ERA-NET PathoGenoMics_TRANSPAT

Ein kritischer Schritt in systemischen Pilzinfektionen ist die Dissemination der Organismen über den Blutkreislauf. Wie filamentöse Pilze diese für sie feindlichen Bedingungen überleben ist weitgehend ungeklärt. Das Ziel des TRANSPAT-Projekt war die Integration von genetischen und Transkriptom-analytischen Methoden zur Erfassung von Genexpressionsnetzwerken von zwei fakultativ pathogenen Pilzen, Aspergillus fumigatus und Fusarium oxysporum. Mithilfe zweier komplementärer Herangehensweisen, einerseits Oligonucleotide-Microarrays und andererseits Parallelsequenzierung von cDNA (RNA-seq), wurden genomweite Expressionsprofile erstellt, welche die Situation während der Frühphase des Wachstums im Blut widerspiegeln. Resultierend daraus, konnten hunderte Gene identifiziert werden, deren Transkriptlevels in Aspergillus und Fusarium bei Wachstum auf Blut signifikant hochreguliert sind. Im österreichischen Subprojekt wurden mehrere entscheidende Virulenzfaktoren identifiziert und/oder charakterisiert. Neben dem Eisenregulator HapX, zählen auch der CCAAT-binding complex (CBC, auch Hap Komplex genannt), sowie der pH Regulator PacC und der Schwefelregulator MetR zu jenen Faktoren. Eine Transkriptomanalyse von Mutanten Stämmen, denen der jeweilige Transkriptionsfaktor fehlte, lieferte neue Einblicke in das genetische Programm, welches über die Virulenz von filamentösen Pilzpathogenen entscheidet. Diese Entdeckung ermöglicht die Identifikation neuer antifungaler Targets und zeigt gleichzeitig neue Behandlungsoptionen auf.