Ubiquitilierung und Sortierung des PIN2 Auxintransporters in Arabidopsis
Sorting and Ubiquitylation Control of PIN2 Auxin Carrier in Arabidopsis
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Auxin,
Protein Ubiquitylation,
Arabidopsis thaliana,
Membrane Protein Sorting,
PIN Proteins,
Genetic Screen
Proteine in der zellulären Plasmamembran fungieren als zentrale Schnittstellen in der Kommunikation zwischen Zellen und deren Umgebung. Höhere Pflanzen sind sesshaft, weshalb diese Form der Interaktion eine wichtige Rolle in der Regulation von Anpassungsmechanismen an veränderte Umweltbedingungen spielt. Zugrundeliegende Mechanismen dieser Interaktionen sind aber noch weitgehend unerforscht. Untersuchungen an den PIN Hormontransportproteinen in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana lieferten wichtige Erkenntnisse zur Regulation von Plasmamembranproteinen in höheren Pflanzen. Arbeiten in unserem Labor zeigten, dass Modifikation von PIN Proteinen durch ein weiteres Protein namens Ubiquitin großen Einfluss auf deren Lokalisierung und Proteinstabilität hat. Basierend auf umfassenden Vorarbeiten in denen wir eine Reihe von cis-regulierenden Determinanten der PIN Ubiquitinierung und Degradation charakterisieren konnten, sollen in diesem Projekt trans-agierende Faktoren der Regulation des intrazellulären Transportes und der Degradation von Plasmamembranproteinen identifiziert werden. Dazu verwenden wir PIN2 als Modellprotein und planen, mittels unterschiedlicher genetischer Screening Methoden, Proteine die PIN2 Ubiquitinierung vermitteln bzw. mit ubiquitiertem PIN2 interagieren können, zu identifizieren. Vorliegende Ergebnisse zeigen bereits, dass Regulation von Plasmamembranproteinen durch Ubiquitinierung die Interaktion zwischen Pflanzen und deren Umwelt dramatisch beeinflussen kann. Die geplante tiefergehende Analyse dieser Prozesse in unserem Labor sollte somit zu einem tiefergehenden Verständnis der Mechanismen der Pflanzenadaption an variable Umweltbedingungen entscheidend beitragen.
PIN-FORMED (PIN) Proteine höherer Pflanzen erfüllen eine zentrale Funktion im gerichteten Transport des Wachstumsregulators Auxin durch den gesamten Pflanzenkörper. Dies wird durch ihre asymmetrische Verteilung an der Plasmamembran von Zellen ermöglicht, wodurch letztlich die Richtung des Transports definiert wird. PINs unterliegen einer komplexen Regulation, was Änderungen in Intensität und Ausrichtung des Auxintransports erlaubt. In diesem Projekt haben wir uns zum Ziel gesetzt, Signalwege zu charakterisieren, die Internalisierung und den proteolytischen Abbau des wurzelspezifischen PIN2-Proteins in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana kontrollieren. Unter Zuhilfenahme einer konstitutiv degradierten Version von PIN2 haben wir genetische Determinanten identifiziert, die die Stabilisierung dieses instabilen Reporterproteines bewirken. Zusätzlich konnte das Pflanzensteroidhormon Brassinosteroid als stabilisierender Faktor identifiziert werden. Dies spielt vor allem in jenen Wurzeln eine Rolle, die ihr Wachstum im Gravitationsfeld der Erde ausrichten. Durch Verwendung einer Kombination zellbiologischer Methoden und mathematischen Modellierungsansätzen konnten wir einen Mechanismus definieren, durch den die Pflanze den Effekt von Gravitationssignalen auf gerichtetes Wachstums mittels Brassinosteroidsignalen reguliert.
Research Output
- 568 Zitationen
- 16 Publikationen
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2015
Titel Meta-regulation of Arabidopsis Auxin Responses Depends on tRNA Maturation DOI 10.1016/j.celrep.2015.03.054 Typ Journal Article Autor Leitner J Journal Cell Reports Seiten 516-526 Link Publikation -
2017
Titel Evolutionary Conserved Cysteines Function as cis-Acting Regulators of Arabidopsis PIN-FORMED 2 Distribution DOI 10.3390/ijms18112274 Typ Journal Article Autor Retzer K Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 2274 Link Publikation -
2022
Titel Endosomally Localized RGLG-Type E3 RING-Finger Ligases Modulate Sorting of Ubiquitylation-Mimic PIN2 DOI 10.3390/ijms23126767 Typ Journal Article Autor Retzer K Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 6767 Link Publikation -
2025
Titel Magnetic Fields Impact on PIN-FORMED Protein Polarity in Arabidopsis thaliana DOI 10.1111/ppl.70274 Typ Journal Article Autor Shabrangy A Journal Physiologia Plantarum Link Publikation -
2022
Titel WAVY GROWTH Arabidopsis E3 ubiquitin ligases affect apical PIN sorting decisions DOI 10.1038/s41467-022-32888-8 Typ Journal Article Autor Konstantinova N Journal Nature Communications Seiten 5147 Link Publikation -
2019
Titel Brassinosteroid signaling delimits root gravitropism via sorting of the Arabidopsis PIN2 auxin transporter DOI 10.1038/s41467-019-13543-1 Typ Journal Article Autor Retzer K Journal Nature Communications Seiten 5516 Link Publikation -
2014
Titel Ubiquitin Lys 63 chains – second-most abundant, but poorly understood in plants DOI 10.3389/fpls.2014.00015 Typ Journal Article Autor Tomanov K Journal Frontiers in Plant Science Seiten 15 Link Publikation -
2014
Titel The dynamics of plant plasma membrane proteins: PINs and beyond DOI 10.1242/dev.103424 Typ Journal Article Autor Luschnig C Journal Development Seiten 2924-2938 Link Publikation -
2014
Titel Expression analysis of Arabidopsis XH/XS-domain proteins indicates overlapping and distinct functions for members of this gene family DOI 10.1093/jxb/ert480 Typ Journal Article Autor Butt H Journal Journal Of Experimental Botany Seiten 1217-1227 Link Publikation -
2014
Titel Ubiquitylation-Mediated Control of Polar Auxin Transport: Analysis of Arabidopsis PIN2 Auxin Transport Protein DOI 10.1007/978-1-4939-1420-3_18 Typ Book Chapter Autor Leitner J Verlag Springer Nature Seiten 233-249 -
2016
Titel RETRACTED ARTICLE: PPP1, a plant-specific regulator of transcription controls Arabidopsis development and PIN expression DOI 10.1038/srep32196 Typ Journal Article Autor Benjamins R Journal Scientific Reports Seiten 32196 Link Publikation -
2016
Titel Genome-wide landscape of DNA methylomes and their relationship with mRNA and miRNA transcriptomes in oxidative and glycolytic skeletal muscles DOI 10.1038/srep32186 Typ Journal Article Autor Shen L Journal Scientific Reports Seiten 32186 Link Publikation -
2015
Titel DIAGEOTROPICA: news from the auxin swamp DOI 10.1016/j.tplants.2015.04.009 Typ Journal Article Autor Retzer K Journal Trends in Plant Science Seiten 328-329 Link Publikation -
2013
Titel Plasma Membrane Protein Ubiquitylation and Degradation as Determinants of Positional Growth in Plants DOI 10.1111/jipb.12059 Typ Journal Article Autor Korbei B Journal Journal of Integrative Plant Biology Seiten 809-823 -
2013
Titel The far side of auxin signaling: fundamental cellular activities and their contribution to a defined growth response in plants DOI 10.1007/s00709-013-0572-1 Typ Journal Article Autor Retzer K Journal Protoplasma Seiten 731-746 Link Publikation -
2013
Titel Arabidopsis TOL Proteins Act as Gatekeepers for Vacuolar Sorting of PIN2 Plasma Membrane Protein DOI 10.1016/j.cub.2013.10.036 Typ Journal Article Autor Korbei B Journal Current Biology Seiten 2500-2505 Link Publikation