberg und die Universität Rostock. Ziel des Projekts war es, eine neuartige Methodik zur Bewertung und Behandlungsunterstützung von monoklonalen Plasmazellstörungen zu entwickeln, wobei ein besonderer Schwerpunkt auf der Bildanalyse von Patienten mit multiplem Myelom lag. An der Medizinischen Universität Wien führten die primären Forschungslinien zu neuartigen Methoden und Algorithmen für die automatische Segmentierung relevanter anatomischer Strukturen in Ganzkörper-Magnetresonanztomographiedaten (MRT), Techniken zur Abbildung von Computertomographie- und Magnetresonanztomographie-Untersuchungen von mehreren Zeitpunkten und mehreren Patienten zu einem einzigen Referenzraum und zu Modellen zur Erkennung und Vorhersage multipler Myelomläsionen aus Bildgebungsdaten. Die Projektergebnisse tragen zu unserer Fähigkeit bei, monoklonale Plasmazellstörungen zu bewerten, zu behandeln und zu untersuchen, die mit Läsionen verbunden sind, die in der MRT sichtbar sind.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Marc-André Weber, Universitätsklinikum Heidelberg - Deutschland
  • Bjoern H. Menze, University of Zurich - Schweiz

Research Output

  • 5979 Zitationen
  • 52 Publikationen
  • 2 Policies
  • 2 Künstlerischer Output
  • 3 Methoden & Materialien
  • 1 Datasets & Models
  • 2 Disseminationen
  • 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2021
    Titel Analyzing Longitudinal wb-MRI Data and Clinical Course in a Cohort of Former Smoldering Multiple Myeloma Patients: Connections between MRI Findings and Clinical Progression Patterns
    DOI 10.5167/uzh-214511
    Typ Other
    Autor Hielscher
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Spatio-temporal alterations in retinal and choroidal layers in the progression of age-related macular degeneration (AMD) in optical coherence tomography
    DOI 10.1038/s41598-021-85110-y
    Typ Journal Article
    Autor Vogl W
    Journal Scientific Reports
    Seiten 5743
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Joint embedding: A scalable alignment to compare individuals in a connectivity space
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2020.117232
    Typ Journal Article
    Autor Nenning K
    Journal NeuroImage
    Seiten 117232
    Link Publikation
  • 2020
    Titel AI-based prediction of lesion occurrence in high-risk women based on anomalies detected in follow-up examinations
    DOI 10.1117/12.2564313
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Burger B
  • 2020
    Titel Cross-species functional alignment reveals evolutionary hierarchy within the connectome
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2020.117346
    Typ Journal Article
    Autor Xu T
    Journal NeuroImage
    Seiten 117346
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Spatial Distribution of Focal Lesions in Whole-Body MRI and Influence of MRI Protocol on Staging in Patients with Smoldering Multiple Myeloma According to the New SLiM-CRAB-Criteria
    DOI 10.3390/cancers12092537
    Typ Journal Article
    Autor Wennmann M
    Journal Cancers
    Seiten 2537
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Automatic lung segmentation in routine imaging is primarily a data diversity problem, not a methodology problem
    DOI 10.1186/s41747-020-00173-2
    Typ Journal Article
    Autor Hofmanninger J
    Journal European Radiology Experimental
    Seiten 50
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Analyzing Longitudinal wb-MRI Data and Clinical Course in a Cohort of Former Smoldering Multiple Myeloma Patients: Connections between MRI Findings and Clinical Progression Patterns
    DOI 10.3390/cancers13050961
    Typ Journal Article
    Autor Wennmann M
    Journal Cancers
    Seiten 961
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Causability and explainability of artificial intelligence in medicine
    DOI 10.1002/widm.1312
    Typ Journal Article
    Autor Holzinger A
    Journal Wiley Interdisciplinary Reviews: Data Mining and Knowledge Discovery
    Link Publikation
  • 2019
    Titel f-AnoGAN: Fast unsupervised anomaly detection with generative adversarial networks
    DOI 10.1016/j.media.2019.01.010
    Typ Journal Article
    Autor Schlegl T
    Journal Medical Image Analysis
    Seiten 30-44
  • 2019
    Titel Exploiting Epistemic Uncertainty of Anatomy Segmentation for Anomaly Detection in Retinal OCT
    DOI 10.48550/arxiv.1905.12806
    Typ Preprint
    Autor Seeböck P
  • 2019
    Titel Using CycleGANs for effectively reducing image variability across OCT devices and improving retinal fluid segmentation
    DOI 10.48550/arxiv.1901.08379
    Typ Preprint
    Autor Seeböck P
  • 2019
    Titel Asymmetric Cascade Networks for Focal Bone Lesion Prediction in Multiple Myeloma
    DOI 10.48550/arxiv.1907.13539
    Typ Preprint
    Autor Licandro R
  • 2019
    Titel Additional file 1: of Automatic segmentation and classification of breast lesions through identification of informative multiparametric PET/MRI features
    DOI 10.6084/m9.figshare.8051168
    Typ Other
    Autor Pinker K
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Additional file 1: of Automatic segmentation and classification of breast lesions through identification of informative multiparametric PET/MRI features
    DOI 10.6084/m9.figshare.8051168.v1
    Typ Other
    Autor Pinker K
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Exploiting Epistemic Uncertainty of Anatomy Segmentation for Anomaly Detection in Retinal OCT
    DOI 10.1109/tmi.2019.2919951
    Typ Journal Article
    Autor Seeböck P
    Journal IEEE Transactions on Medical Imaging
    Seiten 87-98
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Automatic segmentation and classification of breast lesions through identification of informative multiparametric PET/MRI features
    DOI 10.1186/s41747-019-0096-3
    Typ Journal Article
    Autor Vogl W
    Journal European Radiology Experimental
    Seiten 18
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Towards Quantitative Imaging Biomarkers of Tumor Dissemination: a Multi-scale Parametric Modeling of Multiple Myeloma
    DOI 10.1101/613869
    Typ Preprint
    Autor Piraud M
    Seiten 613869
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Using Cyclegans for Effectively Reducing Image Variability Across OCT Devices and Improving Retinal Fluid Segmentation
    DOI 10.1109/isbi.2019.8759158
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Seeböck P
    Seiten 605-609
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Cross-species Functional Alignment Reveals Evolutionary Hierarchy Within the Connectome
    DOI 10.1101/692616
    Typ Preprint
    Autor Xu T
    Seiten 692616
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Towards quantitative imaging biomarkers of tumor dissemination: A multi-scale parametric modeling of multiple myeloma
    DOI 10.1016/j.media.2019.07.001
    Typ Journal Article
    Autor Piraud M
    Journal Medical Image Analysis
    Seiten 214-225
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Identifying and Categorizing Anomalies in Retinal Imaging Data
    DOI 10.48550/arxiv.1612.00686
    Typ Preprint
    Autor Seeböck P
  • 2017
    Titel Unsupervised Anomaly Detection with Generative Adversarial Networks to Guide Marker Discovery
    DOI 10.48550/arxiv.1703.05921
    Typ Preprint
    Autor Schlegl T
  • 2017
    Titel Additional file 6: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d6
    Typ Other
    Autor Baumbach S
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 6: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d6.v1
    Typ Other
    Autor Baumbach S
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 1: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d1
    Typ Other
    Autor Baumbach S
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 1: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d1.v1
    Typ Other
    Autor Baumbach S
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 2: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d2
    Typ Other
    Autor Baumbach S
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 2: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d2.v1
    Typ Other
    Autor Baumbach S
    Link Publikation
  • 2018
    Titel The DNA methylation landscape of glioblastoma disease progression shows extensive heterogeneity in time and space
    DOI 10.1038/s41591-018-0156-x
    Typ Journal Article
    Autor Klughammer J
    Journal Nature Medicine
    Seiten 1611-1624
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Predicting Future Bone Infiltration Patterns in Multiple Myeloma
    DOI 10.1007/978-3-030-00500-9_9
    Typ Book Chapter
    Autor Licandro R
    Verlag Springer Nature
    Seiten 76-84
  • 2018
    Titel Detecting Bone Lesions in Multiple Myeloma Patients Using Transfer Learning
    DOI 10.1007/978-3-030-00807-9_3
    Typ Book Chapter
    Autor Perkonigg M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 22-30
  • 2018
    Titel Keypoint Transfer for Fast Whole-Body Segmentation
    DOI 10.1109/tmi.2018.2851194
    Typ Journal Article
    Autor Wachinger C
    Journal IEEE Transactions on Medical Imaging
    Seiten 273-282
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Unsupervised Identification of Disease Marker Candidates in Retinal OCT Imaging Data
    DOI 10.1109/tmi.2018.2877080
    Typ Journal Article
    Autor Seeböck P
    Journal IEEE Transactions on Medical Imaging
    Seiten 1037-1047
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Data Driven Treatment Response Assessment and Preterm, Perinatal, and Paediatric Image Analysis, First International Workshop, DATRA 2018 and Third International Workshop, PIPPI 2018, Held in Conjunction with MICCAI 2018, Granada, Spain, September 16
    DOI 10.1007/978-3-030-00807-9
    Typ Book
    editors Melbourne A, Licandro R, DiFranco M, Rota P, Gau M, Kampel M, Aughwane R, Moeskops P, Schwartz E, Robinson E, Makropoulos A
    Verlag Springer Nature
  • 2018
    Titel Machine learning: from radiomics to discovery and routine
    DOI 10.1007/s00117-018-0407-3
    Typ Journal Article
    Autor Langs G
    Journal Der Radiologe
    Seiten 1-6
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Volumetry based biomarker speed of growth: Quantifying the change of total tumor volume in whole-body magnetic resonance imaging over time improves risk stratification of smoldering multiple myeloma patients
    DOI 10.18632/oncotarget.25402
    Typ Journal Article
    Autor Wennmann M
    Journal Oncotarget
    Seiten 25254-25264
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Maschinelles Lernen in der Radiologie
    DOI 10.1007/s00117-019-00624-x
    Typ Journal Article
    Autor Langs G
    Journal Der Radiologe
    Seiten 6-14
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Dynamic Memory to Alleviate Catastrophic Forgetting in Continuous Learning Settings
    DOI 10.1007/978-3-030-59713-9_35
    Typ Book Chapter
    Autor Hofmanninger J
    Verlag Springer Nature
    Seiten 359-368
  • 2020
    Titel Distributed changes of the functional connectome in patients with glioblastoma
    DOI 10.1038/s41598-020-74726-1
    Typ Journal Article
    Autor Nenning K
    Journal Scientific Reports
    Seiten 18312
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Automatic lung segmentation in routine imaging is primarily a data diversity problem, not a methodology problem
    DOI 10.48550/arxiv.2001.11767
    Typ Preprint
    Autor Hofmanninger J
  • 2020
    Titel Separation of target anatomical structure and occlusions in chest radiographs
    DOI 10.48550/arxiv.2002.00751
    Typ Preprint
    Autor Hofmanninger J
  • 2020
    Titel Unsupervised deep clustering for predictive texture pattern discovery in medical images
    DOI 10.48550/arxiv.2002.03721
    Typ Preprint
    Autor Perkonigg M
  • 2020
    Titel Deep learning detection and quantification of pneumothorax in heterogeneous routine chest computed tomography
    DOI 10.1186/s41747-020-00152-7
    Typ Journal Article
    Autor Röhrich S
    Journal European Radiology Experimental
    Seiten 26
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Dynamic memory to alleviate catastrophic forgetting in continuous learning settings
    DOI 10.48550/arxiv.2007.02639
    Typ Preprint
    Autor Hofmanninger J
  • 2018
    Titel Fully Automated Segmentation of Hyperreflective Foci in Optical Coherence Tomography Images
    DOI 10.48550/arxiv.1805.03278
    Typ Preprint
    Autor Schlegl T
  • 2018
    Titel Unsupervised Identification of Disease Marker Candidates in Retinal OCT Imaging Data
    DOI 10.48550/arxiv.1810.13404
    Typ Preprint
    Autor Seeböck P
  • 2017
    Titel Unsupervised Anomaly Detection with Generative Adversarial Networks to Guide Marker Discovery
    DOI 10.1007/978-3-319-59050-9_12
    Typ Book Chapter
    Autor Schlegl T
    Verlag Springer Nature
    Seiten 146-157
  • 2017
    Titel Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.1186/s12880-017-0193-9
    Typ Journal Article
    Autor Baumbach S
    Journal BMC Medical Imaging
    Seiten 23
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Segmentation of Skeleton and Organs in Whole-Body CT Images via Iterative Trilateration
    DOI 10.1109/tmi.2017.2720261
    Typ Journal Article
    Autor Bieth M
    Journal IEEE Transactions on Medical Imaging
    Seiten 2276-2286
  • 2017
    Titel Predicting Macular Edema Recurrence from Spatio-Temporal Signatures in Optical Coherence Tomography Images
    DOI 10.1109/tmi.2017.2700213
    Typ Journal Article
    Autor Vogl W
    Journal IEEE Transactions on Medical Imaging
    Seiten 1773-1783
  • 2017
    Titel Mapping Multi-Modal Routine Imaging Data to a Single Reference via Multiple Templates
    DOI 10.1007/978-3-319-67558-9_39
    Typ Book Chapter
    Autor Hofmanninger J
    Verlag Springer Nature
    Seiten 341-348
Policies
  • 2020
    Titel Impact on medical research
    DOI 10.1016/j.media.2019.07.001
    Typ Citation in clinical reviews
  • 2018 Link
    Titel Scientific Advisory Board: European Institute of Biomedical Imaging Research (EIBIR) - GL
    DOI 10.1186/s13244-019-0684-z
    Typ Participation in a guidance/advisory committee
    Link Link
Künstlerischer Output
  • 2017 Link
    Titel Additional file 5: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d5
    Typ Image
    Link Link
  • 2017 Link
    Titel Additional file 4: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d4
    Typ Image
    Link Link
Methoden & Materialien
  • 0
    Titel Algorithm for lesion detection
    Typ Technology assay or reagent
  • 0
    Titel Algorithm for predicting emerging and growing lesions in multiple myeloma
    Typ Technology assay or reagent
  • 2020
    Titel Algorithm for bone segmentation in magnetic resonance imaging data
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
Datasets & Models
  • 2017 Link
    Titel Additional file 3: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d3
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 2020 Link
    Titel National TV interview ORF 1 Magazin Newton
    Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press)
    Link Link
  • 2018 Link
    Titel Data-Driven Treatment Response Assessment Workshop (DATRA 2018) - a MICCAI 2018 satellite event
    DOI 10.1007/978-3-030-00807-9
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel 23 invited talks presenting project results in 2019
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel MICCAI DATRA 2018 Keynote Speaker
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel 14 invited talks presening project results in 2018
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel President of the MICCAI Student Society
    Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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