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Genom-Freisetzung von Viren

Viral Genome Release

Dieter Blaas (ORCID: 0000-0002-9612-3376)
  • Grant-DOI 10.55776/P20915
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2008
  • Projektende 30.09.2013
  • Bewilligungssumme 328.870 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (20%); Gesundheitswissenschaften (80%)

Keywords

    Rhinovirus, Cryo-Electron Microscopy, RNA release, Membrane, Uncoating, Receptor

Abstract Endbericht

Virale Infektionen beginnen mit der spezifischen Bindung des Pathogens an Wirtszellrezeptoren. Daraufhin entlässt das Virus sein Genom ins Zytoplasma. Dies geschieht entweder direkt von der Plasmamembran aus oder nach Eintritt in Endosomen, in das endoplasmatische Retikulum oder in den Golgi auf einer Reihe von möglichen Wegen. Im Falle von lipid-umhüllten Viren ist der Prozess des Eindringens und des Transportes des Genoms ins Zytosol relativ gut bekannt. Jedoch im Fall von nackten Viren gibt es viele offene Fragen: Auf welchen Wegen dringen die Viren in die Zelle ein? Welche Rezeptoren sind daran beteiligt? Wie und wo verlässt das Genom das Virus und dringt daraufhin ins Zytoplasma ein? Ist dieser Prozess gerichtet (d.h. mit welchem Ende verlässt die Nukleinsäure zuerst das virale Kapsid)? Welche Kraft treibt diesen Prozess und wie schnell ist er? Welche Rolle spielen die Rezeptoren in der Freisetzung des Genoms und in dessen Eindringen in die Zelle? Dringt die Nukleinsäure durch eine Pore ein oder wird die endosomale Membrane einfach zerrissen? Wir schlagen vor, diese Fragen unter Verwendung von Rhinoviren des Menschen, den Erregern des Schnupfens als Modellsystem zu untersuchen. Diese kleinen, ikosahedrischen, nackten Viren zirkulieren in Form von mehr als 100 verschiedenen Genotypen in der Population, was zu immer wiederkehrenden Infektionen Anlass gibt. Obwohl strukturell als auch funktionell nahe verwandt, binden Rhinoviren an verschiedene Rezeptoren. Diese leiten sie in unterschiedliche Internalisierungswege und bewirken, dass das Genom von verschiedenen Kompartimenten aus ins Zytoplasma gelangt. Ein besseres Verständnis dieser frühen Prozesse der viralen Infektion könnte den Weg für neue Strategien der Intervention bereiten.

Schnupfenviren sind in der Regel relativ harmlos, können aber in Kombination mit Asthma, chronischer obstruktiver Lungenerkrankung oder zystischer Fibrose sehr gefährlich werden. Außerdem ist ihr ökonomischer Schaden durch Krankenstände und (meist unwirksame Medikamente) enorm. Der erste Schritt zur Infektion ist die Anheftung des Virus an einen Rezeptor in der Zellmembran und die Aufnahme in Endosomen. In diesen Membran-umgebenen Zellorganellen kommt es zu einer Strukturänderung und der Abgabe des RNA Genoms, das durch die endosomale Membran ins Zytoplasma transportiert wird, wo die Replikation stattfindet. Wir untersuchten diese ersten Schritte der Infektion mit strukturbiologischen Methoden. Dazu etablierten wir zunächst ein in vitro System das es erlaubte den RNA Transport vom Virusinneren ins Innere eines Liposoms zu demonstrieren. Daraufhin konnten wir die 3-dimensionale (3D) Struktur jener subviralen Partikel aufklären, die den Übergang zwischen nativem Virus und dem leeren Kapsid darstellen. Unter anderem konnten wir zeigen, dass sich die Faltung des RNA Genoms bei der Vorbereitung zum Verlassen des Virions stark verändert. Diese Konformationsänderungen erscheinen daher zur Feinabstimmung ihres Austritts aus dem Virion notwendig. Des Weiteren konnten wir die 3D Struktur von Membran-gebundenen Viren auflösen; sie erklärt, wie die instabile RNA vom Inneren des Virions ins Zytoplasma gelangt wo sie vervielfältigt wird, ohne jemals den aggressiven Enzymen im Lumen des späten Endosomes ausgesetzt zu sein. Unsere Arbeit umreißt die Dynamik der Strukturänderung vom Virion zum subviralen Partikel und von diesem schließlich zum leeren Kapsid und erklärt wie diese frühen Ereignisse zur Infektion führen.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Yuri Drygin, Lomonosov Moscow State University - Russland
  • Nuria Verdaguer, Spanish National Research Council - Spanien

Research Output

  • 521 Zitationen
  • 13 Publikationen
Publikationen
  • 2012
    Titel Productive Entry Pathways of Human Rhinoviruses
    DOI 10.1155/2012/826301
    Typ Journal Article
    Autor Fuchs R
    Journal Advances in Virology
    Seiten 826301
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Insights into Minor Group Rhinovirus Uncoating: The X-ray Structure of the HRV2 Empty Capsid
    DOI 10.1371/journal.ppat.1002473
    Typ Journal Article
    Autor Garriga D
    Journal PLoS Pathogens
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Characterization of rhinovirus subviral A particles via capillary electrophoresis, electron microscopy and gas-phase electrophoretic mobility molecular analysis: Part I
    DOI 10.1002/elps.201100647
    Typ Journal Article
    Autor Weiss V
    Journal ELECTROPHORESIS
    Seiten 1833-1841
  • 2013
    Titel Human Rhinovirus Subviral A Particle Binds to Lipid Membranes over a Twofold Axis of Icosahedral Symmetry
    DOI 10.1128/jvi.02055-13
    Typ Journal Article
    Autor Kumar M
    Journal Journal of Virology
    Seiten 11309-11312
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Liposomal Nanocontainers as Models for Viral Infection: Monitoring Viral Genomic RNA Transfer through Lipid Membranes
    DOI 10.1128/jvi.00329-11
    Typ Journal Article
    Autor Bilek G
    Journal Journal of Virology
    Seiten 8368-8375
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Recent developments in capillary and chip electrophoresis of bioparticles: Viruses, organelles, and cells
    DOI 10.1002/elps.201100048
    Typ Journal Article
    Autor Subirats X
    Journal ELECTROPHORESIS
    Seiten 1579-1590
  • 2013
    Titel Viral Uncoating Is Directional: Exit of the Genomic RNA in a Common Cold Virus Starts with the Poly-(A) Tail at the 3'-End
    DOI 10.1371/journal.ppat.1003270
    Typ Journal Article
    Autor Harutyunyan S
    Journal PLoS Pathogens
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Uncoating of common cold virus is preceded by RNA switching as determined by X-ray and cryo-EM analyses of the subviral A-particle
    DOI 10.1073/pnas.1312128110
    Typ Journal Article
    Autor Pickl-Herk A
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 20063-20068
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Liposomal Leakage Induced by Virus-Derived Peptides, Viral Proteins, and Entire Virions: Rapid Analysis by Chip Electrophoresis
    DOI 10.1021/ac101435v
    Typ Journal Article
    Autor Weiss V
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 8146-8152
  • 2014
    Titel IgGs are made for walking on bacterial and viral surfaces
    DOI 10.1038/ncomms5394
    Typ Journal Article
    Autor Preiner J
    Journal Nature Communications
    Seiten 4394
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Analysis of a Common Cold Virus and Its Subviral Particles by Gas-Phase Electrophoretic Mobility Molecular Analysis and Native Mass Spectrometry
    DOI 10.1021/acs.analchem.5b01450
    Typ Journal Article
    Autor Weiss V
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 8709-8717
    Link Publikation
  • 2014
    Titel The Rhinovirus Subviral A-Particle Exposes 3'-Terminal Sequences of Its Genomic RNA
    DOI 10.1128/jvi.00539-14
    Typ Journal Article
    Autor Harutyunyan S
    Journal Journal of Virology
    Seiten 6307-6317
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Characterization of rhinovirus subviral A particles via capillary electrophoresis, electron microscopy and gas phase electrophoretic mobility molecular analysis: Part II
    DOI 10.1002/elps.201200686
    Typ Journal Article
    Autor Subirats X
    Journal ELECTROPHORESIS
    Seiten 1600-1609

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