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Ubiquitilierung und Sortierung des PIN2 Auxintransporters in Arabidopsis

Sorting and Ubiquitylation Control of PIN2 Auxin Carrier in Arabidopsis

Christian Luschnig (ORCID: 0000-0003-2099-9280)
  • Grant-DOI 10.55776/P25931
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 08.07.2013
  • Projektende 07.07.2018
  • Bewilligungssumme 324.815 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Auxin, Protein Ubiquitylation, Arabidopsis thaliana, Membrane Protein Sorting, PIN Proteins, Genetic Screen

Abstract Endbericht

Proteine in der zellulären Plasmamembran fungieren als zentrale Schnittstellen in der Kommunikation zwischen Zellen und deren Umgebung. Höhere Pflanzen sind sesshaft, weshalb diese Form der Interaktion eine wichtige Rolle in der Regulation von Anpassungsmechanismen an veränderte Umweltbedingungen spielt. Zugrundeliegende Mechanismen dieser Interaktionen sind aber noch weitgehend unerforscht. Untersuchungen an den PIN Hormontransportproteinen in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana lieferten wichtige Erkenntnisse zur Regulation von Plasmamembranproteinen in höheren Pflanzen. Arbeiten in unserem Labor zeigten, dass Modifikation von PIN Proteinen durch ein weiteres Protein namens Ubiquitin großen Einfluss auf deren Lokalisierung und Proteinstabilität hat. Basierend auf umfassenden Vorarbeiten in denen wir eine Reihe von cis-regulierenden Determinanten der PIN Ubiquitinierung und Degradation charakterisieren konnten, sollen in diesem Projekt trans-agierende Faktoren der Regulation des intrazellulären Transportes und der Degradation von Plasmamembranproteinen identifiziert werden. Dazu verwenden wir PIN2 als Modellprotein und planen, mittels unterschiedlicher genetischer Screening Methoden, Proteine die PIN2 Ubiquitinierung vermitteln bzw. mit ubiquitiertem PIN2 interagieren können, zu identifizieren. Vorliegende Ergebnisse zeigen bereits, dass Regulation von Plasmamembranproteinen durch Ubiquitinierung die Interaktion zwischen Pflanzen und deren Umwelt dramatisch beeinflussen kann. Die geplante tiefergehende Analyse dieser Prozesse in unserem Labor sollte somit zu einem tiefergehenden Verständnis der Mechanismen der Pflanzenadaption an variable Umweltbedingungen entscheidend beitragen.

PIN-FORMED (PIN) Proteine höherer Pflanzen erfüllen eine zentrale Funktion im gerichteten Transport des Wachstumsregulators Auxin durch den gesamten Pflanzenkörper. Dies wird durch ihre asymmetrische Verteilung an der Plasmamembran von Zellen ermöglicht, wodurch letztlich die Richtung des Transports definiert wird. PINs unterliegen einer komplexen Regulation, was Änderungen in Intensität und Ausrichtung des Auxintransports erlaubt. In diesem Projekt haben wir uns zum Ziel gesetzt, Signalwege zu charakterisieren, die Internalisierung und den proteolytischen Abbau des wurzelspezifischen PIN2-Proteins in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana kontrollieren. Unter Zuhilfenahme einer konstitutiv degradierten Version von PIN2 haben wir genetische Determinanten identifiziert, die die Stabilisierung dieses instabilen Reporterproteines bewirken. Zusätzlich konnte das Pflanzensteroidhormon Brassinosteroid als stabilisierender Faktor identifiziert werden. Dies spielt vor allem in jenen Wurzeln eine Rolle, die ihr Wachstum im Gravitationsfeld der Erde ausrichten. Durch Verwendung einer Kombination zellbiologischer Methoden und mathematischen Modellierungsansätzen konnten wir einen Mechanismus definieren, durch den die Pflanze den Effekt von Gravitationssignalen auf gerichtetes Wachstums mittels Brassinosteroidsignalen reguliert.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%

Research Output

  • 568 Zitationen
  • 16 Publikationen
Publikationen
  • 2015
    Titel Meta-regulation of Arabidopsis Auxin Responses Depends on tRNA Maturation
    DOI 10.1016/j.celrep.2015.03.054
    Typ Journal Article
    Autor Leitner J
    Journal Cell Reports
    Seiten 516-526
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Evolutionary Conserved Cysteines Function as cis-Acting Regulators of Arabidopsis PIN-FORMED 2 Distribution
    DOI 10.3390/ijms18112274
    Typ Journal Article
    Autor Retzer K
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 2274
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Endosomally Localized RGLG-Type E3 RING-Finger Ligases Modulate Sorting of Ubiquitylation-Mimic PIN2
    DOI 10.3390/ijms23126767
    Typ Journal Article
    Autor Retzer K
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 6767
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Magnetic Fields Impact on PIN-FORMED Protein Polarity in Arabidopsis thaliana
    DOI 10.1111/ppl.70274
    Typ Journal Article
    Autor Shabrangy A
    Journal Physiologia Plantarum
    Link Publikation
  • 2022
    Titel WAVY GROWTH Arabidopsis E3 ubiquitin ligases affect apical PIN sorting decisions
    DOI 10.1038/s41467-022-32888-8
    Typ Journal Article
    Autor Konstantinova N
    Journal Nature Communications
    Seiten 5147
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Brassinosteroid signaling delimits root gravitropism via sorting of the Arabidopsis PIN2 auxin transporter
    DOI 10.1038/s41467-019-13543-1
    Typ Journal Article
    Autor Retzer K
    Journal Nature Communications
    Seiten 5516
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Ubiquitin Lys 63 chains – second-most abundant, but poorly understood in plants
    DOI 10.3389/fpls.2014.00015
    Typ Journal Article
    Autor Tomanov K
    Journal Frontiers in Plant Science
    Seiten 15
    Link Publikation
  • 2014
    Titel The dynamics of plant plasma membrane proteins: PINs and beyond
    DOI 10.1242/dev.103424
    Typ Journal Article
    Autor Luschnig C
    Journal Development
    Seiten 2924-2938
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Expression analysis of Arabidopsis XH/XS-domain proteins indicates overlapping and distinct functions for members of this gene family
    DOI 10.1093/jxb/ert480
    Typ Journal Article
    Autor Butt H
    Journal Journal Of Experimental Botany
    Seiten 1217-1227
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Ubiquitylation-Mediated Control of Polar Auxin Transport: Analysis of Arabidopsis PIN2 Auxin Transport Protein
    DOI 10.1007/978-1-4939-1420-3_18
    Typ Book Chapter
    Autor Leitner J
    Verlag Springer Nature
    Seiten 233-249
  • 2016
    Titel RETRACTED ARTICLE: PPP1, a plant-specific regulator of transcription controls Arabidopsis development and PIN expression
    DOI 10.1038/srep32196
    Typ Journal Article
    Autor Benjamins R
    Journal Scientific Reports
    Seiten 32196
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Genome-wide landscape of DNA methylomes and their relationship with mRNA and miRNA transcriptomes in oxidative and glycolytic skeletal muscles
    DOI 10.1038/srep32186
    Typ Journal Article
    Autor Shen L
    Journal Scientific Reports
    Seiten 32186
    Link Publikation
  • 2015
    Titel DIAGEOTROPICA: news from the auxin swamp
    DOI 10.1016/j.tplants.2015.04.009
    Typ Journal Article
    Autor Retzer K
    Journal Trends in Plant Science
    Seiten 328-329
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Plasma Membrane Protein Ubiquitylation and Degradation as Determinants of Positional Growth in Plants
    DOI 10.1111/jipb.12059
    Typ Journal Article
    Autor Korbei B
    Journal Journal of Integrative Plant Biology
    Seiten 809-823
  • 2013
    Titel The far side of auxin signaling: fundamental cellular activities and their contribution to a defined growth response in plants
    DOI 10.1007/s00709-013-0572-1
    Typ Journal Article
    Autor Retzer K
    Journal Protoplasma
    Seiten 731-746
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Arabidopsis TOL Proteins Act as Gatekeepers for Vacuolar Sorting of PIN2 Plasma Membrane Protein
    DOI 10.1016/j.cub.2013.10.036
    Typ Journal Article
    Autor Korbei B
    Journal Current Biology
    Seiten 2500-2505
    Link Publikation

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