Ganzkörperbildanalyse zur Diagnostik von Patienten mit monoklonalen Zellerkrankungen
Whole body image analysis for diagnosing patients with monoclonal plasma cell disorders
DACH: Österreich - Deutschland - Schweiz
Wissenschaftsdisziplinen
Informatik (70%); Klinische Medizin (30%)
Keywords
-
Medical Image Analysis,
Oncological Imaging,
Image Processing,
Radiology,
Computer Aided Diagnosis
Die Ganzkörper-Bildgebung mithilfe von Computertomographie (CT) und Magnetresonanztomographie (MRT) entwickelt sich zu einem wichtigen Hilfsmittel in der Diagnose und bei der Therapie von Patienten mit monoklonalen Plasmazellerkrankungen. Diese modernen Bildgebungsverfahren erlauben Rückschlüsse auf die Erkrankung, und ist eine unverzichtbare Ergänzung zu systemischen Blut- und Gewebeparametern. Die enorme Datenmenge, und die Notwendigkeit den Krankheitsfortschritt an einzelnen Körperstellen zu verfolgen, stellt Radiologen vor große Herausforderungen. Im Rahmen des Projektes werden rechnerbasierte Verfahren entwickelt, die erlauben die Krankheitsentwicklung von Patienten mit Multiplen Myelom genau zu bestimmen. Die Läsionen werden detektiert und durch den gesamten Krankheitsverlauf, und über mehrere Patienten hinweg vergleichbar gemacht. Das unterstützt einerseits die Diagnose, andererseits erlaubt es die Bilddaten mit klinischen- molekularen- und genetischen Parametern in Verbindung zu bringen.
Das vom FWF (Österreich) und der DFG (Deutschland) kofinanzierte DACH-Projekt Ganzkörperbildanalyse für Plasmazellstörungen umfasste die Medizinische Universität Wien, die Technische Universität München, die Universität Heidelberg und die Universität Rostock. Ziel des Projekts war es, eine neuartige Methodik zur Bewertung und Behandlungsunterstützung von monoklonalen Plasmazellstörungen zu entwickeln, wobei ein besonderer Schwerpunkt auf der Bildanalyse von Patienten mit multiplem Myelom lag. An der Medizinischen Universität Wien führten die primären Forschungslinien zu neuartigen Methoden und Algorithmen für die automatische Segmentierung relevanter anatomischer Strukturen in Ganzkörper-Magnetresonanztomographiedaten (MRT), Techniken zur Abbildung von Computertomographie- und Magnetresonanztomographie-Untersuchungen von mehreren Zeitpunkten und mehreren Patienten zu einem einzigen Referenzraum und zu Modellen zur Erkennung und Vorhersage multipler Myelomläsionen aus Bildgebungsdaten. Die Projektergebnisse tragen zu unserer Fähigkeit bei, monoklonale Plasmazellstörungen zu bewerten, zu behandeln und zu untersuchen, die mit Läsionen verbunden sind, die in der MRT sichtbar sind.
- Marc-André Weber, Universitätsklinikum Heidelberg - Deutschland
- Bjoern H. Menze, University of Zurich - Schweiz
Research Output
- 5979 Zitationen
- 52 Publikationen
- 2 Policies
- 2 Künstlerischer Output
- 3 Methoden & Materialien
- 1 Datasets & Models
- 2 Disseminationen
- 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
-
2021
Titel Analyzing Longitudinal wb-MRI Data and Clinical Course in a Cohort of Former Smoldering Multiple Myeloma Patients: Connections between MRI Findings and Clinical Progression Patterns DOI 10.5167/uzh-214511 Typ Other Autor Hielscher Link Publikation -
2021
Titel Spatio-temporal alterations in retinal and choroidal layers in the progression of age-related macular degeneration (AMD) in optical coherence tomography DOI 10.1038/s41598-021-85110-y Typ Journal Article Autor Vogl W Journal Scientific Reports Seiten 5743 Link Publikation -
2020
Titel Joint embedding: A scalable alignment to compare individuals in a connectivity space DOI 10.1016/j.neuroimage.2020.117232 Typ Journal Article Autor Nenning K Journal NeuroImage Seiten 117232 Link Publikation -
2020
Titel AI-based prediction of lesion occurrence in high-risk women based on anomalies detected in follow-up examinations DOI 10.1117/12.2564313 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Burger B -
2020
Titel Cross-species functional alignment reveals evolutionary hierarchy within the connectome DOI 10.1016/j.neuroimage.2020.117346 Typ Journal Article Autor Xu T Journal NeuroImage Seiten 117346 Link Publikation -
2020
Titel Spatial Distribution of Focal Lesions in Whole-Body MRI and Influence of MRI Protocol on Staging in Patients with Smoldering Multiple Myeloma According to the New SLiM-CRAB-Criteria DOI 10.3390/cancers12092537 Typ Journal Article Autor Wennmann M Journal Cancers Seiten 2537 Link Publikation -
2020
Titel Automatic lung segmentation in routine imaging is primarily a data diversity problem, not a methodology problem DOI 10.1186/s41747-020-00173-2 Typ Journal Article Autor Hofmanninger J Journal European Radiology Experimental Seiten 50 Link Publikation -
2021
Titel Analyzing Longitudinal wb-MRI Data and Clinical Course in a Cohort of Former Smoldering Multiple Myeloma Patients: Connections between MRI Findings and Clinical Progression Patterns DOI 10.3390/cancers13050961 Typ Journal Article Autor Wennmann M Journal Cancers Seiten 961 Link Publikation -
2019
Titel Causability and explainability of artificial intelligence in medicine DOI 10.1002/widm.1312 Typ Journal Article Autor Holzinger A Journal Wiley Interdisciplinary Reviews: Data Mining and Knowledge Discovery Link Publikation -
2019
Titel f-AnoGAN: Fast unsupervised anomaly detection with generative adversarial networks DOI 10.1016/j.media.2019.01.010 Typ Journal Article Autor Schlegl T Journal Medical Image Analysis Seiten 30-44 -
2019
Titel Exploiting Epistemic Uncertainty of Anatomy Segmentation for Anomaly Detection in Retinal OCT DOI 10.48550/arxiv.1905.12806 Typ Preprint Autor Seeböck P -
2019
Titel Using CycleGANs for effectively reducing image variability across OCT devices and improving retinal fluid segmentation DOI 10.48550/arxiv.1901.08379 Typ Preprint Autor Seeböck P -
2019
Titel Asymmetric Cascade Networks for Focal Bone Lesion Prediction in Multiple Myeloma DOI 10.48550/arxiv.1907.13539 Typ Preprint Autor Licandro R -
2019
Titel Additional file 1: of Automatic segmentation and classification of breast lesions through identification of informative multiparametric PET/MRI features DOI 10.6084/m9.figshare.8051168 Typ Other Autor Pinker K Link Publikation -
2019
Titel Additional file 1: of Automatic segmentation and classification of breast lesions through identification of informative multiparametric PET/MRI features DOI 10.6084/m9.figshare.8051168.v1 Typ Other Autor Pinker K Link Publikation -
2019
Titel Exploiting Epistemic Uncertainty of Anatomy Segmentation for Anomaly Detection in Retinal OCT DOI 10.1109/tmi.2019.2919951 Typ Journal Article Autor Seeböck P Journal IEEE Transactions on Medical Imaging Seiten 87-98 Link Publikation -
2019
Titel Automatic segmentation and classification of breast lesions through identification of informative multiparametric PET/MRI features DOI 10.1186/s41747-019-0096-3 Typ Journal Article Autor Vogl W Journal European Radiology Experimental Seiten 18 Link Publikation -
2019
Titel Towards Quantitative Imaging Biomarkers of Tumor Dissemination: a Multi-scale Parametric Modeling of Multiple Myeloma DOI 10.1101/613869 Typ Preprint Autor Piraud M Seiten 613869 Link Publikation -
2019
Titel Using Cyclegans for Effectively Reducing Image Variability Across OCT Devices and Improving Retinal Fluid Segmentation DOI 10.1109/isbi.2019.8759158 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Seeböck P Seiten 605-609 Link Publikation -
2019
Titel Cross-species Functional Alignment Reveals Evolutionary Hierarchy Within the Connectome DOI 10.1101/692616 Typ Preprint Autor Xu T Seiten 692616 Link Publikation -
2019
Titel Towards quantitative imaging biomarkers of tumor dissemination: A multi-scale parametric modeling of multiple myeloma DOI 10.1016/j.media.2019.07.001 Typ Journal Article Autor Piraud M Journal Medical Image Analysis Seiten 214-225 Link Publikation -
2016
Titel Identifying and Categorizing Anomalies in Retinal Imaging Data DOI 10.48550/arxiv.1612.00686 Typ Preprint Autor Seeböck P -
2017
Titel Unsupervised Anomaly Detection with Generative Adversarial Networks to Guide Marker Discovery DOI 10.48550/arxiv.1703.05921 Typ Preprint Autor Schlegl T -
2017
Titel Additional file 6: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d6 Typ Other Autor Baumbach S Link Publikation -
2017
Titel Additional file 6: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d6.v1 Typ Other Autor Baumbach S Link Publikation -
2017
Titel Additional file 1: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d1 Typ Other Autor Baumbach S Link Publikation -
2017
Titel Additional file 1: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d1.v1 Typ Other Autor Baumbach S Link Publikation -
2017
Titel Additional file 2: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d2 Typ Other Autor Baumbach S Link Publikation -
2017
Titel Additional file 2: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d2.v1 Typ Other Autor Baumbach S Link Publikation -
2018
Titel The DNA methylation landscape of glioblastoma disease progression shows extensive heterogeneity in time and space DOI 10.1038/s41591-018-0156-x Typ Journal Article Autor Klughammer J Journal Nature Medicine Seiten 1611-1624 Link Publikation -
2018
Titel Predicting Future Bone Infiltration Patterns in Multiple Myeloma DOI 10.1007/978-3-030-00500-9_9 Typ Book Chapter Autor Licandro R Verlag Springer Nature Seiten 76-84 -
2018
Titel Detecting Bone Lesions in Multiple Myeloma Patients Using Transfer Learning DOI 10.1007/978-3-030-00807-9_3 Typ Book Chapter Autor Perkonigg M Verlag Springer Nature Seiten 22-30 -
2018
Titel Keypoint Transfer for Fast Whole-Body Segmentation DOI 10.1109/tmi.2018.2851194 Typ Journal Article Autor Wachinger C Journal IEEE Transactions on Medical Imaging Seiten 273-282 Link Publikation -
2018
Titel Unsupervised Identification of Disease Marker Candidates in Retinal OCT Imaging Data DOI 10.1109/tmi.2018.2877080 Typ Journal Article Autor Seeböck P Journal IEEE Transactions on Medical Imaging Seiten 1037-1047 Link Publikation -
2018
Titel Data Driven Treatment Response Assessment and Preterm, Perinatal, and Paediatric Image Analysis, First International Workshop, DATRA 2018 and Third International Workshop, PIPPI 2018, Held in Conjunction with MICCAI 2018, Granada, Spain, September 16 DOI 10.1007/978-3-030-00807-9 Typ Book editors Melbourne A, Licandro R, DiFranco M, Rota P, Gau M, Kampel M, Aughwane R, Moeskops P, Schwartz E, Robinson E, Makropoulos A Verlag Springer Nature -
2018
Titel Machine learning: from radiomics to discovery and routine DOI 10.1007/s00117-018-0407-3 Typ Journal Article Autor Langs G Journal Der Radiologe Seiten 1-6 Link Publikation -
2018
Titel Volumetry based biomarker speed of growth: Quantifying the change of total tumor volume in whole-body magnetic resonance imaging over time improves risk stratification of smoldering multiple myeloma patients DOI 10.18632/oncotarget.25402 Typ Journal Article Autor Wennmann M Journal Oncotarget Seiten 25254-25264 Link Publikation -
2020
Titel Maschinelles Lernen in der Radiologie DOI 10.1007/s00117-019-00624-x Typ Journal Article Autor Langs G Journal Der Radiologe Seiten 6-14 Link Publikation -
2020
Titel Dynamic Memory to Alleviate Catastrophic Forgetting in Continuous Learning Settings DOI 10.1007/978-3-030-59713-9_35 Typ Book Chapter Autor Hofmanninger J Verlag Springer Nature Seiten 359-368 -
2020
Titel Distributed changes of the functional connectome in patients with glioblastoma DOI 10.1038/s41598-020-74726-1 Typ Journal Article Autor Nenning K Journal Scientific Reports Seiten 18312 Link Publikation -
2020
Titel Automatic lung segmentation in routine imaging is primarily a data diversity problem, not a methodology problem DOI 10.48550/arxiv.2001.11767 Typ Preprint Autor Hofmanninger J -
2020
Titel Separation of target anatomical structure and occlusions in chest radiographs DOI 10.48550/arxiv.2002.00751 Typ Preprint Autor Hofmanninger J -
2020
Titel Unsupervised deep clustering for predictive texture pattern discovery in medical images DOI 10.48550/arxiv.2002.03721 Typ Preprint Autor Perkonigg M -
2020
Titel Deep learning detection and quantification of pneumothorax in heterogeneous routine chest computed tomography DOI 10.1186/s41747-020-00152-7 Typ Journal Article Autor Röhrich S Journal European Radiology Experimental Seiten 26 Link Publikation -
2020
Titel Dynamic memory to alleviate catastrophic forgetting in continuous learning settings DOI 10.48550/arxiv.2007.02639 Typ Preprint Autor Hofmanninger J -
2018
Titel Fully Automated Segmentation of Hyperreflective Foci in Optical Coherence Tomography Images DOI 10.48550/arxiv.1805.03278 Typ Preprint Autor Schlegl T -
2018
Titel Unsupervised Identification of Disease Marker Candidates in Retinal OCT Imaging Data DOI 10.48550/arxiv.1810.13404 Typ Preprint Autor Seeböck P -
2017
Titel Unsupervised Anomaly Detection with Generative Adversarial Networks to Guide Marker Discovery DOI 10.1007/978-3-319-59050-9_12 Typ Book Chapter Autor Schlegl T Verlag Springer Nature Seiten 146-157 -
2017
Titel Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.1186/s12880-017-0193-9 Typ Journal Article Autor Baumbach S Journal BMC Medical Imaging Seiten 23 Link Publikation -
2017
Titel Segmentation of Skeleton and Organs in Whole-Body CT Images via Iterative Trilateration DOI 10.1109/tmi.2017.2720261 Typ Journal Article Autor Bieth M Journal IEEE Transactions on Medical Imaging Seiten 2276-2286 -
2017
Titel Predicting Macular Edema Recurrence from Spatio-Temporal Signatures in Optical Coherence Tomography Images DOI 10.1109/tmi.2017.2700213 Typ Journal Article Autor Vogl W Journal IEEE Transactions on Medical Imaging Seiten 1773-1783 -
2017
Titel Mapping Multi-Modal Routine Imaging Data to a Single Reference via Multiple Templates DOI 10.1007/978-3-319-67558-9_39 Typ Book Chapter Autor Hofmanninger J Verlag Springer Nature Seiten 341-348
-
2020
Titel Impact on medical research DOI 10.1016/j.media.2019.07.001 Typ Citation in clinical reviews -
2018
Link
Titel Scientific Advisory Board: European Institute of Biomedical Imaging Research (EIBIR) - GL DOI 10.1186/s13244-019-0684-z Typ Participation in a guidance/advisory committee Link Link
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2017
Link
Titel Additional file 5: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d5 Typ Image Link Link -
2017
Link
Titel Additional file 4: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d4 Typ Image Link Link
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0
Titel Algorithm for lesion detection Typ Technology assay or reagent -
0
Titel Algorithm for predicting emerging and growing lesions in multiple myeloma Typ Technology assay or reagent -
2020
Titel Algorithm for bone segmentation in magnetic resonance imaging data Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich
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2017
Link
Titel Additional file 3: of Analysis of the three-dimensional anatomical variance of the distal radius using 3D shape models DOI 10.6084/m9.figshare.c.3712687_d3 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2020
Link
Titel National TV interview ORF 1 Magazin Newton Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press) Link Link -
2018
Link
Titel Data-Driven Treatment Response Assessment Workshop (DATRA 2018) - a MICCAI 2018 satellite event DOI 10.1007/978-3-030-00807-9 Typ Participation in an activity, workshop or similar Link Link
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2019
Titel 23 invited talks presenting project results in 2019 Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel MICCAI DATRA 2018 Keynote Speaker Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel 14 invited talks presening project results in 2018 Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel President of the MICCAI Student Society Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad Continental/International