Funktionelle Genomik von Säureresistenz und Stress in Hefe
Functional Genomics of Weak Acid Stress Response in Yeast
Wissenschaftsdisziplinen
Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (20%); Biologie (60%); Medizinische Biotechnologie (20%)
Keywords
-
Functional Genomics,
Functions Proteomics,
Signal Transduction,
Stress Response,
Transcriptional Factors,
ABC Gene Regulation
Dieses Forschungsprojekt umfasst die Analyse von Resistenzmechanismen der Bäckerhefe gegen Konservierungsstoffe wie zum Beispiel Sorbinsäure oder Benzoesäure. Solche Resistenzen können zu grossen Problemen in der Lagerung von Lebensmitteln führen, da in Hefezellen durch Säurestress induzierte Resistenzen entstehen können. Diese verhindern den Einsatz von geringeren Konzentrationen von Konservierungsstoffen in Lebensmitteln. Tatsächlich zerstört mikrobieller Befall durch säureresistente Bakterien und Hefen etwa ein Viertel aller gelagerten Lebensmittel, was jährlich zu ungeheuer grossen wirtschaftlichen Schäden führt. Der tägliche Konsum von signifikanten Mengen an Konservierungsstoffen spielt auch in der menschlichen Ernährung eine wichtige Rolle. Deren völlige Unbedenklichkeit ist jedoch nicht eindeutig belegt, zumal vor allem Sorbinsäure und Benzoesäure "Pro-Oxidantien" darstellen die nach zellulärer Aufnahme die mitochondriale Erbinformation durch oxidativen schädigen können. Da oxidativer Stress natürlich auch in der Krebsentstehung eine Rolle spielt, wird die Notwendigkeit einer effizienteren Lebensmittelkonservierung ersichtlich. Wir werden daher in einem globalen Ansatz alle Gene der Bäckerhefe identifizieren die Resistenzen gegen schwache organische Säuren wie Sorbat oder Benzoat vermitteln. Die für diese Säureresistenzen bzw. für die zelluläre Stressantwort verantworlichen Gene werden mittels DNA Genomchips identifiziert und auf molekularer Ebene analysiert. Dabei werden erstmals die molekularen Mechanismen und Komponenten der zellulären Stressantwort gegen Konservierungsstoffe definiert. Weiters erfolgt die Analyse einer neuen Signalkaskade, die die induzierte Expression des Pdr12p Säuretransporters in Hefezellen vermittelt. Der Pdr12p "ATP-Binding Cassette" (ABC) Transporter führt bei erhöhter Expression zu ausgeprägter Säureresistenz. Schlussendlich wird der Wirkmechanismus eines neuen von unserer Gruppe erst kürzlich identifizierten Regulators der Säureresistenz, War1p, im Detail untersucht. Der in diesem Projekt gewählte globale Ansatz der funktionellen Genomik wird daher alle Hefegene identifizieren die Toleranz gegen Konservierungsstoffe vermitteln. Damit werden die molekularen Mechanismen der adaptiven Stressantwort gegen schwache organische Säuren in der Bäckerhefe entschlüsselt, woraus möglicherweise neue Strategien für die Vermeidung von Resistenzen gegen Lebensmittelkonservierungsstoffe entwickelt werden können.
Dieses Forschungsprojekt umfasste die Analyse von Resistenzmechanismen der Bäckerhefe gegen Konservierungsstoffe wie zum Beispiel Sorbinsäure oder Benzoesäure. Es wurden daher in einem globalen Ansatz alle Gene der Bäckerhefe identifiziert die Resistenzen oder Toleranz gegen schwache organische Säuren wie Sorbinsäure oder Benzoesäure vermitteln. Die für diese Säureresistenzen bzw. für die zelluläre Stressantwort verantworlichen Gene wurden mittels Genomchips identifiziert und auf molekularer Ebene analysiert. Dabei werden erstmals die molekularen Mechanismen und Komponenten der zellulären Stressantwort gegen Konservierungsstoffe in Hefe identifiziert. Weiters erfolgte die Analyse einer neuen Signalkaskade, welche die vermehrte Produktion des Pdr12p Säuretransporters in der Zelloberfläche in Hefezellen vorantreibt. Der Pdr12p "ATP-Binding Cassette" (ABC) Transporter führt bei erhöhter Produktion zu ausgeprägter Säureresistenz, ist aber auch für das Wachstum von Hefezellen in Gegenwart von Stresssubatnzen wie schwachen Säuren notwendig. Schlussendlich wurde in dem Projekt ein neuer Genegulator der Säureresistenz, War1p, identifiziert und im Detail charakterisiert. Damit wurden die molekularen Mechanismen der adaptiven Stressantwort gegen schwache organische Säuren in der Bäckerhefe auf molekularer Ebene entschlüsselt, woraus möglicherweise neue Strategien für die Vermeidung von Resistenzen gegen Lebensmittelkonservierungsstoffe entwickelt werden können.
- Peter W. Piper, The University of Sheffield - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 1172 Zitationen
- 14 Publikationen
-
2007
Titel Membrane-active Compounds Activate the Transcription Factors Pdr1 and Pdr3 Connecting Pleiotropic Drug Resistance and Membrane Lipid Homeostasis in Saccharomyces cerevisiae DOI 10.1091/mbc.e07-06-0610 Typ Journal Article Autor Schüller C Journal Molecular Biology of the Cell Seiten 4932-4944 Link Publikation -
2006
Titel High Pdr12 levels in spoilage yeast (Saccharomyces cerevisiae) correlate directly with sorbic acid levels in the culture medium but are not sufficient to provide cells with acquired resistance to the food preservative DOI 10.1016/j.ijfoodmicro.2006.06.035 Typ Journal Article Autor Papadimitriou M Journal International Journal of Food Microbiology Seiten 173-179 -
2005
Titel Yeast ATP-Binding Cassette Transporters: Cellular Cleaning Pumps DOI 10.1016/s0076-6879(05)00026-1 Typ Book Chapter Autor Ernst R Verlag Elsevier Seiten 460-484 -
2008
Titel Weak Organic Acids Trigger Conformational Changes of the Yeast Transcription Factor War1 in Vivo to Elicit Stress Adaptation* DOI 10.1074/jbc.m803095200 Typ Journal Article Autor Gregori C Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 25752-25764 Link Publikation -
2008
Titel Loss of peroxisome function triggers necrosis DOI 10.1016/j.febslet.2008.07.023 Typ Journal Article Autor Jungwirth H Journal FEBS Letters Seiten 2882-2886 -
2005
Titel Yeast ABC transporters – A tale of sex, stress, drugs and aging DOI 10.1016/j.febslet.2005.12.050 Typ Journal Article Autor Jungwirth H Journal FEBS Letters Seiten 1131-1138 -
2004
Titel Expression regulation of the yeast PDR5 ATP-binding cassette (ABC) transporter suggests a role in cellular detoxification during the exponential growth phase DOI 10.1016/s0014-5793(04)00046-8 Typ Journal Article Autor Mamnun Y Journal FEBS Letters Seiten 111-117 -
2004
Titel Screening the yeast deletant mutant collection for hypersensitivity and hyper-resistance to sorbate, a weak organic acid food preservative DOI 10.1002/yea.1141 Typ Journal Article Autor Mollapour M Journal Yeast Seiten 927-946 -
2003
Titel Reversal of antifungal resistance mediated by ABC efflux pumps from Candida albicans functionally expressed in yeast DOI 10.1016/s0924-8579(03)00213-9 Typ Journal Article Autor Schuetzer-Muehlbauer M Journal International Journal of Antimicrobial Agents Seiten 291-300 -
2003
Titel Global Phenotypic Analysis and Transcriptional Profiling Defines the Weak Acid Stress Response Regulon in Saccharomyces cerevisiae DOI 10.1091/mbc.e03-05-0322 Typ Journal Article Autor Schüller C Journal Molecular Biology of the Cell Seiten 706-720 Link Publikation -
2003
Titel The Yeast Protein Kinase C Cell Integrity Pathway Mediates Tolerance to the Antifungal Drug Caspofungin through Activation of Slt2p Mitogen-Activated Protein Kinase Signaling† DOI 10.1128/ec.2.6.1200-1210.2003 Typ Journal Article Autor Reinoso-Martín C Journal Eukaryotic Cell Seiten 1200-1210 Link Publikation -
2003
Titel War1p, a Novel Transcription Factor Controlling Weak Acid Stress Response in Yeast DOI 10.1128/mcb.23.5.1775-1785.2003 Typ Journal Article Autor Kren A Journal Molecular and Cellular Biology Seiten 1775-1785 Link Publikation -
2003
Titel The CRG1 gene required for resistance to the singlet oxygen-generating cercosporin toxin in Cercospora nicotianae encodes a putative fungal transcription factor DOI 10.1016/s0006-291x(03)00171-2 Typ Journal Article Autor Chung K Journal Biochemical and Biophysical Research Communications Seiten 302-310 -
2003
Titel Moderately lipophilic carboxylate compounds are the selective inducers of the Saccharomyces cerevisiae Pdr12p ATP-binding cassette transporter DOI 10.1002/yea.981 Typ Journal Article Autor Hatzixanthis K Journal Yeast Seiten 575-585