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Ein neues Paradigma der genomischen Prägung

A new paradigm for genomic imprinting

Frédéric Berger (ORCID: 0000-0002-3609-8260)
  • Grant-DOI 10.55776/P36231
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.09.2022
  • Projektende 31.08.2026
  • Bewilligungssumme 399.541 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Chromatin, Genome, Marchantia, Epigenetics, Imprinting

Abstract

Die Entwicklung von Embryonen hängt bei vielen Organismen von der Mutter ab. Dies ist bei lebendgebärenden Tieren der Fall, aber auch bei Lebermoosen, die mit den Moosen verwandt sind. Wir haben entdeckt, dass das Lebermoos Marchantia die väterlichen Chromosomen im Embryo unterdrückt. Die Entwicklung des Embryos hängt also in erster Linie von der Expression der mütterlichen Gene ab. Diese Unterdrückung der väterlichen Chromosomen (PCR) wird durch die Ablagerung der repressiven Modifikation des Histon H3 -H3K27me3 vermittelt, einer epigenetischen Markierung, die durch die Zellteilung aufrechterhalten wird. In diesem Vorschlag geht es darum, die Mechanismen zu erforschen, die die PCR in Gang setzen, und herauszufinden, wie die PCR abgebaut wird. Wir werden Biochemie und Genetik einsetzen, um den Prozess zu finden, der das väterliche Genom zum Schweigen bringt, bevor es bei der Befruchtung mit dem mütterlichen Genom verschmilzt. Wir werden untersuchen, wie ein Protein, das an die repressive epigenetische Markierung bindet, an der Aufrechterhaltung der PCR durch räumliche Segregation und Verdichtung des väterlichen Genoms beteiligt ist. Wir werden die Regulierung dieses Proteins identifizieren, die den Zusammenbruch der PCR am Ende der Embryogenese verursacht. Die Untersuchung der PCR wird unser mechanistisches Verständnis der epigenetischen Unterdrückung erweitern und Anhaltspunkte für ähnliche Mechanismen bei lebendgebärenden Tieren liefern.

Forschungsstätte(n)
  • Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology - 100%

Research Output

  • 27 Zitationen
  • 7 Publikationen
  • 1 Datasets & Models
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Nucleosome Positioning Shapes Cryptic Antisense Transcription
    DOI 10.1101/2025.07.14.664753
    Typ Preprint
    Autor Kok J
    Seiten 2025.07.14.664753
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Conservation of chromatin states and their association with transcription factors in land plants
    DOI 10.1101/2025.07.12.664529
    Typ Preprint
    Autor Shukla V
    Seiten 2025.07.12.664529
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The ancestral chromatin landscape of land plants
    DOI 10.1101/2022.10.21.513199
    Typ Preprint
    Autor Hisanaga T
    Seiten 2022.10.21.513199
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Meiosis as a mechanism for epigenetic reprogramming and cellular rejuvenation.
    DOI 10.1242/dev.203046
    Typ Journal Article
    Autor Berger F
    Journal Development (Cambridge, England)
  • 2023
    Titel Paternal imprinting in Marchantia polymorpha
    DOI 10.1111/nph.19377
    Typ Journal Article
    Autor Montgomery S
    Journal New Phytologist
    Seiten 1000-1006
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Epigenetic reprogramming of imprinting at meiosis
    DOI 10.1101/2023.05.17.541143
    Typ Preprint
    Autor Montgomery S
    Seiten 2023.05.17.541143
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The ancestral chromatin landscape of land plants
    DOI 10.1111/nph.19311
    Typ Journal Article
    Autor Hisanaga T
    Journal New Phytologist
    Seiten 2085-2101
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2022 Link
    Titel Cam-2 whole-genome sequencing
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2024
    Titel Keynote for the epigenetic symposium at IPMB
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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