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Elektronenwechselwirkung mit modifizierten Nukleobasen

Electron interaction with modified nucleobases

Stephan Denifl (ORCID: 0000-0001-6072-2070)
  • Grant-DOI 10.55776/I5390
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status laufend
  • Projektbeginn 06.12.2021
  • Projektende 05.06.2026
  • Bewilligungssumme 388.403 €
  • Projekt-Website

CEUS: Österreich - Polen - Slowenien - Tschechien

Wissenschaftsdisziplinen

Physik, Astronomie (100%)

Keywords

    Mass spectrometry, Quantum chemical calculations, Low-energy electrons, Radiosensitizing compounds, Modified nucleobases, Dissociative electron attachment

Abstract

Solide Tumore stellen eine Herausforderung für die Strahlentherapie dar, da diese aufgrund des Mangels von Sauerstoff resistenter gegenüber dieser Therapieform sind. Daher werden sogenannte Radiosensitizer verwendet, die sich in den Tumorzellen anreichern und die Sensitivität gegenüber ionisierender Strahlung erhöhen. Eine Klasse von Radiosensitizern sind chemisch modifizierte Nukleinbasen, die in die DNA während deren Replikation und Reparatur eingebaut werden. Wenn die in der Strahlentherapie eingesetzte ionisierende Strahlung mit biologischer Materie wechselwirkt, werden niederenergetische Elektronen freigesetzt. Wenn sich ein solches Elektron an die modifizierte Nukleinbase anlagert, kann dies zu einem irreversiblen Schaden im Molekül führen. Dieser Prozess wird dissoziative Elektronenanlagerung genannt, die zur Bildung eines reaktiven Radikals führen kann. Dieses Radikal kann DNA nachhaltig schädigen. In diesem Projekt werden wir die Elektronenanlagerung an modifizierte Nukleinbasen und deren mögliche nachfolgende Fragmentierung mittels Experimenten und quantenchemische Rechnungen untersuchen. Experimentell werden wir einen Elektronenstrahl erzeugen und diesen unter wohldefinierten Bedingungen mit modifizierten Nukleinbasen kollidieren lassen. Wenn ein niederenergetisches Elektron von einem Molekül eingefangen wird, bildet es sich ein negativ geladenes Ion. Dieses negative Ion sowie negativ geladene Dissoziationsprodukte können mit einem Massenspektrometer detektiert werden. Mit dieser experimentellen Methode gewinnen wir Kenntnisse über die Effizienz des Elektroneneinfangs und mögliche Fragmentierungswege. Da diese Prozesse sich unterscheiden können, wenn das Molekül isoliert oder solvatisiert ist, werden wir auch die Situation betrachten, wenn die modifizierte Nukleinbase von Wassermolekülen umgeben ist. Die quantenchemischen Berechnungen dienen in diesem Projekt zur Vorhersage von vielversprechenden Modifikationsgruppen, die anschließend synthetisiert und experimentell untersucht werden. Die Berechnungen werden auch zum tieferen Verständnis der experimentell beobachteten Reaktionen dienen. Die Resultate dieses Projektes werden neue Erkenntnisse über elektroneninduzierte Reaktionen in biologisch relevanten Molekülen bringen. Auch der Einfluss der Solvatisierung für die Elektronenanlagerung wird bestimmt. Diese Erkenntnisse werden zu einem rationalen Design von Molekülen führen, die besonders sensitiv gegenüber niederenergetischen Elektronen sind. In der Zukunft werden solche Moleküle dann möglicherweise in Zellstudien, Tierversuchen und klinischen Studien positive Ergebnisse zeigen, die zur nachfolgenden Anwendung in der Strahlentherapie führen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Jacek Czub, Gdansk University of Technology - Polen
  • Sebastian Demkowicz, Gdansk University of Technology - Polen
  • Janusz Adam Rak, University of Gdansk - Polen

Research Output

  • 62 Zitationen
  • 16 Publikationen
  • 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Low-energy electron driven reactions in 2-bromo-5-nitrothiazole
    DOI 10.1063/5.0246241
    Typ Journal Article
    Autor Chen J
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 044304
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Free electron interaction with genistein: positive and negative ion formation
    DOI 10.1039/d5ra05594f
    Typ Journal Article
    Autor Nguyen V
    Journal RSC Advances
    Seiten 46717-46726
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Low-Energy Electron-Induced Dissociation of the Radiosensitizing Agent Sanazole
    DOI 10.1002/cplu.202500120
    Typ Journal Article
    Autor Izadi F
    Journal ChemPlusChem
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Electron interaction with laser-desorbed thymidine and guanine in the gas phase
    DOI 10.1140/epjd/s10053-025-01023-9
    Typ Journal Article
    Autor Parida D
    Journal The European Physical Journal D
    Seiten 76
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Electron scattering processes: fundamentals, challenges, advances, and opportunities
    DOI 10.1140/epjd/s10053-022-00482-8
    Typ Journal Article
    Autor Ptasinska S
    Journal The European Physical Journal D
    Seiten 179
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Low-Energy Electron Interactions with Methyl-p-benzoquinone: A Study of Negative Ion Formation
    DOI 10.1021/acsomega.4c04899
    Typ Journal Article
    Autor Chen J
    Journal ACS Omega
    Seiten 38032-38043
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Dissociative Electron Attachment Dynamics of a Promising Cancer Drug Indicates Its Radiosensitizing Potential
    DOI 10.1002/anie.202407469
    Typ Journal Article
    Autor Izadi F
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Surprising Radiolytic Stability of 8-Thiomethyladenine in an Aqueous Solution
    DOI 10.1021/acs.jpcb.4c01033
    Typ Journal Article
    Autor Datta M
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 3621-3630
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Electron-Induced Decomposition of 5-Bromo-4-thiouracil and 5-Bromo-4-thio-2'-deoxyuridine: The Effect of the Deoxyribose Moiety on Dissociative Electron Attachment
    DOI 10.3390/ijms24108706
    Typ Journal Article
    Autor Izadi F
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 8706
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Intramolecular Proton Transfer in the Radical Anion of Cytidine Monophosphate Sheds Light on the Sensitivities of Dry vs Wet DNA to Electron Attachment-Induced Damage
    DOI 10.1021/jacs.3c00591
    Typ Journal Article
    Autor Chomicz-Man´Ka L
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 9059-9071
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Dissociative Electron Attachment to 5-Iodo-4-thio-2'-deoxyuridine: A Potential Radiosensitizer of Hypoxic Cells
    DOI 10.1021/acs.jpclett.3c02219
    Typ Journal Article
    Autor Saqib M
    Journal The Journal of Physical Chemistry Letters
    Seiten 8948-8955
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Electron attachment induced dissociation of the radiosensitizer molecule 1-(4-bromo-3-nitrophenyl)-1-propanone
    DOI 10.1088/1402-4896/ad97f2
    Typ Journal Article
    Autor Chen J
    Journal Physica Scripta
    Seiten 015407
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Dissoziative Elektronenanlagerungsdynamik eines vielversprechenden Krebsmedikaments zeigt sein Potential als Radiosensitizer
    DOI 10.1002/ange.202407469
    Typ Journal Article
    Autor Izadi F
    Journal Angewandte Chemie
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Electron attachment to fluorodeoxyglucose: Dissociation dynamics in a molecule of near-zero electron affinity
    DOI 10.1063/5.0101726
    Typ Journal Article
    Autor Arthur-Baidoo E
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 074301
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Electron Attachment to 5-Fluorouracil: The Role of Hydrogen Fluoride in Dissociation Chemistry
    DOI 10.3390/ijms23158325
    Typ Journal Article
    Autor Arthur-Baidoo E
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 8325
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Low-Energy Electron Induced Reactions in Metronidazole at Different Solvation Conditions
    DOI 10.3390/ph15060701
    Typ Journal Article
    Autor Lochmann C
    Journal Pharmaceuticals
    Seiten 701
    Link Publikation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2022
    Titel Invited lecture at MDMM2022
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2024
    Titel Invited lecture at the DEA Club meeting
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2024
    Titel Invited lecture at COPCA 2024
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Invited lecture at MultIChem 2023
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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