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Funktionelle Genomik von Säureresistenz und Stress in Hefe

Functional Genomics of Weak Acid Stress Response in Yeast

Karl Kuchler (ORCID: 0000-0003-2719-5955)
  • Grant-DOI 10.55776/P15934
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.12.2002
  • Projektende 30.11.2006
  • Bewilligungssumme 398.564 €

Wissenschaftsdisziplinen

Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (20%); Biologie (60%); Medizinische Biotechnologie (20%)

Keywords

    Functional Genomics, Functions Proteomics, Signal Transduction, Stress Response, Transcriptional Factors, ABC Gene Regulation

Abstract Endbericht

Dieses Forschungsprojekt umfasst die Analyse von Resistenzmechanismen der Bäckerhefe gegen Konservierungsstoffe wie zum Beispiel Sorbinsäure oder Benzoesäure. Solche Resistenzen können zu grossen Problemen in der Lagerung von Lebensmitteln führen, da in Hefezellen durch Säurestress induzierte Resistenzen entstehen können. Diese verhindern den Einsatz von geringeren Konzentrationen von Konservierungsstoffen in Lebensmitteln. Tatsächlich zerstört mikrobieller Befall durch säureresistente Bakterien und Hefen etwa ein Viertel aller gelagerten Lebensmittel, was jährlich zu ungeheuer grossen wirtschaftlichen Schäden führt. Der tägliche Konsum von signifikanten Mengen an Konservierungsstoffen spielt auch in der menschlichen Ernährung eine wichtige Rolle. Deren völlige Unbedenklichkeit ist jedoch nicht eindeutig belegt, zumal vor allem Sorbinsäure und Benzoesäure "Pro-Oxidantien" darstellen die nach zellulärer Aufnahme die mitochondriale Erbinformation durch oxidativen schädigen können. Da oxidativer Stress natürlich auch in der Krebsentstehung eine Rolle spielt, wird die Notwendigkeit einer effizienteren Lebensmittelkonservierung ersichtlich. Wir werden daher in einem globalen Ansatz alle Gene der Bäckerhefe identifizieren die Resistenzen gegen schwache organische Säuren wie Sorbat oder Benzoat vermitteln. Die für diese Säureresistenzen bzw. für die zelluläre Stressantwort verantworlichen Gene werden mittels DNA Genomchips identifiziert und auf molekularer Ebene analysiert. Dabei werden erstmals die molekularen Mechanismen und Komponenten der zellulären Stressantwort gegen Konservierungsstoffe definiert. Weiters erfolgt die Analyse einer neuen Signalkaskade, die die induzierte Expression des Pdr12p Säuretransporters in Hefezellen vermittelt. Der Pdr12p "ATP-Binding Cassette" (ABC) Transporter führt bei erhöhter Expression zu ausgeprägter Säureresistenz. Schlussendlich wird der Wirkmechanismus eines neuen von unserer Gruppe erst kürzlich identifizierten Regulators der Säureresistenz, War1p, im Detail untersucht. Der in diesem Projekt gewählte globale Ansatz der funktionellen Genomik wird daher alle Hefegene identifizieren die Toleranz gegen Konservierungsstoffe vermitteln. Damit werden die molekularen Mechanismen der adaptiven Stressantwort gegen schwache organische Säuren in der Bäckerhefe entschlüsselt, woraus möglicherweise neue Strategien für die Vermeidung von Resistenzen gegen Lebensmittelkonservierungsstoffe entwickelt werden können.

Dieses Forschungsprojekt umfasste die Analyse von Resistenzmechanismen der Bäckerhefe gegen Konservierungsstoffe wie zum Beispiel Sorbinsäure oder Benzoesäure. Es wurden daher in einem globalen Ansatz alle Gene der Bäckerhefe identifiziert die Resistenzen oder Toleranz gegen schwache organische Säuren wie Sorbinsäure oder Benzoesäure vermitteln. Die für diese Säureresistenzen bzw. für die zelluläre Stressantwort verantworlichen Gene wurden mittels Genomchips identifiziert und auf molekularer Ebene analysiert. Dabei werden erstmals die molekularen Mechanismen und Komponenten der zellulären Stressantwort gegen Konservierungsstoffe in Hefe identifiziert. Weiters erfolgte die Analyse einer neuen Signalkaskade, welche die vermehrte Produktion des Pdr12p Säuretransporters in der Zelloberfläche in Hefezellen vorantreibt. Der Pdr12p "ATP-Binding Cassette" (ABC) Transporter führt bei erhöhter Produktion zu ausgeprägter Säureresistenz, ist aber auch für das Wachstum von Hefezellen in Gegenwart von Stresssubatnzen wie schwachen Säuren notwendig. Schlussendlich wurde in dem Projekt ein neuer Genegulator der Säureresistenz, War1p, identifiziert und im Detail charakterisiert. Damit wurden die molekularen Mechanismen der adaptiven Stressantwort gegen schwache organische Säuren in der Bäckerhefe auf molekularer Ebene entschlüsselt, woraus möglicherweise neue Strategien für die Vermeidung von Resistenzen gegen Lebensmittelkonservierungsstoffe entwickelt werden können.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Peter W. Piper, The University of Sheffield - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 1172 Zitationen
  • 14 Publikationen
Publikationen
  • 2007
    Titel Membrane-active Compounds Activate the Transcription Factors Pdr1 and Pdr3 Connecting Pleiotropic Drug Resistance and Membrane Lipid Homeostasis in Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1091/mbc.e07-06-0610
    Typ Journal Article
    Autor Schüller C
    Journal Molecular Biology of the Cell
    Seiten 4932-4944
    Link Publikation
  • 2006
    Titel High Pdr12 levels in spoilage yeast (Saccharomyces cerevisiae) correlate directly with sorbic acid levels in the culture medium but are not sufficient to provide cells with acquired resistance to the food preservative
    DOI 10.1016/j.ijfoodmicro.2006.06.035
    Typ Journal Article
    Autor Papadimitriou M
    Journal International Journal of Food Microbiology
    Seiten 173-179
  • 2005
    Titel Yeast ATP-Binding Cassette Transporters: Cellular Cleaning Pumps
    DOI 10.1016/s0076-6879(05)00026-1
    Typ Book Chapter
    Autor Ernst R
    Verlag Elsevier
    Seiten 460-484
  • 2008
    Titel Weak Organic Acids Trigger Conformational Changes of the Yeast Transcription Factor War1 in Vivo to Elicit Stress Adaptation*
    DOI 10.1074/jbc.m803095200
    Typ Journal Article
    Autor Gregori C
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 25752-25764
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Loss of peroxisome function triggers necrosis
    DOI 10.1016/j.febslet.2008.07.023
    Typ Journal Article
    Autor Jungwirth H
    Journal FEBS Letters
    Seiten 2882-2886
  • 2005
    Titel Yeast ABC transporters – A tale of sex, stress, drugs and aging
    DOI 10.1016/j.febslet.2005.12.050
    Typ Journal Article
    Autor Jungwirth H
    Journal FEBS Letters
    Seiten 1131-1138
  • 2004
    Titel Expression regulation of the yeast PDR5 ATP-binding cassette (ABC) transporter suggests a role in cellular detoxification during the exponential growth phase
    DOI 10.1016/s0014-5793(04)00046-8
    Typ Journal Article
    Autor Mamnun Y
    Journal FEBS Letters
    Seiten 111-117
  • 2004
    Titel Screening the yeast deletant mutant collection for hypersensitivity and hyper-resistance to sorbate, a weak organic acid food preservative
    DOI 10.1002/yea.1141
    Typ Journal Article
    Autor Mollapour M
    Journal Yeast
    Seiten 927-946
  • 2003
    Titel Reversal of antifungal resistance mediated by ABC efflux pumps from Candida albicans functionally expressed in yeast
    DOI 10.1016/s0924-8579(03)00213-9
    Typ Journal Article
    Autor Schuetzer-Muehlbauer M
    Journal International Journal of Antimicrobial Agents
    Seiten 291-300
  • 2003
    Titel Global Phenotypic Analysis and Transcriptional Profiling Defines the Weak Acid Stress Response Regulon in Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1091/mbc.e03-05-0322
    Typ Journal Article
    Autor Schüller C
    Journal Molecular Biology of the Cell
    Seiten 706-720
    Link Publikation
  • 2003
    Titel The Yeast Protein Kinase C Cell Integrity Pathway Mediates Tolerance to the Antifungal Drug Caspofungin through Activation of Slt2p Mitogen-Activated Protein Kinase Signaling†
    DOI 10.1128/ec.2.6.1200-1210.2003
    Typ Journal Article
    Autor Reinoso-Martín C
    Journal Eukaryotic Cell
    Seiten 1200-1210
    Link Publikation
  • 2003
    Titel War1p, a Novel Transcription Factor Controlling Weak Acid Stress Response in Yeast
    DOI 10.1128/mcb.23.5.1775-1785.2003
    Typ Journal Article
    Autor Kren A
    Journal Molecular and Cellular Biology
    Seiten 1775-1785
    Link Publikation
  • 2003
    Titel The CRG1 gene required for resistance to the singlet oxygen-generating cercosporin toxin in Cercospora nicotianae encodes a putative fungal transcription factor
    DOI 10.1016/s0006-291x(03)00171-2
    Typ Journal Article
    Autor Chung K
    Journal Biochemical and Biophysical Research Communications
    Seiten 302-310
  • 2003
    Titel Moderately lipophilic carboxylate compounds are the selective inducers of the Saccharomyces cerevisiae Pdr12p ATP-binding cassette transporter
    DOI 10.1002/yea.981
    Typ Journal Article
    Autor Hatzixanthis K
    Journal Yeast
    Seiten 575-585

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